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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Leite; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
Data corrente: |
22/11/2017 |
Data da última atualização: |
21/09/2023 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
CAMPOS, B. M.; CARMO, A. S. do; EGITO, A. A. do; MARIANTE, A. da S.; ALBUQUERQUE, M. S. M. do; GOUVEIA, J. J. S. de; MALHADO, C. H. M.; VERARDO, L. L.; SILVA, M. V. G. B. da; CARNEIRO, P. L. S. |
Afiliação: |
BÁRBARA MACHADO CAMPOS, UESB; ADRIANA SANTANA DO CARMO, UFG; ANDREA ALVES DO EGITO, CNPGC; ARTHUR DA SILVA MARIANTE, Cenargen; MARIA DO SOCORRO MAUES ALBUQUERQUE, Cenargen; JOÃO JOSÉ SIMONI DE GOUVEIA, UNIVASF; CARLOS HENRIQUE MENDES MALHADO, UESB; LUCAS LIMA VERARDO; MARCOS VINICIUS GUALBERTO B SILVA, CNPGL; PAULO LUIZ SOUZA CARNEIRO, UESB. |
Título: |
Genetic diversity, population structure, and correlations between locally adapted zebu and taurine breeds in Brazil using SNP markers. |
Ano de publicação: |
2017 |
Fonte/Imprenta: |
Tropical Animal Health and Production, v. 49, n. 8, p 1677-1684, 2017. |
DOI: |
10.1007/s11250-017-1376-7 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
Abstract Genetic diversity is one of the most important issues in studies on conservation of cattle breeds and endangered species. The objective of this study was to estimate the levels of genetic differentiation between locally adapted taurine (Bos taurus taurus) and zebu (Bos taurus indicus) breeds in Brazil, which were genotyped for more than 777,000 SNPs. The fixation index (FST), principal component analysis (PCA), and Bayesian clustering were estimated. The FST highlighted genetic differentiation between taurine and zebu breeds. The taurine lines, Caracu and Caracu Caldeano, had significant genetic differentiation (FST close to 5%) despite their recent selection for different uses (meat and milk). This genetic variability can be used for conservation of locally adapted animals, as well as for breeding programs on zebu breeds. Introgression of zebu in locally adapted breeds was identified, especially in Curraleiro Pé-Duro breed. The Gyr breed, however, had low breed purity at genomic level due to its very heterogeneous mixing pattern. |
Palavras-Chave: |
Conservation; Naturalized bovine. |
Thesaurus Nal: |
Genomics; Introgression. |
Categoria do assunto: |
-- G Melhoramento Genético |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/181022/1/Campos2017-Article-GeneticDiversityPopulationStru.pdf
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Marc: |
LEADER 01988naa a2200289 a 4500 001 2083229 005 2023-09-21 008 2017 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $a10.1007/s11250-017-1376-7$2DOI 100 1 $aCAMPOS, B. M. 245 $aGenetic diversity, population structure, and correlations between locally adapted zebu and taurine breeds in Brazil using SNP markers.$h[electronic resource] 260 $c2017 520 $aAbstract Genetic diversity is one of the most important issues in studies on conservation of cattle breeds and endangered species. The objective of this study was to estimate the levels of genetic differentiation between locally adapted taurine (Bos taurus taurus) and zebu (Bos taurus indicus) breeds in Brazil, which were genotyped for more than 777,000 SNPs. The fixation index (FST), principal component analysis (PCA), and Bayesian clustering were estimated. The FST highlighted genetic differentiation between taurine and zebu breeds. The taurine lines, Caracu and Caracu Caldeano, had significant genetic differentiation (FST close to 5%) despite their recent selection for different uses (meat and milk). This genetic variability can be used for conservation of locally adapted animals, as well as for breeding programs on zebu breeds. Introgression of zebu in locally adapted breeds was identified, especially in Curraleiro Pé-Duro breed. The Gyr breed, however, had low breed purity at genomic level due to its very heterogeneous mixing pattern. 650 $aGenomics 650 $aIntrogression 653 $aConservation 653 $aNaturalized bovine 700 1 $aCARMO, A. S. do 700 1 $aEGITO, A. A. do 700 1 $aMARIANTE, A. da S. 700 1 $aALBUQUERQUE, M. S. M. do 700 1 $aGOUVEIA, J. J. S. de 700 1 $aMALHADO, C. H. M. 700 1 $aVERARDO, L. L. 700 1 $aSILVA, M. V. G. B. da 700 1 $aCARNEIRO, P. L. S. 773 $tTropical Animal Health and Production$gv. 49, n. 8, p 1677-1684, 2017.
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Registro original: |
Embrapa Gado de Leite (CNPGL) |
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242. | | CINTRA, L. C.; ZERLOTINI NETO, A.; LOBO, F. P.; SILVA, F. R. da; GIACHETTO, P. F.; FALCAO, P. R. K.; SILVA, L. O. C. da; EGITO, A. A. do; SIQUEIRA, F.; SILVA, N. M. A. da; PAIVA, S. R.; YAMAGISHI, M. E. B.; CAETANO, A. R. Sequencing and de novo genome assembley of a Nelore (Bos indicus) bull. In: INTERNATIONAL PLANT & ANIMAL GENOME, 21., 2013, San Diego. Abstracts... Jersey City: Scherago International, 2013. P0522.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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243. | | CINTRA, L. C.; ZERLOTINI, A.; LOBO, F. P.; SILVA, F. R. da; GIACHETTO, P. F.; KUSER-FALCÃO, P. R.; SILVA, L. O. C. da; EGITO, A. A. do; SIQUEIRA, F.; SILVA, N. M. A. da; PAIVA, S. R.; YAMAGISHI, M. E. B.; CAETANO, A. R. Sequencing and de novo genome assembly of a nelore (Bos indicus) bull. In: INTERNATIONAL PLANT & ANIMAL GENOME, 21., 2013, San Diego. [Abstracts...]. [S.l.: s.n.], 2013. Não paginado. Pôster 0522.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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252. | | CINTRA, L. C.; ZERLOTINI NETO, A.; LOBO, F. P.; GIACHETTO, P. F.; FALCAO, P. R. K.; SILVA, L. O. C. da; EGITO, A. A. do; SIQUEIRA, F.; SILVA, N. M. A. da; PAIVA, S. R.; YAMAGISHI, M. E. B.; CAETANO, A. R. Next generation sequencing and de novo assembly of a Nelore (Bos indicus) bull genome. In: ANNUAL MEETING OF THE EUROPEAN FEDERATION OF ANIMAL SCIENCE, 64., 2013, Nantes. Abstracts... Session 25, Poster 34Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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258. | | ALBUQUERQUE, M. do S. M.; RAMOS, A. F.; PAIVA, S. R.; MARQUES, J. R. F.; FACO, O.; CARNEIRO, P. C. F.; EGITO, A. A. do; VILLELA, L. C. V.; CASTRO, S. T. R.; MOREIRA, J. R. A.; COSTA, H.; COSTA, M. R. T. da R.; JULIANO, R. S.; SANTOS, S. A.; ARAUJO, A. M. de; CARVALHO, G. M. C.; PEREIRA, F. de M.; ALMEIDA, M. J. de O.; LEAL, T. M.; SOUZA, C. J. H. de; SERENO, J. R. B.; MATTOS, P. S. R. de; LEDUR, M. C.; MARIANTE, A. da S. Red Brasileña de Recursos Genéticos Animales. In: SIMPOSIO INTERNACIONAL DE RECURSOS GENÉTICOS PARA AMÉRICA LATINA Y EL CARIBE, 8., 2011, Quito. [Proceedings...] Quito: INIAP, 2011. SIRGEALC.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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Biblioteca(s): Embrapa Pantanal. |
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