|
|
Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Florestas. |
Data corrente: |
21/03/2014 |
Data da última atualização: |
18/02/2015 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
SILVA, F. F. e; RESENDE, M. D. V. de; ROCHA, G. S.; DUARTE, D. A. S.; LOPES, P. S.; BRUSTOLIN, O. J. B.; THUS, S.; VIANA, J. M. S.; GUIMARÃES, S. E. F. |
Afiliação: |
FABIANO FONSECA E SILVA, UFV; MARCOS DEON VILELA DE RESENDE, CNPF; GILSON SILVÉRIO ROCHA, UVF; DARLENE ANA S. DUARTE, UFV; PAULO SÁVIO LOPES, UFV; OTÁVIO J. B. BRUSTOLIN, UFV; SANDER THUS, WAGENINGEN UNIVERSITY; JOSÉ MARCELO S. VIANA, UFV; SIMONE E. F. GUIMARÃES, UFV. |
Título: |
Genomic growth curves of an outbred pig population. |
Ano de publicação: |
2013 |
Fonte/Imprenta: |
Genetics and Molecular Biology, v. 36, n. 4, p. 520-527, 2013. |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
In the current post-genomic era, the genetic basis of pig growth can be understood by assessing SNP marker effects and genomic breeding values (GEBV) based on estimates of these growth curve parameters as phenotypes. Although various statistical methods, such as random regression (RR-BLUP) and Bayesian LASSO (BL), have been applied to genomic selection (GS), none of these has yet been used in a growth curve approach. In this work, we compared the accuracies of RR-BLUP and BL using empirical weight-age data from an outbred F2 (Brazilian Piau X commercial) population. The phenotypes were determined by parameter estimates using a nonlinear logistic regression model and the halothane gene was considered as a marker for evaluating the assumptions of the GS methods in relation to the genetic variation explained by each locus. BL yielded more accurate values for all of the phenotypes evaluated and was used to estimate SNP effects and GEBV vectors. The latter allowed the construction of genomic growth curves, which showed substantial genetic discrimination among animals in the final growth phase. The SNP effect estimates allowed identification of the most relevant markers for each phenotype, the positions of which were coincident with reported QTL regions for growth traits. |
Palavras-Chave: |
Melhoramento genético. |
Thesagro: |
Curva de Crescimento; Porco. |
Categoria do assunto: |
-- |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/99868/1/2013-API-GenomicGrowth.pdf
|
Marc: |
LEADER 02003naa a2200253 a 4500 001 1983083 005 2015-02-18 008 2013 bl uuuu u00u1 u #d 100 1 $aSILVA, F. F. e 245 $aGenomic growth curves of an outbred pig population.$h[electronic resource] 260 $c2013 520 $aIn the current post-genomic era, the genetic basis of pig growth can be understood by assessing SNP marker effects and genomic breeding values (GEBV) based on estimates of these growth curve parameters as phenotypes. Although various statistical methods, such as random regression (RR-BLUP) and Bayesian LASSO (BL), have been applied to genomic selection (GS), none of these has yet been used in a growth curve approach. In this work, we compared the accuracies of RR-BLUP and BL using empirical weight-age data from an outbred F2 (Brazilian Piau X commercial) population. The phenotypes were determined by parameter estimates using a nonlinear logistic regression model and the halothane gene was considered as a marker for evaluating the assumptions of the GS methods in relation to the genetic variation explained by each locus. BL yielded more accurate values for all of the phenotypes evaluated and was used to estimate SNP effects and GEBV vectors. The latter allowed the construction of genomic growth curves, which showed substantial genetic discrimination among animals in the final growth phase. The SNP effect estimates allowed identification of the most relevant markers for each phenotype, the positions of which were coincident with reported QTL regions for growth traits. 650 $aCurva de Crescimento 650 $aPorco 653 $aMelhoramento genético 700 1 $aRESENDE, M. D. V. de 700 1 $aROCHA, G. S. 700 1 $aDUARTE, D. A. S. 700 1 $aLOPES, P. S. 700 1 $aBRUSTOLIN, O. J. B. 700 1 $aTHUS, S. 700 1 $aVIANA, J. M. S. 700 1 $aGUIMARÃES, S. E. F. 773 $tGenetics and Molecular Biology$gv. 36, n. 4, p. 520-527, 2013.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
Registro original: |
Embrapa Florestas (CNPF) |
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
Registros recuperados : 7 | |
1. | | LEITE, M. A. de A.; DUARTE, D. A.; MASSRUHÁ, S. M. F. S. Agricultura digital: levantamento junto ao produtor rural na Região Metropolitana de Campinas. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE AGROINFORMÁTICA, 12., 2019, Indaiatuba. Anais... Ponta Grossa: SBIAGRO, 2019. p. 440-449. Organizadores: Maria Fernanda Moura, Jayme Garcia Arnal Barbedo, Alaine Margarete Guimarães, Valter Castelhano de Oliveira. SBIAgro 2019.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
| |
2. | | LAGROTTA, M. R.; SILVA, F. F. e; RESENDE, M. D. V. de; NASCIMENTO, M.; DUARTE, D. A. S.; AZEVEDO, C. F.; MOTA, R. R. Computação paralela aplicada à seleção genômica via inferência Bayesiana. Revista Brasileira de Biometria, Lavras, v. 35, n. 3, p. 440-448, 2017.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 4 |
Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
| |
3. | | SILVA, F. F.; ROCHA, G. S.; RESENDE, M. D. V. de; GUIMARÃES, S. E. F.; PETERNELLI, L. A.; DUARTE, D. A. S.; AZEVEDO, C. Seleção genômica ampla para curvas de crescimento. Arquivo Brasileiro de Medicina Veterinária e Zootecnia, v. 65, n. 5, p. 1519-1526, 2013.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
| |
4. | | DUARTE, D. A. S.; FORTES, M. R. S.; DUARTE, M. de S.; GUIMARÃES, S. E. F.; VERARDO, L. L.; VERONEZE, R.; RIBEIRO, A. M. F.; LOPES, P. S.; RESENDE, M. D. V. de; SILVA, F. F. e. Genome-wide association studies, meta-analyses and derived gene network for meat quality and carcass traits in pigs. Animal Production Science, v. 58, n. 6, p. 1100-1008, May 2018.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
| |
5. | | SILVA, F. F. e; RESENDE, M. D. V. de; ROCHA, G. S.; DUARTE, D. A. S.; LOPES, P. S.; BRUSTOLIN, O. J. B.; THUS, S.; VIANA, J. M. S.; GUIMARÃES, S. E. F. Genomic growth curves of an outbred pig population. Genetics and Molecular Biology, v. 36, n. 4, p. 520-527, 2013.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
| |
6. | | TOMAZALLI, I. B.; FREITAS, J. B. DE; FABBI, L. M.; FILIPINI, T. A.; SILVA, C. M. da; BEDIN, J. M.; DUARTE, D. A. M.; SANTOS, A. dos; BACARRIN, A.; HIGA, L. R. G.; YANO, D. M. Y.; KILLNER, M.; FREZZA, A. L. C.; ABECIA, E. C. de G.; TRONCO, V. M.; TOMAZELLI JÚNIOR, O.; BARIONI JUNIOR, W. Comparison of the BAX system PCR method to Brazil's official method for the detection of Salmonella in food, water, and environmental samples. Journal of Food Protection, v. 71, n. 12, p. 2442-2447, dec. 2008.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Internacional - A |
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
| |
7. | | FÁVARO, F. N.; NEUMAIER, N.; DUARTE, D. A. B. G.; ALMEIDA FILHO, K. M.; GIANELLI, F. M.; CAMARGO, L. M.; TOLEDO, C. F. T.; DELATTRE, N.; SIBALDELLI, R. N. R.; OLIVEIRA, M. C. N.; NEPOMUCENO, A. L.; FARIAS, J. R. B. Índice de vegetação por diferença normalizada (NDVI) de cultivares de soja sob três níveis de disponibilidade hídirca no solo. In: JORNADA ACADÊMICA DA EMBRAPA SOJA, 5., 2010, Londrina. Resumos... Londrina: Embrapa Soja, 2010. p. 58-60. (Embrapa Soja. Documentos, 323). Editado por Odilon Ferreira Saraiva, Paula Geron Saiz Melo.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
| |
Registros recuperados : 7 | |
|
Nenhum registro encontrado para a expressão de busca informada. |
|
|