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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Meio Ambiente. |
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Data corrente: |
19/02/2016 |
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Data da última atualização: |
19/02/2016 |
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Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
SILVA, L. J.; DUARTE, A. W. F.; ROSA, L. H.; OLIVEIRA, V. M.; MELO, I. S. de. |
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Afiliação: |
L. J. SILVA, ESALQ/USP; A. W. F. DUARTE, USP; L. H. ROSA, UFMG; V. M. OLIVEIRA, CPQBA/Unicamp. |
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Título: |
Fosmid library: methodological challenges. |
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Ano de publicação: |
2015 |
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Fonte/Imprenta: |
In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA, 28., Florianópolis. Anais... Florianópolis: Sociedade Brasileira de Microbiologia, 2015. Ref. 0676-1. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Abstract: Since 1983, Brazil conducts researchs in the Antartic continent through the Brazilian Antartic Program. For many years, studies were focused only to the understanding of the environmental impacts of climate change resulting from human action and the system of micro.- and macrorganisms. The interest of the bioprospecting molecules for use in agriculture or health began only in the last decade in the same continent. Since about half of the known bioactive compounds are originating from bacteria and fungi, and a tiny portion of the microbiota is cultivable in the Laboratory. Recent advances mainly to independent cultivation techniques allow a greater understanding of microbial biodiversity as well as access to functionality of their metabolic pathways. In this context the heterologous expression from metagenomic clones from total environmental DNA (eDNA) it stands out as a promising tool to access the microbial functional part. The objective of this study was to evaluate the efficiency of the cloning procedure (metagenomic library of clones in fosmid vector - pCC2FOS) according to different methodologies of obtaining eDNA, selection of the gene inserts and conditions for the reaction for ligation to vector. The samples were collected at Admiralty Bay - Antarctic Peninsula, during last summer (Nov/Feb 2014-2015.) by the MycoAntar Project. The samples were submitted to extraction of eDNA high molecular weight such as to mechanical and chemical cell lysis procedures. A portion of the product extraction was partitioned by pulsed field gel electrophoresis from which they were recovered fragments containing approximately 40Kb and the other portion went directly to the subsequent procedure. The ligation reaction was made in two different temperatures 16-25°C. The result of the chemical cell lysis reaction was more efficient at obtaining size fragments of interest for the cloning procedure despite the quantitative reduction compared to extraction by mechanical lysis. The recovery procedure of the inserts gel using gelase enzyme resulted in drastic losses at the final concentration of eDNA. In relation to the difference in incubation temperature the binding reaction some differences can be observed. Thus 15,000 clones were obtained and are currently preserved at -80°C for next experiments as well as be submitted to the enzymatic screening functional biological activities of biotechnological interest. MenosAbstract: Since 1983, Brazil conducts researchs in the Antartic continent through the Brazilian Antartic Program. For many years, studies were focused only to the understanding of the environmental impacts of climate change resulting from human action and the system of micro.- and macrorganisms. The interest of the bioprospecting molecules for use in agriculture or health began only in the last decade in the same continent. Since about half of the known bioactive compounds are originating from bacteria and fungi, and a tiny portion of the microbiota is cultivable in the Laboratory. Recent advances mainly to independent cultivation techniques allow a greater understanding of microbial biodiversity as well as access to functionality of their metabolic pathways. In this context the heterologous expression from metagenomic clones from total environmental DNA (eDNA) it stands out as a promising tool to access the microbial functional part. The objective of this study was to evaluate the efficiency of the cloning procedure (metagenomic library of clones in fosmid vector - pCC2FOS) according to different methodologies of obtaining eDNA, selection of the gene inserts and conditions for the reaction for ligation to vector. The samples were collected at Admiralty Bay - Antarctic Peninsula, during last summer (Nov/Feb 2014-2015.) by the MycoAntar Project. The samples were submitted to extraction of eDNA high molecular weight such as to mechanical and chemical cell lysis procedures. A p... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Antarctic peninsula; Metagenomic library; Unculturable microrganisms. |
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Categoria do assunto: |
V Taxonomia de Organismos |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/139515/1/2015RA-008.pdf
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Marc: |
LEADER 03101nam a2200193 a 4500
001 2037800
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520 $aAbstract: Since 1983, Brazil conducts researchs in the Antartic continent through the Brazilian Antartic Program. For many years, studies were focused only to the understanding of the environmental impacts of climate change resulting from human action and the system of micro.- and macrorganisms. The interest of the bioprospecting molecules for use in agriculture or health began only in the last decade in the same continent. Since about half of the known bioactive compounds are originating from bacteria and fungi, and a tiny portion of the microbiota is cultivable in the Laboratory. Recent advances mainly to independent cultivation techniques allow a greater understanding of microbial biodiversity as well as access to functionality of their metabolic pathways. In this context the heterologous expression from metagenomic clones from total environmental DNA (eDNA) it stands out as a promising tool to access the microbial functional part. The objective of this study was to evaluate the efficiency of the cloning procedure (metagenomic library of clones in fosmid vector - pCC2FOS) according to different methodologies of obtaining eDNA, selection of the gene inserts and conditions for the reaction for ligation to vector. The samples were collected at Admiralty Bay - Antarctic Peninsula, during last summer (Nov/Feb 2014-2015.) by the MycoAntar Project. The samples were submitted to extraction of eDNA high molecular weight such as to mechanical and chemical cell lysis procedures. A portion of the product extraction was partitioned by pulsed field gel electrophoresis from which they were recovered fragments containing approximately 40Kb and the other portion went directly to the subsequent procedure. The ligation reaction was made in two different temperatures 16-25°C. The result of the chemical cell lysis reaction was more efficient at obtaining size fragments of interest for the cloning procedure despite the quantitative reduction compared to extraction by mechanical lysis. The recovery procedure of the inserts gel using gelase enzyme resulted in drastic losses at the final concentration of eDNA. In relation to the difference in incubation temperature the binding reaction some differences can be observed. Thus 15,000 clones were obtained and are currently preserved at -80°C for next experiments as well as be submitted to the enzymatic screening functional biological activities of biotechnological interest.
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653 $aMetagenomic library
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700 1 $aROSA, L. H.
700 1 $aOLIVEIRA, V. M.
700 1 $aMELO, I. S. de
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Registro original: |
Embrapa Meio Ambiente (CNPMA) |
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| Registros recuperados : 148 | |
| 121. |  | FERREIRA GOMES, C. C.; OLIVEIRA, L. DE S.; RODRIGUES, D. C.; RIBEIRO, P. R. V.; CANUTO, K. M.; DUARTE, A. S. G.; EÇA, K. S.; FIGUEIREDO, R. W. DE. Evidence for antioxidant and anti-inflammatory potential of mango (Mangifera indica L.) in naproxen-induced gastric lesions in rat. Journal of Food Biochemistry, p.e13880-e13880, 2021| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria Tropical. |
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| 122. | | ALVES, F. M.; OLIFIERS, N.; BIANCHI, R. de C.; DUARTE, A. C.; COTIAS, P. M. T.; D´ANDREA, P. S.; GOMPPER, M. E.; MOURAO, G. de M.; HERRERA, H. M.; JANSEN, A. M. Modulating Variables of Trypanosoma cruzi and Trypanosoma evansi Transmission in Free-Ranging Coati (Nasua nasua) from the Brazilian Pantanal Region. Vector-Borne and Zoonotic Diseases, v. 11, n. 7, p. 835-841, 2011.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Pantanal. |
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| 123. | | SILVA, T. R.; DUARTE, A. W. F.; PASSARINI, M. R. Z.; RUIZ, A. L. T. G.; FRANCO, C. H.; MORAES, C. B.; FANTINATTI-GARBOGGINI, F.; MELO, I. S. de; RODRIGUES, R. A.; OLIVEIRA, V. M. Taxonomic assessment and antimicrobial screening of isolated bacteria from marine and terrestrial Antarctic samples. Revista Ciência, Tecnologia & Ambiente, Araras, SP, v. 6, n. 1, p. 542, 2017. Volume Especial. Edição dos Anais do VIII Simpósio de Microbiologia Aplicada, Rio Claro, maio 2017.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio Ambiente. |
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| 124. | | COSTA, V. M. M.; RIBEIRO, M. F. B.; DUARTE, A. L. L.; MANGUEIRA, J. M.; PESSOA, A. F. A.; AZEVEDO, S. S.; BARROS, A. T. M. de; RIET-CORREA, F.; LABRUNA, M. B. Soroprevalência e fatores de risco para anaplasmose, babesiose e tripanossomiases em bovinos na região semiárida da Paraíba. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE PARASITOLOGIA VETERINÁRIA, 17., 2012, São Luis. Parasitologia veterinária, bem estar e produção animal: anais. São Luis: Colégio Brasileiro de Parasitologia Veterinária, 2012. Resumo: PPR 066. p. 215| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pantanal. |
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| 125. | | COSTA, V. M. de M.; RIBEIRO, M. F. B.; DUARTE, A. L. L.; MANGUEIRA, J. M.; PESSOA, A. F. A.; AZEVEDO, S. S.; BARROS, A. T. M. de; RIET-CORREA, F.; LABRUNA, M. B. Seroprevalence and risk factors for cattle anaplasmosis, babesiosis, and trypanosomiasis in a Brazilian semiarid region. Revista Brasileira de Parasitologia Veterinária, Jaboticabal, v. 22, n. 2, p. 207-213, 2013. 7 p.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Pantanal. |
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| 126. | | ARRUDA, G. L. S. de; DUARTE, A. V. M.; VENDRUSCOLO, T. P. S.; SILVA, R. S. da; CASTRILLO, M. A. de S.; PARRELLA, R. A. da C.; BARELLI, M. A. A. Variabilidade genética de genótipos de sorgo forrageiro. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 9., 2017, Foz do Iguaçu. Melhoramento de plantas: projetando o futuro. Foz do Iguaçu: SBMP, 2017. p. 637.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 127. | | GUEDES, M. A. A.; COSTA, E. L. da; COELHO, E. F.; COELHO FILHO, M. A.; DUARTE, A. M. A.; DINIZ, R. S.; SANTANA, P. B.; LOBO, B. S.; SILVA, G. M.; AMARAL, V. L.; PACHECO, D. D.; DIAS, M. S. C.; VIDIGAL, S. M. Adubação e frequência de irrigação no sistema localizado de microaspersão na cultura do morangueiro no Norte de Minas Gerais. In: CONGRESSO NACIONAL DE IRRIGAÇÃO E DRENAGEM, 17., 2007. Mossoró. Agricultura no semi-árido. Mossoró: [s.n.], 2007. Polliana B. Santana, UNIMONTES; Bernardo S. Lobo, UNIMONTES; Geraldo Magela Silva, UNIMONTES; Valvídio Lopes Amaral, UNIMONTES; Dilermando D. Pacheco, EPAMIG; Mário Sérgio C. Dias, EPAMIG; Sanzio Mollica Vidigal, EPAMIG.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica | Circulação/Nível: -- - -- |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 128. | | GUIMARAES, P. E. de O.; MEIRELLES, W. F.; RIBEIRO, P. H. E.; PACHECO, C. A. P.; GAMA, E. E. G. e; PARENTONI, S. N.; SANTOS, M. X. dos; FERREIRA, A. da S.; CASELA, C. R.; OLIVEIRA, A. C. de; DUARTE, A. P.; CECCOM, G.; CARDOSO, M.; MACHADO, A. T.; SIMIONATO, A. A.; VILARINHO, A.; DONÁ, A. D.; MARCHI, S. L.; RAMALHO, A. R. Correlações entre ambientes baseadas na produtividade de híbridos de milho avaliados na safra e safrinha. In: SEMINÁRIO NACIONAL DE MILHO SAFRINHA, 8., 2005, Assis. Anais... Campinas: Instituto Agronômico, 2005. p. 273-278.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 129. | | GUIMARAES, P. E. de O.; MEIRELLES, W. F.; RIBEIRO, P. H. E.; PACHECO, C. A. P.; GAMA, E. E. G. e; PARENTONI, S. N.; SANTOS, M. X. dos; FERREIRA, A. da S.; CASELA, C. R.; OLIVEIRA, A. C. de; DUARTE, A. P.; CECCOM, G.; CARDOSO, M.; MACHADO, A. T.; SIMLONATO, A. A.; VILARINHO, A.; DONA, A. D.; MARCHI, S. L.; RAMALHO, A. R. Correlações entre ambientes baseadas na produtividade de híbridos de milho avaliados na safra e safrinha. Sete Lagoas Embrapa Milho e Sorgo, 2005. 6 p. (Embrapa Milho e Sorgo. Circular Técnica, 71).| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte; Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 130. | | GUIMARAES, P. E. de O.; MEIRELLES, W. F.; RIBEIRO, P. H. E.; PACHECO, C. A. P.; GAMA, E. E. G. e; PARENTONI, S. N.; SANTOS, M. X. dos; FERREIRA, A. da S.; CASELA, C. R.; OLIVEIRA, A. C. de; DUARTE, A. P.; CECCOM, G.; CARDOSO, M.; MACHADO, A. T.; SIMLONATO, A. A.; VILARINHO, A.; DONA, A. D.; MARCHI, S. L.; RAMALHO, A. R. Corelações entre ambientes baseadas na produtividade de híbridos de milho avaliados na safra e safrinha. Sete Lagoas: Embrapa Milho e Sorgo, 2005. 6 p. (Embrapa Milho e Sorgo. Circular Técnica, 71).| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 131. | | BEZERRA, J. N.; GOMEZ, M. C. V.; ROLÓN, M.; CORONEL, C.; ALMEIDA-BEZERRA, J. W.; FIDELIS, K. R.; MENEZES, S. A. de; CRUZ, R. P. da; DUARTE, A. E.; RIBEIRO, P. R. V.; BRITO, E. S. de; COUTINHO, H. D. M.; MORAIS-BRAGA, M. F. B.; BEZERRA, C. F. Chemical composition, Evaluation of Antiparasitary and Cytotoxic Activity of the essential oil of Psidium brownianum MART EX. DC. Biocatalysis and Agricultural Biotechnology, v. 39, 102247, 2022.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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| 132. | | AMARAL, V. L. do; COSTA, E. L. da; COELHO, E. F.; COELHO FILHO, M. A.; DINIZ, R. S.; DUARTE, A. M. A.; PACHECO, D. D.; DIAS, M. S. C.; GUEDES, M. A. A.; SILVA, G. M.; LOBO, B. S.; SANTANA, P. B.; VIDGAL, S. M. Comparação de sistemas de irrigação com adubação convencional e fertirrigação na cultura do morangueiro. In: CONGRESSO NACIONAL DE IRRIGAÇÃO E DRENAGEM, 17., 2007. Mossoró. Agricultura no semi-árido. Mossoró: [s.n.], 2007. Dilermando D. Pacheco, EPAMIG; Mário Sérgio C. Dias, EPAMIG; Márcia A. Almeida Guedes, EPAMIG; Geraldo Magela Silva, UNIMONTES; Bernardo S. Lobo, UNIMONTES; Polliana B. Santana, EPAMIG; Sanzio Mollica Vidgal, EPAMIG.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica | Circulação/Nível: -- - -- |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 133. | | COSTA, A. R.; SILVA, J. R. de L.; PEREIRA, P. S.; BEZERRA, J. W. A.; OLIVEIRA, M. A. S. de; RIBEIRO, P. R. V.; BRITO, E. S. de; DRUMOND, M. A.; CALIXTO JÚNIOR, J. T.; KAMDEM, J. P.; DUARTE, A. E.; BARROS, L. M.; COUTINHO, H. D. M. Influence of abiotic factors on phytochemical diversity of Anacardium occidentale L. Food Bioscience, v. 49, 101911, 2022.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 134. | | DUARTE, A. M. A.; COSTA, É. L. da; COELHO, E. F.; COELHO FILHO, M. A.; PACHECO, D. D.; DIAS, M. S. C.; GUEDES, M. A. A.; DINIZ, R. S.; SANTANA, P. B.; SILVA, G. M.; AMARAL, V. L.; LOBO, B. S.; SILVA, I. P. da. Frequências de irrigação e formas de adubação na cultura do morangueiro. Gramado, RS, 2007. 3 p. Trabalho apresentado no XXXI Congresso Brasileiro de Ciência do Solo.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 135. | | SABINO, L. B. DE S.; GONZAGA, M. L. DA C.; OLIVEIRA, L. DE S.; DUARTE, A. S. G.; SILVA, L. M. A. e; BRITO, E. S. de; FIGUEIREDO, R. W. DE; SILVA, L. M. R. DA; SOUSA, P. H. M. DE. Polysaccharides from acerola, cashew apple, pineapple, mango and passion fruit co-products: structure, cytotoxicity and gastroprotective effects. Bioactive Carbohydrates and Dietary Fibre, [Amsterdam], v. 24, artigo 100228, 11 p., Oct. 2020.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 3 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria Tropical. |
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| 136. | | SANTANA, P. B.; COELHO, E. F.; COSTA, E. L. da; COELHO FILHO, M. A.; DINIZ, R. S.; DUARTE, A. M. A.; PACHECO, D. D.; DIAS, M. S. C.; AMARAL, V. L.; GUEDES, M. A. A.; SILVA, G. M.; LOBO, B. S.; VIDGAL, S. M. Cultura do morangueiro submetida a diferentes frequências de irrigação e fertirrigação. In: CONGRESSO NACIONAL DE IRRIGAÇÃO E DRENAGEM, 17., 2007. Mossoró. Agricultura no semi-árido. Mossoró: [s.n.], 2007. Mário Sérgio C. Dias, EPAMIG; Valvídio Lopes Amaral, UNIMONTES; Márcia A. Almeida Guedes, UNIMONTES; Geraldo Magela Silva, UNIMONTES; Bernardo S. Lobo, UNIMONTES; Sanzio Mollica Vidgal, EPAMIG.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica | Circulação/Nível: -- - -- |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 137. | | FIGUEIREDO, E. O.; MELO JUNIOR, A. de; OLIVEIRA, L. C. de; OLIVEIRA, M. V. N. d'; FIGUEIREDO, S. M. de M.; SILVA. E. F. da; PAPA, D. de A.; SANTOS, E. K. M. dos; GOMEZ GUILLEN, M.; VERÁS, H. F. P.; GONÇALVES, R. J. F.; DUARTE, A. N. F. Manejo florestal 4.0 - passos para emprego de aeronaves remotamente pilotadas (drones) no planejamento florestal em nativas. Rio Branco, AC: Embrapa Acre, 2020. 46 p. (Embrapa Acre. Documentos, 169). Selo ODS 15.| Biblioteca(s): Embrapa Acre. |
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| 138. | | CASTRILLON, M. A. S.; BARELLI, M. A. A.; CORREA, C. L.; SILVA, V. P.; ALMICI, M. S.; VENDRUSCOLO, T. P. S.; SILVA, R. S.; ZAGO, B. W.; DUARTE, A. V. M.; SILVA, D. D. da; ARAUJO, K. L.; COTA, L. V.; TARDIN, F. D. Multivariate analysis of resistance components of the saccharin and biomass sorghum to Ramulispora sorghi. Scientific Electronic Archives, v. 13, n. 5, p. 39-45, 2020.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 3 |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 139. | | COSTA, A. R.; SILVA, J. R. DE L.; OLIVEIRA, T. J. S. DE; SILVA, T. G. DA; PEREIRA, P. S.; BORBA, E. F. DE O.; BRITO, E. S. de; RIBEIRO, P. R. V.; BEZERRA, J. W. A.; CALIXTO JÚNIOR, J. T.; MENEZES, I. R. A. DE; KAMDEM, J. P.; DUARTE, A. E.; BARROS, L. M. Phytochemical profile of Anacardium occidentale L. (cashew tree) and the cytotoxic and toxicological evaluation of its bark and leaf extracts. South African Journal of Botany, [Amsterdam], v. 135, p. 355-364, Dec. 2020.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria Tropical. |
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| 140. | | GUIMARAES, P. E. de O.; MACHADO, J. R. de A.; GUIMARAES, L. J. M.; MEIRELLES, W. F.; PARENTONI, S. N.; PACHECO, C. A. P.; SILVA, A. R. da; CARVALHO, H. W. L. de; CARDOSO, M. J.; CECCON, G.; MACHADO, A. T.; BASTOS, E. A.; WRUCK, F. J.; VILARINHO, A. A.; GODINHO, V. de P. C.; SOUZA, F. R. S. de; PAES, J. M. V.; SOUZA, E. D.; DUARTE, A. P. Adaptabilidade e estabilidade de híbridos de milho em 35 ambientes. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 5., 2009, Vitória. O melhoramento e os novos cenários da agricultura: anais. Vitória: Incaper, 2009. Artigo em anais. pdf 2453.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
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