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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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Data corrente: |
23/03/2016 |
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Data da última atualização: |
17/06/2024 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
COTTA, M. G.; MARRACCINI, P.; THIS, D.; LEROY, T.; BOCS, S.; DROC, G.; DUFAYARD, J. F.; DEREEPER, A.; LASHERMES, P.; ANDRADE, A. C. |
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Afiliação: |
M. G. COTTA, UFLA; P. MARRACCINI, CIRAD UMR AGAP; D. THIS, CIRAD UMR AGAP; T. LEROY, CIRAD UMR AGAP; S. BOCS, CIRAD UMR AGAP; G. DROC, CIRAD UMR AGAP; J. F. DUFAYARD, CIRAD UMR AGAP; A. DEREEPER, IRD UMR RPM; P. LASHERMES, IRD UMR RPM; ALAN CARVALHO ANDRADE, CENARGEN. |
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Título: |
Molecular mechanisms in the first step of ABA-mediated response to drought in Coffea canephora clones. |
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Ano de publicação: |
2015 |
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Fonte/Imprenta: |
In: INTERNATIONAL CONFERENCE ON COFFEE SCIENCE, 25., 2014, Armenia, Colombia. [Proceedings...]. [Armenia]: ASIC, 2015. p. 42-50. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Global climate changes are becoming more unpredictable and abiotic stress, such as drought and high temperatures, are key factors that affect coffee plant development and production. Although the strategies for drought adaptation in perennial plants are complex, there is genetic variability within the Coffea genus that could be used to increase tolerance. Drought tolerant clones of Coffea canephora have been characterized as vigorous plants with high productivity throughout years under water deficit. Recently, novel intracellular ABA receptors (PYL/RCARs) involved in sensing and signaling of this hormone were identified. A mechanism of ABA transduction was proposed, involving PYR/PYL/RCARs receptors interacting with PP2Cs phosphatases and SnRK2 protein kinases. The goal of this study was to identify and characterize orthologous genes of this tripartite system in C. canephora. For this purpose, protein sequences from Arabidopsis, citrus, rice, grape, and tomato were chosen as query to search orthologous genes in sequence databases. This approach allowed the identification and characterization of 24 candidate genes (9 PYL/RCAR, 6 PP2Cs and 9 SnRK2s) in C. canephora genome. The protein domains identified in the predicted coffee sequences enabled to characterize these genes as family?s members of receptors (PYR/PYL/ RCAR), phosphatases (PP2Cs) or kinases (SnRK2) of ABA response pathway. Phylogenetic analysis allowed the classification of coffee-polypeptide sequences between subclasses and subfamilies. The gene structures of these three gene families were functionally annotated in Coffee Genome Hub (http://coffee-genome.org/). Tissue (leaf, seed, root and floral organ) differential expression was verified through in silico analyses. Regarding drought conditions, data from root transcriptome showed contrasting gene expression for those genes between the tolerant (Cc14, Cc73 and Cc120) and susceptible (Cc22) clones of C. canephora. By comparing gene expression profiles of only drought tolerant (Cc14, Cc73 and Cc120) clones, differential responses were observed suggesting the existence of multiple biological mechanisms for drought tolerance in coffee. All those evidences will help to identify the genetic determinism of drought tolerance essential to obtain molecular markers that could be used in coffee breeding programs. MenosGlobal climate changes are becoming more unpredictable and abiotic stress, such as drought and high temperatures, are key factors that affect coffee plant development and production. Although the strategies for drought adaptation in perennial plants are complex, there is genetic variability within the Coffea genus that could be used to increase tolerance. Drought tolerant clones of Coffea canephora have been characterized as vigorous plants with high productivity throughout years under water deficit. Recently, novel intracellular ABA receptors (PYL/RCARs) involved in sensing and signaling of this hormone were identified. A mechanism of ABA transduction was proposed, involving PYR/PYL/RCARs receptors interacting with PP2Cs phosphatases and SnRK2 protein kinases. The goal of this study was to identify and characterize orthologous genes of this tripartite system in C. canephora. For this purpose, protein sequences from Arabidopsis, citrus, rice, grape, and tomato were chosen as query to search orthologous genes in sequence databases. This approach allowed the identification and characterization of 24 candidate genes (9 PYL/RCAR, 6 PP2Cs and 9 SnRK2s) in C. canephora genome. The protein domains identified in the predicted coffee sequences enabled to characterize these genes as family?s members of receptors (PYR/PYL/ RCAR), phosphatases (PP2Cs) or kinases (SnRK2) of ABA response pathway. Phylogenetic analysis allowed the classification of coffee-polypeptide sequences between subc... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Coffee. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
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520 $aGlobal climate changes are becoming more unpredictable and abiotic stress, such as drought and high temperatures, are key factors that affect coffee plant development and production. Although the strategies for drought adaptation in perennial plants are complex, there is genetic variability within the Coffea genus that could be used to increase tolerance. Drought tolerant clones of Coffea canephora have been characterized as vigorous plants with high productivity throughout years under water deficit. Recently, novel intracellular ABA receptors (PYL/RCARs) involved in sensing and signaling of this hormone were identified. A mechanism of ABA transduction was proposed, involving PYR/PYL/RCARs receptors interacting with PP2Cs phosphatases and SnRK2 protein kinases. The goal of this study was to identify and characterize orthologous genes of this tripartite system in C. canephora. For this purpose, protein sequences from Arabidopsis, citrus, rice, grape, and tomato were chosen as query to search orthologous genes in sequence databases. This approach allowed the identification and characterization of 24 candidate genes (9 PYL/RCAR, 6 PP2Cs and 9 SnRK2s) in C. canephora genome. The protein domains identified in the predicted coffee sequences enabled to characterize these genes as family?s members of receptors (PYR/PYL/ RCAR), phosphatases (PP2Cs) or kinases (SnRK2) of ABA response pathway. Phylogenetic analysis allowed the classification of coffee-polypeptide sequences between subclasses and subfamilies. The gene structures of these three gene families were functionally annotated in Coffee Genome Hub (http://coffee-genome.org/). Tissue (leaf, seed, root and floral organ) differential expression was verified through in silico analyses. Regarding drought conditions, data from root transcriptome showed contrasting gene expression for those genes between the tolerant (Cc14, Cc73 and Cc120) and susceptible (Cc22) clones of C. canephora. By comparing gene expression profiles of only drought tolerant (Cc14, Cc73 and Cc120) clones, differential responses were observed suggesting the existence of multiple biological mechanisms for drought tolerance in coffee. All those evidences will help to identify the genetic determinism of drought tolerance essential to obtain molecular markers that could be used in coffee breeding programs.
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Registro original: |
Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia (CENARGEN) |
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| Registros recuperados : 41 | |
| 21. |  | SALVIANO, A. M.; MOURA, M. S. B. de; SILVA, T. G. F. da; CARMO, J. F. A. do; BRANDÃO, E. O. Acúmulo e exportação de macronutrientes pela cana de açúcar irrigada no Semiárido brasileiro. Revista Científica Intelletto, Venda Nova do Imigrante, ES, v. 2, n. 2, p. 16-27, 2017.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 5 |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 22. | | MENDES, A. M. S.; MOURA, M. S. B. de; SILVA, T. G. F. da; CARMO, J. F. A. do; BRANDÃO, E. O. Acúmulo e exportação de micronutrientes pela cana-de-açucar irrigada no Semiárido brasileiro. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 33., 2011, Uberlândia. Solos nos biomas brasileiros: sustentabilidade e mudanças climáticas: anais. Uberlândia: SBCS: UFU, ICIAG, 2011. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 23. | | BORGES, R. M. E.; LEAO, P. C. de S.; GONÇALVES, N. P. da S; BRANDÃO, E. O.; GOMES, A. P. DE O. Avaliação preliminar da fertilidade de gemas na variedade Superior Seedless em cultivo protegido no Vale do São Francisco. In: CONGRESSO LATINO-AMERICANO DE VITICULTURA E ENOLOGIA, 10.; CONGRESSO BRASILEIRO DE VITICULTURA E ENOLOGIA, 11.; SEMINÁRIO FRANCO-BRASILEIRO DE VITICULTURA E ENOLOGIA, 2., 2005, Bento Gonçalves. Anais... Bento Gonçalves: Embrapa Uva e Vinho, 2005. p. 271. (Embrapa Uva e Vinho. Documentos, 55).| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 24. | | SOUZA, L. S. B. de; MOURA, M. S. B. de; SILVA, T. G. F. da; SOARES, J. M.; SANTOS, W. de S.; BRANDÃO, E. O. Caracterização térmica do feijão-caupi e do milho em sistema de plantio consorciado nas condições do Semi-Árido nordestino. In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA SEMI-ÁRIDO, 2., 2007, Petrolina. Anais... Petrolina: Embrapa Semi-Árido, 2007. (Embrapa Semi-Árido. Documentos 205)| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 25. | | MOURA, M. S. B. de; BRANDÃO, E. O.; SILVA, T. G. F. da; SOARES, J. M.; CARMO, J. F. A. do; SOUZA, L. S. B. de. Comportamento fisiológico da videira Superior Seedless cultivada em ambiente protegido no Submédio São Francisco. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE VITICULTURA E ENOLOGIA, 12., 2008, Bento Gonçalves. Anais... Bento Gonçalves: Embrapa Uva e Vinho, 2008. p. 108| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 26. | | SILVA, T. G. F.; MOURA, M. S. B. de; ZONIER, S.; CARMO, J. F. A. do; BRANDÃO, E. O.; SOUZA, L. S. B. Análise da produtividade da água da cana-de-açúcar irrigada na região semi árida, Brasil. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE AGROMETEOROLOGIA, 16., 2009, Belo Horizonte. Mudanças climáticas, recursos hídricos e energia para uma agricultura sustentável. Belo Horizonte: SBA: UFV: Embrapa Milho e Sorgo, 2009. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 27. | | CARMO, J. F. A. do; MOURA, M. S. B. de; SILVA, T. G. F. da; CAMPOS, C. de O.; BRANDÃO, E. O.; SOARES, J. M. Análise biométrica da cana-de-açúcar irrigada em relação aos graus-dia acumulados no Submédio do São Francisco. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE METEOROLOGIA, 16., 2010, Belém, PA. A Amazônia e o clima global: anais. Belém, PA: SBMET, 2010. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 28. | | SOUZA, L. S. B. de; MOURA, M. S. B. de; SILVA, T. G. F. da; SOARES, J. M.; CARMO, J. F. A. do; BRANDÃO, E. O. Indicadores climáticos para o zoneamento agrícola da palma forrageira (Opuntia sp.). In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA SEMI-ÁRIDO, 3., 2008, Petrolina. Anais... Petrolina: Embrapa Semi-Árido, 2008. p. 23-28. (Embrapa Semi-Árido. Documentos, 210).| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 29. | | MOURA, M. S. B. de; SOUZA, L. S. B.; SANTOS, W. S.; SOARES, J. M.; BRANDÃO, E. O.; SILVA, T. G. F. Graus-dia acumulado para o milho no semi-árido de Pernambuco. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE AGROMETEOROLOGIA, 15., 2007, Aracaju. Efeito das mudanças climáticas na agricultura: anais. Aracaju: Sociedade Brasileira de Agrometeorologia: Embrapa Tabuleiros Costeiros, 2007. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 30. | | MOURA, M. S. B. de; SOUZA, L. S. B. de; SILVA, T. G. F. da; BRANDÃO. E. O.; SOARES, J. M. Efeito da lâmina de irrigação na produtividade do feijão-caupi no semi-árido brasileiro. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ENGENHARIA AGRICOLA, 38., 2009, Juazeiro, Petrolina. Planejamento da bacia hidrográfica e o desenvolvimento da agricultura: anais. Juazeiro, Petrolina: UNIVASF: Embrapa Semiárido: CEFET: SBEA, 2009. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 31. | | MOURA, M. S. B. de; BRANDÃO, E. O.; SOARES, J. M.; DONOSCO, C. S.; SILVA, T. G. F. da; SOUZA, L. S. B. Exigência térmica e caracterização fenológica da videira Cabernet Sauvignon no Vale São Francisco, Brasil. In: CONGRESO LATINOAMERICANO DE VITICULTURA Y ENOLOGIA, 11., 2007, Mendonza. Seduciendo al concumidor de hoy. Mendonza: IVV: CLEIFRA: SECYT, 2007. 1 CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 32. | | MOURA, M. S. B. de; SOUZA, L. S. B. de; SILVA, T. G. F. da; SOARES, J. M.; CARMO, J. F. A. do; BRANDÃO, E. O. Modelos de crescimento para o feijão-caupi e o milho, sob sistemas de plantio exclusivo e consorciado, no Semiárido brasileiro. Revista Brasileira de Agrometeorologia, Sete Lagoas, v. 16, n. 3, p. 275-284, abr. 2011.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 33. | | SILVA, T. G. F. da; MOURA, M. S. B. de; ZOLNIER, S.; SOARES, J. M.; SOUZA, L. S. B. de; BRANDÃO, E. O. Variação do balanço de radiação e de energia da cana-de-açúcar irrigada no Semiárido brasileiro. Revista Brasileira de Engenharia Agrícola e Ambiental, v. 15, n. 2, p. 139-147, 2011.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 34. | | BRANDÃO. E. O.; MOURA, M. S. B. de; SOARES, J. M.; SOUZA, L. S. B.; SILVA, T. G. F. da; CARMO, J. F. A. do. Temperatura do ar em parreirais de uva de mesa sob diferentes alturas de instalação da cobertura plástica. In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA SEMI-ÁRIDO, 3., 2008, Petrolina. Anais... Petrolina: Embrapa Semi-Árido, 2008. p. 11-16. (Embrapa Semi-Árido. Documentos, 210)| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 35. | | SILVA, T. G. F. da; MOURA, M. S. B. de; TURCO, S. H. N.; SÁ, I. I. S.; ZOLNIER, S.; CARMO, J. F. A. do; SOUZA, L. S. B. de; BRANDÃO, E. O. Impacts of two climate change scenarios on the regional variation of the decline in milk production in the Pernambuco State, Brasil. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF AGRICULTURAL ENGINEERING; BRAZILIAN CONGRESS OF AGRICULTURAL ENGINEERING, 37.; INTERNATIONAL LIVESTOCK ENVIRONMENT SYMPOSIUM - ILES, 8., 2008, Foz do Iguaçu. Technology for all: sharing the knowledge for development: proceedings... Foz do Iguaçu: SBEA, 2008. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 36. | | BORGES, R. M. E.; MOURA, M. S. B. de; LEAO, P. C. de S.; GONÇALVES, N. P. da S.; BRANDÃO. E. O.; ALVES, E. O. dos S.; SILVA, T. G. F. Degree-days and phenological characterization of five red grapevines cultivated in a tropical semi-arid region of Brazil. In: INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON GRAPEVINE PHYSIOLOGY AND BIOTECHNOLOGY, 8., 2008, Adelaide. Book of abstracts... Adelaide: Grape and Wine Research and Development Corporation: CSIRO: The University of Melbourne, 2008. p. 212.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 37. | | BORGES, R. M. E.; MOURA, M. S. B. de; LEAO, P. C. de S.; GONÇALVES, N. P. da S.; BRANDÃO. E. O.; ALVES, E. O. dos S.; SILVA, T. G. F. da. Degree-days and phenological characterization of five red grapevines cultivated in a tropical semi-arid region of Brazil. Australian Journal of Grape and Wine Research, Adelaide, v. 16, p. A71, 2010. Suplement 1. Edição dos Abstracts do 8th International Symposium on Grapevine Physiology and Biotechnology, Adelaide, Australia, nov. 2008.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 38. | | MARINHO, L. B.; RODRIGUES, J. J. V.; SOARES, J. M.; LIMA, M. A. C. de; MOURA, M. S. B. de; BRANDÃO, E. O.; SILVA, T. G. F. da; CALGARO, M. Produção e qualidade da videira Superior Seedless sob restrição hídrica na fase de maturação. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasilia, DF, v. 44, n. 12, p. 1682-1691, 2009.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido; Embrapa Unidades Centrais. |
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| 39. | | MOURA, M. S. B. de; BORGES, R. M. E.; BRANDÃO, E. O.; LEAO, P. C. de S.; SOUZA, L. S. B. de; GONÇALVES, N. P. da S.; GOMES, A. P. de O.; SILVA, T. G. F. da. Phenological and thermal demand (degree-days) characterization of four varieties of white grapevine cultivated in Sao Francisco River Valley, Brazil. In: INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON GRAPEVINE PHYSIOLOGY AND BIOTECHNOLOGY, 8., 2008, Adelaide. Book of abstracts... Adelaide: Grape and Wine Research and Development Corporation: CSIRO: The University of Melbourne, 2008. p. 211.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 40. | | MOURA, M. S. B. de; BORGES, R. M. E.; BRANDÃO, E. O.; LEAO, P. C. de S.; SOUZA, L. S. B. de; GONÇALVES, N. P. da S.; GOMES, A. P. de O.; SILVA, T. G. F. da. Phenological and thermal demand (degree-days) characterization of four varieties of white grapevine cultivated in Sao Francisco River Valley, Brazil. Australian Journal of Grape and Wine Research, Adelaide, v. 16, p. A71, 2010. Suplement 1. Edição dos Abstracts do 8th International Symposium on Grapevine Physiology and Biotechnology, Adelaide, Australia, nov. 2008.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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