| |
|
|
|
Registro Completo |
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Leite. |
|
Data corrente: |
04/10/2011 |
|
Data da última atualização: |
05/02/2024 |
|
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
|
Autoria: |
LANGE, C. C.; BRITO, M. A. V. P. e; BRITO, J. R. F.; ARCURI, E. F.; SOUZA, G. N. de; MACHADO, M. A.; DOMINGUES, R.; SALIMENA, A. P. S. |
|
Afiliação: |
CARLA CHRISTINE LANGE, CNPGL; MARIA APARECIDA V PAIVA E BRITO, CNPGL; JOSÉ RENALDI FEITOSA BRITO, Polo de Excelência do Leite; EDNA FROEDER ARCURI, CNPGL; GUILHERME NUNES DE SOUZA, CNPGL; MARCO ANTONIO MACHADO, CNPGL; ROBERT DOMINGUES, Fapemig; ALESSANDRA P. S. SALIMENA, CES-JF. |
|
Título: |
Uso de PCR e sequenciamento do rDNA 16S para identificação de bactérias do gênero Staphylococcus isoladas de mastite bovina. |
|
Ano de publicação: |
2011 |
|
Fonte/Imprenta: |
Pesquisa Veterinária Brasileira, v. 31, n. 1, p. 36-40, 2011. |
|
DOI: |
https://doi.org/10.1590/S0100-736X2011000100006 |
|
Idioma: |
Português |
|
Conteúdo: |
O objetivo deste trabalho foi identificar espécies de Staphylococcus (n=100) isoladas de mastite em rebanhos bovinos do Estado de Minas Gerais. Para esta finalidade foram utilizadas reações de PCR empregando oligonucleotídeos iniciadores descritos anteriormente para amplificar genes específicos de S. aureus (femA), S. intermedius (rDNA 16S) e S. hyicus (rDNA 16S-23S) e o sequenciamento do rDNA 16S. De acordo com as reações de PCR, 83 isolados foram identificados como S. aureus, 13 isolados como S. intermedius, dois como S. hyicus e dois isolados não foram identificados. Foram submetidos ao sequenciamento do rDNA 16S seis isolados identificados como S. aureus e os 17 restantes. Os seis isolados identificados como S. aureus confirmaram essa identificação. Dos outros 17 isolados, 13 foram identificados como S. chromogenes e quatro como S. hyicus, com similaridade igual ou superior a 99%. Baseando-se nos resultados da reação de PCR do gene femA e do sequenciamento do rDNA 16S, foram identificados 83 S. aureus, 13 S. chromogenes e quatro S. hyicus. Neste estudo os oligonucleotídeos iniciadores empregados na reação de PCR para S. intermedius não foram específicos, pois amplificaram também S. chromogenes; e os empregados na reação de PCR para S. hyicus não foram sensíveis, pois falharam na identificação de dois isolados de S. hyicus. A identificação definitiva das duas últimas espécies somente foi possível pelo sequenciamento do rDNA 16S. |
|
Palavras-Chave: |
Coagulase-negative staphylococci (CNS); Coagulase-positive staphylococci (CPS); Intramammary infection. |
|
Thesagro: |
Staphylococcus Aureus. |
|
Categoria do assunto: |
L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal |
|
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/54190/1/Uso-de-PCR-e-sequenciamento.pdf
|
|
Marc: |
LEADER 02403naa a2200265 a 4500
001 1902179
005 2024-02-05
008 2011 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $ahttps://doi.org/10.1590/S0100-736X2011000100006$2DOI
100 1 $aLANGE, C. C.
245 $aUso de PCR e sequenciamento do rDNA 16S para identificação de bactérias do gênero Staphylococcus isoladas de mastite bovina.$h[electronic resource]
260 $c2011
520 $aO objetivo deste trabalho foi identificar espécies de Staphylococcus (n=100) isoladas de mastite em rebanhos bovinos do Estado de Minas Gerais. Para esta finalidade foram utilizadas reações de PCR empregando oligonucleotídeos iniciadores descritos anteriormente para amplificar genes específicos de S. aureus (femA), S. intermedius (rDNA 16S) e S. hyicus (rDNA 16S-23S) e o sequenciamento do rDNA 16S. De acordo com as reações de PCR, 83 isolados foram identificados como S. aureus, 13 isolados como S. intermedius, dois como S. hyicus e dois isolados não foram identificados. Foram submetidos ao sequenciamento do rDNA 16S seis isolados identificados como S. aureus e os 17 restantes. Os seis isolados identificados como S. aureus confirmaram essa identificação. Dos outros 17 isolados, 13 foram identificados como S. chromogenes e quatro como S. hyicus, com similaridade igual ou superior a 99%. Baseando-se nos resultados da reação de PCR do gene femA e do sequenciamento do rDNA 16S, foram identificados 83 S. aureus, 13 S. chromogenes e quatro S. hyicus. Neste estudo os oligonucleotídeos iniciadores empregados na reação de PCR para S. intermedius não foram específicos, pois amplificaram também S. chromogenes; e os empregados na reação de PCR para S. hyicus não foram sensíveis, pois falharam na identificação de dois isolados de S. hyicus. A identificação definitiva das duas últimas espécies somente foi possível pelo sequenciamento do rDNA 16S.
650 $aStaphylococcus Aureus
653 $aCoagulase-negative staphylococci (CNS)
653 $aCoagulase-positive staphylococci (CPS)
653 $aIntramammary infection
700 1 $aBRITO, M. A. V. P. e
700 1 $aBRITO, J. R. F.
700 1 $aARCURI, E. F.
700 1 $aSOUZA, G. N. de
700 1 $aMACHADO, M. A.
700 1 $aDOMINGUES, R.
700 1 $aSALIMENA, A. P. S.
773 $tPesquisa Veterinária Brasileira$gv. 31, n. 1, p. 36-40, 2011.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Gado de Leite (CNPGL) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
|
Registro Completo
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Florestas; Embrapa Trigo. |
|
Data corrente: |
28/01/2020 |
|
Data da última atualização: |
17/09/2020 |
|
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
|
Circulação/Nível: |
A - 1 |
|
Autoria: |
LINS, E. A.; RODRIGUEZ, J. P. M.; SCOLOSKI, S. I.; PIVATO, J.; LIMA, M. B.; FERNANDES, J. M. C.; PEREIRA, P. R. V. da S.; LAU, D.; RIEDER, R. |
|
Afiliação: |
ELISON ALFEU LINS, University of Passo Fundo (UPF), Passo Fundo, Rio Grande do Sul, Brazil1; JOÃO PEDRO MAZUCO RODRIGUEZ, University of Passo Fundo (UPF), Passo Fundo, Rio Grande do Sul, Brazil; SANDY ISMAEL SCOLOSKI, University of Passo Fundo (UPF), Passo Fundo, Rio Grande do Sul, Brazil1; JULIANA PIVATO, The Brazilian Agricultural Research Corporation (Embrapa Wheat), Passo Fundo, Rio Grande do Sul, Brazil2; MARÍLIA BALOTIN LIMA, The Brazilian Agricultural Research Corporation (Embrapa Wheat), Passo Fundo, Rio Grande do Sul, Brazil2; JOSE MAURICIO CUNHA FERNANDES, CNPT; PAULO ROBERTO VALLE DA S PEREIRA, CNPF; DOUGLAS LAU, CNPT; RAFAEL RIEDER, University of Passo Fundo (UPF), Passo Fundo, Rio Grande do Sul, Brazil1. |
|
Título: |
A method for counting and classifying aphids using computer vision. |
|
Ano de publicação: |
2020 |
|
Fonte/Imprenta: |
Computers and Electronics in Agriculture, n. 169, 2020. |
|
DOI: |
https://doi.org/10.1016/j.compag.2019.105200 |
|
Idioma: |
Inglês |
|
Conteúdo: |
Aphids are insects that attack crops and cause damage directly, by consuming the sap of plants, and indirectly,by vectoring microorganisms that can cause diseases. Cereal crops are hosts for many aphid species, includingRhopalosiphumpadi(an economically important aphid species). Recording and classifying aphids are necessaryfor evaluating and predicting crop damage. Thus, serving as a basis for decision making on the utilization ofcontrolmeasures.Itcanalsobeusefultoevaluateplantresistancetoaphids.Traditionally,therecordingprocessis manual and depends on magnification and well-trained staff. The manual counting is also a time-consumingprocess and susceptible to errors. With this in mind, this paper presents a method and software to automate thecounting and classification ofRhopalosiphum padiusing image processing, computer vision, and machinelearningmethods.Thetextalsopresentsacomparisonofmanuallycountsfromexpertsandvaluesobtainedwiththe software, considering 40 samples. The results showed strong positive correlation in counting and classifi-cation(rs=0.92579)and measurement (r=0.9799).Concluding, thesoftware provedtobe reliableandusefulto aphid population monitoring studies. |
|
Palavras-Chave: |
Aphids; Counting. |
|
Thesaurus NAL: |
Classification; Computer vision; Measurement. |
|
Categoria do assunto: |
-- |
|
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/209811/1/1-s2.0-S0168169919306039-main.pdf
|
|
Marc: |
LEADER 02015naa a2200289 a 4500
001 2119503
005 2020-09-17
008 2020 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $ahttps://doi.org/10.1016/j.compag.2019.105200$2DOI
100 1 $aLINS, E. A.
245 $aA method for counting and classifying aphids using computer vision.$h[electronic resource]
260 $c2020
520 $aAphids are insects that attack crops and cause damage directly, by consuming the sap of plants, and indirectly,by vectoring microorganisms that can cause diseases. Cereal crops are hosts for many aphid species, includingRhopalosiphumpadi(an economically important aphid species). Recording and classifying aphids are necessaryfor evaluating and predicting crop damage. Thus, serving as a basis for decision making on the utilization ofcontrolmeasures.Itcanalsobeusefultoevaluateplantresistancetoaphids.Traditionally,therecordingprocessis manual and depends on magnification and well-trained staff. The manual counting is also a time-consumingprocess and susceptible to errors. With this in mind, this paper presents a method and software to automate thecounting and classification ofRhopalosiphum padiusing image processing, computer vision, and machinelearningmethods.Thetextalsopresentsacomparisonofmanuallycountsfromexpertsandvaluesobtainedwiththe software, considering 40 samples. The results showed strong positive correlation in counting and classifi-cation(rs=0.92579)and measurement (r=0.9799).Concluding, thesoftware provedtobe reliableandusefulto aphid population monitoring studies.
650 $aClassification
650 $aComputer vision
650 $aMeasurement
653 $aAphids
653 $aCounting
700 1 $aRODRIGUEZ, J. P. M.
700 1 $aSCOLOSKI, S. I.
700 1 $aPIVATO, J.
700 1 $aLIMA, M. B.
700 1 $aFERNANDES, J. M. C.
700 1 $aPEREIRA, P. R. V. da S.
700 1 $aLAU, D.
700 1 $aRIEDER, R.
773 $tComputers and Electronics in Agriculture$gn. 169, 2020.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Trigo (CNPT) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
Fechar
|
| Expressão de busca inválida. Verifique!!! |
|
|
