| |
|
|
|
Registro Completo |
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Agrobiologia. |
|
Data corrente: |
15/02/2007 |
|
Data da última atualização: |
11/09/2018 |
|
Autoria: |
DIREITO, I. C. N. |
|
Título: |
Detecção de genes degradadores de compostos aromáticos em solos de rizosfera sob manejo convencional e orgânico. |
|
Ano de publicação: |
2005 |
|
Fonte/Imprenta: |
2005. 104 f. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia Vegetal) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro, RJ. |
|
Páginas: |
104 f. |
|
Idioma: |
Português |
|
Notas: |
Orientador: Andrew Macrae.
Co-orientador: Leda Cristina Santana Mendonça Hagler. |
|
Conteúdo: |
0 desenvolvimento mundial e acompanhado pelo aumento da poluição ambiental. Em sistemas agrícolas, os pesticidas são os principais responsáveis pela contaminação do solo e da água. Aproximadamente 70% dos pesticidas comercializados no Brasil apresentam anéis aromáticos em suas estruturas, e a compreensão das rotas de degradação destes compostos e fundamental para a melhoria dos processos de biorremediação. 0 objetivo deste estudo foi detectar genes de degradação de compostos aromáticos em solos, verificando se os sistemas de cultivo convencional e orgânico podem influenciar sobre a detecção e a natureza destes genes. Amostras de solo da rizosfera e bulk foram coletadas em áreas sob cultivo de alface, couve e coco nos sistemas de cultivo convencional e orgânicos. 0 DNA foi extraído do solo, purificado, quantificado e amplificado através da técnica de PCR usando cinco pares de iniciadores desenhados para cinco genes relacionados com a biodegradação de compostos aromáticos. Todos os iniciadores apresentaram sinal de amplificação em pelo menos uma das 12 amostras testadas. Todos os genes apresentaram maior capacidade de detecção nas amostras de solo do sistema orgânico que nas do sistema convencional. 0 gene que apresentou melhor amplificação foi 0 gene tfdB, que codifica para 2,4-Diclorofenol hidroxilase. Este genes apresentou reprodutibilidade na amplificação das amostras sob cultivo de alface. Um estudo detalhado do gene tfdB foi iniciado para determinar a sua diversidade e a influencia da rizosfera empregando as técnicas de clonagem e seqüenciamento. Os genes relacionados com a degradação de compostos aromáticos foram mais detectáveis em solos sob manejo orgânico que convencional. Podemos inferir que 0 tipo e a presença da matéria orgânico são mais importantes que a presença dos pesticidas para a detecção destes genes funcionais. Mais uma vez, a matéria orgânica não se apresenta apenas como um componente do ciclo do carbono. mas como uma peça essencial no direcionamento dos processos de biorremediação. Environmental pollution is increasing with world development. In crop systems, pesticides are the principal agents in soil and water contamination. Aromatic rings are found in approximately 70% of commercially available pesticides in Brazil and understanding their degradation pathways is necessary to improve bioremediation. The aim of this study was to detect aromatic compound degrading genes in soils and to establish if their detection and characteristics were influenced by conventional and organic farming methods. Bulk and rhizosphere soil samples were collected uom conventional and organic farms uom lettuce, kale and coconut plants. DNA was extracted from the soil, purified, quantified and PCR amplified with five primer pairs to detect five aromatic compound biodegrading genes. All primers showed some sign of amplification in at least one of the 12 soil samples tested. More genes were detected and more uequently in the soils uom the organic farm than the conventional farm. The gene that amplified consistently better than the others was the tfdB gene, 2,4-Dichlorophenol hydroxilase. This gene repeatedly amplified better in soil associated with lettuce. A detailed study of tfdB genes has started in order to determine gene diversity and the rhizosphere influence using cloning and sequencing methods. Based on the gene detection results, aromatic compound degrading genes were in greater evidence under organic farming methods than conventional. It would seem that the type and presence of organic matter is more important than the presence of pesticides in order to detect these functional genes. Once again, organic matter is not merely a component of the carbon cycle but a driving force in bioremediation. Menos0 desenvolvimento mundial e acompanhado pelo aumento da poluição ambiental. Em sistemas agrícolas, os pesticidas são os principais responsáveis pela contaminação do solo e da água. Aproximadamente 70% dos pesticidas comercializados no Brasil apresentam anéis aromáticos em suas estruturas, e a compreensão das rotas de degradação destes compostos e fundamental para a melhoria dos processos de biorremediação. 0 objetivo deste estudo foi detectar genes de degradação de compostos aromáticos em solos, verificando se os sistemas de cultivo convencional e orgânico podem influenciar sobre a detecção e a natureza destes genes. Amostras de solo da rizosfera e bulk foram coletadas em áreas sob cultivo de alface, couve e coco nos sistemas de cultivo convencional e orgânicos. 0 DNA foi extraído do solo, purificado, quantificado e amplificado através da técnica de PCR usando cinco pares de iniciadores desenhados para cinco genes relacionados com a biodegradação de compostos aromáticos. Todos os iniciadores apresentaram sinal de amplificação em pelo menos uma das 12 amostras testadas. Todos os genes apresentaram maior capacidade de detecção nas amostras de solo do sistema orgânico que nas do sistema convencional. 0 gene que apresentou melhor amplificação foi 0 gene tfdB, que codifica para 2,4-Diclorofenol hidroxilase. Este genes apresentou reprodutibilidade na amplificação das amostras sob cultivo de alface. Um estudo detalhado do gene tfdB foi iniciado para determinar a sua diversidade e a... Mostrar Tudo |
|
Palavras-Chave: |
Biotecnologia vegetal; Cocos. |
|
Thesagro: |
Alface; Biodegradação; DNA; Microbiologia do Solo; Poluição do Solo; Resíduo Orgânico. |
|
Categoria do assunto: |
-- |
|
Marc: |
LEADER 04637nam a2200229 a 4500
001 1622638
005 2018-09-11
008 2005 bl uuuu m 00u1 u #d
100 1 $aDIREITO, I. C. N.
245 $aDetecção de genes degradadores de compostos aromáticos em solos de rizosfera sob manejo convencional e orgânico.
260 $a2005. 104 f. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia Vegetal) - Universidade Federal do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro$c2005
300 $a104 f.
500 $aOrientador: Andrew Macrae. Co-orientador: Leda Cristina Santana Mendonça Hagler.
520 $a0 desenvolvimento mundial e acompanhado pelo aumento da poluição ambiental. Em sistemas agrícolas, os pesticidas são os principais responsáveis pela contaminação do solo e da água. Aproximadamente 70% dos pesticidas comercializados no Brasil apresentam anéis aromáticos em suas estruturas, e a compreensão das rotas de degradação destes compostos e fundamental para a melhoria dos processos de biorremediação. 0 objetivo deste estudo foi detectar genes de degradação de compostos aromáticos em solos, verificando se os sistemas de cultivo convencional e orgânico podem influenciar sobre a detecção e a natureza destes genes. Amostras de solo da rizosfera e bulk foram coletadas em áreas sob cultivo de alface, couve e coco nos sistemas de cultivo convencional e orgânicos. 0 DNA foi extraído do solo, purificado, quantificado e amplificado através da técnica de PCR usando cinco pares de iniciadores desenhados para cinco genes relacionados com a biodegradação de compostos aromáticos. Todos os iniciadores apresentaram sinal de amplificação em pelo menos uma das 12 amostras testadas. Todos os genes apresentaram maior capacidade de detecção nas amostras de solo do sistema orgânico que nas do sistema convencional. 0 gene que apresentou melhor amplificação foi 0 gene tfdB, que codifica para 2,4-Diclorofenol hidroxilase. Este genes apresentou reprodutibilidade na amplificação das amostras sob cultivo de alface. Um estudo detalhado do gene tfdB foi iniciado para determinar a sua diversidade e a influencia da rizosfera empregando as técnicas de clonagem e seqüenciamento. Os genes relacionados com a degradação de compostos aromáticos foram mais detectáveis em solos sob manejo orgânico que convencional. Podemos inferir que 0 tipo e a presença da matéria orgânico são mais importantes que a presença dos pesticidas para a detecção destes genes funcionais. Mais uma vez, a matéria orgânica não se apresenta apenas como um componente do ciclo do carbono. mas como uma peça essencial no direcionamento dos processos de biorremediação. Environmental pollution is increasing with world development. In crop systems, pesticides are the principal agents in soil and water contamination. Aromatic rings are found in approximately 70% of commercially available pesticides in Brazil and understanding their degradation pathways is necessary to improve bioremediation. The aim of this study was to detect aromatic compound degrading genes in soils and to establish if their detection and characteristics were influenced by conventional and organic farming methods. Bulk and rhizosphere soil samples were collected uom conventional and organic farms uom lettuce, kale and coconut plants. DNA was extracted from the soil, purified, quantified and PCR amplified with five primer pairs to detect five aromatic compound biodegrading genes. All primers showed some sign of amplification in at least one of the 12 soil samples tested. More genes were detected and more uequently in the soils uom the organic farm than the conventional farm. The gene that amplified consistently better than the others was the tfdB gene, 2,4-Dichlorophenol hydroxilase. This gene repeatedly amplified better in soil associated with lettuce. A detailed study of tfdB genes has started in order to determine gene diversity and the rhizosphere influence using cloning and sequencing methods. Based on the gene detection results, aromatic compound degrading genes were in greater evidence under organic farming methods than conventional. It would seem that the type and presence of organic matter is more important than the presence of pesticides in order to detect these functional genes. Once again, organic matter is not merely a component of the carbon cycle but a driving force in bioremediation.
650 $aAlface
650 $aBiodegradação
650 $aDNA
650 $aMicrobiologia do Solo
650 $aPoluição do Solo
650 $aResíduo Orgânico
653 $aBiotecnologia vegetal
653 $aCocos
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Agrobiologia (CNPAB) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
|
| Registros recuperados : 1 | |
| Registros recuperados : 1 | |
|
| Nenhum registro encontrado para a expressão de busca informada. |
|
|
