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| Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Pecuária Sudeste. Para informações adicionais entre em contato com cppse.biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Pecuária Sudeste. |
Data corrente: |
02/12/2020 |
Data da última atualização: |
02/12/2020 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
DINIZ, W. J. da S.; BANERJEE, P.; MAZZONI, G.; COUTINHO, L. L.; CESAR, A. S. M.; AFONSO, J.; GROMBONI, C. F.; NOGUEIRA, A. R. de A.; KADARMIDEEN, H. N.; REGITANO, L. C. de A. |
Afiliação: |
Wellison Jarles da Silva Diniz, UFSCAR; Priyanka Banerjee, Technical University of Denmark; Gianluca Mazzoni, Technical University of Denmark; Luiz Lehmann Coutinho, USP, ESALq; Aline Silva Mello Cesar, USP, ESALq; Juliana Afonso, UFSCAR; Caio Fernando Gromboni, IFBA; ANA RITA DE ARAUJO NOGUEIRA, CPPSE; Haja N. Kadarmideen, Technical University of Denmark; LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE. |
Título: |
Interplay among miR-29 family, mineral metabolism, and gene regulation in Bos indicus muscle. |
Ano de publicação: |
2020 |
Fonte/Imprenta: |
Molecular Genetics and Genomics, v. 295, p. 1113-1127, may. 2020. |
DOI: |
https://doi.org/10.1007/s00438-020-01683-9 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
An interplay between gene expression, mineral concentration, and beef quality traits in Bos indicus muscle has been reported previously under a network approach. However, growing evidence suggested that miRNAs not only modulate gene expression but are also involved with mineral homeostasis. To our knowledge, understanding of the miRNA?gene expression-mineral concentration relationship in mammals is still minimal. Therefore, we carried out a miRNA co-expression and multi-level miRNA?mRNA integration analyses to predict the putative drivers (miRNAs and genes) associated with muscle mineral concentration in Nelore steers. In this study, we identified calcium and iron to be the pivotal minerals associated with miRNAs and gene targets. Furthermore, we identified the miR-29 family (miR-29a, -29b, -29c, -29d-3p, and -29e) as the putative key regulators modulating mineral homeostasis. The miR-29 family targets genes involved with AMPK, insulin, mTOR, and thyroid hormone signaling pathways. Finally, we reported an interplay between miRNAs and minerals acting cooperatively to modulate co-expressed genes and signaling pathways both involved with mineral and energy homeostasis in Nelore muscle. Although we provided some evidence to understand this complex relationship, future work should determine the functional implications of minerals for miRNA levels and their feedback regulation system. |
Palavras-Chave: |
Co expression; Mineral homeostasis; Regulatory network; Systems biology. |
Thesaurus Nal: |
Calcium; Iron. |
Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
Marc: |
LEADER 02344naa a2200313 a 4500 001 2127496 005 2020-12-02 008 2020 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $ahttps://doi.org/10.1007/s00438-020-01683-9$2DOI 100 1 $aDINIZ, W. J. da S. 245 $aInterplay among miR-29 family, mineral metabolism, and gene regulation in Bos indicus muscle.$h[electronic resource] 260 $c2020 520 $aAn interplay between gene expression, mineral concentration, and beef quality traits in Bos indicus muscle has been reported previously under a network approach. However, growing evidence suggested that miRNAs not only modulate gene expression but are also involved with mineral homeostasis. To our knowledge, understanding of the miRNA?gene expression-mineral concentration relationship in mammals is still minimal. Therefore, we carried out a miRNA co-expression and multi-level miRNA?mRNA integration analyses to predict the putative drivers (miRNAs and genes) associated with muscle mineral concentration in Nelore steers. In this study, we identified calcium and iron to be the pivotal minerals associated with miRNAs and gene targets. Furthermore, we identified the miR-29 family (miR-29a, -29b, -29c, -29d-3p, and -29e) as the putative key regulators modulating mineral homeostasis. The miR-29 family targets genes involved with AMPK, insulin, mTOR, and thyroid hormone signaling pathways. Finally, we reported an interplay between miRNAs and minerals acting cooperatively to modulate co-expressed genes and signaling pathways both involved with mineral and energy homeostasis in Nelore muscle. Although we provided some evidence to understand this complex relationship, future work should determine the functional implications of minerals for miRNA levels and their feedback regulation system. 650 $aCalcium 650 $aIron 653 $aCo expression 653 $aMineral homeostasis 653 $aRegulatory network 653 $aSystems biology 700 1 $aBANERJEE, P. 700 1 $aMAZZONI, G. 700 1 $aCOUTINHO, L. L. 700 1 $aCESAR, A. S. M. 700 1 $aAFONSO, J. 700 1 $aGROMBONI, C. F. 700 1 $aNOGUEIRA, A. R. de A. 700 1 $aKADARMIDEEN, H. N. 700 1 $aREGITANO, L. C. de A. 773 $tMolecular Genetics and Genomics$gv. 295, p. 1113-1127, may. 2020.
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Registro original: |
Embrapa Pecuária Sudeste (CPPSE) |
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| Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Meio Ambiente. Para informações adicionais entre em contato com cnpma.biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo
Biblioteca(s): |
Embrapa Meio Ambiente. |
Data corrente: |
10/12/2019 |
Data da última atualização: |
10/12/2019 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
Autoria: |
QUARTAROLI, C. F.; TOSTO, S. G.; GALDINO, S.; PEREIRA, L. C. |
Afiliação: |
CARLOS FERNANDO QUARTAROLI, CNPM; SERGIO GOMES TOSTO, CNPM; SERGIO GALDINO, CNPM; LAURO CHARLET PEREIRA, CNPMA. |
Título: |
Alterações no uso e cobertura das terras no município de Zacarias, estado de São Paulo. |
Ano de publicação: |
2019 |
Fonte/Imprenta: |
In: ENCONTRO SOCIEDADE BRASILEIRA DE ECONOMIA ECOLÓGICA, 13., 2019, Campinas, SP. Anais... Campinas: Unicamp, 2019. |
Idioma: |
Português |
Conteúdo: |
Alterações no uso e cobertura das terras foram investigadas pelo cruzamento de mapas de uso e cobertura das terras dos anos de 2006 e 2016 do município de Zacarias (SP) situado na Região Administrativa de São José do Rio Preto. Os mapas foram elaborados para esse fim por meio da interpretação de imagens de satélite e de dados de campo. As áreas alteradas foram mapeadas, identificadas e quantificadas. Os resultados apontaram redução das áreas de pastagem no período em 21,98%, substituídas sobretudo pela expansão da cana-de-açúcar, cuja área cultivada apresentou crescimento de 17,42% no período. O cultivo da cana-de-açúcar foi a principal forma de uso das terras nos anos estudados com percentuais superiores a 40% da área do município. Embora menos expressiva em termos absolutos, observou-se também crescimento das áreas com seringueira e a redução das áreas com citros no município. A seringueira apresentou taxa de crescimento de 56,38%. A taxa de redução das áreas com citros foi de 81,65%. As áreas com uso e cobertura inalterado na comparação entre os dois anos foi de 84,47% da área do município. Abstract: We analyzed changes in land use and land cover by overlapping land-use and land-cover maps of the city of Zacarias (part of the Administrative Region of São José do Rio Preto, SP, Brazil) in 2006 and 2016. The maps were produced to that end by means of the visual interpretation of satellite images and field data. Changed areas were mapped, identified, and quantified. Our results show that pasture areas decreased 21.98%, and were replaced mainly by sugarcane, which showed an increase of 17.42% over the same period. Sugarcane crops were the main land use in 2006 and 2016, with percentages higher than 40% of the city?s total area. Although showing less significant absolute values, we also observed an increase in areas covered by rubber tree crops, and a decrease in areas covered by citrus crops. Areas with rubber tree crops increased 56.38%. Areas with citrus crops decreased 81.65%. Areas showing no change in land use and land cover in the comparison of both years amounted 84.47% of the city?s area. MenosAlterações no uso e cobertura das terras foram investigadas pelo cruzamento de mapas de uso e cobertura das terras dos anos de 2006 e 2016 do município de Zacarias (SP) situado na Região Administrativa de São José do Rio Preto. Os mapas foram elaborados para esse fim por meio da interpretação de imagens de satélite e de dados de campo. As áreas alteradas foram mapeadas, identificadas e quantificadas. Os resultados apontaram redução das áreas de pastagem no período em 21,98%, substituídas sobretudo pela expansão da cana-de-açúcar, cuja área cultivada apresentou crescimento de 17,42% no período. O cultivo da cana-de-açúcar foi a principal forma de uso das terras nos anos estudados com percentuais superiores a 40% da área do município. Embora menos expressiva em termos absolutos, observou-se também crescimento das áreas com seringueira e a redução das áreas com citros no município. A seringueira apresentou taxa de crescimento de 56,38%. A taxa de redução das áreas com citros foi de 81,65%. As áreas com uso e cobertura inalterado na comparação entre os dois anos foi de 84,47% da área do município. Abstract: We analyzed changes in land use and land cover by overlapping land-use and land-cover maps of the city of Zacarias (part of the Administrative Region of São José do Rio Preto, SP, Brazil) in 2006 and 2016. The maps were produced to that end by means of the visual interpretation of satellite images and field data. Changed areas were mapped, identified, and quantified. Our resu... Mostrar Tudo |
Palavras-Chave: |
Pastos. |
Thesagro: |
Cana de Açúcar; Cobertura do Solo; Heveicultura; Pastagem; Uso da Terra. |
Thesaurus NAL: |
Land cover; Land use; Land use change; Sugarcane. |
Categoria do assunto: |
P Recursos Naturais, Ciências Ambientais e da Terra |
Marc: |
LEADER 02979nam a2200265 a 4500 001 2116481 005 2019-12-10 008 2019 bl uuuu u01u1 u #d 100 1 $aQUARTAROLI, C. F. 245 $aAlterações no uso e cobertura das terras no município de Zacarias, estado de São Paulo.$h[electronic resource] 260 $aIn: ENCONTRO SOCIEDADE BRASILEIRA DE ECONOMIA ECOLÓGICA, 13., 2019, Campinas, SP. Anais... Campinas: Unicamp$c2019 520 $aAlterações no uso e cobertura das terras foram investigadas pelo cruzamento de mapas de uso e cobertura das terras dos anos de 2006 e 2016 do município de Zacarias (SP) situado na Região Administrativa de São José do Rio Preto. Os mapas foram elaborados para esse fim por meio da interpretação de imagens de satélite e de dados de campo. As áreas alteradas foram mapeadas, identificadas e quantificadas. Os resultados apontaram redução das áreas de pastagem no período em 21,98%, substituídas sobretudo pela expansão da cana-de-açúcar, cuja área cultivada apresentou crescimento de 17,42% no período. O cultivo da cana-de-açúcar foi a principal forma de uso das terras nos anos estudados com percentuais superiores a 40% da área do município. Embora menos expressiva em termos absolutos, observou-se também crescimento das áreas com seringueira e a redução das áreas com citros no município. A seringueira apresentou taxa de crescimento de 56,38%. A taxa de redução das áreas com citros foi de 81,65%. As áreas com uso e cobertura inalterado na comparação entre os dois anos foi de 84,47% da área do município. Abstract: We analyzed changes in land use and land cover by overlapping land-use and land-cover maps of the city of Zacarias (part of the Administrative Region of São José do Rio Preto, SP, Brazil) in 2006 and 2016. The maps were produced to that end by means of the visual interpretation of satellite images and field data. Changed areas were mapped, identified, and quantified. Our results show that pasture areas decreased 21.98%, and were replaced mainly by sugarcane, which showed an increase of 17.42% over the same period. Sugarcane crops were the main land use in 2006 and 2016, with percentages higher than 40% of the city?s total area. Although showing less significant absolute values, we also observed an increase in areas covered by rubber tree crops, and a decrease in areas covered by citrus crops. Areas with rubber tree crops increased 56.38%. Areas with citrus crops decreased 81.65%. Areas showing no change in land use and land cover in the comparison of both years amounted 84.47% of the city?s area. 650 $aLand cover 650 $aLand use 650 $aLand use change 650 $aSugarcane 650 $aCana de Açúcar 650 $aCobertura do Solo 650 $aHeveicultura 650 $aPastagem 650 $aUso da Terra 653 $aPastos 700 1 $aTOSTO, S. G. 700 1 $aGALDINO, S. 700 1 $aPEREIRA, L. C.
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Esconder MarcMostrar Marc Completo |
Registro original: |
Embrapa Meio Ambiente (CNPMA) |
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