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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Café. |
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Data corrente: |
16/11/2022 |
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Data da última atualização: |
16/11/2022 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
CASARIN, T.; FREITAS, N. C.; PINTO, R. T.; BREITLER, J. C.; RODRIGUES, L. A. Z.; MARRACCINI, P.; ETIENNE, H.; DINIZ, L. E. C.; ANDRADE, A. C.; PAIVA, L. V. |
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Afiliação: |
TATIANE CASARIN, UNIVERSIDADE FEDERAL DE LAVRAS; NATÁLIA CHAGAS FREITAS, UNIVERSIDADE FEDERAL DE LAVRAS; RENAN TERASSI PINTO, UNIVERSIDADE FEDERAL DE LAVRAS; JEAN‐CHRISTOPHE BREITLER, CENTRO DE COOPERAÇÃO INTERNACIONAL EM PESQUISA AGRÍCOLA PARA O DESENVOLVIMENTO; LEONARDO AUGUSTO ZEBRAL RODRIGUES, UNIVERSIDADE FEDERAL DE LAVRAS; PIERRE MARRACCINI, CENTRO DE COOPERAÇÃO INTERNACIONAL EM PESQUISA AGRÍCOLA PARA O DESENVOLVIMENTO; HERVÉ ETIENNE, CENTRO DE COOPERAÇÃO INTERNACIONAL EM PESQUISA AGRÍCOLA PARA O DESENVOLVIMENTO; LEANDRO EUGENIO CARDAMONE DINIZ, CNPSO; ALAN CARVALHO ANDRADE, CNPCa; LUCIANO VILELA PAIVA, UNIVERSIDADE FEDERAL DE LAVRAS. |
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Título: |
Multiplex CRISPR/Cas9-mediated knockout of the phytoene desaturase gene in Coffea canéfora. |
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Ano de publicação: |
2022 |
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Fonte/Imprenta: |
Scientific Reports, v. 12, 17270, 2022. 10 p. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1038/s41598-022-21566-w |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Coffea canephora (2n=2x22 chromosomes) is a species with extensive genetic diversity and desirable agronomic traits for coffee breeding programs. However, obtaining a new coffee cultivar through conventional breeding techniques may require more than 30 years of crossing cycles and selection, which hampers the effort of keeping up with market demands and rapidly proposing more resilient to climate change varieties. Although, the application of modern biotechnology tools such as precision genetic engineering technologies may enable a faster cultivar development process. Therefore, we aimed to validate the CRISPR/Cas9 system to generate mutations on a selected genotype of C. canephora, the clone 14. Embryogenic calli and a multiplex binary vector containing two sgRNAs targeting different exons of the CcPDS gene were used. The sgRNAs were under the C. canephora U6 promoter regulation. The target gene encodes phytoene desaturase, an enzyme essential for photosynthesis involved in B-carotene biosynthesis. Somatic seedlings and embryos with albino, variegated and green phenotypes regenerated after Agrobacterium tumefaciens-mediated genetic transformation were analyzed by verifying the insertion of the Cas9 gene and later by sequencing the sgRNAs target regions in the genome of Robusta modified seedlings. Among them, 77% had the expected mutations, and of which, 50% of them had at least one target with a homozygous mutation. The genotype, temperature of co-cultivation with the bacteria, and light intensity used for subsequent embryo regeneration appeared to strongly influence the successful regeneration of plants with a mutated CcPDS gene in the Coffea genus. MenosCoffea canephora (2n=2x22 chromosomes) is a species with extensive genetic diversity and desirable agronomic traits for coffee breeding programs. However, obtaining a new coffee cultivar through conventional breeding techniques may require more than 30 years of crossing cycles and selection, which hampers the effort of keeping up with market demands and rapidly proposing more resilient to climate change varieties. Although, the application of modern biotechnology tools such as precision genetic engineering technologies may enable a faster cultivar development process. Therefore, we aimed to validate the CRISPR/Cas9 system to generate mutations on a selected genotype of C. canephora, the clone 14. Embryogenic calli and a multiplex binary vector containing two sgRNAs targeting different exons of the CcPDS gene were used. The sgRNAs were under the C. canephora U6 promoter regulation. The target gene encodes phytoene desaturase, an enzyme essential for photosynthesis involved in B-carotene biosynthesis. Somatic seedlings and embryos with albino, variegated and green phenotypes regenerated after Agrobacterium tumefaciens-mediated genetic transformation were analyzed by verifying the insertion of the Cas9 gene and later by sequencing the sgRNAs target regions in the genome of Robusta modified seedlings. Among them, 77% had the expected mutations, and of which, 50% of them had at least one target with a homozygous mutation. The genotype, temperature of co-cultivation with the bacte... Mostrar Tudo |
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Thesagro: |
Biodiversidade; Café Robusta; Coffea Canephora; Genótipo; Melhoramento Genético Vegetal; Mutação. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1148303/1/Multiplex-CRISPRCas9-mediated.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Café (CNPCa) |
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Biblioteca |
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| Registros recuperados : 105 | |
| 81. |  | CAÇÃO, S. M. B.; SILVA, N. V.; ALVES, G. S. C.; VINECKY, F.; DINIZ, L. E. C.; ANDRADE, A. C.; PEREIRA, L. F. P.; VIEIRA, L. G. E. Using coffea arabica bacterial artificial chromosome library for gene cloning and integrative mapping aproaches. In: INTERNATIONAL CONFERENCE ON COFFEE SCIENCE, 22., 2008, Campinas, Brazil. Programme abstracts. Montpellier, France: Association for Science and Information on Coffee, 2008. PB633.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 82. | | CAÇÃO, S. M. B.; SILVA, N. V.; ALVES, G. S. C.; VINIECK, F.; DINIZ, L. E. C.; ANDRADE, A. C.; PEREIRA, L. F. P.; VIEIRA, L. G. E. Using a Coffea arabica bacterial artificial chromosome library for gene cloning and integrative mapping aproaches. In: INTERNATIONAL CONFERENCE ON COFFEE SCIENCE, 22., 2008, Campinas, Brazil.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 83. | | RAMOS, S. R. R.; LOIOLA, C. M.; ARAGÃO, W. M.; DINIZ, L. E. C.; LINS, P. M. P.; PEREIRA, M. G.; NUNES, A. de O.; RAMOS, H. C. C.; AZEVEDO, C. D. O.; SANTOS, P. H. A. D. Análisis de la distribución de la variabilidad genética en accesiones de cocotero gigante conservados en territorio brasileño. In: SIMPOSIO INTERNACIONAL DE RECURSOS GENETICOS PARA AMERICA LATINA Y EL CARIBE, 9., 2013, El Salvador. Memoria resúmenes. El Salvador, Centa, 2013.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 84. | | RAMOS, S. R. R.; LEDO, A. da S.; WARWICK, D. R. N.; PASSOS, E. E. M.; MORAES, E. F.; RIBEIRO, F. E.; FONTES, H. R.; NASCIMENTO, J. M. F. do; SOBRAL, L. F.; DINIZ, L. E. C. Banco ativo de germoplasma de coco (Cocos nucifera L.) Aracaju: Embrapa Tabuleiros Costeiros, 2009. il.; color.| Tipo: Folder/Folheto/Cartilha |
| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 85. | | GUZZO, E. C.; TOMA, R.; ACEVEDO, J. P. M.; VEGA, J. G.; NEGRISOLI JUNIOR, A. S.; LÖHR, B. L.; SANTOS, T. T. dos; SILVA, D. J. da; DINIZ, L. E. C. Intraspecific body size variability in a population of Billaea rhynchophorae (Blanchard) (Diptera: Tachinidae) parasitizing Rhynchophorus palmarum (Linnaeus) (Coleoptera: Curculionidae) in Brazil. Egyptian Journal of Biological Pest Control, v. 33, 11, 2023. 5 p.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 86. | | AMORIM, J. N. E.; DINIZ, L. E. C.; MUNIZ, A. V. C. da S.; RAMOS, S. R. R.; TAVARES, M. M. F.; LINS, P. M. P.; ARAGAO, W. M. Caracterização preliminar de acessos de coqueiro gigante utilizando-se marcadores microsatélites. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 2., 2012. Anais. Belém, PA. 2012.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 87. | | AMORIM, J. A. E.; DINIZ, L. E. C.; MUNIZ, A. V. C. da S.; RAMOS, S. R. R.; TAVARES, M. M. F.; LINS, P. M. P.; ARAGÃO, W. M. Caracterização preliminar de acessos de coqueiro-gigante utilizando-se marcadores microssatélites. In: CICLO DE PALESTRAS SOBRE USO DE MARCADORES MOLECULARES NA PESQUISA AGROPECUÁRIA, 1., 2012, Aracaju. Anais... Aracaju: Embrapa Tabuleiros Costeiros, 2012. p. 42-43.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 88. | | NUNES, A. de O.; RAMOS, S. R. R.; LOIOLA, C. M.; DINIZ, L. E. C.; PEREIRA, M. G.; AZEVEDO, C. D. de O.; SANTOS, P. H. A. D.; SILVA, R. do C.; SANTOS, E. S. de J. Caracterização molecular de acessos de coqueiro-gigante via marcadores SSR. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 7., 2013, Uberlândia. Variedade melhorada: a força da nossa agricultura: anais. Viçosa, MG: SBMP, 2013.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 89. | | ALVES, G. S. C.; SARAIVA, M. A. P.; PEREIRA, L. F. P.; CAÇÃO, S. M. B.; SILVA, N. V.; DINIZ, L. E. C.; VIEIRA, L. G. E.; ANDRADE, A. C. Construção de filtros de alta densidade a partir de uma biblioteca genômica de cromossomo artificial de bactéria de Coffea arábica L. In : ENCONTRO DO TALENTO ESTUDANTIL DA EMBRAPA RECURSOS GENÉTICOS E BIOTECNOLOGIA, 12., 2007, Brasília, DF. Anais: resumos dos trabalhos. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2007. p. 61.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 90. | | CACAO, S. M. B.; SILVA, N. V.; DOMINGUES, D. S.; VIEIRA, L. G. E.; DINIZ, L. E. C.; VINECKY, F.; ALVES, G. S. C.; ANDRADE, A. C.; CARPENTIERI PIPOLO, V.; PEREIRA, L. F. P. Construction and characterization of a BAC library from the Coffea arabica genotype Timor Hybrid CIFC 832/2. Genetica, v. 141, n. 1-3, p. 217-226, 2013.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 91. | | CACAO, S. M. B.; SILVA, N. V.; DOMINGUES, D. S.; VIEIRA, L. G. E.; PEREIRA, L. F. P.; DINIZ, L. E. C.; VINECKY, F.; ALVES, G. S. C.; ANDRADE, A. C.; CARPENTIERI PIPOLO, V. Construction and characterization of a BAC library from the Coffea arabica genotype Timor Hybrid CIFC 832/2. Genetica, v. 141, n. 1-3, 2013.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 92. | | LOIOLA, C. M.; RAMOS, S. R. R.; DINIZ, L. E. C.; PEREIRA, M. G.; RAMOS, H. C. C.; NUNES, A. de O.; AZEVEDO, C. D. O.; SANTOS, P. H. A. D. Relaciones genéticas entre accesiones de cocotero conservados de Banco Internacional de Coco para a América Latina. In: SIMPOSIO INTERNACIONAL DE RECURSOS GENETICOS PARA AMERICA LATINA Y EL CARIBE, 9., 2013, El Salvador. Memoria resúmenes. El Salvador, Centa, 2013.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 94. | | BRITO, F. A.; NIZIO, D. A. C.; MUNIZ, A. V. C. da S.; DINIZ, L. E. C.; RABBANI, A. R. C.; ARRIGONI BLANK, M. F.; ALVARES CARVALHO, S. V.; FIGUEIRA, G. M.; MONTANARI JUNIOR, I.; BLANK, A. F. Genetic diversity analysis of Varronia curassavica Jacq. accessions using ISSR markers. Genetics and Molecular Research, Ribeirão Preto, v. 15, n. 3, 2016.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 95. | | LOIOLA, C. M.; AZEVEDO, A. O. N.; DINIZ, L. E. C.; ARAGÃO, W. M.; AZEVEDO, C. D. de O.; SANTOS, P. H. A. D.; RAMOS, H. C. C.; PEREIRA, M. G.; RAMOS, S. R. R. Genetic relationships among tall coconut palm (cocos nucifera l.) accessions of the international coconut genebank for latin america and the caribbean (ICG-LAC), evaluated using microsatellite markers (SSRs). PLOS ONE, march, 2016.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 96. | | LOIOLA, C. M.; RAMOS, S. R. R.; ARAGÃO, W. M. de; RAMOS, H. C. C.; PEREIRA, M. G.; DINIZ, L. E. C.; NUNES, A. de O.; AZEVEDO, C. D. O.; SANTOS, P. H. A. D. Diversidade genética estimada por meio de variáveis quantitativas e moleculares em acesso de coqueiro-gigante. Magistra, Cruz das Almas, v. 25, n. especial, p. 286-287, nov. 2013. Anais do 1º Simpósio da Rede de Recursos Genéticos Vegetais do Nordeste (I RGVNE), Cruz das Almas, nov. 2013.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 97. | | CASARIN, T.; FREITAS, N. C.; PINTO, R. T.; BREITLER, J. C.; RODRIGUES, L. A. Z.; MARRACCINI, P.; ETIENNE, H.; DINIZ, L. E. C.; ANDRADE, A. C.; PAIVA, L. V. Multiplex CRISPR/Cas9-mediated knockout of the phytoene desaturase gene in Coffea canéfora. Scientific Reports, v. 12, 17270, 2022. 10 p.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 98. | | CASARIN, T.; FREITAS, N. C.; PINTO, R. T.; BREITLER, J-C.; RODRIGUES, L. A. Z.; MARRACCINI, P.; ETIENNE, H.; DINIZ, L. E. C.; ANDRADE, A. C.; PAIVA, L. V. Multiplex CRISPR/Cas9-mediated knockout of the phytoene desaturase gene in Coffea canephora. Scientific Reports, v. 12, 17270, 2022. 10 p.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 99. | | DIAS, J. A. R.; ALVES, L. L.; COUTO, M. V. S.; BARROS, F. A. L.; CORDEIRO, C. A. M.; PAIXAO, P. E. G.; MENESES, J. O.; CUNHA, F. S.; PEREIRA, S. A.; MARTINS, M. L.; MOURINO, J. L. P.; DINIZ, L. E. C.; MARIA, A. N.; CARNEIRO, P. C. F.; FUJIMOTO, R. Y. Inflammatory response in swim bladder caused by Aeromonas hydrophila in tambaqui (Colossoma macropomum Cuvier, 1816) supplemented with an autochthonous probiotic (Bacillus cereus). Aquaculture Research, p. 1-7, 2021.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 100. | | DIAD, J. A. R.; ALVES, L. L.; BARROS, F. A. L.; CORDEIRO, C. A. M.; MENESES, J. O.; SANTOS, T. B. R.; SANTOS, C. C. M.; PAIXAO, P. E. G.; NOGUEIRA FILHO, R. M.; MARTINS, M. L.; PEREIRA, S. A.; MOURINO, J. L. P.; DINIZ, L. E. C.; MARIA, A. N.; CARNEIRO, P. C. F.; FUJIMOTO, R. Y. Comparative effects of autochthonous single-strain and multistrain probiotics on the productive performance and disease resistance in Colossoma macropomum (Cuvier, 1818). Aquaculture Research, v. 53, n. 11, Aug. 2022.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja; Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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