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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
Data corrente: |
03/05/2005 |
Data da última atualização: |
05/10/2006 |
Autoria: |
DALMOLIN, C. C. |
Título: |
Identificação, análise da seqüência e filogenia do gene da DNA polimerase de Anticarsia gemmatalis nucleopolyhedrivirus. |
Ano de publicação: |
2004 |
Fonte/Imprenta: |
2004. |
Páginas: |
109 f. |
Idioma: |
Português |
Notas: |
Dissertação (Mestrado em Biologia Molecular) - Departamento de Biologia Celular, Instituto de Ciências Biológicas, Universidade de Brasília, Brasília. Orientadora: Maria Elita Batista de Castro. |
Conteúdo: |
A família Baculoviridae constitui um importante grupo de vírus entomopatogênicos, que taxonomicamente está dividida em dois gêneros, Nucleopolyhedrovirus e Granulovirus. Anticarsia gemmatalis nucleopolyhedrovirus (AgMNPV) é um membro desta família, que devido ao seu potencial de infecção, vem sendo utilizado com sucesso para o controle da lagarta A. gemmatalis, principal praga da soja no Brasil. Dentre as proteínas envolvidas na replicação do DNA viral, a DNA polimerase exerce um importante papel em nível de replicação genômica. Além disso, as sequências nucleotídica e de aminoácidos da DNA polimerase têm sido utilizadas em estudos de filogenia por fornecerem dados adeqLJados para análises de evolução dos baculovirus. Para maior entendimento sobre a estrutura genômica do AgMNPV e suas relaçôes filogenéticas, este trabalho foi conduzido com o objetivo de identificar, localizar e sequenciar o gene da DNA polimerase de AgMNPV e com base na sua sequência reconstruir a árvore filogenética de AgMNPV. A localização deste gene foi determinada por hibridização Southern blot usando uma sonda preparada a partir do gene dnapol de Autographa califomica nucleopolyhedrovirus com uma região que corresponde aos fragmentos Hindlll-Q e Hindlll-U no mapa físico de AgMNPV publicado (Maruniak et al., 1999; Johnson e Maruniak, 1989). Uma região de 4.610 nucleotídeos foi sequenciada e analisada para o gene da DNA polimerase. A análise indicou a presença de uma ORF ("Open Reading Frame") de DNA polimerase com 2976 nucleotídeos (número de acesso no GenBank AY526324), que codifica uma proteína putativa de 991 resíduos de aminoácidos, com uma massa molecular predita de 114.7 kDa. Nesta região foram ainda identificadas duas outras possíveis ORFs correspondentes a genes da família BRO e de uma proteína ainda não identificada. Uma ORF 66 foi também identificada na mesma região que contém a proteína "unknown". Análises por BLAST da sequência mostraram que a DNA polimerase de AgMNPV apresenta elevada identidade com a DNA polimerase da linhagem defectiva de Choristoneura fumiferana nucleopolyhedrovirus, CfDEFNPV (94%), seguida de Orgyia pseudotsugata nucleopolyhedrovirus, OpMNPV (77%) e Choristoneura fumiferana... MenosA família Baculoviridae constitui um importante grupo de vírus entomopatogênicos, que taxonomicamente está dividida em dois gêneros, Nucleopolyhedrovirus e Granulovirus. Anticarsia gemmatalis nucleopolyhedrovirus (AgMNPV) é um membro desta família, que devido ao seu potencial de infecção, vem sendo utilizado com sucesso para o controle da lagarta A. gemmatalis, principal praga da soja no Brasil. Dentre as proteínas envolvidas na replicação do DNA viral, a DNA polimerase exerce um importante papel em nível de replicação genômica. Além disso, as sequências nucleotídica e de aminoácidos da DNA polimerase têm sido utilizadas em estudos de filogenia por fornecerem dados adeqLJados para análises de evolução dos baculovirus. Para maior entendimento sobre a estrutura genômica do AgMNPV e suas relaçôes filogenéticas, este trabalho foi conduzido com o objetivo de identificar, localizar e sequenciar o gene da DNA polimerase de AgMNPV e com base na sua sequência reconstruir a árvore filogenética de AgMNPV. A localização deste gene foi determinada por hibridização Southern blot usando uma sonda preparada a partir do gene dnapol de Autographa califomica nucleopolyhedrovirus com uma região que corresponde aos fragmentos Hindlll-Q e Hindlll-U no mapa físico de AgMNPV publicado (Maruniak et al., 1999; Johnson e Maruniak, 1989). Uma região de 4.610 nucleotídeos foi sequenciada e analisada para o gene da DNA polimerase. A análise indicou a presença de uma ORF ("Open Reading Frame") de DNA poli... Mostrar Tudo |
Palavras-Chave: |
AgMNPV; Anticarsia gemmatalis nucleopolyhedrovirus; Árvore fitogenética; DNA polimerase; Inentificação; Localização; Seqüenciamento. |
Categoria do assunto: |
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Marc: |
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Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia (CENARGEN) |
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Registros recuperados : 14 | |
1. | | DALMOLIN, C. C.; VIVAN, A. L.; RIBEIRO, Z. M. A.; CASTRO, M. E. B. Análise de proteínas estruturais e de DNA de isolados temporais de Bombyx Mori Nucleopolyhedrovirus. In: ENCONTRO DO TALENTO ESTUDANTIL DA EMBRAPA RECURSOS GENÉTICOS E BIOTECNOLOGIA, 7., 2002, Brasília, DF. Anais: resumos dos trabalhos. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2002. p. 32.Tipo: Resumo em Anais de Congresso | Circulação/Nível: -- - -- |
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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2. | | DALMOLIN, C. C.; MAIA, E. A.; RIBEIRO, B. M.; SOUZA, M. L.; CASTRO, M. E. B. Clonagem do gene 25KFP de Anticarsia gemmatalis Mnpv para transformação estável de células de insetos. In: ENCONTRO DO TALENTO ESTUDANTIL DA EMBRAPA RECURSOS GENÉTICOS E BIOTECNOLOGIA, 10., 2005, Brasília, DF. Anais: resumos dos trabalhos. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2005. p. 115.Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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3. | | SANTOS, A. C. B.; RIBEIRO, Z. M. A.; DALMOLIN, C. C.; CASTRO, M. E. B. Infectividade do isolado 1-01 de bombyx mori nucleopolyhedrovirus em linhagens celulares de insetos. ENCONTRO DO TALENTO ESTUDANTIL DA EMBRAPA RECURSOS GENETICOS E BIOTECNOLOGIA, 8., 2003, Brasília, DF. Anais: resumos dos trabalhos. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2003. p. 77Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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4. | | DALMOLIN, C. C.; SANTOS, A. C. B.; RIBEIRO, Z. M. A.; CASTRO, M. E. B. Identificação do gene dnapol de Anticarsia gemmatalis Nucleopolyhedrovirus. In: ENCONTRO DO TALENTO ESTUDANTIL DA EMBRAPA RECURSOS GENÉTICOS E BIOTECNOLOGIA, 7., 2002, Brasília, DF. Anais: resumos dos trabalhos. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2002. p. 49.Tipo: Resumo em Anais de Congresso | Circulação/Nível: -- - -- |
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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7. | | RIBEIRO, Z. M. A.; MAIA, A. E.; DALMOLIN, C. C.; SOUZA, M. L.; RIBEIRO, B. M.; CASTRO, M. E. B. Construção de uma linhagem celular estável de Trichoplusia ni contendo o gene 25KFP do baculovírus AgMNPV. In: SIMPÓSIO DE CONTROLE BIOLÓGICO, 10., 2007, Brasília, DF. Inovar para preservar a vida. Resumos. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2007. (Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. Documentos, 250).Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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8. | | PAIVA, M. R.; MIRANDA, H. A.; CIAMPI, A. Y.; DALMOLIN, C. C.; ALEGRIA, M. R. M.; BUSO, G. S. C. Busca de primers microssatélites, in silico, de genes-chave para características bióticas e abióticas de feijão, milho e mandioca. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 51., 2005, Águas de Lindóia, SP. A era da genômica: da bioestatística à bioinformática: anais. Ribeirão Preto, SP: Sociedade Brasileira de Genética, 2005. p. 708.Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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9. | | PAIVA, M. R.; MIRANDA, H. A.; CIAMPI, A. Y.; DALMOLIN, C. C.; ALEGRIA, M. R. M.; BUSO, G. S. C. Busca de primers microssatélites, in silico, de genes-chave para características bióticas e abióticas de feijão, milho e mandioca. In: ENCONTRO DO TALENTO ESTUDANTIL DA EMBRAPA RECURSOS GENÉTICOS E BIOTECNOLOGIA, 10., 2005, Brasília, DF. Anais: resumos dos trabalhos. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2005. p. 156.Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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13. | | CASTRO, M. E. B.; DALMOLIN, C. C.; SANTOS, A. C. B. dos; RIBEIRO, Z. M. de A.; RIBEIRO, B. M.; SOUZA, M. L. Identification, location and partial sequencing of an Anticarsia gemmatalis nucleopolyhedrovirus DNA polymerase gene. In: INTERNATIONAL COLLOQUIUM ON INVERTEBRATE PATHOLOGY AND MICROBIAL CONTROL, 8.; INTERNATIONAL CONFERENCE ON BACILLUS THURINGIENSIS 6.; ANNUAL MEETING OF THE SIP, 35., 2002, Foz do Iguassu. Program and abstracts. Londrina: Embrapa Soja: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia: UEL: SIP, 2002. p. 84-85. (Embrapa Soja. Documentos, 183; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 73).Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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