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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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Data corrente: |
03/11/2010 |
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Data da última atualização: |
22/08/2022 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
GOMES, K. A.; ALMEIDA, T. C.; GESTEIRA, A. da S.; LÔBO, I. P.; GUIMARÃES, A. C. R.; MIRANDA, A. B. de; VAN SLUYS, M. A.; CRUZ, R. S. da; CASCARDO, J. C. M.; CARELS, N. |
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Afiliação: |
Kleber A. Gomes, UESC; Tiago C. Almeida, UESC; ABELMON DA SILVA GESTEIRA, CNPMF; Ivon Pinheiro Lobo, UESC; Ana Carolina R. Guimarães, FIOCRUZ; Antonio B. de Miranda, FIOCRUZ; Marie-Anne Van Sluys, USP; Rosenira Serpa da Cruz, UESC; Júlio Cézar Mattos Cascardo, UESC; Nicolas Carels, UESC. |
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Título: |
ESTs from seeds to assist the selective breeding of Jatropha curcas L. for oil and active compounds. |
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Ano de publicação: |
2010 |
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Fonte/Imprenta: |
Genomics Insights, v. 3, p. 29?56, 2010. |
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ISSN: |
1178-6310 |
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DOI: |
10.4137/GEI.S4340 |
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Idioma: |
Inglês |
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Notas: |
Diponível em:.Acesso em: 03 nov. 2010. |
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Conteúdo: |
We report here on the characterization of a cDNA library from seeds of Jatropha curcas L. at three stages of fruit maturation before yellowing. We sequenced a total of 2200 clones and obtained a set of 931 non-redundant sequences (unigenes) after trimming and quality control, ie, 140 contigs and 791 singlets with PHRED quality $10. We found low levels of sequence redundancy and extensive metabolic coverage by homology comparison to GO. After comparison of 5841 non-redundant ESTs from a total of 13193 reads from GenBank with KEGG, we identified tags with nucleotide variations among J. curcas accessions for genes of fatty acid, terpene, alkaloid, quinone and hormone pathways of biosynthesis. More specifically, the expression level of four genes (palmitoyl-acyl carrier protein thioesterase, 3-ketoacyl-CoA thiolase B, lysophosphatidic acid acyltransferase and geranyl pyrophosphate synthase) measured by real- time PCR proved to be significantly different between leaves and fruits. Since the nucleotide polymorphism of these tags is associated to higher level of gene expression in fruits compared to leaves, we propose this approach to speed up the search for quantitative traits in selective breeding of J. curcas. We also discuss its potential utility for the selective breeding of economically important traits in J. curcas. |
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Palavras-Chave: |
Biofuel; Melhoramento genetico vegatal; Pinhão manso; Terpenes. |
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Thesagro: |
Biocombustível; Jatropha Curcas. |
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Thesaurus Nal: |
alkaloids; fatty acids; genomics. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/23536/1/f-2328-GEI-ESTs-from-Seeds-to-Assist-the-Selective-Breeding-of-Jatropha-curcas-L.pdf-31711.pdf
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Marc: |
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520 $aWe report here on the characterization of a cDNA library from seeds of Jatropha curcas L. at three stages of fruit maturation before yellowing. We sequenced a total of 2200 clones and obtained a set of 931 non-redundant sequences (unigenes) after trimming and quality control, ie, 140 contigs and 791 singlets with PHRED quality $10. We found low levels of sequence redundancy and extensive metabolic coverage by homology comparison to GO. After comparison of 5841 non-redundant ESTs from a total of 13193 reads from GenBank with KEGG, we identified tags with nucleotide variations among J. curcas accessions for genes of fatty acid, terpene, alkaloid, quinone and hormone pathways of biosynthesis. More specifically, the expression level of four genes (palmitoyl-acyl carrier protein thioesterase, 3-ketoacyl-CoA thiolase B, lysophosphatidic acid acyltransferase and geranyl pyrophosphate synthase) measured by real- time PCR proved to be significantly different between leaves and fruits. Since the nucleotide polymorphism of these tags is associated to higher level of gene expression in fruits compared to leaves, we propose this approach to speed up the search for quantitative traits in selective breeding of J. curcas. We also discuss its potential utility for the selective breeding of economically important traits in J. curcas.
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Registro original: |
Embrapa Mandioca e Fruticultura (CNPMF) |
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| Registros recuperados : 7 | |
| 3. |  | OTONI, C. G.; AOUADA, R. de M.; AOUADA, F. A.; CAMILLOTO, G. P.; CRUZ, R. S.; MATTOSO, L. H. C.; SOARES, N. de F. F. Caracterization of pectin-based edible films and effect of addition of papaya puree and cinnamaldehyde nanoemulsions on antimicrobial, thermal and mechanical properties. In: JORNADAS INTERNACIONAIS SOBRE AVANÇOS NA TECNOLOGIA DE FILMES E COBERTURAS FUNCIONAIS EM ALIMENTOS, 4.; AGROBIOENVASES, 2012, Florianópolis. Anais... Florianópolis: UFSC, 2012. P60.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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| 4. | | REIS, R. C.; OLIVEIRA, L. A. de; ALMEIDA, J. M.; JESUS NETA, PALMIRA de; SANTOS, F. D.; SANTOS, V. da S.; CRUZ, R. S. Culinary quality and sensory profile of cassava varieties harvested at different ages qualidade culinária e perfil sensorial de variedades de mandioca de mesa Semina: Ciências Agrárias, Londrina, v. 42, n. 2, p. 657-678, mar./abr. 2021. 1679-0359| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 5. | | OTONI, C. G.; MOURA, M. R. de; AOUADA, F. A.; CAMILLOTO, G. P.; CRUZ, R. S.; LOREVICE, M. V.; SOARES, N. de F. F.; MATTOSO, L. H. C. Miniaturização de partículas em nanoemulsões de cinamaldeído na melhoria do desempenho antimicrobiano de filmes biopoliméricos ativos. In: WORKSHOP DA REDE DE NANOTECNOLOGIA APLICADA AO AGRONEGÓCIO, 8, 2014, Juiz de fora. Anais... São Carlos: Embrapa Instrumentação; Campo Grande: Embrapa Gado de Corte; Juiz de Fora: Embrapa Gado de Leite, 2014. p. 108-112. Editores: Maria Alice Martins, Humberto de Mello Brandão, Marlene de Barros Coelho, Daniel Souza Corrêa, Caue Ribeiro, Luiz Henrique Capparelli Mattoso.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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| 6. | | SOARES, N. de F. F.; CRUZ, R. S.; VILLADIEGO, A. M. D.; MELO, N. R. de; SILVEIRA, M. F. A.; WURLITZER, N. J.; SILVA, W. A. da; RODRIGUES, P. P. de C. F. Embalagem ativa na conservação de alimentos. In: AZEREDO, H. M. C. de (Ed.). Fundamentos de estabilidade de alimentos. 2. ed. rev. ampl. Fortaleza: Embrapa Agroindústria Tropical, 2012.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria Tropical. |
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| 7. | | GOMES, K. A.; ALMEIDA, T. C.; GESTEIRA, A. da S.; LÔBO, I. P.; GUIMARÃES, A. C. R.; MIRANDA, A. B. de; VAN SLUYS, M. A.; CRUZ, R. S. da; CASCARDO, J. C. M.; CARELS, N. ESTs from seeds to assist the selective breeding of Jatropha curcas L. for oil and active compounds. Genomics Insights, v. 3, p. 29?56, 2010. Diponível em:.Acesso em: 03 nov. 2010.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: C - 0 |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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