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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Café. |
Data corrente: |
30/09/2020 |
Data da última atualização: |
07/10/2020 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
MENGISTU, F. G.; MOTOIKE, S. Y.; CAIXETA, E. T.; CRUZ, C. D. |
Afiliação: |
Fekadu Gebretensay Mengistu, Universidade Federal de Viçosa, Departamento de Fitotecnia; Sérgio Yoshimitsu Motoike, Universidade Federal de Viçosa, Departamento de Fitotecnia; EVELINE TEIXEIRA CAIXETA MOURA, CNPCa; Cosme Damião Cruz, Universidade Federal de Viçosa, Departamento de Biologia Geral. |
Título: |
Cross-species amplification and characterization of new microsatellite markers for the macaw palm, Acrocomia aculeata (Arecaceae). |
Ano de publicação: |
2016 |
Fonte/Imprenta: |
Plant Genetic Resources: Characterization and Utilization, v. 14 , n. 3 , p. , 2016. |
DOI: |
https://doi.org/10.1017/S1479262115000179 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
Microsatellites or simple sequence repeats (SSRs) are useful molecular markers allowing for efficient conservation and sustainable use of genetic resources of plant species. Development of SSR marker system for new species is a very expensive task and time consuming. Crossspecies amplification of microsatellite loci is considered as a cost-effective approach for developing microsatellite markers for new species. The aim of this work was to examine the transferability of some SSR markers of two Arecaceae species (Astrocaryum aculeatum and Elaeis oleifera), in Acrocomia aculeata. Out of the total markers analysed 44% of the markers successfully amplified the genomic DNA in A. aculeata, of which 26% were polymorphic detecting a range of three to eight alleles with an average of 4.5 per locus. High average percentage of polymorphic loci (P ¼ 71.2%) per provenance was obtained within a range of 57?100% detecting genetic variation in A. aculeata germplasm collections. The polymorphic markers detected a positive inbreeding coefficient (F . 0) per locus revealing heterozygote deficiency in the accessions that were analysed. As the cross-amplification was at family level, in which the taxonomic distance is relatively wider between the sources (A. aculeatum and E. oleifera) and the target (A. aculeata) species, the amplification success was relatively low. However, the results are promising and implicated that high cross-amplification success could be achieved at species or genus level in A. aculeata. The markers will contribute towards the domestication of the potential macaw palm through realizing various studies such as population genetics, germplasm characterization, genetic improvement and conservation. MenosMicrosatellites or simple sequence repeats (SSRs) are useful molecular markers allowing for efficient conservation and sustainable use of genetic resources of plant species. Development of SSR marker system for new species is a very expensive task and time consuming. Crossspecies amplification of microsatellite loci is considered as a cost-effective approach for developing microsatellite markers for new species. The aim of this work was to examine the transferability of some SSR markers of two Arecaceae species (Astrocaryum aculeatum and Elaeis oleifera), in Acrocomia aculeata. Out of the total markers analysed 44% of the markers successfully amplified the genomic DNA in A. aculeata, of which 26% were polymorphic detecting a range of three to eight alleles with an average of 4.5 per locus. High average percentage of polymorphic loci (P ¼ 71.2%) per provenance was obtained within a range of 57?100% detecting genetic variation in A. aculeata germplasm collections. The polymorphic markers detected a positive inbreeding coefficient (F . 0) per locus revealing heterozygote deficiency in the accessions that were analysed. As the cross-amplification was at family level, in which the taxonomic distance is relatively wider between the sources (A. aculeatum and E. oleifera) and the target (A. aculeata) species, the amplification success was relatively low. However, the results are promising and implicated that high cross-amplification success could be achieved at species or genus leve... Mostrar Tudo |
Palavras-Chave: |
SSRs. |
Thesagro: |
Macaúba. |
Thesaurus Nal: |
Biodiesel; Domestication; Null alleles. |
Categoria do assunto: |
-- |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/216307/1/Mengistu-et-al.-2015-1.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Café (CNPCa) |
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Biblioteca |
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Cutter |
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Volume |
Status |
URL |
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Registro Completo
Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Leite. |
Data corrente: |
19/12/2011 |
Data da última atualização: |
23/01/2023 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Circulação/Nível: |
B - 1 |
Autoria: |
SANTOS, M. E. R.; FONSECA, D. M. da; GOMES, V. M.; NASCIMENTO JÚNIOR, D.; GOMIDE, C. A. de M.; SBRISSIA, A. F. |
Afiliação: |
MANOEL EDUARDO ROZALINO SANTOS, UFV; CNPq; DILERMANDO MIRANDA DA FONSECA, UFV; VIRGÍLIO MESQUITA GOMES, UFV; FAPEMIG; DOMÍCIO NASCIMENTO JÚNIOR, UFV; CARLOS AUGUSTO DE MIRANDA GOMIDE, CNPGL; ANDRÉ FISCHER SBRISSIA, Universidade do Estado de Santa Catarina. |
Título: |
Capim-braquiária sob lotação contínua e com altura única ou variável durante as estações do ano: dinâmica do perfilhamento. |
Ano de publicação: |
2011 |
Fonte/Imprenta: |
Revista Brasileira de Zootecnia, v. 40, n. 11, p. 2332-2339, 2011. |
DOI: |
https://doi.org/10.1590/S1516-35982011001100008 |
Idioma: |
Português |
Conteúdo: |
Objetivou-se estabelecer estratégias de manejo do pastejo, sob lotação contínua, que otimizem o padrão natural de perfilhamento da Brachiaria decumbens cv. Basilisk. Duas estratégias de manejo do pastejo foram estudadas: em uma, o pasto foi mantido com 25 cm de altura média durante todo o período experimental; e na outra foi mantido em 15 cm de altura média durante o inverno, com aumento para 25 cm a partir do início da primavera. Adotou-se o esquema de parcelas subdivididas em delineamento em blocos casualizados com quatro repetições. Consideraram-se como fator primário as estratégias de manejo do pastejo, caracterizadas pelas alturas médias em que os pastos foram mantidos durante as estações do ano (inverno, primavera e verão) e, como fator secundário, as medidas ao longo do período experimental. A taxa de aparecimento de perfilho (4,7%), a taxa de mortalidade (4,7%) e o índice de estabilidade (0,998) foram menores no inverno. Nesta estação, contudo, a taxa de sobrevivência de perfilho foi maior (95,3%). Em comparação aos pastos mantidos com 25 cm, aqueles manejados com 15 cm de altura média no inverno apresentaram maiores taxas de aparecimento de perfilho (34,2%) e índice de estabilidade (1,065). O florescimento do capim-braquiária ocorreu apenas no verão e com pouca intensidade (0,5%). A otimização da renovação de perfilhos no pasto de B. decumbens cv. Basilisk sob lotação contínua ocorre com seu rebaixamento para 15 cm no início do inverno e seu posterior aumento para 25 cm no início da primavera. MenosObjetivou-se estabelecer estratégias de manejo do pastejo, sob lotação contínua, que otimizem o padrão natural de perfilhamento da Brachiaria decumbens cv. Basilisk. Duas estratégias de manejo do pastejo foram estudadas: em uma, o pasto foi mantido com 25 cm de altura média durante todo o período experimental; e na outra foi mantido em 15 cm de altura média durante o inverno, com aumento para 25 cm a partir do início da primavera. Adotou-se o esquema de parcelas subdivididas em delineamento em blocos casualizados com quatro repetições. Consideraram-se como fator primário as estratégias de manejo do pastejo, caracterizadas pelas alturas médias em que os pastos foram mantidos durante as estações do ano (inverno, primavera e verão) e, como fator secundário, as medidas ao longo do período experimental. A taxa de aparecimento de perfilho (4,7%), a taxa de mortalidade (4,7%) e o índice de estabilidade (0,998) foram menores no inverno. Nesta estação, contudo, a taxa de sobrevivência de perfilho foi maior (95,3%). Em comparação aos pastos mantidos com 25 cm, aqueles manejados com 15 cm de altura média no inverno apresentaram maiores taxas de aparecimento de perfilho (34,2%) e índice de estabilidade (1,065). O florescimento do capim-braquiária ocorreu apenas no verão e com pouca intensidade (0,5%). A otimização da renovação de perfilhos no pasto de B. decumbens cv. Basilisk sob lotação contínua ocorre com seu rebaixamento para 15 cm no início do inverno e seu posterior aumento para 2... Mostrar Tudo |
Palavras-Chave: |
Altura do pasto; Aparecimento de perfilho; Manejo do pastejo; Mortalidade de perfilho. |
Thesagro: |
Brachiaria Decumbens. |
Categoria do assunto: |
F Plantas e Produtos de Origem Vegetal |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/50837/1/Artigo-meta-2011-RBZ-08-Gomide.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Gado de Leite (CNPGL) |
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