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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Florestas. |
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Data corrente: |
14/07/2017 |
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Data da última atualização: |
03/01/2018 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
GOIS, I. B.; BORÉM, A.; CRISTOFANI-YALY, M.; RESENDE, M. D. V. de; AZEVEDO, C. F.; BASTIANEL, M.; NOVELLI, V. M.; MACHADO, M. A. |
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Afiliação: |
I. B. Gois, Departamento de Fitotecnia, Universidade Federal de Viçosa; A. Borém, Departamento de Fitotecnia, Universidade Federal de Viçosa; M. Cristofani-Yaly, Instituto Agronômico de Campinas, Centro APTA Citros Sylvio Moreira; MARCOS DEON VILELA DE RESENDE, CNPF; C. F. Azevedo, Departamento de Estatística, Universidade Federal de Viçosa; M. Bastianel, Instituto Agronômico de Campinas, Centro APTA Citros Sylvio Moreira; V. M. Novelli, Instituto Agronômico de Campinas, Centro APTA Citros Sylvio Moreira; M. A. Machado, Instituto Agronômico de Campinas, Centro APTA Citros Sylvio Moreira. |
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Título: |
Genome wide selection in citrus breeding. |
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Ano de publicação: |
2016 |
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Fonte/Imprenta: |
Genetics and Molecular Research, v. 15, n. 4, gmr15048863, Oct. 2016. |
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DOI: |
http://dx.doi.org/10.4238/gmr15048863 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Genome wide selection (GWS) is essential for the genetic improvement of perennial species such as Citrus because of its ability to increase gain per unit time and to enable the efficient selection of characteristics with low heritability. This study assessed GWS efficiency in a population of Citrus and compared it with selection based on phenotypic data. A total of 180 individual trees from a cross between Pera sweet orange (Citrus sinensis Osbeck) and Murcott tangor (Citrus sinensis Osbeck x Citrus reticulata Blanco) were evaluated for 10 characteristics related to fruit quality. The hybrids were genotyped using 5287 DArT_seqTM (diversity arrays technology) molecular markers and their effects on phenotypes were predicted using the random regression - best linear unbiased predictor (rr-BLUP) method. The predictive ability, prediction bias, and accuracy of GWS were estimated to verify its effectiveness for phenotype prediction. The proportion of genetic variance explained by the markers was also computed. The heritability of the traits, as determined by markers, was 16-28%. The predictive ability of these markers ranged from 0.53 to 0.64, and the regression coefficients between predicted and observed phenotypes were close to unity. Over 35% of the genetic variance was accounted for by the markers. Accuracy estimates with GWS were lower than those obtained by phenotypic analysis; however, GWS was superior in terms of genetic gain per unit time. Thus, GWS may be useful for Citrus breeding as it can predict phenotypes early and accurately, and reduce the length of the selection cycle. This study demonstrates the feasibility of genomic selection in Citrus. MenosGenome wide selection (GWS) is essential for the genetic improvement of perennial species such as Citrus because of its ability to increase gain per unit time and to enable the efficient selection of characteristics with low heritability. This study assessed GWS efficiency in a population of Citrus and compared it with selection based on phenotypic data. A total of 180 individual trees from a cross between Pera sweet orange (Citrus sinensis Osbeck) and Murcott tangor (Citrus sinensis Osbeck x Citrus reticulata Blanco) were evaluated for 10 characteristics related to fruit quality. The hybrids were genotyped using 5287 DArT_seqTM (diversity arrays technology) molecular markers and their effects on phenotypes were predicted using the random regression - best linear unbiased predictor (rr-BLUP) method. The predictive ability, prediction bias, and accuracy of GWS were estimated to verify its effectiveness for phenotype prediction. The proportion of genetic variance explained by the markers was also computed. The heritability of the traits, as determined by markers, was 16-28%. The predictive ability of these markers ranged from 0.53 to 0.64, and the regression coefficients between predicted and observed phenotypes were close to unity. Over 35% of the genetic variance was accounted for by the markers. Accuracy estimates with GWS were lower than those obtained by phenotypic analysis; however, GWS was superior in terms of genetic gain per unit time. Thus, GWS may be useful for Citr... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
DarT_seq; Molecular markers; Seleção precoce; Selective accuracy. |
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Thesagro: |
Fruta cítrica; Marcador Molecular; Melhoramento vegetal. |
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Thesaurus Nal: |
Citrus; early selection; linkage disequilibrium; Plant breeding. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/161818/1/2016-M.Deon-GMR-Genome.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Florestas (CNPF) |
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| Registros recuperados : 16 | |
| 1. |  | SCHINOR, E. H.; SIVIERO, A.; CRISTOFANI-YALY, M.; MARENGO, S.; POMPEU JUNIOR, J.; MACHADO, M. A. Caracterização de frutos de acessos de Citrus sunki do banco de germoplasma de citros do Centro Apta Citros Sylvio Moreira. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FRUTICULTURA, 21., 2010, Natal. Frutas: saúde, inovação e responsabilidade: anais. Natal: SBF, 2010. 4 p. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Acre. |
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| 2. | | SCHINOR, E. H.; SIVIERO, A.; CRISTOFANI-YALY, M.; MARENGO, S.; POMPEU JUNIOR, J.; MACHADO, M. A. Caracterização agronômica e molecular de acessos de Citrus sunki do banco de germoplasma de citros do Centro APTA Citros Sylvio Moreira. Citrus Research & Technology, Cordeirópolis, v. 32, n. 1, p. 27-37, 2011.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 4 |
| Biblioteca(s): Embrapa Acre. |
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| 4. | | LATADO, R. R.; CRISTOFANI-YALY, M.; CARVALHO, C. R. de; MACHADO, M. A. Plantas autotetraplóides de citros sob tratamento in vitro com colchicina. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 42, n. 10, p. 1429-1435, out. 2007 Título em inglês: Citrus autotetraploid plants obtained by in vitro treatment with colchicine.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 5. | | CRISTOFANI-YALY, M.; GOIS, I.; RESENDE, M. D. V. de; BASTIANEL, M.; NOVELLI, V. M.; MACHADO, M. A. Aplicação da seleção genômica em citros. In: ENCONTRO SOBRE TEMAS DE GENÉTICA E MELHORAMENTO, 31.; REUNIÃO PAULISTA DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 2., 2014, Piracicaba. Seleção genômica ampla: princípios e aplicações: anais. Piracicaba: ESALQ/LGN, 2014. p. 42-44.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| 6. | | KUBOTA, T. M. K.; MAGALHAES, A. B.; CRISTOFANI-YALY, M.; VILAS-BOAS, P. R.; MILORI, D. M. B. P. Potencial da espectroscopia de fluorescência induzida por laser para separar variedades de laranja geneticamente parecidas. In: SIMPÓSIO NACIONAL DE INSTRUMENTAÇÃO AGROPECUÁRIA, 2014, São Carlos, SP Anais do SIAGRO: ciência, inovação e mercado 2014. São Carlos, SP: Embrapa Instrumentação, 2014. p. 49-52. Editores: Carlos Manoel Pedro Vaz, Débora Marcondes Bastos Pereira Milori, Silvio Crestana. Entrada padronizada: VILLAS-BOAS, P. R.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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| 8. | | GOIS, I. B.; BORÉM, A.; CRISTOFANI-YALY, M.; RESENDE, M. D. V. de; AZEVEDO, C. F.; BASTIANEL, M.; NOVELLI, V. M.; MACHADO, M. A. Genome wide selection in citrus breeding. Genetics and Molecular Research, v. 15, n. 4, gmr15048863, Oct. 2016.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| 9. | | BASTIANEL, M.; CRISTOFANI-YALY, M.; OLIVEIRA, A. de; FREITAS-ASTÚA, J.; GARCIA, A.; RESENDE, M. de; RODRIGUES, V.; MACHADO, M. A. Quantitative trait loci analysis of citrus leprosis resistance in an interspecific backcross family of (Citrus reticulata Blanco × C. sinensis L. Osbeck) × C. sinensis L. Osb. Euphytica, Wageningen, v. 169, n. 1, p. 101-111, set. 2009.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 10. | | CAMPOS, T. M. P.; SANTOS JÚNIOR, J. A.; CRISTOFANI-YALY, M.; BASTIANEL, M.; MILORI, D. M. B. P.; MACHADO, M. A. Seleção de novos híbridos de variedades de porta-enxertos para resistência à morte súbita dos citros. Tropical plant pathology, Brasília, v. 34, 2009. Suplemento. Edição dos resumos do XLII Congresso Brasileiro de Fitopatologia, 2009. Resumo.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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| 11. | | MAGALHÃES, A. B.; KUBOTA, T. M. K.; SILVA, M. N. da; SEILER, R. M. B.; SANTOS, J. Z. dos; RANULFI, A. C.; NOVELLI, V. M.; BASTIANEL, M.; VILLAS-BOAS, P. R.; CRISTOFANI-YALY, M.; MILORI, D. M. B. P. Application on the laser-induced breakdown spectroscopy in identification among pear sweet citrus varieties very close genetically. In: WORKSHOP SOBRE LASER EM QUÍMICA ANALÍTICA, 2., 2015, São Carlos. Livro de resumos... São Carlos: UFSCar; Embrapa Instrumentação, 2015. p. 30.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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| 12. | | MACHADO, M. A.; AMARAL, A. M. do; BASTIANEL, M.; BOSCARIOL-CAMARGO, R. L.; CARLOS, E. F.; DELLA COLETTA FILHO, H.; CRISTOFANI-YALY, M.; FREITAS-ASTÚA, J.; LOCALI-FABRIS, E. C.; NOVELLI, V. M.; PERONI, L. A.; SILVA-PINHATI, A. C.; SOUZA, A. A.; STACH-MACHADO, D. R.; TAKITA, M. A.; TARGON, M. L. P. N.; REIS, M. da S. Expressed citrus sequence (CitEST) database in Brazil: features and tools. In: THE INTERNATIONAL CONFERENCE ON THE STATUS OF PLANT & ANIMAL GENOME RESEARCH, 16., 2008, San Diego. Final abstracts guide. San Diego: Illumina, 2008. W105| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 13. | | MACHADO, M. A.; SOUZA, A. A.; AMARAL, A. M.; TAKITA, M. A.; FREITAS-ÁSTUA, J.; CRISTOFANI-YALY, M.; BASTIANEL, M.; LOCALI-FABRIS, E. C.; COLETTA FILHO, H. D.; PINHATI, A. C. S.; CAMARGO, R. L. B.; KISHI, L. T.; TARGON, M. L. P. N. Genômica da interação de citros com patógenos. Tropical Plant Pathology, Brasília, DF, v. 34, ago. 2009. Suplemento. Edição dos Resumos do XLII Congresso Brasileiro de Fitopatologia, Rio de Janeiro, ago. 2009. Suplemento. Mesa redonda 9.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 14. | | MACHADO, M. A.; SOUZA, A. A.; AMARAL, A. M.; TAKITA, M. A.; FREITAS-ÁSTUA, J.; CRISTOFANI-YALY, M.; BASTIANEL, M.; LOCALI-FABRIS, E. C.; DELLA COLETTA FILHO, H.; PINHATI, A. C. S.; CAMARGO, R. L. B.; KISHI, L. T.; TARGON, M. L. P. N. Genômica da interação de citros com patógenos. Tropical Plant Pathology, Brasília, DF, v. 34, ago. 2009. Suplemento. Edição dos Resumos do XLII Congresso Brasileiro de Fitopatologia, Rio de Janeiro, ago. 2009. Suplemento. Mesa redonda 9.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 15. | | GIRARDI, E. A.; POMPEU JUNIOR, J.; TEÓFILO SOBRINHO, J.; SOARES FILHO, W. dos S.; PASSOS, O. S.; CRISTOFANI-YALY, M.; SEMPIONATO, O. R.; STUCHI, E. S.; DONADIO, L. C.; MATTOS JUNIOR, D. de; BASSANEZI, R. B.; GARCIA, L. A. P.; AYRES, A. J. Guia de reconhecimento dos citros em campo: Um guia prático para o reconhecimento em campo de variedades de laranjeira-doce e outras espécies de citros cultivadas no estado de São Paulo e Triângulo Mineiro. Araraquara : Fundecitrus, 2021. 158p. il.| Tipo: Autoria/Organização/Edição de Livros |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 16. | | PRADO, G. S.; ROCHA, D. C.; SANTOS, L. N. dos; CONTILIANI, D. F.; NOBILE, P. M.; MARTINATI-SCHENK, J. C.; PADILHA, L.; MALUF, M. P.; LUBINI, G.; PEREIRA, T. C.; MONTEIRO-VITORELLO, C. B.; CRESTE, S.; BOSCARIOL-CAMARGO, R. L.; TAKITA, M. A.; CRISTOFANI-YALY, M.; SOUZA, A. A. de. CRISPR technology towards genome editing of the perennial and semi-perennial crops citrus, coffee and sugarcane. Frontiers in Plant Science, v. 14, article 1331258, 2023.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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