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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Leite; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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Data corrente: |
06/11/2019 |
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Data da última atualização: |
06/02/2024 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
SILVA, A. A.; SILVA, D. A.; SILVA, F. F.; COSTA, C. N.; LOPES, P. S.; CAETANO, A. R.; THOMPSON, G.; CARVALHEIRA, J. |
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Afiliação: |
A. A. SILVA, UFV; D. A. SILVA, UFV; F. F. SILVA, UFV; CLAUDIO NAPOLIS COSTA, CNPGL; P. S. LOPES, UFV; ALEXANDRE RODRIGUES CAETANO, Cenargen; G. THOMPSON, CIBIO-INBIO, UNIVERSITY OF PORTO, PORTUGAL; J. CARVALHEIRA, CIBIO-INBIO, UNIVERSITY OF PORTO, PORTUGAL. |
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Título: |
Autoregressive single-step test-day model for genomic evaluations of Portuguese Holstein cattle. |
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Ano de publicação: |
2019 |
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Fonte/Imprenta: |
Journal of Dairy Science, v. 102, n. 7, p. 6330-6339, 2019. |
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DOI: |
10.3168/jds.2018-15191 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
The multiple-lactation autoregressive test-day (AR) model is the adopted model for the national genetic evaluation of dairy cattle in Portugal. Under this model, animals' permanent environment effects are assumed to follow a first-order autoregressive process over the long (auto-correlations between parities) and short (auto-correlations between test-days within lactation) terms. Given the relevance of genomic prediction in dairy cattle, it is essential to include marker information in national genetic evaluations. In this context, we aimed to evaluate the feasibility of applying the single-step genomic (G)BLUP to analyze milk yield using the AR model in Portuguese Holstein cattle. In total, 11,434,294 test-day records from the first 3 lactations collected between 1994 and 2017 and 1,071 genotyped bulls were used in this study. Rank correlations and differences in reliability among bulls were used to compare the performance of the traditional (A-AR) and single-step (H-AR) models. These 2 modeling approaches were also applied to reduced data sets with records truncated after 2012 (deleting daughters of tested bulls) to evaluate the predictive ability of the H-AR. Validation scenarios were proposed, taking into account young and proven bulls. Average EBV reliabilities, empirical reliabilities, and genetic trends predicted from the complete and reduced data sets were used to validate the genomic evaluation. Average EBV reliabilities for H-AR (A-AR) using the complete data set were 0.52 (0.16) and 0.72 (0.62) for genotyped bulls with no daughters and bulls with 1 to 9 daughters, respectively. These results showed an increase in EBV reliabilities of 0.10 to 0.36 when genomic information was included, corresponding to a reduction of up to 43% in prediction error variance. Considering the 3 validation scenarios, the inclusion of genomic information improved the average EBV reliability in the reduced data set, which ranged, on average, from 0.16 to 0.26, indicating an increase in the predictive ability. Similarly, empirical reliability increased by up to 0.08 between validation tests. The H-AR outperformed A-AR in terms of genetic trends when unproven genotyped bulls were included. The results suggest that the single-step GBLUP AR model is feasible and may be applied to national Portuguese genetic evaluations for milk yield. MenosThe multiple-lactation autoregressive test-day (AR) model is the adopted model for the national genetic evaluation of dairy cattle in Portugal. Under this model, animals' permanent environment effects are assumed to follow a first-order autoregressive process over the long (auto-correlations between parities) and short (auto-correlations between test-days within lactation) terms. Given the relevance of genomic prediction in dairy cattle, it is essential to include marker information in national genetic evaluations. In this context, we aimed to evaluate the feasibility of applying the single-step genomic (G)BLUP to analyze milk yield using the AR model in Portuguese Holstein cattle. In total, 11,434,294 test-day records from the first 3 lactations collected between 1994 and 2017 and 1,071 genotyped bulls were used in this study. Rank correlations and differences in reliability among bulls were used to compare the performance of the traditional (A-AR) and single-step (H-AR) models. These 2 modeling approaches were also applied to reduced data sets with records truncated after 2012 (deleting daughters of tested bulls) to evaluate the predictive ability of the H-AR. Validation scenarios were proposed, taking into account young and proven bulls. Average EBV reliabilities, empirical reliabilities, and genetic trends predicted from the complete and reduced data sets were used to validate the genomic evaluation. Average EBV reliabilities for H-AR (A-AR) using the complete data set w... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Autoregressive test-day model; Holstein cattle; Single-step genomic BLUP. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
LEADER 03130naa a2200253 a 4500
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Registro original: |
Embrapa Gado de Leite (CNPGL) |
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| 221. |  | LEITE, J. L. B.; CARVALHO, G. R.; RESENDE, J. C. de; ROCHA, D. T. da; DINIZ, F. H.; TEIXEIRA, S. R.; HOTT, M. C.; ANDRADE, R. G.; SIQUEIRA, K. B.; COSTA, C. N. Nota de conjuntura: Leite e derivados: março/2017. Intelactus, mar. 2017.| Tipo: Artigo de Divulgação na Mídia |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 222. | | OLIVEIRA, D. C. F.; BRUNELI, F. A. T.; COSTA, C. N.; PEIXOTO, M. G. C. D.; SANTOS, G. G. dos; FILHO, A. E. V; FARO, L. E.; BONAFÉ, C. M. Phenotypic correlations between longevity measure and age at first calving of dairy zebu cattle. In: INTERNATIONAL MEETING OF ADVANCES IN ANIMAL SCIENCE, 2016, Jaboticabal. [Proceedings...]. Jaboticabal: Unesp, 2016. 1| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 224. | | COSTA, C. N.; TEIXEIRA, N. M.; FREITAS, A. F. de; COBUCI, J. A.; VALLOTO, A. A.; RIBAS NETO, P. G.; BARRA, R. B.; CAMPOS, L. de S.; HAGUIHARA, K.; MARQUES, A. Sumário Nacional de Touros da Raça Holandesa - 2006. Juiz de Fora: Embrapa Gado de Leite, 2006. 67 p. (Embrapa Gado de Leite. Documentos, 110).| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 226. | | COSTA, C. N.; FREITAS, A. F. de; COBUCI, J. A.; GUIMARÃES, M. F. M.; VALLOTO, A. A.; RIBAS NETO, P. G.; HORST, J. A.; MENDONÇA JÚNIOR, C. F.; CAMPOS, L. de S.; MARQUES, A. Sumário Nacional de Touros da Raça Holandesa - 2008. Juiz de Fora: Embrapa Gado de Leite, 2008. 62 p. (Embrapa Gado de Leite. Documentos, 129).| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 227. | | COSTA, C. N.; FREITAS, A. F. de; COBUCI, J. A.; GUIMARÃES, M. F. M.; VALLOTO, A. A.; RIBAS NETO, P. G.; HORST, J. A.; MENDONÇA JÚNIOR, C. F.; CAMPOS, L. de S.; MARQUES, A.; SOUZA, M. A. de. Sumário Nacional de Touros da Raça Holandesa - 2009. Juiz de Fora: Embrapa Gado de Leite, 2009. 72 p. (Embrapa Gado de Leite. Documentos, 134).| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 228. | | ANDRADE, R. G.; GARCIA, L. C. S.; HOTT, M. C.; MAGALHAES JUNIOR, W. C. P. de; PEIXOTO, M. G. C. D.; COSTA, C. N.; PIRES, M. de F. A.; SANTANA JÚNIOR, M. L.; BRUNELI, F. A. T.; CARVALHO, G. R. Zoneamento dos efeitos do estresse térmico em vacas leiteiras no Sudeste do Brasil. Revista Contemporânea, v. 3, n. 12, p. 29977-29991, 2023.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
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| 229. | | SIQUEIRA, K. B.; COSTA, C. N.; ROCHA, D. T. da; CARVALHO, G. R.; STOCK, L. A.; RESENDE, J. C. de; LEITE, J. L. B.; HOTT, M. C.; MOREIRA, M. S. de P.; LANA, M. S.; ANDRADE, R. G.; OLIVEIRA, S. J. de M.; TEIXEIRA, S. R.; VALENTE, E.; SOARES, H. F.; LIMA, M. F.; GOMES, I. R.; TEIXERA, V. T.; RIBEIRO, V. de M. Leite e Derivados: fevereiro/2018. Intelactus, fev. 2018.| Tipo: Artigo de Divulgação na Mídia |
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| 230. | | VERNEQUE, R. da S.; LEMOS, A. DE M.; TEIXEIRA, N. M.; MACHADO, M. A.; MARTINEZ, M. L.; TEODORO, R. L.; DURÃES, M. C.; MIRANDA, J. E. C. de; COSTA, C. N.; FREITAS, A. F. DE; PEIXOTO, M. G. C. D.; BRUNELI, F. A. T.; SANTOS, G. G. dos; PANETTO, J. C. do C.; SILVA, M. V. G. B. Melhoramento genético animal. In: CAMPOS, O. F. de; MIRANDA, J. E. C. de (ed.). Gado de leite: o produtor pergunta, a Embrapa responde. 3. ed. rev. ampl. Brasília, DF: Embrapa; Juiz de Fora: Embrapa Gado de Leite, 2012. p. 185-211 (Coleção 500 perguntas 500 respostas).| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
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| 231. | | SILVA, M. V. G. B.; PAIVA, L. DE C.; CEMBRANELLI, M. DE A. R.; MARTINS, M. F.; RODRIGUES, W. B. R.; ARBEX, W. A.; BRUNELI, F. A. T.; PANETTO, J. C. do C.; COSTA, C. N.; SANTOS, G. G. dos; CARVALHO, B. C. de. Programa de mejoramiento genetico de la raza girolando - Sumário de toros - Resultado de la prueba de progenie - Julio 2012. Juiz de Fora: Embrapa Gado de Leite, 2012 51 p. (Embrapa Gado de Leite. Documentos, 157)| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 232. | | SILVA, M. V. G. B.; PAIVA, L. DE C.; CEMBRANELLI, M. DE A. R.; MARTINS, M. F.; FREITAS, A. F. DE; RODRIGUES, W. B. R.; BRUNELI, F. A. T.; ARBEX, W. A.; CANAZA-CAYO, A. W.; PANETTO, J. C. do C.; COSTA, C. N.; SANTOS, G. G. dos; CARVALHO, B. C. de; FERREIRA, M. B. D. Programa de melhoramento genético da raça girolando - Sumário de touros - Resultado do teste de progênie - julho 2012. Juiz de Fora: Embrapa Gado de Leite, 2012. 52 p. (Embrapa Gado de Leite. Documentos, 154).| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 233. | | SILVA, M. V. G. B.; FREITAS, A. F. de; PAIVA, L. de C.; MENEZES, C. R. A. de; COSTA, C. N.; GUIMARAES, M. F. M.; CAETANO, A. R.; PAIVA, S. R.; ARBEX, W. A.; JUNQUEIRA, A. N.; MOURA, L. F. de M.; AZEVEDO, A. A. Programa de melhoramento genético da raça Girolando: teste de progênie: Sumário de Touros 2010. Juiz de Fora: Embrapa Gado de Leite, 2010. 48 p. il. (Embrapa Gado de Leite. Documentos, 139).| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 234. | | CARVALHO, G. R.; COSTA, C. N.; ROCHA, D. T. da; DINIZ, F. H.; RESENDE, J. C. de; LEITE, J. L. B.; SIQUEIRA, K. B.; STOCK, L. A.; LANA, M. S.; HOTT, M. C.; MOREIRA, M. S. de P.; ANDRADE, R. G.; TEIXEIRA, S. R.; GOMES, I.; TOSTES, V.; MACEDO, V. Nota de Conjuntura: Leite e Derivados - Abril/2018. In: Intelactus| Tipo: Artigo de Divulgação na Mídia |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 235. | | ROCHA, D. T. da; DINIZ, F. H.; STOCK, L. A.; MOREIRA, M. S. de P.; RESENDE, J. C. de; HOTT, M. C.; ANDRADE, R. G.; COSTA, C. N.; SIQUEIRA, K. B.; RIBEIRO, V. de M.; TOSTES, V. T.; CARVALHO, G. R. Nota de conjuntura: Leite e Derivados - junho/2018. Intelactus - junho/2018.| Tipo: Artigo de Divulgação na Mídia |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 236. | | RESENDE, J. C. de; CARVALHO, G. R.; ROCHA, D. T. da; COSTA, C. N.; STOCK, L. A.; HOTT, M. C.; ANDRADE, R. G.; MAGALHAES JUNIOR, W. C. P. de; DINIZ, F. H.; CHAVES, D. O.; SIQUEIRA, P. H. M.; NARDY, V. P. D. Nota de Conjuntura: Leite e Derivados - Novembro/2019. Juiz de Fora, 12 nov. 2019. 1 p.| Tipo: Artigo de Divulgação na Mídia |
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| 237. | | COSTA, C. N.; FREITAS, A. F. de; COBUCI, J. A.; VALLOTO, A. A.; RIBAS NETO, P. G.; SILVA, M. V. G. B.; GUIMARÃES, M. F. M.; HORST, J. A.; MENDONÇA JÚNIOR, C. F.; CAMPOS, L. de S.; MARQUES, A.; SOUZA, M. A. de. Sumário Nacional de Touros da Raça Holandesa - 2010. Juiz de Fora: Embrapa Gado de Leite, 2010. 68 p. (Embrapa Gado de Leite. Documentos, 140).| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 238. | | COSTA, C. N.; COBUCI, J. A.; MARQUES, A.; RIBAS NETO, P. G.; VALLOTO, A. A.; HORST, J. A.; MENDONÇA JUNIOR, C. F. DE; OLIVEIRA, F. O. F.; BRUNELI, F. A. T.; PANETTO, J. C. do C.; CAMPOS, L. DE S.; RIGON, J. L.; PEREIRA, V. H. M.; SILVA, M. V. G. B.; MARTINS, M. F.; FREITAS, A. F. DE. Sumário Nacional de Touros da Raça Holandesa - 2012. Juiz de Fora: Embrapa Gado de Leite, 2012. 40 p. (Embrapa Gado de Leite. Documentos, 158).| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 239. | | COSTA, C. N.; COBUCI, J. A.; SANTOS, G. G. dos; MARQUES, A.; RIBAS NETO, P. G.; VALLOTO, A. A.; HORST, J. A.; MENDONÇA JUNIOR, C. F. DE; BRUNELI, F. A. T.; PANETTO, J. C. do C.; CAMPOS, L. DE S.; RIGON, J. L.; PEREIRA, V. H. M.; PEREIRA, I. B.; FREITAS, A. F. DE. Sumário Nacional de Touros da Raça Holandesa - 2013. Juiz de Fora: Embrapa Gado de Leite, 2013. 52 p. (Embrapa Gado de Leite. Documentos, 167).| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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