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1.Imagem marcado/desmarcadoCINTRA, L. C. Computational investigations in eukaryotes genome de novo assembly using short reads. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 7.; INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE IBEROAMERICAN SOCIETY FOR BIOINFORMATICS, 3., 2011, Florianópolis. Proceedings... Florianópolis: Associação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional, 2011. Não paginado. X-MEETING 2011.

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2.Imagem marcado/desmarcadoCINTRA, L. C. Instruções para uso do Open Grid Engine no Laboratório Multiusuário de Bioinformática. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2016. 26 p. il. (Embrapa informática Agropecuária. Documentos, 154).

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3.Imagem marcado/desmarcadoCINTRA, L. C. Sistemas de arquivos distribuídos em apoio ao processamento científico. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2017. 45 p. il. (Embrapa informática Agropecuária. Documentos, 151).

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4.Imagem marcado/desmarcadoCINTRA, L. C. Virtualização com o Xen: instalando e configurando o ambiente. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2010. 8 p. (Embrapa Informática Agropecuária. Comunicado Técnico, 102).

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5.Imagem marcado/desmarcadoCINTRA, L. C. Uma proposta para a virtualização de servidores utilizando Xen. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2011. 7 p. il. (Embrapa Informática Agropecuária. Comunicado técnico, 111).

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6.Imagem marcado/desmarcadoZERLOTINI NETO, A.; CINTRA, L. C. Análise de dados de RNA-Seq utilizando o Galaxy. Campinas: Embrapa informática Agropecuária, 2016. 36 p. il. (Embrapa informática Agropecuária. Documentos, 149).

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7.Imagem marcado/desmarcadoCINTRA, L. C.; GONZALEZ, C. A. L. Uso de nuvem pública para computação de alto desempenho. Campinas: Embrapa Agricultura Digital, 2022. 14 p. il. color. (Embrapa Agricultura Digital. Documentos, 188).

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8.Imagem marcado/desmarcadoCINTRA, L. C.; HONGO, J. A.; LOBO, F. P. Development of a computational pipeline to detect positive selection. In: INTERNATIONAL PLANT & ANIMAL GENOME, 20., 2012, San Diego. Abstracts... Jersey City: Scherago International, 2012. 1 pôster. PAG 2012. P1007.

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9.Imagem marcado/desmarcadoCINTRA, L. C.; NAKAI, A. M.; CORREA, J. L. Methods, procedures and techniques used in constructing AgroICT. In: MASSRUHÁ, S. M. F. S.; LEITE, M. A. de A.; LUCHIARI JUNIOR, A.; ROMANI, L. A. S. (Ed.). Information and communication technologies and their relations with agriculture. Brasília, DF: Embrapa, 2016. ch. 15, p. 287-294.

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10.Imagem marcado/desmarcadoCINTRA, L. C.; NAKAI, A. M.; CORREA, J. L. Métodos, procedimentos e técnicas utilizadas na construção de AgroTIC. In: MASSRUHÁ, S. M. F. S.; LEITE, M. A. de A.; LUCHIARI JUNIOR, A.; ROMANI, L. A. S. (Ed.). Tecnologias da informação e comunicação e suas relações com a agricultura. Brasília, DF: Embrapa, 2014. Cap. 15. p. 293-301.

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11.Imagem marcado/desmarcadoVAZ, G. J.; CORREA, J. L.; CINTRA, L. C.; FERREIRA, D. M.; PIEROZZI JUNIOR, I. Agropedia brasilis. Versão 1.0. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2012. 1 CD-ROM.

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12.Imagem marcado/desmarcadoHONGO, J. A.; CASTRO, G. M. de; CINTRA, L. C.; ZERLOTINI, A.; LOBO, F. P. POTION: an end-to-end pipeline for positive Darwinian selection detection in genome-scale data through phylogenetic comparison of protein-coding genes. BMC Genomics, London, v. 16, n. 1, 567, Aug. 2015.

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13.Imagem marcado/desmarcadoNAGAI, L. A. E.; SILVA, F. R.; CINTRA, L. C.; GIACHETTO, P. F.; ZERLOTINI NETO, A. Using Galaxy to facilitate RNA-Seq analysis. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 8., 2012, Campinas. Abstract book... Ribeirão Preto: AB3C, 2012. Não paginado. X-MEETING 2012.

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14.Imagem marcado/desmarcadoFELTRIM, D.; GUPTA, B.; GUNDIMEDA, S.; KIYOTA, E.; DOMINGUES JÚNIOR, A. P.; CINTRA, L. C.; MAZZAFERA, P. Exposure of Eucalyptus to varied temperature and CO2 has a profound effect on the physiology and expression of genes related to cell wall formation and remodeling. Tree Genetics & Genomes v. 18, n. 1, 3, Feb. 2022.

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15.Imagem marcado/desmarcadoPAIXÃO, R. V.; SILVA, G. F. da; CAETANO, A. R.; CINTRA, L. C.; VARELA, E. S.; O'SULLIVAN, F. L. A. Phylogenomic and expression analysis of Colossoma macropomum cyp19a1a and cyp19a1b and their non-classical role in tambaqui sex differentiation. Gene, v. 843, art. 146795, Nov. 2022.

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16.Imagem marcado/desmarcadoZERLOTINI NETO, A.; NHANI JÚNIOR, A.; VIEIRA, F. D.; CINTRA, L. C.; MUDADU, M. de A.; FALCÃO, P. R. K.; GIACHETTO, P. F. Applications of bioinformatics in agriculture. In: MASSRUHÁ, S. M. F. S.; LEITE, M. A. de A.; OLIVEIRA, S. R. de M.; MEIRA, C. A. A.; LUCHIARI JUNIOR, A.; BOLFE, E. L. (ed.). Digital agriculture: research, development and innovation in production chains. Brasília, DF: Embrapa, 2023. cap. 10, p. 179-194.

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17.Imagem marcado/desmarcadoZERLOTINI NETO, A.; NHANI JÚNIOR, A.; VIEIRA, F. D.; CINTRA, L. C.; MUDADU, M. de A.; FALCÃO, P. R. K.; GIACHETTO, P. F. Aplicações da bioinformática na agricultura. In: MASSRUHÁ, S. M. F. S.; LEITE, M. A. de A.; OLIVEIRA, S. R. de M.; MEIRA, C. A. A.; LUCHIARI JUNIOR, A.; BOLFE, E. L. (Ed.). Agricultura digital: pesquisa, desenvolvimento e inovação nas cadeias produtivas. Brasília, DF: Embrapa, 2020. cap. 10, p. 234-257.

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18.Imagem marcado/desmarcadoCINTRA, L. C.; ZERLOTINI, A.; SILVA, F. R. da; LOBO, F. P.; YAMAGISHI, M. E. B.; KUSER-FALCÃO, P. R. K.; GIACHETTO, P. F. Embrapa Bioinformatic Multi-user laboratory. In: INTERNATIONAL PLANT & ANIMAL GENOME, 21., 2013, San Diego. [Abstracts...]. [S.l.: s.n.], 2013. Não paginado. Pôster 1017.

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19.Imagem marcado/desmarcadoKUSER-FALCÃO, P. R.; YAMAGISHI, M. E. B.; GIACHETTO, P. F.; SILVA, F. R.; LOBO, F. P.; CINTRA, L. C.; ZERLOTINI, A.; HIGA, R.; VIEIRA, F. Embrapa Bioinformatics Multi-Users Laboratory - LMB. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 8., 2012, Campinas. Abstract book... Ribeirão Preto: AB3C, 2012. Não paginado. X-MEETING 2012.

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20.Imagem marcado/desmarcadoGUIMARÃES, P. S.; SCHENK, J. C. M.; CINTRA, L. C.; GIACHETTO, P. F.; SILVAROLLA, M. B.; PADILHA, L.; MALUF, M. P. Large-scale prospection of genes on caffeine-free Coffea arabica plants - discovery of novel markers associated with development and secondary metabolism. Plant Gene, v. 27, p. 1-9, Sept. 2021. Article 100314.

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1.Imagem marcado/desmarcadoPIRES, A. M. M.; MATTIAZZO, M. E.; BERTON, R. S. Ácidos orgânicos como extratores de metais pesados fitodisponíveis em solos tratados com lodo de esgoto. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 39, n. 7, p. 671-676, jul. 2004.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: Internacional - A
Biblioteca(s): Embrapa Meio Ambiente; Embrapa Unidades Centrais.
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2.Imagem marcado/desmarcadoSILVA, F. C. da; BOARETTO, A. E.; BERTON, R. S. Efeitos de aplicação lodo de esgoto da cana-de-açúcar e meio ambiente. Alcoolbrás, São Paulo, n. 133, p. 52-63, 2011.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: C - 0
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3.Imagem marcado/desmarcadoPIRES, A. M. M.; MATTIAZZO, M. E.; BERTON, R. S.; GUILHERME, L. R. G.; MARCHI, G. Extração de metais pesados fitodisponíveis em solos tratados com lodo de esgoto: uso de ácidos orgânicos. Jaguariúna: Embrapa Meio Ambiente, 2005. 5 p. (Embrapa Meio Ambiente. Comunicado Técnico, 28).
Biblioteca(s): Embrapa Meio Ambiente.
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4.Imagem marcado/desmarcadoSILVA, F. C. da; SANTOS, A. D. dos; BERTON, R. S. Gestão pública de resíduo sólido domiciliar orgânico no município: compostagem, agricultura e informática. In: MAGNONI JÚNIOR, L.; STEVENS, D.; SILVA, W. T. L. da; VALE, J. M. F. do; PURINI, S. R. de M.; MAGNONI, M. da G. M.; SEBASTIÃO, E.; BRANCO JÚNIOR, G.; ADORNO FILHO, E. F.; FIGUEIREDO, W. dos S.; SEBASTIÃO, I. (Org.). JC na Escola Ciência, Tecnologia e Sociedade: mobilizar o conhecimento para alimentar o Brasil. 2. ed. São Paulo: Centro Paula Souza, 2017. p. 111-139.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
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5.Imagem marcado/desmarcadoSILVA, F. C. da; SANTOS, A. D. dos; BERTON, R. S. Avaliação operacional de processos e socioambiental de unidades de reciclagem e compostagem de resíduo sólido domiciliar no estado de São Paulo. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2017. 72 p. il. (Embrapa informática Agropecuária. Documentos, 150).
Tipo: Documentos
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6.Imagem marcado/desmarcadoCARNIER, R.; BERTON, R. S.; COSCIONE, A. R.; PIRES, A. M. M.; CORBO, J. Z. F. Coffee silverskin and expired coffee powder used as organic fertilizers. Coffee Science, v. 14, n. 1, p. 24-32, 2019.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: B - 1
Biblioteca(s): Embrapa Meio Ambiente.
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7.Imagem marcado/desmarcadoSILVA, F. C. da; BERTON, R. S.; CHITOLINA, J. C.; BALLESTERO, S. D.; BARIONI, L. Establishment of recommendations and parameters for use of urban waste compost in agriculture in the State of Sao Paulo - Brazil. In: INTERNATIONAL ORBIT CONFERENCE, 7., 2010, Heraklion Crete. Organic resources in the carbon economy: proceedings. Thessaloniki, Greece: Grafima, 2010. p. 1246. Poster. Orbit 2010.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
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8.Imagem marcado/desmarcadoCARNIER, R.; BERTON, R. S.; COSCIONE, A. R.; PIRES, A. M. M.; CORBO, J. Z. F. Método da hidrólise ácida na disponibilidade de nitrogênio em resíduos orgânicos. Revista de Ciências Agrárias, v. 43, n. 3, p. 619-627, 2019.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: B - 1
Biblioteca(s): Embrapa Meio Ambiente.
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9.Imagem marcado/desmarcadoSILVA, F. C. da; BERTON, R. S.; CHITOLINA, J. C.; BALLESTERO, S. D. Recomendações técnicas para o uso agrícola do composto de lixo urbano no Estado de São Paulo. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2002. 17 p. (Embrapa Informática Agropecuária. Circular Técnica, 3).
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10.Imagem marcado/desmarcadoSILVA, F. C. da; COSTA, F. O. da; RODRIGUES, L. H.; BERTON, R. S. Sistema especialista para uso agrícola de composto de lixo urbano no Estado de São Paulo. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ENGENHARIA AGRÍCOLA, 32., 2003, Goiânia. Novas Fronteiras: o desafio de engenharia agrícola: [trabalhos apresentados]. Goiânia: SBEA, 2003. 5 p.
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11.Imagem marcado/desmarcadoSILVA, F. C. da; CHITOLINA, J. C.; BERTON, R. S.; BALESTEIRO, S. D. Uso do composto de lixo em cultivos energéticos no Estado de São Paulo. Alcoolbrás, São Paulo, n. 134, p. 40-54, 2011.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: C - 0
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12.Imagem marcado/desmarcadoSILVA, F. C. da; RODRIGUES, L. H. A.; SANTOS, A. D. dos; BERTON, R. S. Uso de compostos orgânicos: controle ambiental e informatização. In: SIMPÓSIO SOBRE COMPOSTAGEM, 1., 2004, Botucatu. Ciência e tecnologia: anais. Botucatu: Unesp-Faculdade de Ciências Agronômicas, 2004. 1 CD-ROM. SICOM 2004. Parte do CD-ROM (CD-2004.00062).
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13.Imagem marcado/desmarcadoSILVA, F. C. da; BOARETTO, A. E.; BERTON, R. S.; ZOTELLI, H. B.; PEXE, C. A.; BERNARDES, E. M. Efeito de lodo de esgoto na fertilidade de um argissolo vermelho-amarelo cultivado com cana-de-açúcar. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 36, n. 5, p. 831-840, maio 2001.
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Unidades Centrais.
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14.Imagem marcado/desmarcadoSILVA, F. C. da; BOARETTO, A. E.; BERTON, R. S.; ZOTELLI, H. B.; PEXE, C. A.; MENDONCA, E. Cana-de-açúcar cultivada em solo adubado com lodo de esgoto: nutrientes, metais pesados e produtividade. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 33, n. 1, p. 1-8, jan. 1998.
Biblioteca(s): Embrapa Solos; Embrapa Unidades Centrais.
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15.Imagem marcado/desmarcadoSILVA, F. C. da; COSTA, F. O. da; SANTOS, A. D. dos; RODRIGUES, L. H.; BERTON, R. S. Expert system for use of composed urban garbage in agriculture for the state of São Paulo, Brazil. In: BIOMASS AND ORGANIC WASTE AS SUSTAINABLE RESOURCES INTERNATIONAL CONFERENCE, 19., 2009, China. Conference summaries. China: ORBIT; China Agricultural University, 2009. Não paginado. ORBIT 2009.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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16.Imagem marcado/desmarcadoSILVA, F. C. da; BOARETTO, A. E.; ABREU JÚNIOR, C. H.; BERTON, R. S.; BASSO, L. C.; BARBIERI, V. Impactos da aplicação de lodo de esgoto na cultura da cana-de-açúcar e no ambiente. Holos Environment, Rio Claro, v. 10, n. 1, p. 62-82, 2010.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: B - 4
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17.Imagem marcado/desmarcadoRODRIGUES, G. A.; SANTOS, G. C. G.; SOARES, A. G.; JUNIOR, J. P. D.; ANDRADE, C. A. de; COSCIONE, A. R.; BERTON, R. S. Avaliação do biocarvão da cama de frango como fonte de fósforo para cultura do milho. In: CONGRESSO INTERINSTITUCIONAL DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 9., 2015, Campinas. Anais... Campinas: Instituto Agronômico (IAC), 2015. Nº 15113.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Meio Ambiente.
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18.Imagem marcado/desmarcadoSILVA, F. C. da; FANTE JUNIOR, L.; RODRIGUES, J. A.; PILOTTO, J. E.; BOARETTO, A. E.; OLIVEIRA, J. C. M. de; BERTON, R. S.; ZOTELLI, H. B. Efeitos do lodo de esgoto na distribuição radicular e nos teores de metais pesados em cana-de-açúcar. Rio de Janeiro: EMBRAPA-CNPS, 1997. 12 p. (EMBRAPA-CNPS. Pesquisa em andamento, 2).
Biblioteca(s): Embrapa Solos.
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19.Imagem marcado/desmarcadoSILVA, F. C. da; FANTE JR. L.; RODRIGUES, J. A.; PILOTTO, J. E.; BOARETTO, A. E.; OLIVEIRA, J. C. M. de; BERTON, R. S.; ZOTELLI, H. B. Efeitos do lodo de esgoto na fertilidade do solo e na distribuicao das raizes da cana-de-acucar (soqueira). In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIENCIA DO SOLO, 26., 1997. Rio de Janeiro, RJ. Resumos... Rio de Janeiro: Sociedade Brasileira de Ciencia do Solo, 1997. p.459.
Biblioteca(s): Embrapa Solos.
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20.Imagem marcado/desmarcadoSILVA, G. S. P. L. da; SILVA, F. C. da; ALVES, B. J. R.; TOMAZ, E.; BERTON, R. S.; MARCHIORI, L. F. S.; SILVEIRA, F. G. da. Efeitos da aplicação de vinhaça "in natura" ou concentrada associado ao N-fertilizante em soqueira de cana-de-açúcar e no ambiente. Holos Environment, Rio Claro, v. 9, n. 1, p. 1-21, 2019.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: B - 4
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