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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Florestas. |
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Data corrente: |
27/12/2012 |
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Data da última atualização: |
27/01/2016 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
CAVALCANTI, J. J. V.; RESENDE, M. D. V. de; SANTOS, F. H. C. dos; PINHEIROS, C. R. |
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Afiliação: |
JOSE JAIME VASCONCELOS CAVALCANTI, CNPA; MARCOS DEON VILELA DE RESENDE, CNPF; FRANCISCO HERBETH COSTA DOS SANTOS, Doutorando em Agronomia, Universidade Federal do Ceará; CÁSSIA RENATA PINHEIRO5, Bolsista nível superior, Embrapa Agroindústria Tropical. |
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Título: |
Prediçao simultânea dos efeitos de marcadores moleculares e seleção genômica ampla em cajueiro. |
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Ano de publicação: |
2012 |
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Fonte/Imprenta: |
Revista Brasileira de Fruticultura, Jaboticabal, v. 34, n. 3, p. 840-846, set. 2012. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
A seleção genômica ampla (genome wide selection - GWS) foi proposta como uma forma de aumentar a eficiência e acelerar o melhoramento genético, enfatizando a predição simultânea dos efeitos genéticos de grande número de marcadores genéticos de DNA dispersos em todo o genoma de um organismo, de forma a capturar os efeitos de todos os locos e explicar a variação genética de um caráter quantitativo. Objetivou-se com o presente trabalho aplicar o princípio da GWS no melhoramento do cajueiro, estimando simultaneamente os efeitos de 238 marcadores avaliados em 74 indivíduos de uma família de irmãos completos, visando a explicar grande porcentagem da variação genotípica total do caráter peso da amêndoa e a aumentar a eficiência do melhoramento do cajueiro. Verificou-se que a capacidade preditiva e a acurácia são praticamente maximizadas na análise com 70 marcadores de maiores efeitos. O aumento do número de marcadores não aumenta linearmente a acurácia da GWS pelo método RR-BLUP. Os 70 marcadores de maiores efeitos capturam 74% da variação genotípica total e propiciam alta acurácia seletiva (86%) da seleção para o peso de amêndoas, enquanto os cinco marcadores de maiores efeitos capturam apenas 19% da variação genotípica total e propiciam acurácia seletiva de apenas 44%. Assim, a seleção assistida (MAS), baseada em poucos (cinco) marcadores de efeitos significativos, propicia eficiência muito inferior à GWS. Os valores genéticos genômicos preditos na população de validação cruzada aproximam-se bem dos valores fenotípicos observados, com correlação de 0,79. A estimação simultânea dos efeitos dos marcadores, segundo o conceito da GWS, é uma alternativa interessante, visando a aumentar a eficiência do melhoramento do cajueiro. MenosA seleção genômica ampla (genome wide selection - GWS) foi proposta como uma forma de aumentar a eficiência e acelerar o melhoramento genético, enfatizando a predição simultânea dos efeitos genéticos de grande número de marcadores genéticos de DNA dispersos em todo o genoma de um organismo, de forma a capturar os efeitos de todos os locos e explicar a variação genética de um caráter quantitativo. Objetivou-se com o presente trabalho aplicar o princípio da GWS no melhoramento do cajueiro, estimando simultaneamente os efeitos de 238 marcadores avaliados em 74 indivíduos de uma família de irmãos completos, visando a explicar grande porcentagem da variação genotípica total do caráter peso da amêndoa e a aumentar a eficiência do melhoramento do cajueiro. Verificou-se que a capacidade preditiva e a acurácia são praticamente maximizadas na análise com 70 marcadores de maiores efeitos. O aumento do número de marcadores não aumenta linearmente a acurácia da GWS pelo método RR-BLUP. Os 70 marcadores de maiores efeitos capturam 74% da variação genotípica total e propiciam alta acurácia seletiva (86%) da seleção para o peso de amêndoas, enquanto os cinco marcadores de maiores efeitos capturam apenas 19% da variação genotípica total e propiciam acurácia seletiva de apenas 44%. Assim, a seleção assistida (MAS), baseada em poucos (cinco) marcadores de efeitos significativos, propicia eficiência muito inferior à GWS. Os valores genéticos genômicos preditos na população de validação cruzada ... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Melhoramento genético; Seleção genômica ampla. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/72825/1/Deon-RBF-Predicao.pdf
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Marc: |
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520 $aA seleção genômica ampla (genome wide selection - GWS) foi proposta como uma forma de aumentar a eficiência e acelerar o melhoramento genético, enfatizando a predição simultânea dos efeitos genéticos de grande número de marcadores genéticos de DNA dispersos em todo o genoma de um organismo, de forma a capturar os efeitos de todos os locos e explicar a variação genética de um caráter quantitativo. Objetivou-se com o presente trabalho aplicar o princípio da GWS no melhoramento do cajueiro, estimando simultaneamente os efeitos de 238 marcadores avaliados em 74 indivíduos de uma família de irmãos completos, visando a explicar grande porcentagem da variação genotípica total do caráter peso da amêndoa e a aumentar a eficiência do melhoramento do cajueiro. Verificou-se que a capacidade preditiva e a acurácia são praticamente maximizadas na análise com 70 marcadores de maiores efeitos. O aumento do número de marcadores não aumenta linearmente a acurácia da GWS pelo método RR-BLUP. Os 70 marcadores de maiores efeitos capturam 74% da variação genotípica total e propiciam alta acurácia seletiva (86%) da seleção para o peso de amêndoas, enquanto os cinco marcadores de maiores efeitos capturam apenas 19% da variação genotípica total e propiciam acurácia seletiva de apenas 44%. Assim, a seleção assistida (MAS), baseada em poucos (cinco) marcadores de efeitos significativos, propicia eficiência muito inferior à GWS. Os valores genéticos genômicos preditos na população de validação cruzada aproximam-se bem dos valores fenotípicos observados, com correlação de 0,79. A estimação simultânea dos efeitos dos marcadores, segundo o conceito da GWS, é uma alternativa interessante, visando a aumentar a eficiência do melhoramento do cajueiro.
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653 $aSeleção genômica ampla
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700 1 $aSANTOS, F. H. C. dos
700 1 $aPINHEIROS, C. R.
773 $tRevista Brasileira de Fruticultura, Jaboticabal$gv. 34, n. 3, p. 840-846, set. 2012.
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Registro original: |
Embrapa Florestas (CNPF) |
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| Registros recuperados : 146 | |
| 83. |  | MESQUITA, A. L. M.; CAVALCANTI, J. J. V.; BRAGA SOBRINHO, R.; CARDOSO, J. E.; MOTA, M. do S. C. de S. Comportamento alimentar e de vôo do escaravelho Hilarianus sp. (Coleoptera, Scarabaeidae) em plantios de cajueiro. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FRUTICULTURA, 21., 2010, Natal. Anais... Natal: Sociedade Brasileira de Fruticultura, 2010.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria Tropical. |
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| 84. | | CAVALCANTI, J. J. V.; VASCONCELOS, U. A. A.; VASCONCELOS, W. S.; SANTOS, R. C. dos; FARIAS, F. J. C.; ARAUJO, G. P. de; ASSUNCAO, J. H. de. Combining ability estimates for agronomic and morphological traits in cotton under water stress. IN: WORLD COTTON RESEARCH CONFERENCE, 6., 2016. Goiânia, Brazil. Proceedings... England, UK: Innovation in Textiles, 2016. p. 131-132.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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| 85. | | LIMA, E. N.; CAVALCANTI, J. J. V.; BORDALLO, P. do N.; PINHEIRO, C. R.; OLIVEIRA, F. I. C. de; SOUZA, Y. E. R. de. Estimativa de variabilidade genética em gravioleiras utilizando marcadores ISSR. In: ENCONTRO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA AGROINDÚSTRIA TROPICAL, 6., 2008, Fortaleza. Resumos... Fortaleza: Embrapa Agroindústria Tropical, 2008. p. 4| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria Tropical. |
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| 87. | | OLIVEIRA, F. I. C. de; SOUSA, T. R. M. de; CAVALCANTI, J. J. V.; VIDAL NETO, F. das C.; SANTOS, F. H. C. dos; CORDEIRO, E. R. Estimativa de parâmetros genéticos de progênies de cajueiro-anão para aspectos morfológicos no Estado do Ceará. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FRUTICULTURA, 21., 2010, Natal. Anais... Natal: Sociedade Brasileira de Fruticultura, 2010.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria Tropical. |
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| 88. | | CASTRO, A. C. R.; CAVALCANTI, J. J. V.; BORDALLO, P. N.; BARROS L. M.; SOBREIRA JÚNIOR, O. V.; OLIVEIRA, K. G. S. Recursos genéticos de caju: coleção Cerrados. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 2., 2008, Brasilia,DF. Resumos... Brasilia, DF: Embrapa Reursos Genéticos e Biotecnologia: FUNCREDI, 2008.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria Tropical. |
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| 89. | | PAIVA, J. R. de; CAVALCANTI, J. J. V.; BARROS, L. de M.; CRISÓSTOMO, J. R.; LIMA, A. C.; CARDOSO, J. E.; MESQUITA, A. L. M.; MOSCA, J. L. BRS 274 (BRS Jacaju): common or giant cashew clone. Crop Breeding and Applied Biotechnology, v.8, p.236-238, 2008| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Internacional - C |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria Tropical. |
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| 90. | | PAIVA, J. R. de; CAVALCANTI, J. J. V.; BARROS, L. de M.; CRISÓSTOMO, J. R.; LIMA, A. C.; CARDOSO, J. E.; MESQUITA, A. L. M.; MOSCA, J. L. BRS 275 (BRS Dão): hybrid clone of dwarf x common or giant cashew. Crop Breeding and Applied Biotechnology, v.8, p.245-247, 2008.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Internacional - C |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria Tropical. |
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| 91. | | SOUZA, M. F. de; MIRANDA, O. C.; PAIVA, J. R. de; BARROS, L. de M.; CORREA, M. C. de M.; CAVALCANTI, J. J. V.; MELO, D. S. BRS BAHIA 12: clone de cajueiro-anão precoce para plantio comercial no Município de Ribeira do Pombal, BA, e áreas similares. Fortaleza: Embrapa Agroindústria Tropical, 2004. 26 p. (Embrapa Agroindustria Tropical. Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento, 17).| Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria Tropical. |
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| 92. | | GONDIM, T. M. de S.; LIMA, L. M. de; SOARES, A. C. F. dos; LIMA, M. M. de A.; CAVALCANTI, J. J. V.; FREIRE, R. M. M. Coleção de germoplasma de sisal da Embrapa. Revista de Recursos Genéticos - RG News, v. 5, n. 2, p. 89, 2019. Resumos apresentado no SIMPÓSIO DA REDE DE RECURSOS GENÉTICOS VEGETAIS DO NORDESTE, 4., 2019, Areias. Anais...| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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| 93. | | SANTOS, F. H. C. dos; CAVALCANTI, J. J. V.; SILVA, F. P. da; LIMA, A. C.; SOUSA, T. R. M. de; CORDEIRO, E. R. Identificação de QTLs candidatos associados ao peso da amêndoa da castanha de caju. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FRUTICULTURA, 21., 2010, Natal. Anais... Natal: Sociedade Brasileira de Fruticultura, 2010.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria Tropical. |
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| 94. | | SOUZA, S. C. de; CAVALCANTI, J. J. V.; RAMOS, J. P. C.; ALVES, I.; SANTOS, R. C. dos; LIMA, L. M. de. Genetic divergence in Agave accessions through ISSR markers and phenotypic traits. African Journal of Agricultural Research, v. 13, n. 11, p. 526-533, Mar. 2018. Article number: 4C7CCF056288| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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| 96. | | FREIRE, R. M. M.; CAVALCANTI, J. J. V.; SILVA, C. R. C. S.; CARVALHO, J. M. F. C.; LIMA, L. M. de; SANTOS, R. C. dos. Investigação sobre a ocorrência de pleiotropismo no teor de óleo em eventos T2 de algodão CRY1IA. In: CONGRESSO BRASILEIRO DO ALGODÃO, 10., 2015, Foz do Iguaçu. Resumos. Brasília, DF: ABRAPA, 2015.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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| 97. | | TAVARES, T. M.; SIEBENEICHLER, S. C.; OLIVEIRA, F. N. de; NUNES, T. V.; CAVALCANTI, J. J. V.; GOMES, D. C.; SANTOS, D. P. da S.; VELOSO, R. A. Crescimento de cajueiro anão precoce nas condições edafoclimáticas do Estado do Tocantins. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FISIOLOGIA VEGETAL, 12., 2009, Fortaleza. Resumos... Fortaleza: Sociedade Brasileira de Fisiologia Vegetal, 2009.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 98. | | RAMOS, J. P. C.; SIZENANDO, C. I. T.; FREIRE, M. A. O.; CAVALCANTI, J. J. V.; LIMA, L. M. de; SANTOS, R. C. dos. Divergência genética em acessos de amendoim com base em descritores morfológicos, agronômicos e fisiológicos. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MAMONA, 6.; SIMPÓSIO INTERNACIONAL DE OLEAGINOSAS ENERGÉTICAS, 3., 2014, Fortaleza. Energia e segurança alimentar na agricultura familiar: anais. Campina Grande, PB: Embrapa Algodão, 2014. p. 199| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 100. | | PAIVA, J. R. de; BARROS, L. de M.; CRISÓSTOMO, J. R.; ARAUJO, J. P. P. de; ROSSETTI, A. G.; CAVALCANTI, J. J. V.; FELIPE, E. M. Depressão por endogamia em progênies de cajueiro anão precoce var. Nanum. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 33, n. 4, p. 425-431, abr. 1998 Título em inglês: Inbreeding depression in early dwarf type progenies of cashew var. Nanum.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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