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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Amazônia Ocidental. |
Data corrente: |
06/03/2023 |
Data da última atualização: |
01/09/2023 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
CASTRO, G. S.; SOUZA, T. F.; SILVA, G. F. da; PEDROSO, R. C. N.; MENEZES, K. S.; SOARES, M. A.; DIAS, G. M.; SANTOS, A. O.; YAMAGISHI, M. E. B.; FARIA, J. V.; JANUÁRIO, A. H.; KOOLEN, H. H. F. |
Afiliação: |
GLEUCINEI S. CASTRO, UNIVERSIDADE DO ESTADO DO AMAZONAS; THIAGO F. SOUSA, UNIVERSIDADE FEDERAL DO AMAZONAS; GILVAN FERREIRA DA SILVA, CPAA; RITA C. N. PEDROSO, UNIVERSIDADE DE FRANCA; KELLY S. MENEZES, UNIVERSIDADE DO ESTADO DO AMAZONAS; MARCOS A. SOARES, UNIVERSIDADE FEDERAL DE MATO GROSSO; GUSTAVO M. DIAS, UNIVERSIDADE FEDERAL DO ABC; ALINE O. SANTOS, UNIVERSIDADE DO ESTADO DO AMAZONAS; MICHEL EDUARDO BELEZA YAMAGISHI, CNPTIA; JÉSSICA V. FARIA, UNIVERSIDADE DO ESTADO DO AMAZONAS; ANA H. JANUÁRIO, UNIVERSIDADE DE FRANCA; HECTOR H. F. KOOLEN, UNIVERSIDADE DO ESTADO DO AMAZONAS. |
Título: |
Characterization of peptaibols produced by a marine strain of the fungus Trichoderma endophyticum via Mass Spectrometry, genome mining and phylogeny-based prediction. |
Ano de publicação: |
2023 |
Fonte/Imprenta: |
Metabolites, v. 13, n. 2, 221, Feb. 2023. |
DOI: |
https://doi.org/10.3390/metabo13020221 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
Abstract. Trichoderma is recognized as a prolific producer of nonribosomal peptides (NRPs) known as peptaibols, which have remarkable biological properties, such as antimicrobial and anticancer activities, as well as the ability to promote systemic resistance in plants against pathogens. In this study, the sequencing of 11-, 14- and 15-res peptaibols produced by a marine strain of Trichoderma isolated from the ascidian Botrylloides giganteus was performed via liquid chromatography coupled to high-resolution tandem mass spectrometry (LC-MS/MS). Identification, based on multilocus phylogeny, revealed that our isolate belongs to the species T. endophyticum, which has never been reported in marine environments. Through genome sequencing and genome mining, 53 biosynthetic gene clusters (BGCs) were identified as being related to bioactive natural products, including two NRP-synthetases: one responsible for the biosynthesis of 11- and 14-res peptaibols, and another for the biosynthesis of 15-res. Substrate prediction, based on phylogeny of the adenylation domains in combination with molecular networking, permitted extensive annotation of the mass spectra related to two new series of 15-res peptaibols, which are referred to herein as "endophytins". The analyses of synteny revealed that the origin of the 15-module peptaibol synthetase is related to 18, 19 and 20-module peptaibol synthetases, and suggests that the loss of modules may be a mechanism used by Trichoderma species for peptaibol diversification. This study demonstrates the importance of combining genome mining techniques, mass spectrometry analysis and molecular networks for the discovery of new natural products. MenosAbstract. Trichoderma is recognized as a prolific producer of nonribosomal peptides (NRPs) known as peptaibols, which have remarkable biological properties, such as antimicrobial and anticancer activities, as well as the ability to promote systemic resistance in plants against pathogens. In this study, the sequencing of 11-, 14- and 15-res peptaibols produced by a marine strain of Trichoderma isolated from the ascidian Botrylloides giganteus was performed via liquid chromatography coupled to high-resolution tandem mass spectrometry (LC-MS/MS). Identification, based on multilocus phylogeny, revealed that our isolate belongs to the species T. endophyticum, which has never been reported in marine environments. Through genome sequencing and genome mining, 53 biosynthetic gene clusters (BGCs) were identified as being related to bioactive natural products, including two NRP-synthetases: one responsible for the biosynthesis of 11- and 14-res peptaibols, and another for the biosynthesis of 15-res. Substrate prediction, based on phylogeny of the adenylation domains in combination with molecular networking, permitted extensive annotation of the mass spectra related to two new series of 15-res peptaibols, which are referred to herein as "endophytins". The analyses of synteny revealed that the origin of the 15-module peptaibol synthetase is related to 18, 19 and 20-module peptaibol synthetases, and suggests that the loss of modules may be a mechanism used by Trichoderma species for pept... Mostrar Tudo |
Palavras-Chave: |
De novo sequencing; Fungo marinho; Marine fungus; Molecular networking; Nonribosomal peptides; Peptídeos não ribossomais; Rede molecular; Synteny analysis; Tricoderma. |
Thesagro: |
Peptídeo. |
Thesaurus Nal: |
Hypocreaceae. |
Categoria do assunto: |
-- |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1152102/1/metabolites-13-00221-v2.pdf
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Marc: |
LEADER 02911naa a2200397 a 4500 001 2152102 005 2023-09-01 008 2023 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $ahttps://doi.org/10.3390/metabo13020221$2DOI 100 1 $aCASTRO, G. S. 245 $aCharacterization of peptaibols produced by a marine strain of the fungus Trichoderma endophyticum via Mass Spectrometry, genome mining and phylogeny-based prediction.$h[electronic resource] 260 $c2023 520 $aAbstract. Trichoderma is recognized as a prolific producer of nonribosomal peptides (NRPs) known as peptaibols, which have remarkable biological properties, such as antimicrobial and anticancer activities, as well as the ability to promote systemic resistance in plants against pathogens. In this study, the sequencing of 11-, 14- and 15-res peptaibols produced by a marine strain of Trichoderma isolated from the ascidian Botrylloides giganteus was performed via liquid chromatography coupled to high-resolution tandem mass spectrometry (LC-MS/MS). Identification, based on multilocus phylogeny, revealed that our isolate belongs to the species T. endophyticum, which has never been reported in marine environments. Through genome sequencing and genome mining, 53 biosynthetic gene clusters (BGCs) were identified as being related to bioactive natural products, including two NRP-synthetases: one responsible for the biosynthesis of 11- and 14-res peptaibols, and another for the biosynthesis of 15-res. Substrate prediction, based on phylogeny of the adenylation domains in combination with molecular networking, permitted extensive annotation of the mass spectra related to two new series of 15-res peptaibols, which are referred to herein as "endophytins". The analyses of synteny revealed that the origin of the 15-module peptaibol synthetase is related to 18, 19 and 20-module peptaibol synthetases, and suggests that the loss of modules may be a mechanism used by Trichoderma species for peptaibol diversification. This study demonstrates the importance of combining genome mining techniques, mass spectrometry analysis and molecular networks for the discovery of new natural products. 650 $aHypocreaceae 650 $aPeptídeo 653 $aDe novo sequencing 653 $aFungo marinho 653 $aMarine fungus 653 $aMolecular networking 653 $aNonribosomal peptides 653 $aPeptídeos não ribossomais 653 $aRede molecular 653 $aSynteny analysis 653 $aTricoderma 700 1 $aSOUZA, T. F. 700 1 $aSILVA, G. F. da 700 1 $aPEDROSO, R. C. N. 700 1 $aMENEZES, K. S. 700 1 $aSOARES, M. A. 700 1 $aDIAS, G. M. 700 1 $aSANTOS, A. O. 700 1 $aYAMAGISHI, M. E. B. 700 1 $aFARIA, J. V. 700 1 $aJANUÁRIO, A. H. 700 1 $aKOOLEN, H. H. F. 773 $tMetabolites$gv. 13, n. 2, 221, Feb. 2023.
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Registro original: |
Embrapa Amazônia Ocidental (CPAA) |
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Registros recuperados : 120 | |
101. | | SOUZA, J. R. DE; MAGALHÃES, R. S.; RIBEIRO, B. N.; MINGOTTE, F. L. C.; CASTRO, G. S. A.; GUERRA, J. G. M.; ESPINDOLA, J. A. A. Desempenho agronômico da batata-doce em sucessão a milho e crotalaria inoculados com fungos micorrízicos. Science and Technology Innovation in Agronomy, Bebedouro, v.3, n.1, p. 106-114, dez. 2019. p. 106- 114.Tipo: Artigo em Periódico Indexado |
Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia; Embrapa Territorial. |
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102. | | MIRANDA, E. E. de; CARVALHO, C. A. de; OSHIRO, O. T.; MARTINHO, P. R. R.; MAGALHÃES, L. A.; CASTRO, G. S. A. Number, maps and facts: Agriculture leads environmental preservation. In: INTERNATIONAL CONFERENCE ON AGRO BIG DATA AND DECISION SUPPORT SYSTEMS IN AGRICULTURE, 2017, Montevideo. Proceedings... Montevideo: Universitat de Lleida; Universidad de la República Uruguay, 2017. p. 175-178.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Territorial. |
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103. | | SORATTO, R. P.; CRUSCIOL, C. A. C.; CAMPOS, M. DE; COSTA, C. H. M. DA; GILABEL, A. P.; CASTRO, G. S. A.; FERRARI NETO, J. Silicate rocks as an alternative potassium fertilizer for upland rice and common bean crops. Pesquisa Agropecuária Brasileira, v. 56, e01411, 2021.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
Biblioteca(s): Embrapa Territorial; Embrapa Unidades Centrais. |
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104. | | TOLEDO, M. Z.; CASTRO, G. S. A.; CRUSCIOL, C. A. C.; SORATTO, R. P.; CAVARIANI, C.; ISHIZUKA, M. S; PICOLI, L. B. Silicon leaf application and physiological quality of white oat and wheat seeds. Semina. Ciências Agrárias, Londrina, v. 33, n. 5, p. 1693-1702, set./out. 2012.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Amapá. |
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105. | | CRUSCIOL, C. A. C.; MARQUES, R. A.; CARMEIS FILHO, A. C. A.; SORATTO, R. P.; COSTA, C. H. M.; FERRARI NETO, F.; CASTRO, G. S. A.; PARIZ, C. M.; CASTILHOS, A. M DE. Annual crop rotation of tropical pastures with no-till soil as affectedby lime surface application. European Journal of Agronomy, v. 80, p. 88?104, oct. 2016.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Territorial. |
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106. | | FURTADO, A. L. dos S.; CARVALHO, C. A. de; PINTO, D. M.; CASTRO, G. S. A.; MAGALHÃES, L. A.; MANGABEIRA, J. A. de C.; JARDINE, J. G.; TOSTO, S. G. Aplicação do software M-MacBeth para avaliar o impacto institucional da delimitação e caracterização territorial do Matopiba. Campinas: Embrapa Monitoramento por Satélite, 2017. (Embrapa Monitoramento por Satélite. Documentos, 119)Biblioteca(s): Embrapa Territorial. |
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107. | | CASTRO, G. S.; SOUZA, T. F.; SILVA, G. F. da; PEDROSO, R. C. N.; MENEZES, K. S.; SOARES, M. A.; DIAS, G. M.; SANTOS, A. O.; YAMAGISHI, M. E. B.; FARIA, J. V.; JANUÁRIO, A. H.; KOOLEN, H. H. F. Characterization of peptaibols produced by a marine strain of the fungus Trichoderma endophyticum via Mass Spectrometry, genome mining and phylogeny-based prediction. Metabolites, v. 13, n. 2, 221, Feb. 2023.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 3 |
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Amazônia Ocidental. |
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108. | | CRUSCIOL, C. A. C.; MARQUES, R. R.; CARMEIS FILHO, A. C. A.; SORATTO, R. P.; COSTA, C. H. M.; FERRARI NETO, J.; CASTRO, G. S. A.; PARIZ, C. M.; CASTILHOS, A. M.; FRANZLUEBBERS, A. J. Lime and gypsum combination improves crop and forage yields and estimated meat production and revenue in a variable charge tropical soil. Nutrient Cycling in Agroecosystems, v. 115, n. 312, p. 1-26, 2019.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
Biblioteca(s): Embrapa Territorial. |
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109. | | PINTO, D. M.; OLIVEIRA, P. de; MINITTI, A. F.; MENDES, A. M.; VILELA, G. F.; CASTRO, G. S. A.; NOGUEIRA JUNIOR, L. R.; BOGIANI, J. C.; ROCHA, J. D.; NOVAES, R. M. L.; BARROS, I. de; RODRIGUES, G. S. Impact assessment of information and communication technologies in agriculture: application of the Ambitec-TICs method. Journal of Technology Management and Innovation, v. 16, n. 2, p. 91-101, 2021.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Gado de Leite; Embrapa Meio Ambiente; Embrapa Territorial. |
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110. | | PINTO, D. M.; FURTADO, A. L. dos S.; CASTRO, G. S. A.; VILELA, G. F.; MENDES, A. M.; TOSTO, S. G.; MANGABEIRA, J. A. de C.; BERTIN, P. R. B.; SIMÕES, M.; FIDALGO, E. C. C.; DOMPIERI, M. H. G.; DRUCKER, D. P.; CUSTODIO, D. de O.; RASCHE, F.; VICTORIA, D. de C. Implantação da gestão de dados espaciais na Embrapa: processo, ferramenta e perspectiva do usuário. In: CONFERÊNCIA LUSO-BRASILEIRA SOBRE ACESSO ABERTO, 9., 2018, Lisboa. Anais... Lisboa: ISCTE-IUL, 2018.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Solos. |
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111. | | PINTO, D. M.; FURTADO, A. L. dos S.; CASTRO, G. S. A.; VILELA, G. F.; MENDES, A. M.; TOSTO, S. G.; MANGABEIRA, J. A. de C.; BERTIN, P. R. B.; SIMÕES, M.; FIDALGO, E. C. C.; DOMPIERI, M. H. G.; DRUCKER, D. P.; CUSTODIO, D. de O.; RASCHE, F.; VICTORIA, D. de C. Implantação da gestão de dados espaciais na Embrapa: processo, ferramenta e perspectiva do usuário. In: CONFERÊNCIA LUSO-BRASILEIRA SOBRE ACESSO ABERTO, 9., 2018, Lisboa. Anais... Lisboa: ISCTE-IUL, 2018. 5 p.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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112. | | PINTO, D. M.; RODRIGUES, G. S.; CASTRO, G. S. A.; VILELA, G. F.; MENDES, A. M.; NOGUEIRA JUNIOR, L. R.; BOGIANI, J. C.; ROCHA, J. D.; BERTIN, P. R. B.; DRUCKER, D. P.; SIMÕES, M.; ESQUERDO, J. C. D. M.; CUSTODIO, D. de O.; RASCHE, F.; DART, R. de O. GeoInfo: impactos sociais do repositório de dados de pesquisa da Embrapa. In: CONFERÊNCIA LUSO-BRASILEIRA CIÊNCIA ABERTA, 11., 2020, Braga, Portugal. Anais... Braga: Universidade do Minho, 2020. 4 p. Confoa 2020.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Solos. |
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113. | | PINTO, D. M.; RODRIGUES, G. S.; CASTRO, G. S. A.; VILELA, G. F.; MENDES, A. M.; NOGUEIRA JUNIOR, L. R.; BOGIANI, J. C.; ROCHA, J. D.; BERTIN, P. R. B.; DRUCKER, D. P.; SIMÕES, M.; ESQUERDO, J. C. D. M.; CUSTODIO, D. de O.; RASCHE, F.; DART, R. de O. GeoInfo: impactos sociais do repositório de dados de pesquisa da Embrapa. In: CONFERÊNCIA LUSO-BRASILEIRA CIÊNCIA ABERTA, 11., 2020, Braga, Portugal. Anais... Braga: Universidade do Minho, 2020. 4 p.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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114. | | PINTO, D. M.; RODRIGUES, G. S.; CASTRO, G. S. A.; VILELA, G. F.; MENDES, A. M.; NOGUEIRA JUNIOR, L. R.; BOGIANI, J. C.; ROCHA, J. D.; BERTIN, P. R. B.; DRUCKER, D. P.; SIMÕES, M.; ESQUERDO, J. C. D. M.; CUSTODIO, D. de O.; RASCHE, F.; DART, R. de O. GeoInfo: impactos sociais do repositório de dados de pesquisa da Embrapa. In: CONFERÊNCIA LUSO-BRASILEIRA CIÊNCIA ABERTA, 11., 2020, Braga, Portugal. Anais... Braga: Universidade do Minho, 2020. 4 p.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Territorial. |
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115. | | PINTO, D. M.; RODRIGUES, G. S.; CASTRO, G. S. A.; VILELA, G. F.; MENDES, A. M.; NOGUEIRA JUNIOR, L. R.; BOGIANI, J. C.; ROCHA, J. D.; BERTIN, P. R. B.; DRUCKER, D. P.; SIMÕES, M.; ESQUERDO, J. C. D. M.; CUSTODIO, D. de O.; RASCHE, F.; DART, R. de O.; CAMPOS, G. A. DE. GEOINFO: impactos sociais do repositório de dados de pesquisa da EMBRAPA. Páginas a&b: arquivos e biblioteca, p. 145-149, 2021. Série 3. Número especial da 11ª Conferência Luso-Brasileira de Ciência Aberta, Braga, out. 2020.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 4 |
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Meio Ambiente; Embrapa Solos; Embrapa Territorial. |
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116. | | VENTURIERI, A.; SILVA, L. G. T.; VALENTE, M. A.; SILVA, R. de N. P. da; GIBSON, V. M.; FERNANDES, A. V.; MELEM JUNIOR, N. J.; RABELO, B. V.; ARAUJO, D. M. de F.; CASTRO, G. S. A.; ALVES, L. W. R.; GUSMÃO, L. H. A. Mapeamento de solos e aptidão agrícola das terras do Cerrado Amapaense, realizado em escala de reconhecimento de alta intensidade, como subsídio ao MacroZEE. Belém, PA: Embrapa Amazônia Oriental, 2017. 48 p. (Embrapa Amazônia Oriental. Documentos, 429). Anexo 1 CD-ROM.Biblioteca(s): Embrapa Amapá; Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Territorial. |
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117. | | ROCHA, J. D.; MONTEIRO, J. E. B. de A.; BRAGA, R. M.; CASTRO, G. S. A.; CARVALHO, C. A. de; STEINMETZ, R. L. R.; GAMBETTA, R.; BARROSO, P. A. V.; MARAFON, A. C.; MAY, A.; MACHADO, J. C.; VILARINHO, A. A.; MIRANDA, R. A. de; OTENIO, M. H.; ROCHA, J. R. DO A. S. DE C.; ASSIS, E. E. R. DE. Panorama para geração de energia por fermentação de gramíneas em Roraima. Campinas: Embrapa Territorial, 2019. 39 p. (Embrapa Territorial. Documentos, 129).Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Meio Ambiente; Embrapa Milho e Sorgo; Embrapa Roraima; Embrapa Suínos e Aves; Embrapa Tabuleiros Costeiros; Embrapa Territorial. |
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118. | | ROCHA, J. D.; MONTEIRO, J. E. B. de A.; BRAGA, R. M.; CASTRO, G. S. A.; CARVALHO, C. A. de; STEINMETZ, R. L. R.; GAMBETTA, R.; BARROSO, P. A. V.; MARAFON, A. C.; MAY, A.; MACHADO, J. C.; VILARINHO, A. A.; MIRANDA, R. A. de; OTENIO, M. H.; ROCHA, J. R. DO A. S. DE C.; ASSIS, E. E. R. DE. Panorama para geração de energia por fermentação de gramíneas em Roraima. Campinas: Embrapa Territorial, 2019 39 p. (Embrapa Territorial. Documentos, 129).Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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119. | | SOUSA, T. F.; REÇA, B. N. P. V.; CASTRO, G. S.; SILVA, I. J. S. da; CANIATO, F. F.; JÚNIOR, M. B. de A.; YAMAGISHI, M. E. B.; KOOLEN, H. H. F.; BATAGLION, G. A.; HANADA, R. E.; SILVA, G. F. da. Trichoderma agriamazonicum sp. nov. (Hypocreaceae), a new ally in the control of phytopathogens. Microbiological Research, v. 275, 127469, Oct. 2023.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Amazônia Ocidental. |
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120. | | PINTO, D. M.; OLIVEIRA, P. de; MINITTI, A. F.; MENDES, A. M.; VILELA, G. F.; CASTRO, G. S. A.; ROCHA, J. D.; BOGIANI, J. C.; NOGUEIRA JUNIOR, L. R.; COSTA, C. C. da; NOVAES, R. M. L.; JESUS, I. R. D. de; FAE, V. A.; EDUARDO, M. de P.; FOSCHINI, M. M.; ALENCAR, J. R. DE; CRUZ, M. C. D.; GARCIA, E. P. DE. A.; JARDINE, J. G.; RODRIGUES, G. S. Ambitec-TICs: avaliação de impactos de tecnologias de informação e comunicação aplicadas à agropecuária. Campinas: Embrapa Territorial, 2020. 31 p. (Embrapa Territorial. Documentos, 131)Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Instrumentação; Embrapa Meio Ambiente; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia; Embrapa Solos; Embrapa Territorial. |
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