Data/hora: 22/06/2024 01:07:42

Biblioteca(s): | Embrapa Mandioca e Fruticultura.
Data corrente: | 26/10/2009
Data da última atualização: | 17/12/2009
Autoria: | FERREIRA, C. F.; SANTOS, C. M. R.; CASSIANO, L. P.; COELHO, M. C. F.; TOGAWA, R. C.; MARTINS, N. F.; SOUZA JUNIOR, M. T.
Afiliação: | Cláudia Fortes Ferreira, CNPMF; Candice Mello Romero Santos, CENARGEN; Lizangela Pinheiro Cassiano, CENARGEN; Marly Catarina Felipe Coelho, CENARGEN; Roberto Coiti Togawa, CENARGEN; Natalia Florêncio Martins, CENARGEN; Manoel Teixeira Souza Júnior, Embrapa LABEX Europa.
Título: | Identificação de "EST-derived SSRs" em banco de dados de transcriptoma de Musa balbisiana var. Pisang Klutuk Wulung.
Ano de publicação: | 2009
Fonte/Imprenta: | In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 5., 2009, Guarapari. O melhoramento e os novos cenários da agricultura: anais. Vitória: Incaper, 2009. 1 CD-ROM.
Idioma: | Português
Notas: | pdf 1894
Conteúdo: | Raízes e folhas de plantas de banana (Musa spp.) da variedade PKW (BB), produzidas em cultivo hidropônico, foram utilizadas para a construção de duas bibliotecas de cDNA. O sequenciamento dos clones de cDNA, seguido de trimagem e montagem dos ESTs de alta qualidade pelo CAP3, resultou em 2.967 MbAES (Musa balbisiana Assembled EST Sequences), sendo 435 contigs e 2.532 singletons. Aproximadamente 38% dos MbAES foram do tipo "no hits" após BLASTx contra vários bancos de dados públicos. As seqüências de EST alinhadas foram classificadas em 23 categorias diferentes de acordo com funções protéicas putativas (KOG), com graus de similaridade variando de 35-60%. Os ESTs gerados também foram investigados quanto à existência e abundância de SSRs, tendo sido identificados 53 "EST-derived SSRs".
Thesagro: | Banana; Clone; Gene Marcador; Melhoramento Genético Vegetal.
Categoria do assunto: | --
Registro original: | Embrapa Mandioca e Fruticultura (CNPMF)