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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Unidades Centrais. |
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Data corrente: |
02/04/2004 |
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Data da última atualização: |
04/09/2006 |
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Autoria: |
CARVALHO, L. de F. S. |
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Título: |
BLOOM-BLAST object Oriented Management: uma solução integrada para gerenciamento dos resultados do BLAST por meio de um paradigma orientado a objetos. |
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Ano de publicação: |
2002 |
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Fonte/Imprenta: |
2002 . |
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Páginas: |
203 f. |
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Idioma: |
Português |
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Notas: |
Pós Graduação (Pesquisa Mestrado em Gestão do Conhecimento e da Tecnologia da Informação)) - Universidade Católica de Brasília - Brasília-DF |
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Conteúdo: |
Considerada uma disciplina especial desde o início dos anos 80, a bioinformática
pode ser definida como uma modalidade que abrange todos os aspectos de
aquisição, processamento, armazenamento, distribuição, análise e interpretação da
informação biológica. Tudo ocorre numa estreita sinergia com o paradigma
fundamental da biologia molecular, a qual postula que a informação genética está
armazenada nas seqüências de DNA. Após a iniciativa pública do Projeto do Genoma Humano, iniciado em 1990 e com prazo previsto para ser completado em 2005, tem havido crescimento extraordinário do volume de seqüências de nucleotídeos e de aminoácidos disponível em bancos de dados. Para que se converta em efetivo benefício na medicina, na biotecnologia, na agronomia e em diversas outras áreas, toda essa informação genética precisa ser processada, comparada e analisada, o que constitui novos desafios para bioinformática, matemática e estatística: integrar e disponibilizar esses dados por meio de ferramentas amigáveis que permitam a mineração eficiente de informações pelos especialistas, mesmo aqueles pouco afeitos a computadores e a biologia molecular. A proposta desta pesquisa é integrar o maior número possível de serviços de análise de seqüências, encapsulando-os em um único aplicativo de interface gráfica interativa. Inicialmente estão sendo considerados quatro serviços, a saber: alinhamento pairwise, alinhamento múltiplo, predição de estrutura secundária de proteína e derivação de árvore filogenética. Com isso, pretende-se tornar a análise genômica mais acessível, eficiente e simplificada, o que permitirá aos pesquisadores concentrarem-se principalmente na interpretação biológica dos resultados.
Quanto à bioinformática, os resultados obtidos nesta pesquisa permitem concluir
que o aplicativo em desenvolvimento vem possibilitando aos pesquisadores da Rede
Biofoco: melhor gerenciamento, organização e disponibilização das informações
genômicas; e uso desse como ferramenta de datamining, auxiliando na visualização e
exploração das informações que trafegam como entrada ou saída entre as diversas
ferramentas integradas. Quanto à informática, alguns dos principais ganhos são:
validação e emprego de orientação a objetos, CORBA, UML e RUP no
desenvolvimento de uma ferramenta para uso científico; integração com utilitários
externos e com os sistemas Anotação e Genoma; e reuso da arquitetura empregada
no sistema Genoma. MenosConsiderada uma disciplina especial desde o início dos anos 80, a bioinformática
pode ser definida como uma modalidade que abrange todos os aspectos de
aquisição, processamento, armazenamento, distribuição, análise e interpretação da
informação biológica. Tudo ocorre numa estreita sinergia com o paradigma
fundamental da biologia molecular, a qual postula que a informação genética está
armazenada nas seqüências de DNA. Após a iniciativa pública do Projeto do Genoma Humano, iniciado em 1990 e com prazo previsto para ser completado em 2005, tem havido crescimento extraordinário do volume de seqüências de nucleotídeos e de aminoácidos disponível em bancos de dados. Para que se converta em efetivo benefício na medicina, na biotecnologia, na agronomia e em diversas outras áreas, toda essa informação genética precisa ser processada, comparada e analisada, o que constitui novos desafios para bioinformática, matemática e estatística: integrar e disponibilizar esses dados por meio de ferramentas amigáveis que permitam a mineração eficiente de informações pelos especialistas, mesmo aqueles pouco afeitos a computadores e a biologia molecular. A proposta desta pesquisa é integrar o maior número possível de serviços de análise de seqüências, encapsulando-os em um único aplicativo de interface gráfica interativa. Inicialmente estão sendo considerados quatro serviços, a saber: alinhamento pairwise, alinhamento múltiplo, predição de estrutura secundária de proteína ... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Bioinformática; BLAST; BLOSUM; FAST; Projeto Genoma. |
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Thesagro: |
Biologia Molecular; DNA; RNA. |
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Categoria do assunto: |
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Marc: |
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520 $aConsiderada uma disciplina especial desde o início dos anos 80, a bioinformática pode ser definida como uma modalidade que abrange todos os aspectos de aquisição, processamento, armazenamento, distribuição, análise e interpretação da informação biológica. Tudo ocorre numa estreita sinergia com o paradigma fundamental da biologia molecular, a qual postula que a informação genética está armazenada nas seqüências de DNA. Após a iniciativa pública do Projeto do Genoma Humano, iniciado em 1990 e com prazo previsto para ser completado em 2005, tem havido crescimento extraordinário do volume de seqüências de nucleotídeos e de aminoácidos disponível em bancos de dados. Para que se converta em efetivo benefício na medicina, na biotecnologia, na agronomia e em diversas outras áreas, toda essa informação genética precisa ser processada, comparada e analisada, o que constitui novos desafios para bioinformática, matemática e estatística: integrar e disponibilizar esses dados por meio de ferramentas amigáveis que permitam a mineração eficiente de informações pelos especialistas, mesmo aqueles pouco afeitos a computadores e a biologia molecular. A proposta desta pesquisa é integrar o maior número possível de serviços de análise de seqüências, encapsulando-os em um único aplicativo de interface gráfica interativa. Inicialmente estão sendo considerados quatro serviços, a saber: alinhamento pairwise, alinhamento múltiplo, predição de estrutura secundária de proteína e derivação de árvore filogenética. Com isso, pretende-se tornar a análise genômica mais acessível, eficiente e simplificada, o que permitirá aos pesquisadores concentrarem-se principalmente na interpretação biológica dos resultados. Quanto à bioinformática, os resultados obtidos nesta pesquisa permitem concluir que o aplicativo em desenvolvimento vem possibilitando aos pesquisadores da Rede Biofoco: melhor gerenciamento, organização e disponibilização das informações genômicas; e uso desse como ferramenta de datamining, auxiliando na visualização e exploração das informações que trafegam como entrada ou saída entre as diversas ferramentas integradas. Quanto à informática, alguns dos principais ganhos são: validação e emprego de orientação a objetos, CORBA, UML e RUP no desenvolvimento de uma ferramenta para uso científico; integração com utilitários externos e com os sistemas Anotação e Genoma; e reuso da arquitetura empregada no sistema Genoma.
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Registro original: |
Embrapa Unidades Centrais (AI-SEDE) |
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| Registros recuperados : 27 | |
| 27. |  | ATHAYDE, N. B.; COSTA, O. A. D.; ROÇA, R. de O.; GUIDONI, A. L.; ARAÚJO, A. P. de; CARVALHO, L. de F.; SILVA, H. F. de; ALVES JÚNIOR, R. T. Lesões de pele e carcaça de suínos suplementados com ractopamina em condições de produção comercial. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ZOOTECNIA, 21., 2011, Maceió. Anais... Brasília, DF: ABZ, 2011. 1 CD-ROM. Projeto: 03.08.06.008.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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