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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Café. |
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Data corrente: |
08/01/2024 |
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Data da última atualização: |
08/01/2024 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
CARVALHO, K. de; BESPALHOK FILHO, J. C.; SANTOS, T. B. dos; SOUZA, S. G. H. de; VIEIRA, L. G. E.; PEREIRA, L. F. P.; DOMINGUES, D. S. |
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Afiliação: |
KENIA DE CARVALHO, INSTITUTO AGRONÔMICO DO PARANÁ; JOÃO CARLOS BESPALHOK FILHO, UNIVERSIDADE FEDERAL DO PARANÁ; TIAGO BENEDITO DOS SANTOS, INSTITUTO AGRONÔMICO DO PARANÁ; SILVIA GRACIELE HÜLSE DE SOUZA, INSTITUTO AGRONÔMICO DO PARANÁ; LUIZ GONZAGA ESTEVES VIEIRA, INSTITUTO AGRONÔMICO DO PARANÁ; LUIZ FILIPE PROTASIO PEREIRA, CNPCa; DOUGLAS SILVA DOMINGUES, INSTITUTO AGRONÔMICO DO PARANÁ. |
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Título: |
Nitrogen starvation, salt and heat stress in coffee (coffea arabica L.): identification and validation of new genes for qPCR normalization. |
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Ano de publicação: |
2013 |
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Fonte/Imprenta: |
Molecular Biotechnology, v. 53, n. 3, p. 315-325, 2013. |
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DOI: |
https://www.doi.org/10.1007/s12033-012-9529-4 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Abiotic stresses are among the most important factors that affect food production. One important step to face these environmental challenges is the transcriptional modulation. Quantitative real-time PCR is a rapid, sensitive, and reliable method for the detection of mRNAs and it has become a powerful tool to mitigate plant stress tolerance; however, suitable reference genes are required for data normalization. Reference genes for coffee plants during nitrogen starvation, salinity and heat stress have not yet been reported. We evaluated the expression stability of ten candidate reference genes using geNorm PLUS, NormFinder, and BestKeeper softwares, in plants submitted to nitrogen starvation, salt and heat stress. EF1, EF1 alpha, GAPDH, MDH, and UBQ10 were ranked as the most stable genes in all stresses and software analyses, while RPL39 and RPII were classified as the less reliable references. For reference gene validation, the transcriptional pattern of a Coffea non-symbiotic hemoglobin (CaHb1) was analyzed using the two new recommended and the most unstable gene references for normalization. The most unstable gene may lead to incorrect interpretation of CaHb1 transcriptional analysis. Here, we recommend two new reference genes in Coffea for use in data normalization in abiotic stresses: MDH and EF1. |
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Thesaurus Nal: |
High temperature high pressure treatment; Leaves; Minerals; Nitrogen; Nutrition; Roots; Salinity. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Café (CNPCa) |
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Biblioteca |
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Tipo/Formato |
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Registro |
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URL |
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| Registros recuperados : 11 | |
| 2. |  | CARVALHO, K. de; PETKOWICZ, C. L. O.; NAGASHIMA, G. T.; BESPALHOK FILHO, J. C.; VIEIRA, L. G. E.; PEREIRA, L. F. P.; DOMINGUES, D. S. Homeologous genes involved in mannitol synthesis reveal unequal contributions in response to abiotic stress in Coffea arábica. Molecular Genetics and Genomics, v. 289, n. 5, p. 951-963, 2014.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 3. | | CARVALHO, K. de; RINCÃO, M. P.; DARBEN, L. M.; CARVALHO, M. C. C. G. de; LOPES, I. de O. N.; ABDELNOOR, R. V.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C. External application of dsRNA targeting a Phakopsora pachyrhizi effector candidate attenuated fungal pathogenicity. In: INTERNATIONAL PLANT & ANIMAL GENOME CONFERENCE, 25., 2017, San Diego. Abstracts... [S. l.: s. n.], 2017. não paginado. PLANT AND ANIMAL GENOME XXV CONFERENCE - INTLPAG, 2017.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 4. | | CAMPOS, M. K. F. de; CARVALHO, K. de; SOUZA, F. S. de; MARUR, C. J.; PEREIRA, L. F. P.; BESPALHOK FILHO, J. C.; VIEIRA, L. G. E. Drought tolerance and antioxidant enzymatic activity in transgenic 'Swingle' citrumelo plants over-accumulating proline. Environmental and Experimental Botany, v.72, n. 2, p. 242-250, 2011.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 5. | | SANTOS, T. B. dos; BABA, V. Y.; SOARES, J. D. M.; CARVALHO, K. de; BRAGHINI, M. T.; PEREIRA, L. F. P.; DOMINGUES, D. S. Efeito da ferrugem e da supressão de nitrogênio no nível transcricional do gene nitrato redutase (CaNR) em Coffea arabica L. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 8., 2013, Salvador. Sustentabilidade e inclusão Social. Brasília, DF: Embrapa Café, 2013.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 6. | | CARVALHO, K. de; BESPALHOK FILHO, J. C.; SANTOS, T. B. dos; SOUZA, S. G. H. de; VIEIRA, L. G. E.; PEREIRA, L. F. P.; DOMINGUES, D. S. Nitrogen starvation, salt and heat stress in coffee (coffea arabica L.): identification and validation of new genes for qPCR normalization. Molecular Biotechnology, v. 53, n. 3, p. 315-325, 2013.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 7. | | RINCÃO, M. P.; CARVALHO, M. C. da C G. de; NASCIMENTO, L. C.; LOPES-CAITAR, V. S.; CARVALHO, K. de; DARBEN, L. M.; YOKOYAMA, A.; CARAZZOLLE, M. F.; ABDELNOOR, R. V.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C. New insights into Phakopsora pachyrhizi infection based on transcriptome analysis in planta. Genetics and Molecular Biology, v. 41, n. 3, p. 671-691, 2018.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 8. | | BARROS, V. de A.; FONTESA, P. P.; SOUZA, G. B. de; GONÇALVES, A. B.; CARVALHO, K. de; RINCÃO, M. P.; LOPES, I. de O. N.; COSTA, M. D. L.; ALVES, M. S.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C.; FIETTO, L. G. Phakopsora pachyrhizi triggers the jasmonate signaling pathway during compatible interaction in soybean and GmbZIP89 plays a role of major component in the pathway. Plant physiology and biochemistry, v. 151, p. 526-534, 2020.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 9. | | BABA, V. Y.; BRAGHINI, M. T.; SANTOS, T. B. dos; CARVALHO, K. de; SOARES, J. D. M.; IVAMOTO-SUZUKI, S. T.; MALUF, M. P.; PADILHA, L.; PACCOLA-MEIRELLES, L. D.; PEREIRA, L. F. P.; DOMINGUES, D. S. Transcriptional patterns of Coffea arabica L. nitrate reductase, glutamine and asparagine synthetase genes are modulated under nitrogen suppression and coffee leaf rust. PeerJ, v. 8, e8320, 2020. eCollection 2020.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 10. | | PARMEZAN, T. R.; BRITO JUNIOR, S. L.; CARVALHO, K. de; AQUINO, M. de; BIRKETT, M.; PICKETT, J.; NUNES, E. de O.; ABDELNOOR, R. V.; HOFFMANN-CAMPO, C. B.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C. Transcriptional profile of genes involved in the production of terpenes and glyceollins in response to biotic stresses in soybean. Genetics and molecular biology, v. 43, p. 1-12, 2020.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 11. | | SANTOS, I, M. O. dos; ABE, V. Y.; CARVALHO, K. de; BARAZETTI, A. R.; SIMIONATO, A. S.; PEGA, G. E. de A.; MATIS, S. H.; CANO, B. G.; CELY, M. V. T.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C.; CHRYSSAFIDS, A. L.; ANDRADE, G. Secondary metabolites of Pseudomonas aeruginosa lv strain decrease asian soybean rust severity in experimentally infected plants. Plants, v. 10, n. 8, 1495, 2021. 12 p.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 3 |
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