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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agroindústria Tropical. |
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Data corrente: |
17/10/2007 |
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Data da última atualização: |
05/02/2009 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
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Autoria: |
BRUNO, L. M.; CARVALHO, J. D. G.; CARVALHO, A. K. F. de; ANDRADE, A. P. C. de; QUEIROZ, A. A. M. |
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Afiliação: |
Laura Maria Bruno, CNPAT; Juliane Döering Gasparin Carvalho, UECE; Ana Karine Furtado de Carvalho, UFC; Ana Paula Colares de Andrade, UFC; Ana Amélia Martins Queiroz, UFC. |
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Título: |
Caracterização de microbiota lática isolada de queijos de coalho comercializado no Rio Grande do Norte. |
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Ano de publicação: |
2007 |
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Fonte/Imprenta: |
In: CONGRESSO LATINO AMERICANO DE ANALISTAS DE ALIMENTOS, 15., 2007, Fortaleza. Anais... Fortaleza: LACEN; UFC, 2007. |
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Páginas: |
4 p. |
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Descrição Física: |
1 CD-ROM. |
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Idioma: |
Português |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Agroindústria Tropical (CNPAT) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Uva e Vinho. Para informações adicionais entre em contato com cnpuv.biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Uva e Vinho. |
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Data corrente: |
14/02/2013 |
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Data da última atualização: |
31/01/2019 |
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Tipo da produção científica: |
Orientação de Tese de Pós-Graduação |
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Autoria: |
DUBIELA, C. R. |
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Afiliação: |
CARLA ROSA DUBIELA, UNIVERSIDADE ESTADUAL DE MARINGÁ. |
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Título: |
Detecção por RT-PCR em tempo real (Taqman) e caracterização molecular parcial de vírus que infectam a videira. |
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Ano de publicação: |
2012 |
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Fonte/Imprenta: |
2012. |
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Páginas: |
114 f. |
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Descrição Física: |
il., color. |
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Idioma: |
Português |
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Notas: |
Dissertação (Mestrado em Genética e Melhoramento) - Universidade Estadual de Maringá, Maringá. Orientado por Eliezer Rodrigues de Souto, UEM; e co-orientado por Thor Vinícius Martins Fajardo, CNPUV. |
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Conteúdo: |
Nos últimos anos, o Brasil tem se destacado na produção de uvas, seja para consumo in natura ou para processamento. Contudo, a ocorrência de doenças é sempre mencionada como uma das ameaças à viticultura, pois pode ocasionar danos significativos à produção e à qualidade da uva. Dentre os patógenos da videira, os vírus merecem destaque devido aos danos que podem causar, o que pode comprometer a viabilidade econômica desta atividade. Cerca de 60 espécies virais infectam a videira; no Brasil, já foram detectados dez vírus nesta cultura: Grapevine leafroll-associated virus (GLRaV-1, -2, -3, -5 e -6), Grapevine virus A e B (GVA e GVB), Grapevine rupestris stem pitting-associated virus (GRSPaV), Grapevine fleck virus (GFkV) e Grapevine fanleaf virus (GFLV). A aplicação, das ferramentas de diagnose dos vírus que infectam a videira, evolui continuamente, marcadamente a RT-PCR em Tempo Real, técnica que vem ganhando espaço no diagnóstico viral em função das vantagens sobre a PCR convencional. Os objetivos deste trabalho foram avaliar a eficiência da RT-PCR em Tempo Real (TaqMan), variação que utiliza sonda marcada com um fluoróforo, para a detecção de dez importantes espécies virais que infectam a videira no Brasil: GLRaV-1, -2, -3 e -5, GVA, GVB, Grapevine virus D (GVD), GRSPaV, GFkV e GFLV. As reações visaram promover detecções individuais ou simultâneas (duplex e triplex). RNAs totais de videiras sadias e comprovadamente infectadas com estes vírus foram utilizados em ensaios tipo presença/ausência empregando-se um kit comercial para reações ?one step? de RT-PCR em Tempo Real. Para validação desta técnica, 36 acessos de videiras, recuperados após tratamentos de termoterapia e cultura de tecidos, foram indexados. Foi possível detectar, de maneira muito sensível e precisa, em reações simplex com amostras infectadas por diferentes isolados, todos os vírus supracitados, a exceção do GLRaV-1. Também foi possível detectar em ensaios duplex, o GVA, GRSPaV, GLRaV-2 e GLRaV-3 (com sondas marcadas com o fluoróforo VIC e ?quencher? TAMRA) combinados com o GVB, GFLV, GFkV, GVD e GLRaV-5 (FAM/TAMRA). Já as reações triplex somente foram possíveis a partir de cDNA viral clonado. Na indexação dos 36 acessos, o status fitossanitário dos materiais avaliados foi considerado muito bom. Dez plantas de videira, por tratamento, cvs. Cabernet Franc e C. Sauvignon, com e sem sintomas de infecção viral, foram avaliadas agronomicamente. Em ambas cvs. detectou-se o GRSPaV e GVB, por meio de RT-PCR em Tempo Real, nas plantas avaliadas. Foram verificadas diferenças significativas, em favor das plantas sem sintomas, para muitas das variáveis agronômicas avaliadas. Adicionalmente, objetivou-se: (a) estender a caracterização molecular de um isolado local de GFkV e (b) realizar a caracterização molecular de isolados locais do GVD e GLRaV-5. Os fragmentos de DNA amplificados foram clonados e sequenciados. Além desta caracterização, foram indexados, por meio de RT-PCR em Tempo Real, 37 acessos de videira para o GFkV, GVD e GLRaV-5. Adicionalmente, três fragmentos de DNA de GLRaV-1 e GVA, amplificados com oligonucleotídeos utilizados nas reações de RT-PCR em Tempo Real, foram sequenciados na tentativa de elucidar resultados, parcialmente negativos. As sequências de nucleotídeos e de aminoácidos deduzidos dos genes da proteína capsidial (CP) do GFkV, da CP e da ?RNA binding protein? (GVD) e do gene parcial da HSP70 do GLRaV-5 foram obtidas para isolados locais. Foi possível detectar estes vírus em 20 (GVD), 7 (GLRaV-5) e 6 (GFkV) amostras avaliadas. A presença do GVD ainda não havia sido relatada no Brasil e o GLRaV-5 havia sido detectado, apenas por meio de sorologia, no Estado de São Paulo. A análise das sequências dos fragmentos de DNA do GLRaV-1 e GVA permitiu propor explicações sobre resultados obtidos. A RT-PCR em Tempo Real (TaqMan) aporta sensibilidade e especificidade ao diagnóstico viral, sendo uma importante ferramenta na indexação de materiais propagativos de videira, capaz de detectar, eficientemente, diferentes espécies e isolados virais. A caracterização molecular de isolados locais contribuiu no sentido de apoiar a definição dos oligonucleotídeos e das sondas visando maior eficiência desta técnica. MenosNos últimos anos, o Brasil tem se destacado na produção de uvas, seja para consumo in natura ou para processamento. Contudo, a ocorrência de doenças é sempre mencionada como uma das ameaças à viticultura, pois pode ocasionar danos significativos à produção e à qualidade da uva. Dentre os patógenos da videira, os vírus merecem destaque devido aos danos que podem causar, o que pode comprometer a viabilidade econômica desta atividade. Cerca de 60 espécies virais infectam a videira; no Brasil, já foram detectados dez vírus nesta cultura: Grapevine leafroll-associated virus (GLRaV-1, -2, -3, -5 e -6), Grapevine virus A e B (GVA e GVB), Grapevine rupestris stem pitting-associated virus (GRSPaV), Grapevine fleck virus (GFkV) e Grapevine fanleaf virus (GFLV). A aplicação, das ferramentas de diagnose dos vírus que infectam a videira, evolui continuamente, marcadamente a RT-PCR em Tempo Real, técnica que vem ganhando espaço no diagnóstico viral em função das vantagens sobre a PCR convencional. Os objetivos deste trabalho foram avaliar a eficiência da RT-PCR em Tempo Real (TaqMan), variação que utiliza sonda marcada com um fluoróforo, para a detecção de dez importantes espécies virais que infectam a videira no Brasil: GLRaV-1, -2, -3 e -5, GVA, GVB, Grapevine virus D (GVD), GRSPaV, GFkV e GFLV. As reações visaram promover detecções individuais ou simultâneas (duplex e triplex). 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Palavras-Chave: |
Caracterização molecular; PCR em Tempo Real; TaqMan. |
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Thesagro: |
Doença de planta; Uva; Vírus; Viticultura. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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500 $aDissertação (Mestrado em Genética e Melhoramento) - Universidade Estadual de Maringá, Maringá. Orientado por Eliezer Rodrigues de Souto, UEM; e co-orientado por Thor Vinícius Martins Fajardo, CNPUV.
520 $aNos últimos anos, o Brasil tem se destacado na produção de uvas, seja para consumo in natura ou para processamento. Contudo, a ocorrência de doenças é sempre mencionada como uma das ameaças à viticultura, pois pode ocasionar danos significativos à produção e à qualidade da uva. Dentre os patógenos da videira, os vírus merecem destaque devido aos danos que podem causar, o que pode comprometer a viabilidade econômica desta atividade. Cerca de 60 espécies virais infectam a videira; no Brasil, já foram detectados dez vírus nesta cultura: Grapevine leafroll-associated virus (GLRaV-1, -2, -3, -5 e -6), Grapevine virus A e B (GVA e GVB), Grapevine rupestris stem pitting-associated virus (GRSPaV), Grapevine fleck virus (GFkV) e Grapevine fanleaf virus (GFLV). A aplicação, das ferramentas de diagnose dos vírus que infectam a videira, evolui continuamente, marcadamente a RT-PCR em Tempo Real, técnica que vem ganhando espaço no diagnóstico viral em função das vantagens sobre a PCR convencional. Os objetivos deste trabalho foram avaliar a eficiência da RT-PCR em Tempo Real (TaqMan), variação que utiliza sonda marcada com um fluoróforo, para a detecção de dez importantes espécies virais que infectam a videira no Brasil: GLRaV-1, -2, -3 e -5, GVA, GVB, Grapevine virus D (GVD), GRSPaV, GFkV e GFLV. As reações visaram promover detecções individuais ou simultâneas (duplex e triplex). RNAs totais de videiras sadias e comprovadamente infectadas com estes vírus foram utilizados em ensaios tipo presença/ausência empregando-se um kit comercial para reações ?one step? de RT-PCR em Tempo Real. Para validação desta técnica, 36 acessos de videiras, recuperados após tratamentos de termoterapia e cultura de tecidos, foram indexados. Foi possível detectar, de maneira muito sensível e precisa, em reações simplex com amostras infectadas por diferentes isolados, todos os vírus supracitados, a exceção do GLRaV-1. Também foi possível detectar em ensaios duplex, o GVA, GRSPaV, GLRaV-2 e GLRaV-3 (com sondas marcadas com o fluoróforo VIC e ?quencher? TAMRA) combinados com o GVB, GFLV, GFkV, GVD e GLRaV-5 (FAM/TAMRA). Já as reações triplex somente foram possíveis a partir de cDNA viral clonado. Na indexação dos 36 acessos, o status fitossanitário dos materiais avaliados foi considerado muito bom. Dez plantas de videira, por tratamento, cvs. Cabernet Franc e C. Sauvignon, com e sem sintomas de infecção viral, foram avaliadas agronomicamente. Em ambas cvs. detectou-se o GRSPaV e GVB, por meio de RT-PCR em Tempo Real, nas plantas avaliadas. Foram verificadas diferenças significativas, em favor das plantas sem sintomas, para muitas das variáveis agronômicas avaliadas. Adicionalmente, objetivou-se: (a) estender a caracterização molecular de um isolado local de GFkV e (b) realizar a caracterização molecular de isolados locais do GVD e GLRaV-5. Os fragmentos de DNA amplificados foram clonados e sequenciados. Além desta caracterização, foram indexados, por meio de RT-PCR em Tempo Real, 37 acessos de videira para o GFkV, GVD e GLRaV-5. Adicionalmente, três fragmentos de DNA de GLRaV-1 e GVA, amplificados com oligonucleotídeos utilizados nas reações de RT-PCR em Tempo Real, foram sequenciados na tentativa de elucidar resultados, parcialmente negativos. As sequências de nucleotídeos e de aminoácidos deduzidos dos genes da proteína capsidial (CP) do GFkV, da CP e da ?RNA binding protein? (GVD) e do gene parcial da HSP70 do GLRaV-5 foram obtidas para isolados locais. Foi possível detectar estes vírus em 20 (GVD), 7 (GLRaV-5) e 6 (GFkV) amostras avaliadas. A presença do GVD ainda não havia sido relatada no Brasil e o GLRaV-5 havia sido detectado, apenas por meio de sorologia, no Estado de São Paulo. A análise das sequências dos fragmentos de DNA do GLRaV-1 e GVA permitiu propor explicações sobre resultados obtidos. A RT-PCR em Tempo Real (TaqMan) aporta sensibilidade e especificidade ao diagnóstico viral, sendo uma importante ferramenta na indexação de materiais propagativos de videira, capaz de detectar, eficientemente, diferentes espécies e isolados virais. A caracterização molecular de isolados locais contribuiu no sentido de apoiar a definição dos oligonucleotídeos e das sondas visando maior eficiência desta técnica.
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Registro original: |
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