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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Milho e Sorgo. |
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Data corrente: |
07/08/2020 |
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Data da última atualização: |
27/10/2020 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
PINHEIRO, D. H.; MOREIRA, R. O.; LEITE, N. A.; REDOAN, A. C.; XAVIER, A. da S.; BARROS, B. de A.; CARNEIRO, N. P. |
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Afiliação: |
Daniele Heloisa Pinheiro; Raquel Oliveira Moreira, UNESP; Natalia Alves Leite, Universidade Federal do Rio Grande do Sul; Ana Carolina Redoan; Andre da Silva Xavier, Universidade Federal do Espírito Santo; BEATRIZ DE ALMEIDA BARROS, CNPMS; NEWTON PORTILHO CARNEIRO, CNPMS. |
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Título: |
Suitable reference genes for RT-qPCR analysis in Dichelops melacanthus (Hemiptera: Pentatomidae). |
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Ano de publicação: |
2020 |
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Fonte/Imprenta: |
Molecular Biology Reports, v. 47, p. 4989-5000, 2020. |
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DOI: |
10.1007/s11033-020-05550-z |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
The relative quantification of gene expression is mainly realized through reverse transcription-quantitative PCR (RT-qPCR). However, the accuracy of this technique is deeply influenced by the expression stability of the reference genes used for data normalization. Therefore, the selection of suitable reference genes for a given experimental condition is a prerequisite in gene expression studies.Dichelops melacanthus(Hemiptera: Pentatomidae) is an important phloem sap-sucking insect pest of soybean, wheat, and maize in Brazil. Most of the genetic and molecular biology studies require gene expression analysis. Nevertheless, there are no reports about reference genes for RT-qPCR data normalization inD. melacanthus. In this study, we evaluated the expression stability of nine candidate reference genes (nadh,sdhb,gapdh,fau,ef1a,rpl9,ube4a,gusandrps23) in different developmental stages, body parts, sex, starvation-induced stress and dsRNA exposure by RefFinder software that integrates the statistical algorithms geNorm, NormFinder, BestKeeper, and Delta Ct method. Our results showed that ef1a and nadh are the most stable reference genes for developmental stages,fauandrps23for sex,ube4aandrps23for body parts,rpl9andfaufor starvation stress, andnadhandsdhbfor dsRNA exposure treatment. The reference genes selected in this work will be useful for further RT-qPCR analyses onD. melacanthus, facilitating future gene expression studies that can provide a better understanding of the developmental, physiological, and molecular processes of this important insect pest. Moreover, the knowledge gained from these studies can be helpful to design effective and sustainable pest management strategies. MenosThe relative quantification of gene expression is mainly realized through reverse transcription-quantitative PCR (RT-qPCR). However, the accuracy of this technique is deeply influenced by the expression stability of the reference genes used for data normalization. Therefore, the selection of suitable reference genes for a given experimental condition is a prerequisite in gene expression studies.Dichelops melacanthus(Hemiptera: Pentatomidae) is an important phloem sap-sucking insect pest of soybean, wheat, and maize in Brazil. Most of the genetic and molecular biology studies require gene expression analysis. Nevertheless, there are no reports about reference genes for RT-qPCR data normalization inD. melacanthus. In this study, we evaluated the expression stability of nine candidate reference genes (nadh,sdhb,gapdh,fau,ef1a,rpl9,ube4a,gusandrps23) in different developmental stages, body parts, sex, starvation-induced stress and dsRNA exposure by RefFinder software that integrates the statistical algorithms geNorm, NormFinder, BestKeeper, and Delta Ct method. Our results showed that ef1a and nadh are the most stable reference genes for developmental stages,fauandrps23for sex,ube4aandrps23for body parts,rpl9andfaufor starvation stress, andnadhandsdhbfor dsRNA exposure treatment. The reference genes selected in this work will be useful for further RT-qPCR analyses onD. melacanthus, facilitating future gene expression studies that can provide a better understanding of the develop... Mostrar Tudo |
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Thesagro: |
Gene; Inseto; Percevejo; Seleção Genética. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
LEADER 02446naa a2200253 a 4500
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520 $aThe relative quantification of gene expression is mainly realized through reverse transcription-quantitative PCR (RT-qPCR). However, the accuracy of this technique is deeply influenced by the expression stability of the reference genes used for data normalization. Therefore, the selection of suitable reference genes for a given experimental condition is a prerequisite in gene expression studies.Dichelops melacanthus(Hemiptera: Pentatomidae) is an important phloem sap-sucking insect pest of soybean, wheat, and maize in Brazil. Most of the genetic and molecular biology studies require gene expression analysis. Nevertheless, there are no reports about reference genes for RT-qPCR data normalization inD. melacanthus. In this study, we evaluated the expression stability of nine candidate reference genes (nadh,sdhb,gapdh,fau,ef1a,rpl9,ube4a,gusandrps23) in different developmental stages, body parts, sex, starvation-induced stress and dsRNA exposure by RefFinder software that integrates the statistical algorithms geNorm, NormFinder, BestKeeper, and Delta Ct method. Our results showed that ef1a and nadh are the most stable reference genes for developmental stages,fauandrps23for sex,ube4aandrps23for body parts,rpl9andfaufor starvation stress, andnadhandsdhbfor dsRNA exposure treatment. The reference genes selected in this work will be useful for further RT-qPCR analyses onD. melacanthus, facilitating future gene expression studies that can provide a better understanding of the developmental, physiological, and molecular processes of this important insect pest. Moreover, the knowledge gained from these studies can be helpful to design effective and sustainable pest management strategies.
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Registro original: |
Embrapa Milho e Sorgo (CNPMS) |
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Biblioteca |
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| Registros recuperados : 220 | |
| 141. |  | CASTANHEIRA, A. L. M.; SOUZA, I. R. P. de; OLIVEIRA, E. de; CARNEIRO, N. P.; NETTO, D. A. M.; PAIVA, E. Diversidade genética de isolados geográficos de Spiroplasma kunkelii. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 26.; SIMPÓSIO BRASILEIRO SOBRE A LAGARTA-DO-CARTUCHO, SPODOPTERA FRUGIPERDA, 2.; SIMPÓSIO SOBRE COLLETOTRICHUM GRAMINICOLA, 1., 2006, Belo Horizonte. Inovação para sistemas integrados de produção: trabalhos apresentados. [Sete Lagoas]: ABMS, 2006. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 142. | | VASCONCELOS, V. D. B.; MAGALHAES, P. C.; CARNEIRO, A. A.; GUIMARAES, C. T.; SOUZA, E. T. S.; SILVA, V. L.; DEUS, F. G.; CARNEIRO, N. P. DREB gene family in drought tolerant maize lines. In: INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON GENOMICS OF PLANT GENETIC RESOURCES, 2., 2010, Bologna, Itália. Final program and abstracts. Bologna: University of Bologna, 2010. p. 111.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 143. | | COELHO, M. R. R.; MOTA, F. F. da; CARNEIRO, N. P.; MARRIEL, I. E.; PAIVA, E.; ROSADO, A. S.; SELDIN, L. Diversity of Paenibacillus spp. in the rhizosphere of four sorghum (Sorghum bicolor) cultivars sown with two contrasting levels of nitrogen fertilizer assessed by rpoB-Based PCR-DGGE and sequencing analysis. Journal of Microbiology and Biotechnology, v. 17, n. 5, p. 753-760, 2007.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Internacional - A |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 144. | | SIMEONE, M. L. F.; MAGALHAES, P. C.; CARNEIRO, N. P.; GOMES JÚNIOR, C. C.; AVILA, R. G.; SOUZA, T. C. de; OLIVEIRA, A. C. de. Ecophysiological characterization of sorghum genotypes submitted to water deficit tolerance. In: GOES, R. J. (org.). Cadeias produtivas e novas tecnologias: aspectos econômicos, ecológicos e sociais. Ponta Grossa: Atena, 2021. p. 69-83.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 145. | | MAGALHAES, P. C.; SIMEONE, M. L. F.; CARNEIRO, N. P.; GOMES JUNIOR, C. C.; SOUZA, T. C. de; OLIVEIRA, A. C. de; FONSECA, T. M. da. Efeitos de diferentes níveis de estresse hídrico na caracterização ecofisiológica de genótipos de sorgo. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 31., 2016, Bento Gonçalves. Milho e sorgo: inovações, mercados e segurança alimentar: anais. Sete Lagoas: Associação Brasileira de Milho e Sorgo, 2016.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 146. | | OLIVEIRA, K. E. S. de; VALINHAS, M. C.; OLIVEIRA, R. P. de; SOUSA, S. M. de; CARNEIRO, A. A.; CARNEIRO, N. P. Edição dos genes ZmBahd01 e ZmBahd05 em milho via CRISPR/Cas9. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 33., 2022, Sete Lagoas. Brasil: 200 anos de independência: sustentabilidade e desafios para a cadeia produtiva de grãos: resumos. Sete Lagoas: Associação Brasileira de Milho e Sorgo, 2022. Evento online.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 147. | | PEDROSO, J. C.; NEPOMUCENO, A. L.; SILVA, J. F. V.; CARNEIRO, N. P.; MARTINS, P. K.; BRETON, M. C.; MARIN, S. R. R.; BINNECK, E. Differential gene expression in nematode resistant soybean genotypes. Nematology, Boston, v. 4, n. 2, p. 235, 2002. Presented in Fourth International Congress of Nematology. Programme and abstracts. 8-13 June 2002, Tenbel, La Galletas, Arona, Tenerife, Canary Islands, Spain.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 148. | | CARNEIRO, N. P.; GOMES, E. A.; SOUZA, I. R. P. de; CARNEIRO, A. A.; GUZMÁS, F.; OLIVEIRA, E. de; CONCI, L. Variabilidade genética de fitoplasma em populações de milho. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 26.; SIMPÓSIO BRASILEIRO SOBRE A LAGARTA-DO-CARTUCHO, SPODOPTERA FRUGIPERDA, 2.; SIMPÓSIO SOBRE COLLETOTRICHUM GRAMINICOLA, 1., 2006, Belo Horizonte. Inovação para sistemas integrados de produção: trabalhos apresentados. [Sete Lagoas]: ABMS, 2006. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 149. | | ANDRADE, L. C. de S. S.; BARROS, B. de A.; CARNEIRO, A. A.; SOUZA, I. R. P. de; OLIVEIRA, E. de; ARAGAO, F. J. L.; CARNEIRO, N. P. Validação da indução ao SCMV (Sugarcane Mosaic Virus) em plantas de milho via RNA interferente. In: SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 4., 2012, Sete Lagoas. [Trabalhos apresentados]. Sete Lagoas: Embrapa Milho e Sorgo, 2012.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 150. | | ANDRADE, L. C. de S. S.; BARROS, B. de A.; CARNEIRO, A. A.; SOUZA, I. R. P. de; OLIVEIRA, E. de; ARAGAO, F. J. L.; CARNEIRO, N. P. Validação da indução ao SCMV (Sugarcane Mosaic Virus) em plantas de milho via RNA interferente. In: SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 4., 2012, Sete Lagoas. [Trabalhos apresentados]. Sete Lagoas: Embrapa Milho e Sorgo, 2012.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 151. | | PINHEIRO, D. H.; MOREIRA, R. O.; LEITE, N. A.; REDOAN, A. C.; XAVIER, A. da S.; BARROS, B. de A.; CARNEIRO, N. P. Suitable reference genes for RT-qPCR analysis in Dichelops melacanthus (Hemiptera: Pentatomidae). Molecular Biology Reports, v. 47, p. 4989-5000, 2020.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 152. | | CARNEIRO, N. P.; CARNEIRO, A. A.; PAIVA, E.; CANCADO, G. M.; ALVES, V. M. C.; BELELE, C. L.; PURCINO, A. A. C. Tolerância ao alumínio em tabacos transformados com os genes de citrato sintase de planta e bactéria regulada por promotores especificos de raiz e constitutivo. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 23., 2000, Uberlândia, MG. A inovação tecnológica e a competividade no contexto dos mercados globalizados: resumos expandidos. Sete Lagoas: ABMS: Embrapa Milho e Sorgo; Uberlândia: Universidade Federal de Uberlandia, 2000. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 153. | | CARNEIRO, N. P.; CARNEIRO, A. A.; PAIVA, E.; CANCADO, G. M.; ALVES, V. M. C.; BELELE, C. L.; PURCINO, A. A. C. Tolerância ao alumínio em tabacos transformados com os genes de citrato sintase de planta e bactéria regulada por promotores específicos de raiz e constitutivo. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 23., 2000, Uberlândia. A inovação tecnológica e a competividade no contexto dos mercados globalizados: resumos. Sete Lagoas: ABMS: Embrapa Milho e Sorgo; Uberlândia: Universidade Federal de Uberlândia, 2000. p. 146.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 154. | | SOUZA, R. A. V. de; SILVA, E. T. S.; ALVES, M. de C.; NAIE, A.; CARNEIRO, N. P.; BOREM, A.; CARNEIRO, A. A. Transformação genética de embriões imaturos de milho tropical via Agrobacterium tumefaciens. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 30.; SIMPÓSIO SOBRE LEPDÓPTEROS COMUNS A MILHO, SOJA E ALGODÃO, 1., 2014, Salvador. Eficiência nas cadeias produtivas e o abastecimento global: resumos expandidos. Sete Lagoas: Associação Brasileira de Milho e Sorgo, 2014. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 156. | | POSSA, K. F.; CARNEIRO, M. H.; PEREIRA, M. F.; LANA, U. G. D. P.; CARNEIRO, N. P.; MAGALHAES, J. V. D.; GUIMARAES, C. T.; CARNEIRO, A. A. Transformação genética de milho com o gene de tolerância ao alumínio SbMATE isolado de sorgo. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 55., 2009, Águas de Lindóia, SP. Resumos... Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2009. p. 88.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 157. | | OLIVEIRA, K. E. de; ALVES, M. de C.; BARROS, B. de A.; CARNEIRO, N. P.; VALICENTE, F. H.; CARNEIRO, A. A. Transformação genética de milho Hill com o gene crycnpms222 de Bacillus thuringiensis. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 30.; SIMPÓSIO SOBRE LEPDÓPTEROS COMUNS A MILHO, SOJA E ALGODÃO, 1., 2014, Salvador. Eficiência nas cadeias produtivas e o abastecimento global: resumos expandidos. Sete Lagoas: Associação Brasileira de Milho e Sorgo, 2014. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 158. | | ALVES, P. A.; MOREIRA, R. O.; BARROS, B. de A.; ALVES, M. de C.; MAGALHAES, P. C.; CARNEIRO, A. A.; CARNEIRO, N. P. Transformação genética de milho utilizando o gene AtDREB2A visando tolerância à seca. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 30.; SIMPÓSIO SOBRE LEPDÓPTEROS COMUNS A MILHO, SOJA E ALGODÃO, 1., 2014, Salvador. Eficiência nas cadeias produtivas e o abastecimento global: resumos expandidos. Sete Lagoas: Associação Brasileira de Milho e Sorgo, 2014. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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