|
|
| Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Pecuária Sul. Para informações adicionais entre em contato com cppsul.biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Pecuária Sul. |
Data corrente: |
25/10/2021 |
Data da última atualização: |
10/12/2021 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
COMIN, H. B.; SOLLERO, B. P.; GASPAR, E. B.; DOMINGUES, R.; CARDOSO, F. F. |
Afiliação: |
H. B. COMIN, UFPEL; BRUNA PENA SOLLERO, CPPSUL; EMANUELLE BALDO GASPAR, CPPSUL; ROBERT DOMINGUES, CPPSUL; FERNANDO FLORES CARDOSO, CPPSUL. |
Título: |
Genome-wide association study of resistance/susceptibility to infectious bovine keratoconjunctivitis in Brazilian Hereford cattle. |
Ano de publicação: |
2021 |
Fonte/Imprenta: |
Animal Genetics, v. 52, n. 6, p. 881-886, Dec. 2021. |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
Genome-wide association studies were conducted to identify the more informative genomic regions and SNPs, as well as to identify candidate genes associated with infectious bovine keratoconjunctivitis (IBK) resistance/susceptibility in Hereford cattle. A Bayes B statistical approach was initially applied in genome-wide association studies by using deregressed estimated breeding values for IBK resistance/susceptibility. To estimate the combined effect of a genomic region that is potentially associated with QTL, 2504 non-overlapping 1-Mb windows that varied in SNP number were defined, with the most informative 24 windows including 427 SNPs and explaining more than 20% of the estimated genetic variance for IBK resistance/susceptibility. These regions were explored with respect to their biological functions through functional analysis to map potential candidate genes. The significant SNPs were mapped on chromosomes 1, 3, 5, 6, 7, 8, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 18, 20, 23, and 28, and candidate genes were detected as related to the IBK. Most informative SNPs in term of genetic variance were located in proximity of genes related to phenotypic expression of lesions and biological processes associated to the IBK. Knowledge about phenotypic and genomic variation generated in the present study can be used to on design selection strategies to improve the resistance to IBK of Hereford cattle herds. Keywords Bayesian inference, beef cattle, candidate genes, functional analysis |
Thesagro: |
Conjuntivite; Doença Animal; Olho; Queratite. |
Categoria do assunto: |
-- |
Marc: |
LEADER 02152naa a2200217 a 4500 001 2135552 005 2021-12-10 008 2021 bl uuuu u00u1 u #d 100 1 $aCOMIN, H. B. 245 $aGenome-wide association study of resistance/susceptibility to infectious bovine keratoconjunctivitis in Brazilian Hereford cattle.$h[electronic resource] 260 $c2021 520 $aGenome-wide association studies were conducted to identify the more informative genomic regions and SNPs, as well as to identify candidate genes associated with infectious bovine keratoconjunctivitis (IBK) resistance/susceptibility in Hereford cattle. A Bayes B statistical approach was initially applied in genome-wide association studies by using deregressed estimated breeding values for IBK resistance/susceptibility. To estimate the combined effect of a genomic region that is potentially associated with QTL, 2504 non-overlapping 1-Mb windows that varied in SNP number were defined, with the most informative 24 windows including 427 SNPs and explaining more than 20% of the estimated genetic variance for IBK resistance/susceptibility. These regions were explored with respect to their biological functions through functional analysis to map potential candidate genes. The significant SNPs were mapped on chromosomes 1, 3, 5, 6, 7, 8, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 18, 20, 23, and 28, and candidate genes were detected as related to the IBK. Most informative SNPs in term of genetic variance were located in proximity of genes related to phenotypic expression of lesions and biological processes associated to the IBK. Knowledge about phenotypic and genomic variation generated in the present study can be used to on design selection strategies to improve the resistance to IBK of Hereford cattle herds. Keywords Bayesian inference, beef cattle, candidate genes, functional analysis 650 $aConjuntivite 650 $aDoença Animal 650 $aOlho 650 $aQueratite 700 1 $aSOLLERO, B. P. 700 1 $aGASPAR, E. B. 700 1 $aDOMINGUES, R. 700 1 $aCARDOSO, F. F. 773 $tAnimal Genetics$gv. 52, n. 6, p. 881-886, Dec. 2021.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
Registro original: |
Embrapa Pecuária Sul (CPPSUL) |
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
Registros recuperados : 410 | |
102. | | MOTA, R. R.; TEMPELMAN, R. J.; CARDOSO, F. F.; AGUILAR, I. G.; LOPES, P. S. Genomic wide-selection for tick resistance in Hereford and Braford cattle via reaction norm model. In: WORLD CONGRESS ON GENETICS APPLIED TO LIVESTOCK PRODUCTION, 10., 2014, Vancouver, British Columbia, Canada. Proceedings... Champaign: ASAS, 2014. 1 CD-ROM.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul. |
| |
103. | | AGUILAR, I.; LEGARRA, A.; CARDOSO, F. F.; MASUDA, Y.; LOURENCO, D.; MISZTAL, I. Frequentist p-values for large-scale-single step genome-wide association, with an application to birth weight in American Angus cattle. Genetics Selection Evolution, v. 51, n. 28, 20 June 2019.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul. |
| |
104. | | SANTOS, P. A. dos; REIMANN, F. A.; SOLLERO, B. P.; MINHO, A. P.; CARDOSO, F. F. Identificação de genes candidatos relacionados ao carcinoma ocular bovino de acordo com a base de dados MESH (Medical Subject Headings). In: SIMPÓSIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA PECUÁRIA SUL, 7., 2017, Bagé. Resumos... Bagé: Embrapa Pecuária Sul, 2017. p. 25. Claudia Cristina Gulias Gomes, editora técnica.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul. |
| |
105. | | COSTA, R. F. da; SOLLERO, B. P.; YOKOO, M. J. I.; CARDOSO, F. F. Importância relativa de critérios de seleção baseados em índices de seleção econômico e empírico. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 11., 2015, Santa Maria, RS. Melhoramento animal da academia ao campo: uma parceria em construção: anais. Santa Maria, RS: SBMA: UFSM, 2015.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul. |
| |
107. | | CAMPOS, G.; CARDOSO, F. F.; PICCOLI, M.; CAMPOS, L.; AZAMBUJA, R.; BRACCINI NETO, J. Índices de seleção em bovinos da raça Aberdeen Angus. In: CONGRESSO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 22.; ENCONTRO DE PÓS-GRADUAÇÃO, 15., 2013, Pelotas. Anais... Pelotas: UFPel, 2013.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul. |
| |
112. | | REIS, A. P.; CARDOSO, F. F.; COSTA, R. F. da; BIEGELMEYER, P.; YOKOO, M. J. I. Ganho genético monetário para resistência ao carrapato com diferentes acurácias. In: SALÃO INTERNACIONAL DE ENSINO, EXTENSÃO E PESQUISA, 5., 2013, Bagé. Discussão, participação e cidadania: anais. Bagé: Unipampa, 2013. SIEPE.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul. |
| |
115. | | SANTANA JÚNIOR, M. L.; ELER, J. P.; CARDOSO, F. F.; FERRAS, J. B. S. Interação genótipo x ambiente para ganho de peso pós-desmama de bovinos de corte compostos. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 48., 2011, Belém, PA. O desenvolvimento da produção animal e a responsabilidade frente a novos desafios: anais. Belém, PA: SBZ, 2011. 1 CD-ROM.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul. |
| |
Registros recuperados : 410 | |
|
Nenhum registro encontrado para a expressão de busca informada. |
|
|