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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Pesca e Aquicultura. |
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Data corrente: |
19/04/2018 |
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Data da última atualização: |
19/02/2019 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
SHIOTSUKI, L.; CARDOSO, F. F.; ALBUQUERQUE, L. G. |
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Afiliação: |
LUCIANA SHIOTSUKI, CNPASA; FERNANDO FLORES CARDOSO, CPPSUL; L. G. ALBUQUERQUE, UNESP, Jaboticabal-SP. |
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Título: |
Method for the estimation of genetic merit of animals with uncertain paternity under Bayesian inference. |
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Ano de publicação: |
2018 |
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Fonte/Imprenta: |
Journal of Animal Breeding and Genetics, v. 135, n. 2, p. 116-123, 2018. |
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ISSN: |
0931-2668 |
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DOI: |
10.1111/jbg.12322 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
The use of controlled mating or artificial insemination is impracticable in the case of large herds, mainly because of labour costs and the need to delimit areas during the breeding period. However, the exclusion of information from animals with uncertain paternity reduces genetic progress. The objectives of this study were as follows: (i) propose an iterative empirical Bayesian procedure to implement the hierarchical animal model (ITER); (ii) calculate the posterior probabilities of paternity by the maximum likelihood method following the concepts; (iii) compare an average numerator relationship matrix (ANRM), Bayesian hierarchical (HIER) models and ITER. Records of Nellore animals born between 1984 and 2006 from the zootechnical archive of Agropecuaria Jacarezinho Ltda were used. For data consistency, records of contemporary groups (CGs) with fewer than three animals and animals whose records were 3.5 standard deviations above or below the mean of their CG were eliminated. After editing the data, 62,212 animals in the file and 12,876 animals in pedigree file were maintained, respectively. Spearman and Pearson correlations between the posterior mean of the genetic effects of animals were calculated to compare the ranking of animals for selection. Simulated data were used to confirm the veracity of the model. The correlations between ITER and HIER and between ITER and ANRM were similar evaluating different files, which decreased at the same proportion when only high-ranked animals were evaluated. In conclusion, the model proposed herein is a suitable computational alternative to improve the prediction of breeding values of animals in genetic evaluations using large databases, including animals with uncertain paternity. MenosThe use of controlled mating or artificial insemination is impracticable in the case of large herds, mainly because of labour costs and the need to delimit areas during the breeding period. However, the exclusion of information from animals with uncertain paternity reduces genetic progress. The objectives of this study were as follows: (i) propose an iterative empirical Bayesian procedure to implement the hierarchical animal model (ITER); (ii) calculate the posterior probabilities of paternity by the maximum likelihood method following the concepts; (iii) compare an average numerator relationship matrix (ANRM), Bayesian hierarchical (HIER) models and ITER. Records of Nellore animals born between 1984 and 2006 from the zootechnical archive of Agropecuaria Jacarezinho Ltda were used. For data consistency, records of contemporary groups (CGs) with fewer than three animals and animals whose records were 3.5 standard deviations above or below the mean of their CG were eliminated. After editing the data, 62,212 animals in the file and 12,876 animals in pedigree file were maintained, respectively. Spearman and Pearson correlations between the posterior mean of the genetic effects of animals were calculated to compare the ranking of animals for selection. Simulated data were used to confirm the veracity of the model. The correlations between ITER and HIER and between ITER and ANRM were similar evaluating different files, which decreased at the same proportion when only high-ranked a... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Mérito genético; Multiple-sire mating; Uncertain paternity. |
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Thesagro: |
Animal. |
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Thesaurus Nal: |
Animals; Bayesian theory; Genetic merit; Uncertainty. |
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Categoria do assunto: |
L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal |
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Marc: |
LEADER 02546naa a2200265 a 4500
001 2090735
005 2019-02-19
008 2018 bl uuuu u00u1 u #d
022 $a0931-2668
024 7 $a10.1111/jbg.12322$2DOI
100 1 $aSHIOTSUKI, L.
245 $aMethod for the estimation of genetic merit of animals with uncertain paternity under Bayesian inference.$h[electronic resource]
260 $c2018
520 $aThe use of controlled mating or artificial insemination is impracticable in the case of large herds, mainly because of labour costs and the need to delimit areas during the breeding period. However, the exclusion of information from animals with uncertain paternity reduces genetic progress. The objectives of this study were as follows: (i) propose an iterative empirical Bayesian procedure to implement the hierarchical animal model (ITER); (ii) calculate the posterior probabilities of paternity by the maximum likelihood method following the concepts; (iii) compare an average numerator relationship matrix (ANRM), Bayesian hierarchical (HIER) models and ITER. Records of Nellore animals born between 1984 and 2006 from the zootechnical archive of Agropecuaria Jacarezinho Ltda were used. For data consistency, records of contemporary groups (CGs) with fewer than three animals and animals whose records were 3.5 standard deviations above or below the mean of their CG were eliminated. After editing the data, 62,212 animals in the file and 12,876 animals in pedigree file were maintained, respectively. Spearman and Pearson correlations between the posterior mean of the genetic effects of animals were calculated to compare the ranking of animals for selection. Simulated data were used to confirm the veracity of the model. The correlations between ITER and HIER and between ITER and ANRM were similar evaluating different files, which decreased at the same proportion when only high-ranked animals were evaluated. In conclusion, the model proposed herein is a suitable computational alternative to improve the prediction of breeding values of animals in genetic evaluations using large databases, including animals with uncertain paternity.
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Registro original: |
Embrapa Pesca e Aquicultura (CNPASA) |
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Biblioteca |
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Registro |
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| Registros recuperados : 134 | |
| 101. |  | RUGGIERO, C.; SÃO JOSÉ, A. R.; VOLPE, C. A.; OLIVEIRA, J. C. de; DURIGAN, J. F.; BAUMGARTNER, J. G.; SILVA, J. R. da; NAKAMURA, K.; FERREIRA, M. E.; KAVATI, R.; PEREIRA, V. de P. Maracujá para exportação: aspectos técnicos da produção. Brasília: EMBRAPA-SPI, 1996. 64 p. (Publicações Técnicas FRUPEX, 19).| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 102. | | SANTOS, W. dos; ARAÚJO, D.; TORRES-DINI, D.; CORNACINI, M. R.; SILVA, J. R. da; ZARUMA, D. U. G.; RECCO, C. R. S. B.; MORAES, M. L. T.; SOUSA, V. A. de; AGUIAR, A. V. de. Genetic divergence in Pinus caribaea var. hondurensis progeny in Brazil. In: 2014 IUFRO FOREST TREE BREEDING CONFERENCE, 2014, Prague. Book of abstracts. [S.l.]: IUFRO: Faculty of Forestry and Wood Sciences, 2014. p. 63. Disponibilizado online. P 18.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| 103. | | CORNACINI, M. R.; ALCANTARA, M. A. M.; SILVA, J. R. da; CORRÊA, A. J. M.; CAMBUIM, J.; MANOEL, R. de O.; ALVES, P. F.; AGUIAR, A. V. de; MORAES, M. L. T. de; MARINO, C. L. Flowering in test of provenance and progenies of Astronium fraxinifolium Schott (Anacardiaceae) in three reproductive events. Pesquisa Florestal Brasileira, Colombo, v. 39, (nesp), e201902043, 2019. p. 512. Edição especial dos resumos do IUFRO World Congress, 25., 2019, Curitiba.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| 104. | | CORNACINI, M. R.; ALCANTARA, M. A. M.; SILVA, J. R. da; CORRÊA, A. J. M.; CAMBUIM, J.; MANOEL, R. de O.; ALVES, P. F.; ROSSINI, B. C.; AGUIAR, A. V. de; MORAES, M. L. T. de; MARINO, C. L. Florescimento em teste de procedência e progênies de Astronium fraxinifolium Schott (Anacardiaceae) em três eventos reprodutivos. In: FELSEMBURGH, C. A. (org.). A produção do conhecimento na engenharia florestal. Ponta Grossa: Atena, 2020. cap. 9. p. 82-91.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| 105. | | HERLING, V. R.; SILVA, J. R. da; GODOY, R.; PRIMAVESI, A. C. P. de A.; CERQUEIRA LUZ, P. H de; MELIS, M. H. Van; CARRER, C. R. O.; GOMIDE, C. A.; LIMA, C. G. Estudo de alguns parâmetros agronômicos de cultivares de aveia (Avena spp.). In: REUNIÃO DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 35., 1998, Botucatu. Anais... Botucatu: SBZ, 1998. p. 524-526.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 106. | | SILVA, H. A. P da; OLIVEIRA, R. S. da S. de; GONÇALO, T. P.; SILVA, J. R. da; GALISA, P. de S.; VIDAL, M. S.; ARAUJO, J. L. S. de. Identificação de genes expressos em nódulos de feijão-caupi (Vigna unguiculata) submetido ao déficit hídrico. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 29.; REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS, 13.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 11.; REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 8., 2010, Guarapari. Fontes de nutrientes e produção agrícola: modelando o futuro: anais. Viçosa: SBCS, 2010. 5 p. Trab. 843. 1 CD-ROM. FERTBIO 2010| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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| 107. | | GODOY, R.; REIS, R. A; RODRIGUES, L. R. de A.; HERLING, V. R.; SILVA, J. R. da; SMITH, M. F.; BATISTA, L. A. R.; PRIMAVESI, A. C. P. de A. Ensaio brasileiro de cultivares recomendadas de aveia no Estado de São Paulo, 1998. In: REUNIÃO DA COMISSÃO BRASILEIRA DE PESQUISA DE AVEIA, 19., 1999, Porto Alegre, RS. Anais... Porto Alegre: UFRGS, 1999. p.317-322.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 108. | | GODOY, R.; RODRIGUES, L. R. de A.; REIS, R. A.; HERLING, V. R.; SILVA, J. R. da; SMITH, M. F.; PRIMAVESI, A. C. A.; BATISTA, L. A. R.; MACHADO, L. A. Z. Ensaio regional de aveias forrageiras - 1998. In: REUNIAO DA COMISSAO BRASILEIRA DE PESQUISA DE AVEIA, 19., 1999, Porto Alegre, RS. Resultados experimentais... Porto Alegre: UFRGS, 1999. p.407-416.| Biblioteca(s): Embrapa Agropecuária Oeste. |
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| 109. | | GODOY, R.; RODRIGUES, L. R. de A.; REIS, R. A.; HERLING, V. R.; SILVA, J. R. da; SMITH, M. F.; PRIMAVESI, A. C. P. de A.; BATISTA, L. A. R.; MACHADO, L. A. Z. Ensaio regional de aveias forrageiras - 1998. In: REUNIAO DA COMISSAO BRASILEIRA DE PESQUISA DE AVEIA, 19., 1999, Porto Alegre, RS. Anais... Porto Alegre: UFRGS, 1999. p.407-416.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 110. | | GODOY, R.; PRIMAVESI, A. C. P. de A.; BATISTA, L. A. R.; CESAR, F. C.; REIS, R. A.; HERLING, V. R.; YAMANAKA, R. N.; DANTAS, R.; SILVA, J. R. da. Recomendação de cultivares de aveia para o estado de São Paulo. São Carlos, SP: EMBRAPA-CPPSE, 1998. 9 p. (Embrapa-CPPSE. Comunicado técnico, 19).| Tipo: Comunicado Técnico/Recomendações Técnicas |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 111. | | GODOY, R.; RODRIGUES, L. R. de A.; REIS, R. A.; HERLING, V. R.; SILVA, J. R. da; SMITH, M. F.; PRIMAVESI, A. C. P. de A.; BATISTA, L. A. R. Recomendação de cultivares de aveia para a produção de forragem no Estado de São Paulo. São Carlos, SP: Embrapa Pecuária Sudeste, 1999. 7p. (Embrapa Pecuária Sudeste. Comunicado técnico, 24).| Tipo: Comunicado Técnico/Recomendações Técnicas |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 112. | | GODOY, R.; REIS, R. A.; RODRIGUES, L. R. A. de; HERLING, V. R.; SILVA, J. R. da; SMITH, M. F.; BATISTA, L. A. R.; PRIMAVESI, A. C. P. de A. Recomendação de cultivares de aveia para produção de grãos no Estado de São Paulo. São Carlos, SP: Embrapa Pecuária Sudeste, 1999. 5 p. (Embrapa Pecuária Sudeste. Comunicado técnico 25.)| Tipo: Comunicado Técnico/Recomendações Técnicas |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 113. | | YAMAMOTO, E. L. M.; HOLANDA, I. S. A.; MORAIS, P. L. D. de; NUNES, G. H. de S.; ANTONIO, R. P.; LEMOS, M. de S.; SILVA, J. R. da. Selection of umbu-cajazeira clones using the REML/BLUP. Revista Brasileira de Ciências Agrárias, v. 12, n. 4, p. 496-502, 2017.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 114. | | ARAGÃO, F. A. S. de; PAIVA, W. de O.; CRISÓSTOMO, J. R.; MOREIRA, M. A. B.; SILVA, J. R. da; DANTAS, M. S. M.; COSTA, G. G.; GUIMARÃES, I. P.; NOGUEIRA, C. S. R.; COSTA FILHO, J. H. da. Desempenho de híbridos experimentais de meloeiro em dois ambientes. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FRUTICULTURA, 20.; ANNUAL MEETING OF THE INTERAMERICAN SOCIETY FOR TROPICAL HORTICULTURE, 54., 2008, Vitória. Frutas para todos: estratégias, tecnologias e visão sustentável. Vitória: Sociedade Brasileira de Fruticultura, 2008. Resumo. 1 CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 115. | | ARAGAO, F. A. S. de; PAIVA, W. de O.; CRISÓSTOMO, J. R.; MOREIRA, M. A. B.; SILVA, J. R. da; DANTAS, M. S. M.; COSTA, G. G.; GUIMARÃES, I. P.; NOGUEIRA, C. S. R.; COSTA FILHO, J. H. da. Desempenho de híbridos experimentais de meloeiro em dois ambientes. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FRUTICULTURA, 20; ANNUAL MEETING OF THE INTERAMERICAN SOCIETY FOR TROPICAL HORTICULTURE, 54., 2008, Vitória. Book of Abstracts. Vitória: International Society for Tropical Horticulture, 2008. p. 81.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria Tropical. |
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| 116. | | FERREIRA, H.; GÓIS, M. H. de O.; PRATA, R. C.; ARAÚJO, K. R. da S. de; MEDEIROS, S. J. de; NASCIMENTO, F. G. O. do; SILVA, J. da; SILVA, J. R. da. Desenvolvimento foliar de mudas de mamoeiro 'golden thb' em diferentes concentrações de água de esgoto tratada. In: SIMPÓSIO DO PAPAYA BRASILEIRO, 7., 2018, Vitória. Produção e sustentabilidade hídrica. [s.l.], 2018. 5 il.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 117. | | LUZ, K. C. da; CORNACINI, M. R.; SILVA, J. R. da; BERNARDI, C. M. M.; SEBBENN, A. M.; MORAES, M. L. T. de; AGUIAR, A. V. de; ZANATA, M.; CAMBUIM, J.; MENEZES, M. L. F. Diversidade genética entre procedências Cariniana legalis a partir de caracteres de crescimento das rebrotas. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 3., 2014, Santos. Anais... Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Recursos Genéticos, 2014. CD-ROM. Resumo.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| 118. | | LOPES, W. de A. R.; TORRES FILHO, J.; NUNES, G. H. de S.; ARAGAO, F. A. S. de; SILVA, J. R. da; DANTAS, M. S. M.; GUIMARÃES, I. P.; FERREIRA, H. A. Divergência genética entre acessos de melão coletados no Nordeste brasileiro. Horticultura Brasileira, v. 26, n. 2, p. S5762-S5765, 2008.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria Tropical. |
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| 119. | | NUNES, G. H. do S.; C. FILHO, J. H. da; DANTAS, M. S. M.; PAULA, V. F. S. de; SOUZA, A. D. de; TORRES FILHO, J.; SILVA, J. R. da; ARAGÃO, F. A. de S. Divergência genética entre linhagens de melão pele de sapo. Horticultura Brasileira, Brasília, DF, v. 25, n. 1, ago. 2007. s 92. Suplemento. Trabalho apresentado no 47. Congresso Brasileiro de Olericultura, 4. Simpósio Brasileiro sobre Cucurbitáceas, 2007. Porto Seguro. Resumo 498.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso | Circulação/Nível: -- - -- |
| Biblioteca(s): Embrapa Hortaliças. |
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| 120. | | GALISA, P. de S. G.; PEREIRA, W.; SILVA, H. A. P. da; MOREIRA, I. M.; GONÇALO, T. P.; SILVA, J. R. da; VIDAL, M. S.; BALDANI, J. I.; ARAUJO, J. L. S. de; REIS, V. M. Obtenção de fragmentos derivados de transcritos diferencialmente expressos em raízes de cana-de-açúcar inoculada com bactérias diazotróficas. In: SEMANA CIENTÍFICA JOHANNA DÖBEREINER, 10., 18 a 24 de outubro de 2010, Seropédica. Ciência para o Desenvolvimento Sustentável: anais... Seropédica: Embrapa Agrobiologia, 2010.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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