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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Agrossilvipastoril. |
Data corrente: |
08/11/2019 |
Data da última atualização: |
08/11/2019 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
TIAGO, A. V.; HOOGERHEIDE, E. S. S.; PEDRI, E. C. M. de; CARDOSO, E. dos S.; PINTO, J. M. A.; PENA, G. F.; ROSSI, A. A. B. |
Afiliação: |
AUANA VICENTE TIAGO, UNEMAT, Alta Floresta, MT; EULALIA SOLER SOBREIRA HOOGERHEIDE, CPAMT; ELIANE CRISTINA MORENO DE PEDRI, UNEMAT, Alta Floresta, MT; ELISA DOS SANTOS CARDOSO, UNEMAT, Alta Floresta, MT; JOYCE MENDES ANDRADE PINTO, CPAMT; GUILHERME FERREIRA PENA, UNEMAT, Alta Floresta, MT; ANA APARECIDA BANDINI ROSSI, UNEMAT, Alta Floresta, MT. |
Título: |
Genetic diversity and population structure of cassava ethno-varieties grown in six municipalities in the state of Mato Grosso, Brazil. |
Ano de publicação: |
2019 |
Fonte/Imprenta: |
Genetics and molecular research, v. 18, n. 4, gmr18357, 2019. |
DOI: |
http://dx.doi.org/10.4238/gmr18357 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
Cassava is one of the main energy foods for millions of people, and has a great diversity of ethno-varieties that have specific characteristics often not found in commercial varieties. These constitute a gene pool and therefore a genetic resource that should be conserved and preserved. In this context, the objective of our study was to evaluate the genetic diversity and population structure of ethno-varieties of cassava grown in six municipalities of the state of Mato Grosso, with the aim of characterization and conservation of the varieties found in this area. The study was carried out with 157 samples of cassava. For the molecular analyses, 15 fluorochrome-labeled SSR loci were used. Microsatellite markers amplified a total of 158 alleles. The polymorphism information content for each locus varied from 0.132 (SSRY126) to 0.838 (SSRY47), with a mean of 0.680. The expected and observed heterozygosity showed an average of between 0.717 and 0.688, for SSRY126 and SSRY47, respectively. The heterozygosity values observed were higher than those expected in five of the six populations, generating negative values of the fixation index (-0.070). Among the six populations, Alta Floresta and Cuiabá had the highest percentage of polymorphic loci (100%). The groupings obtained by UPGMA, Structure and PCoA among the six populations were concordant in allocating the individuals into two genetic groups. We found considerable genetic diversity among the samples, evidenced by the high values in the diversity indices. These high values are possibly related to the management of the fields and the exchange of propagative material among the farmers. Therefore, it is proposed that both populations be conserved since they have potential that could be used for genetic improvement of this essential crop. MenosCassava is one of the main energy foods for millions of people, and has a great diversity of ethno-varieties that have specific characteristics often not found in commercial varieties. These constitute a gene pool and therefore a genetic resource that should be conserved and preserved. In this context, the objective of our study was to evaluate the genetic diversity and population structure of ethno-varieties of cassava grown in six municipalities of the state of Mato Grosso, with the aim of characterization and conservation of the varieties found in this area. The study was carried out with 157 samples of cassava. For the molecular analyses, 15 fluorochrome-labeled SSR loci were used. Microsatellite markers amplified a total of 158 alleles. The polymorphism information content for each locus varied from 0.132 (SSRY126) to 0.838 (SSRY47), with a mean of 0.680. The expected and observed heterozygosity showed an average of between 0.717 and 0.688, for SSRY126 and SSRY47, respectively. The heterozygosity values observed were higher than those expected in five of the six populations, generating negative values of the fixation index (-0.070). Among the six populations, Alta Floresta and Cuiabá had the highest percentage of polymorphic loci (100%). The groupings obtained by UPGMA, Structure and PCoA among the six populations were concordant in allocating the individuals into two genetic groups. We found considerable genetic diversity among the samples, evidenced by the high values... Mostrar Tudo |
Palavras-Chave: |
Alta Floresta-MT; Apiacas-MT; Caceres-MT; Cuiaba-MT; Jangada-MT; Pocone-MT; SSR markers. |
Thesagro: |
Manihot Esculenta. |
Thesaurus Nal: |
Genetic variation; Manihot. |
Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/204416/1/2019-cpamt-eulalia-hoogerheide-genetic-diversty-structure-population-ethno-varieties-municipalities-state-mato-grosso.pdf
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Marc: |
LEADER 02794naa a2200325 a 4500 001 2114055 005 2019-11-08 008 2019 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $ahttp://dx.doi.org/10.4238/gmr18357$2DOI 100 1 $aTIAGO, A. V. 245 $aGenetic diversity and population structure of cassava ethno-varieties grown in six municipalities in the state of Mato Grosso, Brazil.$h[electronic resource] 260 $c2019 520 $aCassava is one of the main energy foods for millions of people, and has a great diversity of ethno-varieties that have specific characteristics often not found in commercial varieties. These constitute a gene pool and therefore a genetic resource that should be conserved and preserved. In this context, the objective of our study was to evaluate the genetic diversity and population structure of ethno-varieties of cassava grown in six municipalities of the state of Mato Grosso, with the aim of characterization and conservation of the varieties found in this area. The study was carried out with 157 samples of cassava. For the molecular analyses, 15 fluorochrome-labeled SSR loci were used. Microsatellite markers amplified a total of 158 alleles. The polymorphism information content for each locus varied from 0.132 (SSRY126) to 0.838 (SSRY47), with a mean of 0.680. The expected and observed heterozygosity showed an average of between 0.717 and 0.688, for SSRY126 and SSRY47, respectively. The heterozygosity values observed were higher than those expected in five of the six populations, generating negative values of the fixation index (-0.070). Among the six populations, Alta Floresta and Cuiabá had the highest percentage of polymorphic loci (100%). The groupings obtained by UPGMA, Structure and PCoA among the six populations were concordant in allocating the individuals into two genetic groups. We found considerable genetic diversity among the samples, evidenced by the high values in the diversity indices. These high values are possibly related to the management of the fields and the exchange of propagative material among the farmers. Therefore, it is proposed that both populations be conserved since they have potential that could be used for genetic improvement of this essential crop. 650 $aGenetic variation 650 $aManihot 650 $aManihot Esculenta 653 $aAlta Floresta-MT 653 $aApiacas-MT 653 $aCaceres-MT 653 $aCuiaba-MT 653 $aJangada-MT 653 $aPocone-MT 653 $aSSR markers 700 1 $aHOOGERHEIDE, E. S. S. 700 1 $aPEDRI, E. C. M. de 700 1 $aCARDOSO, E. dos S. 700 1 $aPINTO, J. M. A. 700 1 $aPENA, G. F. 700 1 $aROSSI, A. A. B. 773 $tGenetics and molecular research$gv. 18, n. 4, gmr18357, 2019.
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Registro original: |
Embrapa Agrossilvipastoril (CPAMT) |
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Registros recuperados : 18 | |
2. | | PEDRI, E. C. M. de; TIAGO, A. V.; CARDOSO, E. dos S.; HOOGERHEIDE, E. S. S.; ROSSI, A. A. B. Diversidade genética de mandiocas cultivadas no norte de mato grosso por meio de microssatélites. In: SEMANA ACADÊMICA DA PESQUISA E INOVAÇÃO; CONGRESSO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 13.; AGINOVTECH; SEMINÁRIO DA PÓS-GRADUAÇÃO DA UNEMAT, 3., 2021, Cáceres, MT. Anais... Cáceres: Unemat, 2022. SAPI; XIII CONIC; AGINOVTECH, e III SEPOSTipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Agrossilvipastoril. |
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3. | | PEDRI, E. C. M. de; CARDOSO, E. dos S.; HOOGERHEIDE, E. S. S.; ROSSI, A. A. B. Produtividade da parte aérea de mandiocas cacau em diferentes épocas de colheita. In: SEMINÁRIO DE BIODIVERSIDADE E AGROECOSSISTEMAS AMAZÔNICOS: BIODIVERSIDADE E A INTEGRAÇÃO LAVOURA-PECUÁRIA-FLORESTA NOS AGROECOSSISTEMAS AMAZÔNICOS, 7., 2019, Alta Floresta, MT. Anais... Alta Floresta, MT: PPGBioAgro, 2019. não paginado.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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5. | | TIAGO, A. V.; PEDRI, E. C. M. de; ROSSI, F. S.; CARDOSO, E. dos S.; HOOGERHEIDE, E. S. S.; ROSSI, A. A. B. Caracterização de germoplasma de mandioca cultivada no estado de Mato Grosso, Brasil. Revista RG News, v. 4, n. 3, p. 217, 2018. Resumo apresentado no CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 5., 2018, Fortaleza. Anais... Fortaleza: Sociedade Brasileira de Recursos Genéticos, 2018.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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6. | | PEDRI, E. C. M. de; TIAGO, A. V.; CARDOSO, E. dos S.; HOOGERHEIDE, E. S. S.; YAMASHITA, O. M.; ROSSI, A. A. B. Caracterização molecular de etnovariedades de mandioca cultivadas por agricultores no município de Apiacás, MT. In: ENCONTRO DE CIÊNCIA E TECNOLOGIAS AGROSSUSTENTÁVEIS; JORNADA CIENTÍFICA DA EMBRAPA AGROSSILVIPASTORIL, 6., 2017, Sinop, MT. Resumos... Sinop, MT: Embrapa Agrossilpastoril, 2017. p. 188-191.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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7. | | PEDRI, E. C. M. de; HOOGERHEIDE, E. S. S.; ROSSI, A. A. B.; TIAGO, A. V.; CARDOSO, E. dos S.; YAMASHITA, O. M. Características culinárias de etnovariedades de mandioca de mesa em diferentes épocas de colheita. In: FARIAS NETO, A. L. de; NASCIMENTO, A. F. do; ROSSONI, A. L.; MAGALHÃES, C. A. de S.; ITUASSU, D. R.; HOOGERHEIDE, E. S. S.; IKEDA, F. S.; FERNANDES JUNIOR, F.; FARIA, G. R.; ISERNHAGEN, I.; VENDRUSCULO, L. G.; MORALES, M. M.; CARNEVALLI, R. A. (Ed.). Embrapa Agrossilvipastoril: primeiras contribuições para o desenvolvimento de uma agropecuária sustentável. Brasília, DF: Embrapa, 2019. pt. 8, cap. 5, p. 574-578.Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
Biblioteca(s): Embrapa Agrossilvipastoril. |
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8. | | TIAGO, A. V.; PEDRI, E. C. M. de; CARDOSO, E. dos S.; TIAGO, P. V.; CARPEJANI, A. A.; HOOGERHEIDE, E. S. S.; ROSSI, A. A. B. Estrutura populacional de etnovariedades de mandioca, cultivadas no município de Alta Floresta, MT, Brasil In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 9., 2017, Foz do Iguaçu. Melhoramento de plantas: projetando o futuro. Foz do Iguaçu: SBMP, 2017. p. 766.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Agrossilvipastoril. |
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9. | | PEDRI, E. C. M. de; SANTOS, L. L. dos; WOLF, M. S.; TIAGO, A. V.; CARDOSO, E. dos S.; HOOGERHEIDE, E. S. S.; ROSSI, A. A. B. Diversidade genética entre etnovariedades de mandioca cultivadas no norte do estado de Mato Grosso por meio de descritores morfoagronômicos. Research, Society and Development, v. 10, n. 5, e25410514871, 2021.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 2 |
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10. | | PEDRI, E. C. M. de; TIAGO, A. V.; CARDOSO, E. dos S.; HOOGERHEIDE, E. S. S.; YAMASHITA, O. M.; ROSSI, A. A. B. Diversidade genética de etnovariedades de mandioca (Manihot esculenta Crantz) cultivadas no norte de Mato Grosso. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 9., 2017, Foz do Iguaçu. Melhoramento de plantas: projetando o futuro. Foz do Iguaçu: SBMP, 2017. p. 753.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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11. | | TIAGO, A. V.; HOOGERHEIDE, E. S. S.; PEDRI, E. C. M. de; CARDOSO, E. dos S.; PINTO, J. M. A.; PENA, G. F.; ROSSI, A. A. B. Genetic diversity and population structure of cassava ethno-varieties grown in six municipalities in the state of Mato Grosso, Brazil. Genetics and molecular research, v. 18, n. 4, gmr18357, 2019.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
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12. | | ZORTÉA, K. É. M.; ROSSI, A. A. B.; TIAGO, A. V.; CARDOSO, E. dos S.; PINTO, J. M. A.; HOOGERHEIDE, E. S. S. Spondias mombin (Anarcadiaceae): molecular characterization and conservation. Revista de Biología Tropical, v. 69, n. 3, p. 1023-1036, 2021.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
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13. | | PEDRI, E. C. M. de; CARDOSO, E. dos S.; ZORTÉA, K. É. M.; WOLF, M. S.; SANTOS, L. L. dos; FERREIRA, E. L.; HOOGERHEIDE, E. S. S.; ROSSI, A. A. B. Caracterização fenotípica de etnovariedades de mandioca cultivadas no Norte Mato-grossense. In: SIMPOSIO LATINOAMERICANO DE QUÍMICA; WORKSHOP DE BIOTECNOLOGÍA DE LA REDE BIONORTE, 5., 2021, Macapá, AP. Los desafíos de la investigación en América Latina: anais. Macapá, AP: Associação Brasileira de Química - Regional Amapá, 2021. não paginado.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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14. | | TIAGO, A. V.; ROSSI, A. A. B.; PEDRI, E. C. M. de; ROSSI, F. S.; ROCHA, V. D. da; LIMA, J. A.; HOOGERHEIDE, E. S. S.; SANTOS, L. L. dos; CARDOSO, E. dos S.; SOUZA, S. A. M. Estrutura genética de mandiocas cultivadas na amazônia norte mato-grossense. In: OLIVEIRA JUNIOR, J. M. B. de; CALVÃO, L. B. (Org.). Ciências biológicas: campo promissor em pesquisa 3. Ponta Grosso, PR: Atena, 2020. v. 3. Cap. 14. p. 169-179.Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
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15. | | PEDRI, E. C. M. de; HOOGERHEIDE, E. S. S.; TIAGO, A. V.; CARDOSO, E. dos S.; ZORTÉA, K. É. M.; SANTOS, L. L. dos; WOLF, M. S.; ROSSI, A. A. B. Divergência genética entre etnovariedades de mandioca com base em caracteres agronômicos quantitativos. Contribuciones a Las Ciencias Sociales, v. 16, n. 6, p. 3577-3590, 2023.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 4 |
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16. | | PEDRI, E. C. M. de; HOOGERHEIDE, E. S. S.; TIAGO, A. V.; CARDOSO, E. dos S.; PINTO, J. M. A.; SANTOS, L. L.; YAMASHITA, O. M.; ROSSI, A. A. B. Genetic diversity of cassava landraces cultivated in northern Mato Grosso State, Brazil, using microsatellite markers. Genetics and Molecular Research, v. 18, n.3, gmr18135, 2019. gmr18315.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
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17. | | PEDRI, E. C. M. de; ROSSI, A. A. B.; HOOGERHEIDE, E. S. S.; TIAGO, A. V.; CARDOSO, E. dos S.; ZORTÉA, K. É. M.; ROCHA, V. D. da; YAMASHITA, O. M. Efeito de épocas da colheita sobre características agronômicas de etnovariedades da mandioca. Revista Ibero-Americana de Ciências Ambientais, v. 11, n. 3, p. 20-31, 2020.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
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18. | | TIAGO, A. V.; PEDRI, E. C. M. de; ROSSI, F. S.; SANTOS, L. L. dos; LIMA, J. A.; CARDOSO, E. dos S.; ROVEDA, A. P.; HOOGERHEIDE, E. S. S.; ROSSI, A. A. B. Phenotypic characterization of cassava ethno-varieties in the state of Mato Grosso, Brazil. Genetics and Molecular Research, v. 19, n. 2, gmr18538, 2020.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
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