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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agroenergia; Embrapa Suínos e Aves. |
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Data corrente: |
10/06/2016 |
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Data da última atualização: |
08/11/2016 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
TUPINAMBÁ, D. D.; CANTAO, M. E.; COSTA, O. Y. A.; BERGMANN, J. C.; KRUGER, R. H.; KYAW, C. M.; BARRETO, C. C.; QUIRINO, B. F. |
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Afiliação: |
DAIVA DOMENECH TUPINAMBÁ, UCB; MAURICIO EGIDIO CANTAO, CNPSA; OHANA YONARA ASSIS COSTA, UCB; JÉSSICA CARVALHO BERGMANN, UCB; RICARDO HENRIQUE KRUGER, UNB; CYNTHIA MARIA KYAW, UNB; CRISTINE CHAVES BARRETO, UCB; BETANIA FERRAZ QUIRINO, CNPAE. |
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Título: |
Archaeal community changes associated with cultivation of amazon forest soil with oil palm. |
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Ano de publicação: |
2016 |
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Fonte/Imprenta: |
Archaea, Cairo, v. 2016, article ID 3762159, 14 p., 2016. |
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DOI: |
http://dx.doi.org/10.1155/2016/3762159 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Abstract: This study compared soil archaeal communities of the Amazon forest with that of an adjacent area under oil palm cultivation by 16S ribosomal RNA gene pyrosequencing. Species richness and diversity were greater in native forest soil than in the oil palm-cultivated area, and 130 OTUs (13.7%) were shared between these areas. Among the classified sequences, Thaumarchaeota were predominant in the native forest, whereas Euryarchaeota were predominant in the oil palm-cultivated area. Archaeal species diversity was 1.7 times higher in the native forest soil, according to the Simpson diversity index, and the Chao1 index showed that richness was five times higher in the native forest soil. A phylogenetic tree of unclassified Thaumarchaeota sequences showed that most of the OTUs belong to Miscellaneous Crenarchaeotic Group. Several archaeal genera involved in nutrient cycling (e.g., methanogens and ammonia oxidizers) were identified in both areas, but significant differences were found in the relative abundances of Candidatus Nitrososphaera and unclassified Soil Crenarchaeotic Group (prevalent in the native forest) and Candidatus Nitrosotalea and unclassified Terrestrial Group (prevalent in the oil palm-cultivated area). More studies are needed to culture some of these Archaea in the laboratory so that their metabolism and physiology can be studied. |
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Palavras-Chave: |
Archaeal; Área adjacente sob cultivo; Comunidades arcaicas; Comunidades microbianas; Floresta amazônica; Genômica; Mata nativa; Óleo de palma; Palma de óleo. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
LEADER 02341naa a2200325 a 4500
001 2046765
005 2016-11-08
008 2016 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $ahttp://dx.doi.org/10.1155/2016/3762159$2DOI
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520 $aAbstract: This study compared soil archaeal communities of the Amazon forest with that of an adjacent area under oil palm cultivation by 16S ribosomal RNA gene pyrosequencing. Species richness and diversity were greater in native forest soil than in the oil palm-cultivated area, and 130 OTUs (13.7%) were shared between these areas. Among the classified sequences, Thaumarchaeota were predominant in the native forest, whereas Euryarchaeota were predominant in the oil palm-cultivated area. Archaeal species diversity was 1.7 times higher in the native forest soil, according to the Simpson diversity index, and the Chao1 index showed that richness was five times higher in the native forest soil. A phylogenetic tree of unclassified Thaumarchaeota sequences showed that most of the OTUs belong to Miscellaneous Crenarchaeotic Group. Several archaeal genera involved in nutrient cycling (e.g., methanogens and ammonia oxidizers) were identified in both areas, but significant differences were found in the relative abundances of Candidatus Nitrososphaera and unclassified Soil Crenarchaeotic Group (prevalent in the native forest) and Candidatus Nitrosotalea and unclassified Terrestrial Group (prevalent in the oil palm-cultivated area). More studies are needed to culture some of these Archaea in the laboratory so that their metabolism and physiology can be studied.
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Registro original: |
Embrapa Suínos e Aves (CNPSA) |
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| 61. |  | BABUJIA, L. C.; SILVA, A. P.; NAKATANI, A. S.; CANTAO, M. E.; VASCONCELOS, A. T. R.; VISENTAINER, J. V.; HUNGRIA, M. Impact of long-term cropping of glyphosate-resistant transgenic soybean [Glycine max (L.) Merr.] on soil microbiome. Transgenic Research, Feb., p.1-6, 2016.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja; Embrapa Suínos e Aves. |
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| 62. | | SILVA, V. H.; PANDOLFI, J. R. C.; GODOY, T. F.; PEIXOTO, J. de O.; TESSMANN, A. L.; CANTAO, M. E.; LEDUR, M. C. Hepatocyte nuclear factor 4 gene associated with bone traits and birth weight in male chickens. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 59., 2013, Águas de Lindóia. Resumos... Ribeirão Preto: SBG, 2013. p. 27.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 63. | | ZANELLA, R.; GAVA, D.; PEIXOTO, J. de O.; SCHAEFER, R.; ZANELLA, J. R. C.; BIONDO, N.; SILVA, M. V. G. B.; CANTAO, M. E.; LEDUR, M. C. Genetic markers associated with influenza vaccination efficacy in swine. In: INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON EMERGING AND RE-EMERGING PIG DISEASES, 7., 2015, Kyoto. Proceedings... Kyoto: Science Council of Japan; JSVS; JPVS; JASV, 2015.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 64. | | ZANELLA, R.; IBELLI, A. M. G.; PEIXOTO, J. de O.; CANTAO, M. E.; SILVA, M. V. G. B.; GIACHETTO, P. F.; FREITAS, M.; LOPES, J.; LEDUR, M. C. Genetic associations of farrowing length in two maternal lines of pigs. In: WORLD CONGRESS OF GENETICS APPLIED TO LIVESTOCK PRODUCTION, 10., 2014, Vancouver. Proceedings... Vancouver: WCGALP: American Society of Animal Science, 2014.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite; Embrapa Suínos e Aves. |
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| 66. | | ZANELLA, R.; PEIXOTO, J. de O.; CARDOSO, F. F.; CARDOSO, L. L.; BIEGELMEYER, P.; CANTAO, M. E.; OTAVIANO, A.; FREITAS, M. S.; CAETANO, A. R.; LEDUR, M. C. Genetic diversity analysis of two commercial breeds of pigs using genomic and pedigree data. Genetics Selection Evolution, v. 48, n. 24, 30 Mar. 2016.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia; Embrapa Suínos e Aves. |
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| 68. | | ZANELLA, R.; PEIXOTO, J. de O.; CANTAO, M. E.; CARDOSO, F. F.; FREITAS, L.; OTAVIANO, A.; CAETANO, A. R.; LEDUR, M. C. Detecting levels of autozygosity in two pure lines of pigs using genomic and pedigree data. In: INTERNATIONAL PIG VETERINARY SOCIETY CONGRESS, 23., Cancun. Proceedings... León, México: IPVS, 2014. p. 140. p. 140| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 69. | | SOUZA, R. C.; CANTÃO, M. E.; NOGUEIRA, M. A.; VANSCONCELOS, A. T. R.; BARCELLOS, F. G.; VICENTE, V. A.; HUNGRIA, M. Diversidade funcional de genes com potencial biotecnológico em um solo agrícola no Norte do Paraná. In: CONGRESSO BRASILEIRO MICROBIOLOGIA, 27., SIMPÓSIO IBEROAMERICANO SOBRE MICRO-ORGANISMOS FOTOSSINTETIZANTES, 2.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICOBACTÉRIAS, 15.; SIMPÓSIO DE FERMENTAÇÃO ALCOÓLICA, 2.; BRAZILIAN MICROBIOME WORKSHOP; BRAZILIAN MICROBIOME PROJECT MEETING, 1.; SIMPÓSIO DE COLEÇÕES DE CULTURA, 4.; MINI-SIMPÓSIO SOBRE NEW DELHI METALO-BETA-LACTAMASE-1 (NDM-1); 2013, NATAL. Anais... [São Paulo]: Sociedade Brasileira de Microbiologia, 2013.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 70. | | CANTAO, M. E.; OLIVEIRA FILHO, J. X. de; KICH, J. D.; KLEIN, C. S.; ZANELLA, R.; MORES, M. A. Z.; REBELATTO, R.; MORES, N. Draft genome sequence of Pasteurella multocida strain 11246. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE AB3C; BRAZILIAN SYMPOSIUM ON BIOINFORMATICS, 2013, Recife. Abstract book... Recife: Brazilian Association for Bioinformatics and Computer Biology; Braziian Computer Society, 2013. Não paginado. X-meeting BSB 2013. Pôster.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 71. | | SALMÓRIA, L. A.; IBELLI, A. M. G.; TAVERNARI, F. de C.; PEIXOTO, J. de O.; MARCELINO, D. E. P.; CANTAO, M. E.; LEDUR, M. C. Duodenum transcriptome profile of laying hens submitted to different levels of calcium and phosphorus in the diet. In: BRAZILIAN CONGRESS OF GENETICS, 66., 2021. E-Book. Ribeirão Preto: SBG, 2021. 66º Congresso Brasileiro de Genética. Genética On-line. p. 228.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 72. | | MARCHESI, J. P.; SBARDELLA, A. P.; JOAQUIM, L. B.; CANTAO, M. E.; PEIXOTO, J. de O.; BUZANKAS, M. E.; LEDUR, M. C.; MUNARI, D. P. Linkage disequilibrium and effective population size in a paternal broiler line. In: INTERNATIONAL MEETING OF ADVANCES IN ANIMAL SCIENCE, 2016, Jaboticabal. Posters presentations... Jabotical: PPGZ Unesp, 2016.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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