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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Suínos e Aves. |
Data corrente: |
14/10/2015 |
Data da última atualização: |
18/02/2016 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
GAVA, D.; SOUZA, C. K.; SCHAEFER, R.; VINCENT, A. L.; CANTAO, M. E.; COLDEBELLA, A.; ZANELLA, J. R. C. |
Afiliação: |
DANIELLE GAVA, CNPSA; CARINE KUNZLER DE SOUZA, UFRGS; REJANE SCHAEFER, CNPSA; AMY LOUISE VINCENT, USDA/ARS; MAURICIO EGIDIO CANTAO, CNPSA; ARLEI COLDEBELLA, CNPSA; JANICE REIS CIACCI ZANELLA, CNPSA. |
Título: |
A TaqMan-based real-time PCR for detection and quantification of porcine parvovirus 4. |
Ano de publicação: |
2015 |
Fonte/Imprenta: |
Journal of Virological Methods, v. 219, p. 14-17, 2015. |
DOI: |
http://dx.doi.org/10.1016/j.jviromet.2015.03.011 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
Porcine parvovirus 4 (PPV4) is a DNA virus, and a member of the Parvoviridae family within the Bocavirus genera. It was detected recently in swine, but its epidemiology and pathology remain unclear. A TaqManbased real-time PCR (qPCR) targeting a conserved region of the ORF3 gene of PPV4 was developed. The qPCR detection limit was 9.5 × 101 DNA copies/L. There was no cross-reaction with porcine parvovirus, torque teno virus 1, torque teno virus 2, porcine circovirus type 1, porcine circovirus type 2, or with pseudorabies virus. Two hundred and seventy-two samples, including serum, semen, lungs, feces, ovarian follicular fluids, ovaries and uterus, were evaluated by qPCR and PPV4 was detected in 36 samples (13.2%). When compared with a conventional PCR (cPCR), the qPCR assay was 10 times more sensitive and the detection of PPV4 DNA in field samples was increased 2.5 times. Partial sequencing of PPV4 ORF3 gene, obtained from two pooled samples of uterus and ovaries, revealed a high nucleotide identity (98?99%) with a reference PPV4 sequence. The qPCR can be used as a fast and accurate assay for the detection and quantification of PPV4 in field samples and for epidemiological studies in swine herds. |
Palavras-Chave: |
Porcine parvovirus; Swine disease. |
Thesagro: |
Doença animal; Parvovirose; Suíno; Virologia. |
Thesaurus Nal: |
Parvoviridae; Quantitative polymerase chain reaction; SsDNA viruses; Virology. |
Categoria do assunto: |
-- |
Marc: |
LEADER 02164naa a2200325 a 4500 001 2026395 005 2016-02-18 008 2015 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $ahttp://dx.doi.org/10.1016/j.jviromet.2015.03.011$2DOI 100 1 $aGAVA, D. 245 $aA TaqMan-based real-time PCR for detection and quantification of porcine parvovirus 4.$h[electronic resource] 260 $c2015 520 $aPorcine parvovirus 4 (PPV4) is a DNA virus, and a member of the Parvoviridae family within the Bocavirus genera. It was detected recently in swine, but its epidemiology and pathology remain unclear. A TaqManbased real-time PCR (qPCR) targeting a conserved region of the ORF3 gene of PPV4 was developed. The qPCR detection limit was 9.5 × 101 DNA copies/L. There was no cross-reaction with porcine parvovirus, torque teno virus 1, torque teno virus 2, porcine circovirus type 1, porcine circovirus type 2, or with pseudorabies virus. Two hundred and seventy-two samples, including serum, semen, lungs, feces, ovarian follicular fluids, ovaries and uterus, were evaluated by qPCR and PPV4 was detected in 36 samples (13.2%). When compared with a conventional PCR (cPCR), the qPCR assay was 10 times more sensitive and the detection of PPV4 DNA in field samples was increased 2.5 times. Partial sequencing of PPV4 ORF3 gene, obtained from two pooled samples of uterus and ovaries, revealed a high nucleotide identity (98?99%) with a reference PPV4 sequence. The qPCR can be used as a fast and accurate assay for the detection and quantification of PPV4 in field samples and for epidemiological studies in swine herds. 650 $aParvoviridae 650 $aQuantitative polymerase chain reaction 650 $aSsDNA viruses 650 $aVirology 650 $aDoença animal 650 $aParvovirose 650 $aSuíno 650 $aVirologia 653 $aPorcine parvovirus 653 $aSwine disease 700 1 $aSOUZA, C. K. 700 1 $aSCHAEFER, R. 700 1 $aVINCENT, A. L. 700 1 $aCANTAO, M. E. 700 1 $aCOLDEBELLA, A. 700 1 $aZANELLA, J. R. C. 773 $tJournal of Virological Methods$gv. 219, p. 14-17, 2015.
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Registro original: |
Embrapa Suínos e Aves (CNPSA) |
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Registros recuperados : 148 | |
21. | | SCHAEFER, R.; MORES, N.; GAVA, D.; CANTAO, M. E.; ZANELLA, J. R. C. Long-term circulation of influenza A viruses in swine in Brazil. In: Journal of the Brazilian Society for Virology, Ribeirão Preto, v. 19, p. 53-54, 2014. Suppl. 2. Edição dos anais do 25º. Brazilian Congress of Virology e 9º. Mercosur Meeting of Virology, Ribeirão Preto, set./out, 2014.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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22. | | MEZZARI, M. P.; SILVA, M. L. B. da; CANTAO, M. E.; MA, J.; NOSSA, C. W. Insights of putative pathogens reduction from swine wastewater treatment processes through 16s rDNA pyrosequencing analyses. In: SIMPÓSIO INTERNACIONAL SOBRE GERENCIAMENTO DE RESÍDUOS AGROPECUÁRIOS E AGROINDUSTRIAIS, 4., 2015, Rio de Janeiro, RJ. Anais... Brasília: Embrapa, 2015.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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23. | | SCHAEFER, R.; GAVA, D.; HAACH, V.; ZANELLA, J. R. C.; CANTAO, M. E. Novel H1N2 swine influenza virus reassortant strain derived from the pandemic H1N1/2009 virus. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE VIROLOGIA, 29.; ENCONTRO DE VIROLOGIA DO MERCOSUL, 13., 2018, Gramado. Resumos... Brasília: SBV, 2018.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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24. | | SCHAEFER, R.; GAVA, D.; HAACH, V.; CANTAO, M. E.; NELSON, M. I. Novel human-like H1N1 swine influenza virus with the six internal genes derived from H1N1/2009 virus. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE VIROLOGIA, 28.; ENCONTRO DE VIROLOGIA DO MERCOSUL, 12., 2017, Belo Horizonte. Trabalho pôsteres... Brasília: SBV, 2017.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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29. | | GOLDONI, I.; IBELLI, A. M. G.; PEIXOTO, J. de O.; HUL, L. M.; CANTAO, M. E.; LEDUR, M. C. Análise comparativa de transcriptoma de frangos normais e afetados com necrose da cabeça do fêmur. In: ENCONTRO DE GENÉTICA DO NORDESTE, 23., 2021, Petrolina. Da produção de alimentos à saúde única: anais. Natal: UFRN: Sociedade Brasileira de Genética Regional Nordeste, 2021. Evento online.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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31. | | SOUZA, R. C. de; CANTÃO, M. E.; NOGUEIRA, M. A.; VASCONCELOS, A. T. R.; NICOLAS, M. F.; HUNGRIA, M. Biodiversidade de procariotos em solo sob plantio direto e plantio convencional em rotação ou sucessão de culturas. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MICROBILOGIA, 26.; SIMPÓSIO INTERNACIONAL DE BACTÉRIAS LÁTICAS; ENCONTRO NACIONAL DE PROFESSORES DE MICROBIOLOGIA; SIMPÓSIO DE COLEÇÕES DE CULTURAS, 4., 2011, Foz do Iguaçu. Anais... São Paulo: SBM, 2011. Resumo, 365-1.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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35. | | TUPINAMBA, D.; CANTAO, M. E.; COSTA, O. Y.; BERGMANN, J. C.; KYAW, C.; BARRETO, C.; QUIRINO, B. F. High-throughput sequencing characterization of land use impact on archaeal community: Amazon native forest and oil palm plantation. In: SYMPOSIUM ON BIOTECHNOLOGY FOR FUELS AND CHEMICALS, 37., 2015, San Diego, California. [Resumos ...] Fairfax: Society for Industrial Microbiology and Biotechnology, 2015. Resumo T67Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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36. | | SCHAEFER, R.; GAVA, D.; HAACH, V.; SERRÃO, V. H. B.; CANTAO, M. E.; ZANELLA, J. R. C. Genetic diversity of porcine circovirus type 2 causing clinical disease in Brazilian pig herds concomitant with PCV2 vaccination. Virus Reviews & Research, Brasília, DF, v. 20, p. 247-248, Oct. 2015. Supplement 1, ref. VV335. Edição dos Resumos do XXVI Brazilian Congress of Virology, X Mercosur Meeting of Virology, Florianóplis, SC, Oct. 2015.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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37. | | GARCIA, D. A.; LOPES, J. S.; FARAH, M. M.; OTAVIANO, A. R.; CANTAO, M. E.; LEDUR, M. C. Ganhos em acurácia com a utilização de informações genômicas na avaliação genética de suínos. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 11., 2015, Santa Maria. Anais... Santa Maria: SBMA, 2015.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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38. | | TOCHETTO, C.; JUNQUEIRA, D. M.; ANDERSON, T. K.; GAVA, D.; HAACH, V.; CANTAO, M. E.; VINCENT, A. L.; SCHAEFER, R. Introductions of pre-2009 human-origin seasonal influenza A viruses in Brazilian swine herds. In: INTERNATIONAL PIG VETERINARY SOCIETY CONGRESS, 26., 2022, Rio de Janeiro. Proceedings... Rio de Janeiro, RJ: IPVS: Abraves, 2022. p. 700.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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40. | | GAVA, D.; SCHAEFER, R.; SERRÃO, V. H. B.; CANTAO, M. E.; SILVA, M. C.; ZANELLA, J. R. C. Mutations in the capsid protein of porcine circovirus type 2 indicates a viral immune evasion. In: Journal of the Brazilian Society for Virology, Ribeirão Preto, v. 19, p. 234-235, 2014. Suppl. 2. Edição dos anais do 25º. Brazilian Congress of Virology e 9º. Mercosur Meeting of Virology, Ribeirão Preto, set./out, 2014.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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