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Biblioteca(s):  Embrapa Suínos e Aves.
Data corrente:  14/10/2015
Data da última atualização:  18/02/2016
Tipo da produção científica:  Artigo em Periódico Indexado
Autoria:  GAVA, D.; SOUZA, C. K.; SCHAEFER, R.; VINCENT, A. L.; CANTAO, M. E.; COLDEBELLA, A.; ZANELLA, J. R. C.
Afiliação:  DANIELLE GAVA, CNPSA; CARINE KUNZLER DE SOUZA, UFRGS; REJANE SCHAEFER, CNPSA; AMY LOUISE VINCENT, USDA/ARS; MAURICIO EGIDIO CANTAO, CNPSA; ARLEI COLDEBELLA, CNPSA; JANICE REIS CIACCI ZANELLA, CNPSA.
Título:  A TaqMan-based real-time PCR for detection and quantification of porcine parvovirus 4.
Ano de publicação:  2015
Fonte/Imprenta:  Journal of Virological Methods, v. 219, p. 14-17, 2015.
DOI:  http://dx.doi.org/10.1016/j.jviromet.2015.03.011
Idioma:  Inglês
Conteúdo:  Porcine parvovirus 4 (PPV4) is a DNA virus, and a member of the Parvoviridae family within the Bocavirus genera. It was detected recently in swine, but its epidemiology and pathology remain unclear. A TaqManbased real-time PCR (qPCR) targeting a conserved region of the ORF3 gene of PPV4 was developed. The qPCR detection limit was 9.5 × 101 DNA copies/L. There was no cross-reaction with porcine parvovirus, torque teno virus 1, torque teno virus 2, porcine circovirus type 1, porcine circovirus type 2, or with pseudorabies virus. Two hundred and seventy-two samples, including serum, semen, lungs, feces, ovarian follicular fluids, ovaries and uterus, were evaluated by qPCR and PPV4 was detected in 36 samples (13.2%). When compared with a conventional PCR (cPCR), the qPCR assay was 10 times more sensitive and the detection of PPV4 DNA in field samples was increased 2.5 times. Partial sequencing of PPV4 ORF3 gene, obtained from two pooled samples of uterus and ovaries, revealed a high nucleotide identity (98?99%) with a reference PPV4 sequence. The qPCR can be used as a fast and accurate assay for the detection and quantification of PPV4 in field samples and for epidemiological studies in swine herds.
Palavras-Chave:  Porcine parvovirus; Swine disease.
Thesagro:  Doença animal; Parvovirose; Suíno; Virologia.
Thesaurus Nal:  Parvoviridae; Quantitative polymerase chain reaction; SsDNA viruses; Virology.
Categoria do assunto:  --
Marc:  Mostrar Marc Completo
Registro original:  Embrapa Suínos e Aves (CNPSA)
Biblioteca ID Origem Tipo/Formato Classificação Cutter Registro Volume Status URL
CNPSA20281 - 1UPCAP - DD
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21.Imagem marcado/desmarcadoSCHAEFER, R.; MORES, N.; GAVA, D.; CANTAO, M. E.; ZANELLA, J. R. C. Long-term circulation of influenza A viruses in swine in Brazil. In: Journal of the Brazilian Society for Virology, Ribeirão Preto, v. 19, p. 53-54, 2014. Suppl. 2. Edição dos anais do 25º. Brazilian Congress of Virology e 9º. Mercosur Meeting of Virology, Ribeirão Preto, set./out, 2014.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves.
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22.Imagem marcado/desmarcadoMEZZARI, M. P.; SILVA, M. L. B. da; CANTAO, M. E.; MA, J.; NOSSA, C. W. Insights of putative pathogens reduction from swine wastewater treatment processes through 16s rDNA pyrosequencing analyses. In: SIMPÓSIO INTERNACIONAL SOBRE GERENCIAMENTO DE RESÍDUOS AGROPECUÁRIOS E AGROINDUSTRIAIS, 4., 2015, Rio de Janeiro, RJ. Anais... Brasília: Embrapa, 2015.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves.
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23.Imagem marcado/desmarcadoSCHAEFER, R.; GAVA, D.; HAACH, V.; ZANELLA, J. R. C.; CANTAO, M. E. Novel H1N2 swine influenza virus reassortant strain derived from the pandemic H1N1/2009 virus. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE VIROLOGIA, 29.; ENCONTRO DE VIROLOGIA DO MERCOSUL, 13., 2018, Gramado. Resumos... Brasília: SBV, 2018.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves.
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24.Imagem marcado/desmarcadoSCHAEFER, R.; GAVA, D.; HAACH, V.; CANTAO, M. E.; NELSON, M. I. Novel human-like H1N1 swine influenza virus with the six internal genes derived from H1N1/2009 virus. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE VIROLOGIA, 28.; ENCONTRO DE VIROLOGIA DO MERCOSUL, 12., 2017, Belo Horizonte. Trabalho pôsteres... Brasília: SBV, 2017.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves.
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25.Imagem marcado/desmarcadoSOUZA, R. C.; CANTAO, M. E.; NOGUEIRA, M. A.; VASCONCELOS, A. T. R.; HUNGRIA, M. Outstanding impact of soil tillage on the abundance of soil hydrolases revealed by a metagenomic approach. Brazilian Journal of Microbiology, v. 49, p. 723-730, 2018.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
Biblioteca(s): Embrapa Soja; Embrapa Suínos e Aves.
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26.Imagem marcado/desmarcadoHAACH, V.; GAVA, D.; CANTAO, M. E.; FRANCO, A. C.; SCHAEFER, R. Padronização de uma RT-qPCR multiplex one-step para subtipagem do vírus influenza a em suínos. In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 13., 2019, Concórdia. Anais... Concórdia: Embrapa Suínos e Aves: UNC, 2019. p. 75-76. JINC 2019.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves.
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27.Imagem marcado/desmarcadoSCHAEFER, R.; NELSON, M. I.; GAVA, D.; CANTAO, M. E.; ZANELLA, J. R. C. Evolution of novel influenza a viruses os human origin in swine in Brazil. In: INTERNATIONAL BIOINFORMATICS WORKSHOP ON MOLECULAR BIOLOGY/ EPIDEMIOLOGY AND VIRAL EVOLUTION, 3., 2015, Belo Horizonte. Abstract book. Fiocruz Minas, 2015. p. 24-25.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves.
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28.Imagem marcado/desmarcadoSOUZA, R. C.; CANTAO, M. E.; VASCONCELOS, A. T. R.; NOGUEIRA, M. A.; HUNGRIA, M. Soil metagenomics reveals differences under conventional and no-tillage with crop rotation or succession. Applied Soil Ecology, v. 72, p. 49-61, Oct. 2013.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
Biblioteca(s): Embrapa Soja; Embrapa Suínos e Aves.
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29.Imagem marcado/desmarcadoGOLDONI, I.; IBELLI, A. M. G.; PEIXOTO, J. de O.; HUL, L. M.; CANTAO, M. E.; LEDUR, M. C. Análise comparativa de transcriptoma de frangos normais e afetados com necrose da cabeça do fêmur. In: ENCONTRO DE GENÉTICA DO NORDESTE, 23., 2021, Petrolina. Da produção de alimentos à saúde única: anais. Natal: UFRN: Sociedade Brasileira de Genética Regional Nordeste, 2021. Evento online.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves.
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30.Imagem marcado/desmarcadoDOMENECH, D.; CANTAO, M. E.; COSTA, O. Y.; CARVALHO B. J.; KYAW, C. M.; KRUGER, R. H.; QUIRINO, B. F. Comparative characterization of the archaeal community in the amazon forest: native forest and oil palm plantation by high-throughput sequencing. In: CONGRESSO LATINOAMERICANO DE MICROBIOLOGIA, 22.; CONGRESSO BOLIVIANO DE MICROBIOLOGIA, 4., 2014, Cartagena. Memórias: Clínica- Bioanálisis - Industrial - Ambiental. Cartagena: Universidad de Antioquia; Associação Colombiana de Microbiologia, 2014. p. 87. Publicado em: Hechos Microbiológicos, v. 5. n. 2, suplemento 2, p. 62, noviembre, 2014. p. 87. ALAM 2014; CCM 2014.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia; Embrapa Suínos e Aves.
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31.Imagem marcado/desmarcadoSOUZA, R. C. de; CANTÃO, M. E.; NOGUEIRA, M. A.; VASCONCELOS, A. T. R.; NICOLAS, M. F.; HUNGRIA, M. Biodiversidade de procariotos em solo sob plantio direto e plantio convencional em rotação ou sucessão de culturas. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MICROBILOGIA, 26.; SIMPÓSIO INTERNACIONAL DE BACTÉRIAS LÁTICAS; ENCONTRO NACIONAL DE PROFESSORES DE MICROBIOLOGIA; SIMPÓSIO DE COLEÇÕES DE CULTURAS, 4., 2011, Foz do Iguaçu. Anais... São Paulo: SBM, 2011. Resumo, 365-1.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Soja.
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32.Imagem marcado/desmarcadoFRIGO, A.; SAVOLDI, I. R.; IBELLI, A. M. G.; PEIXOTO, J. de O.; CANTAO, M. E.; LEDUR, M. C. Identificação de SNPs nos genes MYH2 e CLIC4 associados à hérnia umbilical em suínos. In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 13., 2019, Concórdia. Anais... Concórdia: Embrapa Suínos e Aves: UNC, 2019. p. 32-33. JINC 2019.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves.
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33.Imagem marcado/desmarcadoSCHAEFER, R.; RECH, R. R.; GAVA, D.; CANTAO, M. E.; SILVA, M. C. da; SILVEIRA, S.; ZANELLA, J. R. C. A human-like H1N2 influenza virus detected during an outbreak of acute respiratory disease in swine in Brazil. Archives of virology, 2014.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves.
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34.Imagem marcado/desmarcadoZANELLA, R.; CANTAO, M. E.; PEIXOTO, J. de O.; PANDOLFI, J. R. C.; COUTINHO, L. L.; LEDUR, M. C. Collaborative effort to identify genes involved with bone related traits in broiler chickens. In: INTERNATIONAL PLANT & ANIMAL GENOME, 21., 2013, San Diego. Abstracts... Jersey City: Scherago International, 2013. P0640.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves.
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35.Imagem marcado/desmarcadoTUPINAMBA, D.; CANTAO, M. E.; COSTA, O. Y.; BERGMANN, J. C.; KYAW, C.; BARRETO, C.; QUIRINO, B. F. High-throughput sequencing characterization of land use impact on archaeal community: Amazon native forest and oil palm plantation. In: SYMPOSIUM ON BIOTECHNOLOGY FOR FUELS AND CHEMICALS, 37., 2015, San Diego, California. [Resumos ...] Fairfax: Society for Industrial Microbiology and Biotechnology, 2015. Resumo T67
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia.
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36.Imagem marcado/desmarcadoSCHAEFER, R.; GAVA, D.; HAACH, V.; SERRÃO, V. H. B.; CANTAO, M. E.; ZANELLA, J. R. C. Genetic diversity of porcine circovirus type 2 causing clinical disease in Brazilian pig herds concomitant with PCV2 vaccination. Virus Reviews & Research, Brasília, DF, v. 20, p. 247-248, Oct. 2015. Supplement 1, ref. VV335. Edição dos Resumos do XXVI Brazilian Congress of Virology, X Mercosur Meeting of Virology, Florianóplis, SC, Oct. 2015.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves.
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37.Imagem marcado/desmarcadoGARCIA, D. A.; LOPES, J. S.; FARAH, M. M.; OTAVIANO, A. R.; CANTAO, M. E.; LEDUR, M. C. Ganhos em acurácia com a utilização de informações genômicas na avaliação genética de suínos. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 11., 2015, Santa Maria. Anais... Santa Maria: SBMA, 2015.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves.
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38.Imagem marcado/desmarcadoTOCHETTO, C.; JUNQUEIRA, D. M.; ANDERSON, T. K.; GAVA, D.; HAACH, V.; CANTAO, M. E.; VINCENT, A. L.; SCHAEFER, R. Introductions of pre-2009 human-origin seasonal influenza A viruses in Brazilian swine herds. In: INTERNATIONAL PIG VETERINARY SOCIETY CONGRESS, 26., 2022, Rio de Janeiro. Proceedings... Rio de Janeiro, RJ: IPVS: Abraves, 2022. p. 700.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves.
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39.Imagem marcado/desmarcadoSOUZA, R. C.; HUNGRIA, M.; CANTAO, M. E.; VASCONCELOS, A. T. R.; NOGUEIRA, M. A.; VICENTE, V. A. Metagenomic analysis reveals microbial functional redundancies and specificities in a soil under different tillage and crop-management regimes. Applied Soil Ecology, v. 86, p. 106-112, 2014.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
Biblioteca(s): Embrapa Soja; Embrapa Suínos e Aves.
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40.Imagem marcado/desmarcadoGAVA, D.; SCHAEFER, R.; SERRÃO, V. H. B.; CANTAO, M. E.; SILVA, M. C.; ZANELLA, J. R. C. Mutations in the capsid protein of porcine circovirus type 2 indicates a viral immune evasion. In: Journal of the Brazilian Society for Virology, Ribeirão Preto, v. 19, p. 234-235, 2014. Suppl. 2. Edição dos anais do 25º. Brazilian Congress of Virology e 9º. Mercosur Meeting of Virology, Ribeirão Preto, set./out, 2014.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
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