| |
|
|
|
Registro Completo |
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Caprinos e Ovinos. |
|
Data corrente: |
16/03/2015 |
|
Data da última atualização: |
23/09/2019 |
|
Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
|
Autoria: |
CARDOSO, C. C.; SILVA, E. C. da; PIMENTEL, C. M.; CAETANO, A. R.; FACO, O.; PAIVA, S. R. |
|
Afiliação: |
CAIO CESAR CARDOSO, bolsista, CENARGEN; ELIZABETE CRISTINA DA SILVA, UNB; CONCEPTA MCMANUS PIMENTEL, UNIVERSIDADE FEDERAL DO RIO GRANDE SUL; ALEXANDRE RODRIGUES CAETANO, CENARGEN; OLIVARDO FACO, CNPC; SAMUEL REZENDE PAIVA, CENARGEN. |
|
Título: |
Estimativa inicial de erros de paternidade em um programa de melhoramento genético de caprinos leiteiros. |
|
Ano de publicação: |
2012 |
|
Fonte/Imprenta: |
In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 49., 2012, Brasília, DF. A produção animal no mundo em transformação: anais. Brasília, DF: SBZ, 2012. 3 f. |
|
Páginas: |
3 p. |
|
Idioma: |
Português |
|
Conteúdo: |
Resumo: Este trabalho teve como objetivo em avaliar seis locos para confirmação de paternidade do Teste de Progênie do programa de melhoramento de caprinos leiteiros. 103 amostras de DNA genômico de animais pertencentes a três raças caprinas (Saanen, Anglo Nubiana e Alpina) foram usadas. Foram testados nove marcadores moleculares para o teste de paternidade: INRA05, TCRVB6,SRCRSP9, INRA63, MAF65 e MCM527. Os fragmentos amplificados foram separados em sequenciador automático, ABI Prism 3100 (AppliedBiosystems) e os dados foram analisados com o software Genotyper v. 3.7.0.1 (AppliedBiosystems) para identificação dos genótipos. Foi utilizado o software Cervus v. 3.0.3 para obtermos a o número de alelos (K), heterozigosidades observada (Ho) e esperada (He), conteúdo de informação polimórfica (PIC), duas probabilidades de exclusão (P e PE2) para cada loco. Os seis locos do presente estudo amplificaram fragmentos polimórficos nas três raças avaliadas. O número de alelos encontrados foi entre cinco e 13 locos. O maior valor obtido de PIC foi o SRCRSP9 (0,86), mas o loco INRA05 apresentou a maior probabilidade de exclusão 0,84.O teste de exclusão de paternidade foi confirmado, já que foi obtida uma alta taxa de exclusão. A porcentagem de acerto no teste de paternidade foi de 47,82% para pares (suposto pai e produto) e de 39,02% para trios (suposto pai, matriz e produto). Para uma maior probabilidade de exclusão deverão ser acrescentados outro locos para um teste mais confiável. [Paternity test with molecular markers in breeding program of dairy goats]. Abstract: This study aimed to evaluate six loci for paternity confirmation in animals from the Dairy Goat Breeding Program Progeny Test. 103 genomic DNA samples of animals belonging to three goat breeds (Saanen, Anglo Nubian and Alpine) were used in this work. Six different molecular markers were used for paternity testing: INRA05, TCRVB6,SRCRSP9, INRA63, MAF65 e MCM527. The amplified fragments were separated in an automated sequencer, ABI PRISM 3100 (Applied Biosystems) and data were analyzed with the Genotyper software v. 3.7.0.1 (Applied Biosystems) to identify the genotypes. Cervus v. 3.0.3 software was used to obtain the number of alleles (K), observed (Ho) and expected (He) heterozygosity, polymorphic information content (PIC), two exclusion probabilities (PE1 and PE2) for each locus. The six loci amplified in this study were polymorphic in the three breeds studied. The number of alleles per locos varied from five to thirteen. The highest value obtained for PIC was for the SRCRSP9 locus (0.86) but INRA05 had the highest exclusion probability of 0.84.The markers tested for paternity exclusion was confirmed, since they had a high rate of exclusion. The percentage of success in paternity test was 47.82% for pairs (alleged father and product) and 39.02% for trios (alleged father, mother and product). For a greater probability of exclusion should be added to other loci for a paternity test more reliable. MenosResumo: Este trabalho teve como objetivo em avaliar seis locos para confirmação de paternidade do Teste de Progênie do programa de melhoramento de caprinos leiteiros. 103 amostras de DNA genômico de animais pertencentes a três raças caprinas (Saanen, Anglo Nubiana e Alpina) foram usadas. Foram testados nove marcadores moleculares para o teste de paternidade: INRA05, TCRVB6,SRCRSP9, INRA63, MAF65 e MCM527. Os fragmentos amplificados foram separados em sequenciador automático, ABI Prism 3100 (AppliedBiosystems) e os dados foram analisados com o software Genotyper v. 3.7.0.1 (AppliedBiosystems) para identificação dos genótipos. Foi utilizado o software Cervus v. 3.0.3 para obtermos a o número de alelos (K), heterozigosidades observada (Ho) e esperada (He), conteúdo de informação polimórfica (PIC), duas probabilidades de exclusão (P e PE2) para cada loco. Os seis locos do presente estudo amplificaram fragmentos polimórficos nas três raças avaliadas. O número de alelos encontrados foi entre cinco e 13 locos. O maior valor obtido de PIC foi o SRCRSP9 (0,86), mas o loco INRA05 apresentou a maior probabilidade de exclusão 0,84.O teste de exclusão de paternidade foi confirmado, já que foi obtida uma alta taxa de exclusão. A porcentagem de acerto no teste de paternidade foi de 47,82% para pares (suposto pai e produto) e de 39,02% para trios (suposto pai, matriz e produto). Para uma maior probabilidade de exclusão deverão ser acrescentados outro locos para um teste mais confiável. [Pat... Mostrar Tudo |
|
Palavras-Chave: |
Microsatellites; Microssatélite; Paternidade; Paternity tests. |
|
Thesagro: |
Caprino; Genética animal; Marcador molecular. |
|
Thesaurus Nal: |
Animal genetics; Genetic markers; Goats. |
|
Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
|
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/163386/1/CNPC-2012-Estimativa.pdf
|
|
Marc: |
LEADER 04006nam a2200301 a 4500
001 2011473
005 2019-09-23
008 2012 bl uuuu u00u1 u #d
100 1 $aCARDOSO, C. C.
245 $aEstimativa inicial de erros de paternidade em um programa de melhoramento genético de caprinos leiteiros.$h[electronic resource]
260 $aIn: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 49., 2012, Brasília, DF. A produção animal no mundo em transformação: anais. Brasília, DF: SBZ, 2012. 3 f.$c2012
300 $a3 p.
520 $aResumo: Este trabalho teve como objetivo em avaliar seis locos para confirmação de paternidade do Teste de Progênie do programa de melhoramento de caprinos leiteiros. 103 amostras de DNA genômico de animais pertencentes a três raças caprinas (Saanen, Anglo Nubiana e Alpina) foram usadas. Foram testados nove marcadores moleculares para o teste de paternidade: INRA05, TCRVB6,SRCRSP9, INRA63, MAF65 e MCM527. Os fragmentos amplificados foram separados em sequenciador automático, ABI Prism 3100 (AppliedBiosystems) e os dados foram analisados com o software Genotyper v. 3.7.0.1 (AppliedBiosystems) para identificação dos genótipos. Foi utilizado o software Cervus v. 3.0.3 para obtermos a o número de alelos (K), heterozigosidades observada (Ho) e esperada (He), conteúdo de informação polimórfica (PIC), duas probabilidades de exclusão (P e PE2) para cada loco. Os seis locos do presente estudo amplificaram fragmentos polimórficos nas três raças avaliadas. O número de alelos encontrados foi entre cinco e 13 locos. O maior valor obtido de PIC foi o SRCRSP9 (0,86), mas o loco INRA05 apresentou a maior probabilidade de exclusão 0,84.O teste de exclusão de paternidade foi confirmado, já que foi obtida uma alta taxa de exclusão. A porcentagem de acerto no teste de paternidade foi de 47,82% para pares (suposto pai e produto) e de 39,02% para trios (suposto pai, matriz e produto). Para uma maior probabilidade de exclusão deverão ser acrescentados outro locos para um teste mais confiável. [Paternity test with molecular markers in breeding program of dairy goats]. Abstract: This study aimed to evaluate six loci for paternity confirmation in animals from the Dairy Goat Breeding Program Progeny Test. 103 genomic DNA samples of animals belonging to three goat breeds (Saanen, Anglo Nubian and Alpine) were used in this work. Six different molecular markers were used for paternity testing: INRA05, TCRVB6,SRCRSP9, INRA63, MAF65 e MCM527. The amplified fragments were separated in an automated sequencer, ABI PRISM 3100 (Applied Biosystems) and data were analyzed with the Genotyper software v. 3.7.0.1 (Applied Biosystems) to identify the genotypes. Cervus v. 3.0.3 software was used to obtain the number of alleles (K), observed (Ho) and expected (He) heterozygosity, polymorphic information content (PIC), two exclusion probabilities (PE1 and PE2) for each locus. The six loci amplified in this study were polymorphic in the three breeds studied. The number of alleles per locos varied from five to thirteen. The highest value obtained for PIC was for the SRCRSP9 locus (0.86) but INRA05 had the highest exclusion probability of 0.84.The markers tested for paternity exclusion was confirmed, since they had a high rate of exclusion. The percentage of success in paternity test was 47.82% for pairs (alleged father and product) and 39.02% for trios (alleged father, mother and product). For a greater probability of exclusion should be added to other loci for a paternity test more reliable.
650 $aAnimal genetics
650 $aGenetic markers
650 $aGoats
650 $aCaprino
650 $aGenética animal
650 $aMarcador molecular
653 $aMicrosatellites
653 $aMicrossatélite
653 $aPaternidade
653 $aPaternity tests
700 1 $aSILVA, E. C. da
700 1 $aPIMENTEL, C. M.
700 1 $aCAETANO, A. R.
700 1 $aFACO, O.
700 1 $aPAIVA, S. R.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Caprinos e Ovinos (CNPC) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
|
| Registros recuperados : 304 | |
| 61. |  | NINOV, K.; LEDUR, M. C.; NONES, K.; COLDEBELLA, A.; BERTOL, T. M.; CAETANO, A. R.; COUTINHO, L. L. Associação de polimorfismo de base única (SNP) no íntron 8 do gene do receptor da leptina em galinhas com rendimento de órgãos. In: REUNIAO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 44., 2007, Jaboticabal. Anais... Jaboticabal: SBZ, 2007. 1 CD-ROM. Projeto n. 02.03.21.600-01.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica | Circulação/Nível: -- - -- |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
|   |
| 63. | | SILVA, J. M. da; ROMANIUC, A. R.; CAETANO, A. R.; GIACHETTO, P. F.; YAMAGISHI, M. E. B. Java Merging Copy Number Variants (JM-CNV): a new algorithm for identifying Copy Number Variant Regions (CNVR). In: PLANT & ANIMAL GENOME CONFERENCE, 23., 2015, San Diego, CA. [Abstracts...]. San Diego: [s.n.], 2015. Não paginado. PAG 2015. Pôster P1170.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
|  |
| 64. | | PIMENTEL, F.; MCMANUS, C.; SOARES, K.; CAETANO, A. R.; FARIA, D. A. de; PAIVA, S. R.; IANELLA, P. Landscape genetics for Brazilian equines. Journal of Equine Veterinary Science, v. 126, 104251, 2023.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 4 |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
|  |
| 65. | | DE CAMPOS, T. A.; MERIGHE, G. K. F.; AMARAL, M. E. J.; MEIRELLES, F. V.; CAETANO, A. R. Construção de uma biblioteca genômica tipo BAC de nelore (Bos taurus indicus). In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 54., 2008, Salvador. Resumos... Salvador: SBG, 2008. p. 224. 1 CD-ROM. Apresentado também no: In: ENCONTRO DO TALENTO ESTUDANTIL DA EMBRAPA RECURSOS GENÉTICOS E BIOTECNOLOGIA, 13., 2008, Brasília, DF. Anais: resumos dos trabalhos. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2008. Resumo 028.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
| |
| 66. | | CARDOSO, C. C.; SILVA, E. C. da; PIMENTEL, C. M.; CAETANO, A. R.; FACO, O.; PAIVA, S. R. Estimativa inicial de erros de paternidade em um programa de melhoramento genético de caprinos leiteiros. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 49., 2012, Brasília. A produção animal no mundo em transformação: anais. Brasília, DF: SBZ, 2012. 3 p.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
| |
| 67. | | CARDOSO, C. C.; SILVA, E. C. da; PIMENTEL, C. M.; CAETANO, A. R.; FACO, O.; PAIVA, S. R. Estimativa inicial de erros de paternidade em um programa de melhoramento genético de caprinos leiteiros. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 49., 2012, Brasília, DF. A produção animal no mundo em transformação: anais. Brasília, DF: SBZ, 2012. 3 f. 3 p.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
| |
| 69. | | GALVÃO, S. R.; MARIANI, P.; WILLIAMS, J. L.; WOMACH, J. E.; AMARAL, M. E. J.; CAETANO, A. R. Mapeamento físico e comparativo do cromossomo 14 bubalino (Bubalus bubalis) com painel de células híbridas irradiadas. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 54., 2008, Salvador. Resumos... Salvador: SBG, 2008. p. 220. 1 CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
| |
| 73. | | IANELLA, P.; ARAUJO, R. O.; LACERDA, T. S.; MCMANUS, C. M.; CAETANO, A. R.; PAIVA, S. R. SNP mining and linkage disequilibrium analysis in the PRNP gene of different brazilian sheep breeds. In: INTERNATIONAL PLANT & ANIMAL GENOME, 20., 2012, San Diego. Abstract... Jersey City: Scherago International, 2012. PO584.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
| |
| 75. | | NINOV, K.; LEDUR, M. C.; NONES, K.; CAETANO, A. R.; COLDEBELLA, A.; BERTOL, T. M.; COUTINHO, L. L. Mining of polymorphism in the leptin receptor gene in two chicken lines and their association with performance and carcass traits. In: INTERNATIONAL CONFERENCE ON ANIMAL GENETICS, 30., 2006, Porto Seguro, BA. [Proceedings...]. Belo Horizonte, MG: CBRA, 2006.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
| |
| 77. | | CARREIRO, C. de M.; McMANUS, C.; SANTOS, S. A.; MARTINS, C. F.; CAETANO, A. R.; PAIVA, S. R. Estudo da Origem do Ovino Crioulo do Pantanal por Marcadores Mitocondriais e do Cromossomo Y. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 49., 2012, Brasília. Anais... Brasília: Sociedade Brasileira de Zootecnia, 2012. 3 p.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
| |
| 78. | | CARREIRO, C. de M.; McMANUS, C.; SANTOS, S. A.; MARTINS, C. F.; CAETANO, A. R.; PAIVA, S. R. Estudo da Origem do Ovino Crioulo do Pantanal por Marcadores Mitocondriais e do Cromossomo Y. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 49., 2012, Brasília. Anais... Brasília: Sociedade Brasileira de Zootecnia, 2012. (CD-ROM). 3p.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pantanal. |
| |
| 79. | | VINOCUR, M. E.; BRASS, K. E.; CAETANO, A. R.; SILVA, L. F.; SILVA, A. C.; SILVA, C. A. M. Equine protease inhibitor system as a marker for the diagnosis of chronic obstructive pulmonary disease (COPD). Genetics and Molecular Biology, v. 28, n. 3, p. 382-385, 2005.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
| |
| 80. | | COSTA, N. S.; SILVEIRA, M. M.; VARGAS, L. N.; CAETANO, A. R.; RUMPF, R.; FRANCO, M. M. Epigenetic characterization of the H19/IGF2 locus in calf clones placenta. Pesquisa Veterinária Brasileira, v. 40, n. 12, p. 1063-1072, 2020.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
| |
| Registros recuperados : 304 | |
|
| Nenhum registro encontrado para a expressão de busca informada. |
|
|
