| |
|
|
 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Arroz e Feijão. Para informações adicionais entre em contato com cnpaf.biblioteca@embrapa.br. |
|
Registro Completo |
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Arroz e Feijão. |
|
Data corrente: |
04/10/2021 |
|
Data da última atualização: |
08/12/2021 |
|
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
|
Autoria: |
MORAIS JÚNIOR, O. P.; BRESEGHELLO, F.; DUARTE, J. B.; COELHO, A. S. G.; BORBA, T. C. O.; AGUIAR, J. T.; NEVES, P. C. F.; MORAIS, O. P. |
|
Afiliação: |
ODILON PEIXOTO MORAIS JUNIOR, UFG; FLAVIO BRESEGHELLO, CNPAF; JOAO BATISTA DUARTE, UFG; ALEXANDRE S. G. COELHO, UFG; TEREZA CRISTINA DE OLIVEIRA BORBA, CNPAF; JORDENE T. AGUIAR; PERICLES DE CARVALHO FERREIRA NEVES, CNPAF; ORLANDO PEIXOTO DE MORAIS, CNPAF. |
|
Título: |
Assessing prediction models for different traits in a rice population derived from a Recurrent Selection Program. |
|
Ano de publicação: |
2018 |
|
Fonte/Imprenta: |
Crop Science, v. 58, n. 6, p. 2347-2359, Nov./Dec. 2018. |
|
ISSN: |
0011-183X |
|
DOI: |
https://doi.org/10.2135/cropsci2018.02.0087 |
|
Idioma: |
Inglês |
|
Conteúdo: |
Genomic selection (GS) is a promising approach to improve rice (Oryza sativa L.) populations by using genome-wide markers for selection prior to phenotyping to estimate breeding values. In this study, our objectives were to compare certain prediction models with different struc-tures of genetic relationship and statistical approaches for relevant traits in rice and to discuss some implications for integrating GS into a recurrent selection program of irrigated rice. We assessed nine models in terms of predictive potential, using empirical data from S1:3 progenies phenotyped for eight traits with different heritabilities and genotyped with 6174 high-quality single nucleotide polymorphism markers. For all traits, marker-based models outperformed prediction based on pedigree records alone. A similar level of accuracy was observed for many models, although the level of prediction stability and prediction bias varied widely. Random forest was slightly superior for less complex traits, although with high predic-tion bias, whereas the semiparametric RKHS method (reproducing kernel Hilbert spaces) was superior for many traits, showing high stability and low bias. Bayesian variable selec-tion method Bayes Cp showed acceptable accuracy and stability for several traits and thus could be useful for genomic prediction aiming at persisting accuracy for a long-term recurrent selection. |
|
Thesagro: |
Arroz; Melhoramento Genético Vegetal; Oryza Sativa; Seleção Recorrente. |
|
Thesaurus Nal: |
Plant breeding; Recurrent selection; Rice. |
|
Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
|
Marc: |
LEADER 02349naa a2200313 a 4500
001 2135012
005 2021-12-08
008 2018 bl uuuu u00u1 u #d
022 $a0011-183X
024 7 $ahttps://doi.org/10.2135/cropsci2018.02.0087$2DOI
100 1 $aMORAIS JÚNIOR, O. P.
245 $aAssessing prediction models for different traits in a rice population derived from a Recurrent Selection Program.$h[electronic resource]
260 $c2018
520 $aGenomic selection (GS) is a promising approach to improve rice (Oryza sativa L.) populations by using genome-wide markers for selection prior to phenotyping to estimate breeding values. In this study, our objectives were to compare certain prediction models with different struc-tures of genetic relationship and statistical approaches for relevant traits in rice and to discuss some implications for integrating GS into a recurrent selection program of irrigated rice. We assessed nine models in terms of predictive potential, using empirical data from S1:3 progenies phenotyped for eight traits with different heritabilities and genotyped with 6174 high-quality single nucleotide polymorphism markers. For all traits, marker-based models outperformed prediction based on pedigree records alone. A similar level of accuracy was observed for many models, although the level of prediction stability and prediction bias varied widely. Random forest was slightly superior for less complex traits, although with high predic-tion bias, whereas the semiparametric RKHS method (reproducing kernel Hilbert spaces) was superior for many traits, showing high stability and low bias. Bayesian variable selec-tion method Bayes Cp showed acceptable accuracy and stability for several traits and thus could be useful for genomic prediction aiming at persisting accuracy for a long-term recurrent selection.
650 $aPlant breeding
650 $aRecurrent selection
650 $aRice
650 $aArroz
650 $aMelhoramento Genético Vegetal
650 $aOryza Sativa
650 $aSeleção Recorrente
700 1 $aBRESEGHELLO, F.
700 1 $aDUARTE, J. B.
700 1 $aCOELHO, A. S. G.
700 1 $aBORBA, T. C. O.
700 1 $aAGUIAR, J. T.
700 1 $aNEVES, P. C. F.
700 1 $aMORAIS, O. P.
773 $tCrop Science$gv. 58, n. 6, p. 2347-2359, Nov./Dec. 2018.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Arroz e Feijão (CNPAF) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
|
| Registros recuperados : 184 | |
| 101. |  | BORBA, T. C. de O.; BRESEGHELLO, F.; DEL PELOSO, M. J.; MELO, L. C.; PEREIRA, H. S.; BRONDANI, R. P. V. Diversidade genética em acessos de feijoeiro comum analisada através de marcadores microssatélites. In: CONGRESSO NACIONAL DE PESQUISA DE FEIJÃO, 9., 2008, Campinas. Ciência e tecnologia na cadeia produtiva do feijão. Campinas: Instituto Agronômico, 2008. 1 CD-ROM. (IAC. Documentos, 85).| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
|    |
| 102. | | GONDIM, S. G. C. A.; RESENDE, L. V.; BRONDANI, R. P. V.; BORBA, T. C. de O.; SILVA-JÚNIOR, N. J.; TELLES, M. P. C. Desenvolvimento de iniciadores de regiões microssatélites para a espécie migradora Hoplias malabaricus (Bloch, 1974). In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 55., 2009, Águas de Lindóia, SP. Resumos... Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2009. p. 95.| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
| |
| 103. | | BORBA, T. C. B.; PAES, N. S.; OLIVEIRA, R. S.; EVANGELISTA, I. B. R.; CAVALCANTE, K. L.; GROSSI-de-SÁ, M. F. Desenvolvimento de calos de Gossypium hirsutum. In: ENCONTRO DO TALENTO ESTUDANTIL DA EMBRAPA RECURSOS GENÉTICOS E BIOTECNOLOGIA, 10., 2005, Brasília, DF. Anais: resumos dos trabalhos. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2005. p. 48.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
| |
| 104. | | CARDOSO, P. C. B.; BRONDANI, C.; MENEZES, I. P. P.; VALDISSER, P. A. M. R.; BORBA, T. C. O.; DEL PELOSO, M. J.; VIANELLO, R. P. Discrimination of common bean cultivars using multiplexed microsatellite markers. Genetics and Molecular Research, v. 13, n. 1, p. 1964-1978, 2014.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
| |
| 105. | | RIBEIRO, A. G.; RODRIGUES, L. A.; BORBA, T. C. de O.; COSTA, S. de P. P.; ABREU, A. G. de; SOARES, S. da S.; MELLO, R. N. de. Monitoramento dos genes PI1, PI2 e PI33 de resistência à brusone em linhagens de arroz. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 9., 2017, Foz do Iguaçu. Melhoramento de plantas: projetando o futuro. Foz do Iguaçu: SBMP, 2017. p. 89.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
| |
| 106. | | VIEIRA, A. F.; VALDISSER, P. A. M. R.; BORBA, T. C. de O.; LANNA, A. C.; VIANELLO, R. P.; NEVES, L. G.; BRONDANI, C. Marcadores SNPs derivados de captureseq associados a tolerância à seca em arroz. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 9., 2017, Foz do Iguaçu. Melhoramento de plantas: projetando o futuro. Foz do Iguaçu: SBMP, 2017. p. 86.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
| |
| 108. | | SILVA, G. R. da; BASSINELLO, P. Z.; CARVALHO, R. N.; UTUMI, M. M.; CASTRO, A. P. de; BORBA, T. C. de O. Busca de um sítio de fenotipagem de gessados em arroz de terras altas e a relação do defeito com a qualidade de grãos. In: SEMINÁRIO JOVENS TALENTOS, 15., 2021, Santo Antônio de Goiás. Resumos... Brasília, DF: Embrapa; Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2021. p. 17. Evento on-line.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Rondônia. |
| |
| 109. | | SILVA, G. R. da; BASSINELLO, P. Z.; CARVALHO, R. N.; UTUMI, M. M.; CASTRO, A. P. de; BORBA, T. C. de O. Busca de um sítio de fenotipagem de gessados em arroz de terras altas e a relação do defeito com a qualidade de grãos. In: SEMINÁRIO JOVENS TALENTOS, 15., 2021, Santo Antônio de Goiás. Resumos... Brasília, DF: Embrapa; Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2021. p. 17. Evento on-line.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
| |
| 111. | | GARCIA, R. A. V.; RANGEL, P. N.; BRONDANI, C.; MARTINS, W. S.; MELO, L. C.; CARNEIRO, M. S.; BORBA, T. C. O.; BRONDANI, R. P. V. The characterization of a new set of EST-derived simple sequence repeat (SSR) markers as a resource for the genetic analysis of Phaseolus vulgaris. BMC Genetics, v. 12, n. 41, 2011.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
| |
| 112. | | CARDOSO, A. A.; ANDRAUS, M. de P.; BORBA, T. C. de O.; MARTIN-DIDONET, C. C. G.; FERREIRA, E. P. de B. Characterization of rhizobia isolates obtained from nodules of wild genotypes of common bean. Brazilian Journal of Microbiology, São Paulo, v. 48, n. 1, p. 43-50, jan./mar. 2017.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
| |
| 113. | | MELO, A. T. O.; BRONDANI, R. P. V.; BRONDANI, C.; COELHO, A. S. G.; BORBA, T. C. de O.; MAGNABOSCO, C. de U. Caracterização molecular de genótipos de dendê (Elaeis guineensis Jacq.) através marcadores microssatélites fluorescentes. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 55., 2009, Águas de Lindóia, SP. Resumos... Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2009. p. 211.| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
| |
| 114. | | MELO, A. T. O.; BRONDANI, R. P. V.; BRONDANI, C.; COELHO, A. S. G.; BORBA, T. C. de O.; MAGNABOSCO, C. de U. Caracterização molecular de genótipos de dendê (Elaeis guineensis jacq.) através de marcadores microssatélites fluorescentes. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 55., 2009, Águas de Lindóia, SP. Resumos... Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2009. 1 CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
| |
| 116. | | CASCÃO, L. M.; CIESLAK, J. F.; MELO, L. C.; OLIVEIRA, J. P. de; DEL PELOSO, M. J.; COSTA, J. G. C. da; BORBA, T. C. de O. Caracterização genética da coleção nuclear de feijão da Embrapa pelo uso de marcadores SSR. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 7., 2013, Uberlândia. Variedade melhorada: a força da nossa agricultura: anais. Viçosa, MG: SBMP, 2013. p. 40-42.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
| |
| 117. | | ARAÚJO, L. G. de; PAIVA, B. A. R. de; BORBA, T. C. de O.; CORTES, M. V. de C. B.; WENDLAND, A. Caracterização genética por REP-PCR de isolados de Xanthomonas axonopodis pv. phaseoli e Xanthomonas fuscans subsp. fuscans. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 8., 2015, Goiânia. O melhoramento de plantas, o futuro da agricultura e a soberania nacional: anais. Goiânia: UFG: SBMP, 2015.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
| |
| 118. | | MOTA, A. P. S.; MENEZES, I. P. P. de; VEIGA, M. M. A.; BRONDANI, C.; BORBA, T. C. de O.; PEREIRA, H. S.; VIANELLO, R. P. Caracterização de germoplasma cultivado de Phaseolus vulgaris que compõem ensaios de VCU utilizando marcadores microssatélites. In: CONGRESSO NACIONAL DE PESQUISA DE FEIJÃO, 10., 2011, Goiânia. Anais... Goiânia: Embrapa Arroz e Feijão, 2011. 1 CD-ROM. CONAFE.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
| |
| 119. | | SOUZA, G. A. de; SILVA, E. B. da; RODRIGUES, L. A.; BORBA, T. C. de O.; ABREU, A. G. de; MELLO, R. N. de; TORGA, P. P. Caracterização molecular dos acessos de arroz vermelho (Oryza sativa L.) do Banco de Germoplasma da Embrapa. In: SEMINÁRIO JOVENS TALENTOS, 10., 2016, Santo Antônio de Goiás. Coletânea dos resumos apresentados. Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2016. p. 15. (Embrapa Arroz e Feijão. Documentos, 311).| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
| |
| 120. | | CIESLAK, J. F.; BORBA, T. C. de O.; MELO, L. C.; OLIVEIRA, J. P. de; DEL PELOSO, M. J.; COSTA, J. G. C. da. Caracterização molecular dos acessos componentes da coleção nuclear de feijão da Embrapa utilizando marcadores microssatélites. In: SEMINÁRIO JOVENS TALENTOS, 5., 2011, Santo Antônio de Goiás. Resumos apresentados. Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2011. p. 26. (Embrapa Arroz e Feijão. Documentos, 270).| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
| |
| Registros recuperados : 184 | |
|
| Nenhum registro encontrado para a expressão de busca informada. |
|
|
