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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Soja. |
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Data corrente: |
18/06/2012 |
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Data da última atualização: |
13/07/2017 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
NASCIMENTO, L. C. do; COSTA, G. G. L.; BINNECK, E.; PEREIRA, G. A. G.; CARAZZOLLE, M. F. |
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Afiliação: |
LEANDRO COSTA DO NASCIMENTO, UNICAMP; GUSTAVO GILSON LACERDA COSTA, UNICAMP; ELISEU BINNECK, CNPSO; GONÇALO AMARANTE GUIMARÃES PEREIRA, UNICAMP; MARCELO FALSARELLA CARAZZOLLE, UNICAMP. |
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Título: |
A web-based bioinformatics interface applied to the GENOSOJA Project: databases and pipelines. |
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Ano de publicação: |
2012 |
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Fonte/Imprenta: |
Genetics and Molecular Biology, Ribeirão Preto, v. 35, n. 1, suppl., p. 203-211, May 2012. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
The Genosoja consortium is an initiative to integrate different omics research approaches carried out in Brazil. Basically, the aim of the project is to improve the plant by identifying genes involved in responses against stresses that affect domestic production, like drought stress and Asian Rust fungal disease. To do so, the project generated several types of sequence data using different methodologies, most of them sequenced by next generation sequencers. The initial stage of the project is highly dependent on bioinformatics analysis, providing suitable tools and integrated databases. In this work, we describe the main features of the Genosoja web database, including the pipelines to analyze some kinds of data (ESTs, SuperSAGE, microRNAs, subtractive cDNA libraries), as well as web interfaces to access information about soybean gene annotation and expression. |
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Palavras-Chave: |
Bioinformática; Expressão genética. |
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Thesagro: |
Gene; Soja. |
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Thesaurus Nal: |
Bioinformatics; Gene expression; Genes; Soybeans. |
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Categoria do assunto: |
S Ciências Biológicas |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/61065/1/gmb.web-based.v35n1s.203-211.2012.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Soja (CNPSO) |
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Biblioteca |
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Registro |
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URL |
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| Registros recuperados : 169 | |
| 41. |  | NEPOMUCENO, A. L.; FARIAS, J. R. B.; NEUMAIER, N.; TOBITA, S.; YAMANAKA, N.; BINNECK, E.; MOLINA, J.; STOLF, R. Drought induced gene expression in Brazilian soybean genotypes. In: INTERNATIONAL CONFERENCE ON INTEGRATED APPROACHES TO SUSTAIN AND IMPROVE PLANT PRODUCTION UNDER DROUGHT STRESS, 2., 2005, Rome. InterDrought - II: final program and abstract book. Rome, 2005. Não paginado. Resumo: P 6.34.| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 42. | | SOSA-GOMEZ, D. R.; HUMBER, R. A.; HODGE, K. T.; BINNECK, E.; SILVA-BRANDÃO, K. L. da. Variability of the mitochondrial SSU rDNA of Nomuraea species and other entomopathogenic fungi from Hypocreales. Mycopathologia, Netherlands, v. 167, n. 3, p. 145-154, mar. 2009.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 3 |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 43. | | NEPOMUCENO, A. L.; ABDELNOOR, R; FARIAS, J. R. B.; MARCELINO, F. C.; BINNECK, E.; ALMEIDA, A. M. Soybean drought tolerance and asian rust resistance: searching for solutions in Brazil. Journal of Basic & Applied Genetics, Buenos Aires, v. 18, p. S-65, Sept. 2007. Resumo apresentado no XXXVI Congreso Argentino de Genetica, 2007, Buenos Aires.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 44. | | BARBOSA, E. G. G.; IWATA, M.; SILLA, P. R.; ALMEIDA, A. M. R.; ABDELNOOR, R. V.; BINNECK, E. Sintenia de duas regiões genômicas da soja contendo genes de resistência à ferrugem-asiática com outras plantas modelo. In: JORNADA ACADÊMICA DA EMBRAPA SOJA, 4., 2009, Londrina. Resumos... Londrina: Embrapa Soja, 2009. p. 37-41. (Embrapa Soja. Documentos, 312). Editado por Odilon Ferreira Saraiva, Paula Geron Saiz Melo.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 45. | | NASCIMENTO, L. C. do; COSTA, G. G. L.; BINNECK, E.; PEREIRA, G. A. G.; CARAZZOLLE, M. F. A web-based bioinformatics interface applied to the GENOSOJA Project: databases and pipelines. Genetics and Molecular Biology, Ribeirão Preto, v. 35, n. 1, suppl., p. 203-211, May 2012.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 46. | | BINNECK, E.; IWATA, M.; SANTOS, L. G. A. dos; MARCELINO, F. C.; ABDELNOOR, R. V.; NEPOMUCENO, A. L. VSQUAL: a visual system to assist DNA sequencing quality control. In: SIMPOSIO NACIONAL DE BIOTECNOLOGIA REDBIO-ARGENTINA, 7.; CONGRESO INTERNACIONAL-REDBIO-ARGENTINA, 2., 2009, Rosario. La biotecnologia y los futuros escenarios mundiales: [resumenes]. Rosario: INTA, 2009. p. 59.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 47. | | MARTINS, P. K.; JORDÃO, B. Q.; BRETON, M. C.; PEDROSO, J. C.; MARIN, S. R. R.; BINNECK, E.; OYA, T.; NEPOMUCENO, A. L. Avaliação dos efeitos do déficit hídrico na expressão gênica em raízes de soja [Glycine max (l.) Merrill] In: CONGRESSO NACIONAL DE GENÉTICA, 48., 2002, Águas de Lindóia. A genética na inclusão social: resumos. Águas de Lindóia: SBG, 2002. 1 CD-ROM. Resumo Área MG pdf.091.| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 48. | | PEREIRA, S. S.; STOLF, R.; ROLLA, A. A. P.; FUGANTI, R.; MARIN, S. R. R.; BINNECK, E.; ABDELNOOR, R. V.; MARCELINO F. C.; NEPOMUCENO, A. L. Análise da expressão de fatores de transcrição relacionados com tolerância à seca, em soja, através da técnica de PCR em tempo real. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 54., 2008, Salvador. Resumos... Salvador: SBG, 2008. p. 245.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 49. | | BRITO JÚNIOR, S. L.; MARCELINO, F. C.; POLIZEL, A. L.; STOLF, R.; BINNECK, E.; NEPOMUCENO, A. L.; BORÉM, A.; ABDELNOOR, R. V. Análise da expressão de genes relacionados a estresses em soja em resposta ao fungo Phakopsora pachyrhizi. Tropical Plant Pathology, Brasília, DF, v. 33, p. S 202, ago. 2008. Suplemento. Edição dos Resumos apresentado no XLI Congresso Brasileiro de Fitopatologia, Belo Horizonte, ago., 2008.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Internacional - A |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 50. | | MORALES, A. M. R.; MOLINA, J. C.; LEMOS, N. G.; FUGANTI, R.; NEPOMUCENO, A. L.; NEUMAIER, N.; FARIAS, J. R. B.; BINNECK, E. Análise dos genes expressos em raízes de soja submetidas a déficit hídrico. In: SIMPOSIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA UNIFIL, 12., 2004, Londrina. Resumos... Londrina: UniFil, 2004. 1 CD-ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 51. | | ALMEIDA, A. M. R.; BINNECK, E.; PIUGA, F. F.; MARIN, S. R. R.; VALLE, P. R. Z. R. do; SILVEIRA, C. A. Characterization of powdery mildews strains from soybean, bean, sunflower, and weeds in Brazil using rDNA-ITS sequences. Tropical Plant Pathology, Brasília, DF, v. 33, n. 1, p. 20-26. jan./fev. 2008.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Internacional - A |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 52. | | VITORINO, J. C.; BARBOSA, E. G. G.; IWATA, M.; SILLA, P. R.; SARAIVA, O. F.; FRANCHINI, J. C.; GONÇALVES, S. L.; BINNECK, E. Base de dados sobre a dinâmica de decomposição de resíduos vegetais em sistemas de manejo do solo. In: JORNADA ACADÊMICA DA EMBRAPA SOJA, 4., 2009, Londrina. Resumos... Londrina: Embrapa Soja, 2009. p. 175-179. (Embrapa Soja. Documentos, 312). Editado por Odilon Ferreira Saraiva, Paula Geron Saiz Melo.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 53. | | FERREIRA, J. R.; TORRES, G. A. M.; CONSOLI, L.; BINNECK, E.; DEUNER, C. C.; CHINOY, C.; GODDARD, R.; STEED, A.; NICHOLSON, P. Caracterização fenotípica de linhagens tilling de genes-candidatos de resistência a Magnaporthe oryzae em trigo. In: MOSTRA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 13.; MOSTRA DE PÓS-GRADUAÇÃO DA EMBRAPA TRIGO, 10., 2018, Passo Fundo. Resumos... Brasília, DF: Embrapa, 2018. 47 p. Pós-graduação.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Trigo. |
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| 54. | | ALMEIDA, A. M. R.; KITAJIMA, E. W.; PIUGA, F. F.; OLIVEIRA, T. G.; BINNECK, E.; BENATO, L. C.; PINTO, M. C.; VALENTIN, N. Caracterização, epidemiologia e controle de viroses de soja. In: HOFFMANN-CAMPO, C. B.; SARAIVA, O. F. (Org.). Resultados de pesquisa da Embrapa Soja - 2001: doenças e nematóides. Londrina: Embrapa Soja, 2002. p. 18-21. (Embrapa Soja. Documentos, 194).| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 55. | | FERREIRA-NETO, J. R. C.; SILVA, M. D. da; BENKO-ISEPPON, A. M.; PANDOLFI, V.; BINNECK, E.; NEPOMUCENO, A. L.; ABDELNOOR, R. V.; KIDO, E. A. Inositol phosphates and Raffinose family oligosaccharides pathways: Structural genomics and transcriptomics in soybean under root dehydration Plant Gene, v. 20, 100202, 2019. 13 p.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 56. | | FUGANTI, R.; BENEVENTI, M. A.; SILVA, J. F. V.; ARIAS, C. A. A.; MARIN, S. R. R.; BINNECK, E.; NEPOMUCENO, A. L. Inserção de microssatélite na região promotora da proteína de choque térmico (GMHSP17.6-L) em plantas de soja resistentes e suscetíveis a Meloidogyne javanica. In: CONGRESSO NACIONAL DE GENÉTICA , 49., 2003, Águas de Lindóia. A dupla hélice do DNA: [resumos]. [S. l.]: SBG, 2003. 1 CD-ROM. Resumo Área GP pdf. 058.| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 57. | | FUGANTI, R.; BENEVENTI, M. A.; SILVA, J. F. V.; ARIAS, C. A. A.; MARIN, S. R. R.; BINNECK, E.; NEPOMUCENO, A. L. Identificação de marcadores moleculares de microssatélites para seleção de genótipos de soja resistentes a Meloidogyne javanica. Nematologia Brasileira, Brasília, DF, v. 28, n. 2, p. 125-130, dez. 2004.| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 58. | | FERREIRA, J. R.; DEUNER, C. C.; TORRES, G. A. M.; TURCHETTO, C.; CONSOLI, L.; SCAGLIUSI, S. M. M.; NHANI JUNIOR, A.; BINNECK, E.; FERNANDES, J. M. C. Caracterização de genes candidatos de resistência à Magnaporthe oryzae em trigo. In: MOSTRA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 10., MOSTRA DE PÓS-GRADUAÇÃO DA EMBRAPA TRIGO, 7., 2015, Passo Fundo. Resumos... Brasília, DF: Embrapa, 2015. Pós-Graduação. p. 41.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Trigo. |
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| 59. | | ALMEIDA, A. M. R.; PIUGA, F. F.; MARIN, S. R. R.; SILVEIRA, C. A. da; BINNECK, E.; RIBEIRO DO VALLE, P. Z. R. Powdery mildews of soybean and weeds in Brazil: identification by the ribosomal DNA sequences. In: WORLD SOYBEAN RESEARCH CONFERENCE, 7.; INTERNATIONAL SOYBEAN PROCESSING AND UTILIZATION CONFERENCE, 4.; CONGRESSO BRASILEIRO DE SOJA, 3., 2004, Foz do Iguassu. Abstracts of contributed papers and posters. Londrina: Embrapa Soybean, 2004. p. 73-74. (Embrapa Soja. Documentos, 228). Editado por Flávio Moscardi, Clara Beatriz Hoffmann-Campo, Odilon Ferreira Saraiva, Paulo Roberto Galerani, Francisco Carlos Krzyzanowski, Mercedes Concordia Carrão-Panizzi.| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 60. | | BRETON, M. C.; RUAS, C. F.; NEUMAIER, N.; MARTINS, P. K.; PEDROSO, J. C.; MARIN, S. R. R.; BINNECK, E.; FARIAS, J. R. B.; NEPOMUCENO, A. L. Respostas moleculares de cultivares de soja [Glycine max (L.) Merrill] ao fotoperíodo. In: CONGRESSO NACIONAL DE GENÉTICA, 48., 2002, Águas de Lindóia. A genética na inclusão social: resumos. Águas de Lindóia: SBG, 2002. 1 CD-ROM. Resumo Área MG pdf.090.| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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