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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Soja. |
Data corrente: |
18/06/2012 |
Data da última atualização: |
13/07/2017 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
NASCIMENTO, L. C. do; COSTA, G. G. L.; BINNECK, E.; PEREIRA, G. A. G.; CARAZZOLLE, M. F. |
Afiliação: |
LEANDRO COSTA DO NASCIMENTO, UNICAMP; GUSTAVO GILSON LACERDA COSTA, UNICAMP; ELISEU BINNECK, CNPSO; GONÇALO AMARANTE GUIMARÃES PEREIRA, UNICAMP; MARCELO FALSARELLA CARAZZOLLE, UNICAMP. |
Título: |
A web-based bioinformatics interface applied to the GENOSOJA Project: databases and pipelines. |
Ano de publicação: |
2012 |
Fonte/Imprenta: |
Genetics and Molecular Biology, Ribeirão Preto, v. 35, n. 1, suppl., p. 203-211, May 2012. |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
The Genosoja consortium is an initiative to integrate different omics research approaches carried out in Brazil. Basically, the aim of the project is to improve the plant by identifying genes involved in responses against stresses that affect domestic production, like drought stress and Asian Rust fungal disease. To do so, the project generated several types of sequence data using different methodologies, most of them sequenced by next generation sequencers. The initial stage of the project is highly dependent on bioinformatics analysis, providing suitable tools and integrated databases. In this work, we describe the main features of the Genosoja web database, including the pipelines to analyze some kinds of data (ESTs, SuperSAGE, microRNAs, subtractive cDNA libraries), as well as web interfaces to access information about soybean gene annotation and expression. |
Palavras-Chave: |
Bioinformática; Expressão genética. |
Thesagro: |
Gene; Soja. |
Thesaurus Nal: |
Bioinformatics; Gene expression; Genes; Soybeans. |
Categoria do assunto: |
S Ciências Biológicas |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/61065/1/gmb.web-based.v35n1s.203-211.2012.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Soja (CNPSO) |
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Registros recuperados : 169 | |
8. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | VITORINO, J. C.; SILLA, P. R.; CAMARGO-BRUNETTO, M. A. de.; BINNECK, E. Abordagem computacional para a identificação de elementos cis-regulatórios no genoma da soja. In: JORNADA ACADÊMICA DA EMBRAPA SOJA, 5., 2010, Londrina. Resumos... Londrina: Embrapa Soja, 2010. p. 95-97. (Embrapa Soja. Documentos, 323). Editado por Odilon Ferreira Saraiva, Paula Geron Saiz Melo.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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9. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | VITORINO, J. C.; SILLA, P. R.; CAMARGO-BRUNETTO, M. A. de.; BINNECK, E. Abordagem computacional para a identificação de elementos cis-regulatóriso no genoma da soja. In: JORNADA ACADÊMICA DA EMBRAPA SOJA, 5., 2010, Londrina. Resumos... Londrina: Embrapa Soja, 2010. p. 95-97. (Embrapa Soja. Documentos, 323). Editado por Odilon Ferreira Saraiva, Paula Geron Saiz Melo.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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11. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | SOSA-GOMEZ, D. R.; CORONEL, N.; BINNECK, E.; ZUCCHI, M. I.; ROSADO-NETO, G. RAPD and mitochondrial DNA analysis of the soybean stalk weevil, Sternechus subsignatus (Coleoptera: Curculionidae. Bulletin of Entomological Research, Cambridge, v. 98, n. 5, p. 475-481, June 2008.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Internacional - A |
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13. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | MITANI, E. A.; NASCIMENTO, L. S.; SILLA, P. R.; BINNECK, E. Portais Web desenvolvidos no laboratório de bioinformática da Embrapa Soja. In: JORNADA ACADÊMICA DA EMBRAPA SOJA, 5., 2010, Londrina. Resumos... Londrina: Embrapa Soja, 2010. p. 50-52. (Embrapa Soja. Documentos, 323). Editado por Odilon Ferreira Saraiva, Paula Geron Saiz Melo.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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16. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | ZIOBER, I. L.; PAIÃO, F. G.; BINNECK, E.; COUTINHO, L. L.; NEPOMUCENO, A. L.; SHIMOKOMAKI, M. Identificação de diferentes transcritos do gene que codifica proteína receptora de rianodina tipo 1 em frangos submetidos ao teste do halotano. In: SEMANA DE BIOTECNOLOGIA, 4., 208, Londrina. Anais... Londrina: UEL. Departamento de Bioquímica e Biotecnologia, 2008. p. 22.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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17. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | SOUZA, T. D.; GODOY, S. M.; FELICIANO, D. C.; BINNECK, E.; SÓSA-GOMEZ, D. R. Genetic diversity of the entomopathogenic fungus metarhizium rileyi based on SSR. In: INTERNATIONAL CONGRESS ON INVERTEBRATE PATHOLOGY AND MICROBIAL CONTROL, 2023; ANNUAL MEETING OF THE SOCIETY FOR INVERTEBRATE PATHOLOGY, 55., 2023, Maryland. Program and abstracts... [Verona]: Society for Invertebrate Pathology, 2023. PF-4. p. 80.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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19. | ![Imagem marcado/desmarcado](/consulta/web/img/desmarcado.png) | COSTAMILAN, L. M.; ALMEIDA, A. M. R.; YORINORI, J. T.; SEIXAS, C. D. S.; BINNECK, E. Diaporthe phaseolorum var. caulivora, primeira ocorrência deste fungo associado ao cancro da haste da soja, no Brasil. Fitopatologia Brasileira, Brasília, DF, v. 32, p. S146, ago. 2007. Suplemento, ref. 0180. Edição dos Resumos do XL Congresso Brasileiro de Fitopatologia, Maringá, ago. 2007.Tipo: Resumo em Anais de Congresso | Circulação/Nível: -- - -- |
Biblioteca(s): Embrapa Soja; Embrapa Trigo. |
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