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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Soja. |
Data corrente: |
19/01/2011 |
Data da última atualização: |
03/06/2011 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
Autoria: |
SILLA, P. R.; CAMARGO-BRUNETTO, M. A. de O.; BINNECK, E. |
Afiliação: |
PAULO R. SILLA, UEL; MARIA ANGÉLICA DE O. CAMARGO-BRUNETTO, UEL; ELISEU BINNECK, CNPSO. |
Título: |
Using a support vector machine to identify Pre-miRNAs in soybean (Glycine max) introns. |
Ano de publicação: |
2010 |
Fonte/Imprenta: |
In: INTERNATIONAL CONFERENCE ON INTELLIGENT SYSTEMS DESIGN AND APPLICATIONS, 2010, Cairo. Proceedings... [Cairo]: IEEE, 2010. CD-ROM. |
Páginas: |
P. 1235-1241. |
ISBN: |
978-1-4244-8135-4 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
MicroRNAs (miRNAs) are small Ribonucleic Acid (RNA) molecules ?18?22 nucleotides (nt) in length that regulates gene expression in animals, plants and viruses. Due to its small size and occurrence in different development stages of organisms, the experimental identification of miRNAs becomes difficult, and computational approaches are being developed in order to precede and guide biological experiments. This paper describes our approach based on a Support Vector Machine (SVM) algorithm to identify miRNA?s precursor (pre-miRNA) in soybean (Glycine max) transcript introns, that was developed using a secondary structure predictor of pre-miRNAs sequences to establish the feature set for training, testing and validation phases of SVM algorithm. |
Palavras-Chave: |
Bioinformática. |
Categoria do assunto: |
-- |
Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Soja (CNPSO) |
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Biblioteca |
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Volume |
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URL |
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Registros recuperados : 169 | |
23. | | BUENO, P.; LAU, E. Y.; BINNECK, E.; NHANI JUNIOR, A.; SCAGLIUSI, S. M. M. RNA-Seq para análise de genes diferencialmente expressos em micrósporos de trigo. In: MOSTRA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 15.; MOSTRA DE PÓS-GRADUAÇÃO DA EMBRAPA TRIGO, 12., 2020, Passo Fundo. Resumos... Brasília, DF: Embrapa, 2021. p. 48.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Soja. |
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24. | | BUENO, P.; LAU, E. Y.; BINNECK, E.; NHANI JUNIOR, A.; SCAGLIUSI, S. M. M. RNA-Seq para análise de genes diferencialmente expressos em micrósporos de trigo. In: MOSTRA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 15.; MOSTRA DE PÓS-GRADUAÇÃO DA EMBRAPA TRIGO, 12., 2020, Passo Fundo. Resumos... Brasília, DF: Embrapa, 2021. p. 48.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Trigo. |
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25. | | BINNECK, E.; SILVA, J. F. V.; NEUMAIER, N.; FARIAS, J. R. B.; NEPOMUCENO, A. L. VSQual: a visual system to assist DNA sequencing quality control. Genetics and Molecular Research, Ribeirão Preto, v. 3, n. 4, p. 474-482, 2004.Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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26. | | TURCHETTO, C.; GONZÁLES, H. H. S.; TORRES, G. A. M.; NHANI, A.; CONSOLI, L.; BINNECK, E. Suppression subtractive hybridization analysis of genes regulated by Magnaporthe oryzae infection in wheat adult plants. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 61., 2015, Águas de Lindóia. Pós-genômica: [resumos]. [Ribeirão Preto]: Sociedade Brasileira de Genética, [2015]. p. 34.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Trigo. |
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29. | | MITANI, E. A.; NASCIMENTO, L. S.; SILLA, P. R.; FARIAS, J. R. B.; BINNECK, E. Sistema Web para estimativas de perdas por seca na cultura da soja. In: JORNADA ACADÊMICA DA EMBRAPA SOJA, 5., 2010, Londrina. Resumos... Londrina: Embrapa Soja, 2010. p. 48-49. (Embrapa Soja. Documentos, 323). Editado por Odilon Ferreira Saraiva, Paula Geron Saiz Melo.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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30. | | NASCIMENTO, L. S.; SILLA, P. R.; VITORINO, J. C.; IWATA, M.; MITANI, E. A.; BINNECK, E. Soybean gene express: plataforma para análise de expressão diferencial e bibliotecas substrativas de cDNA. In: JORNADA ACADÊMICA DA EMBRAPA SOJA, 5., 2010, Londrina. Resumos... Londrina: Embrapa Soja, 2010. p. 105-109. (Embrapa Soja. Documentos, 323). Editado por Odilon Ferreira Saraiva, Paula Geron Saiz Melo.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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31. | | COSTAMILAN, L.; BERTAGNOLLI, P.; YORINORI, J.; ALMEIDA, A.; SEIXAS, C.; BINNECK, E.; ARAÚJO, M.; CARBONARI, J. Soybean stem canker (Diaporthe phaseolorum var. caulivora) in Brazil. In: WORLD SOYBEAN RESEARCH CONFERENCE, 8., 2009, Beijing. Developing a global soy blueprint for a safe secure and sustainable supply: abstracts. Beijing: Chinese Academy of Agricultural Sciences: Institute of Crop Science, 2009. p. 250. Resumo P654. WSRC 2009. Editado por Lijuan Qiu, Rongxia Guan, Jian Jin, Qijan Song, Shuntang Guo, Wenbin Li, Yuanchao Wang, Tianfu Han, Xiaobing Liu, Deyue Yu, Lianzhou Jiang, Deliang Peng.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Trigo. |
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32. | | COSTAMILAN, L.; BERTAGNOLLI, P.; YORINORI, J.; ALMEIDA, A.; SEIXAS, C.; BINNECK, E.; ARAÚJO, M.; CARBONARI, J. Soybean stem canker (Diaporthe phasseolorum var. caulivora) in Brazil. In: WORLD SOYBEAN RESEARCH CONFERENCE, 8., 2009, Beijing. Developing a global soy blueprint for a safe secure and sustainable supply: abstracts. Beijing: Chinese Academy of Agricultural Sciences: Institute of Crop Science, 2009. p. 250, ref. P654. WSRC 2009. Editado por Lijuan Qiu, Rongxia Guan, Jian Jin, Qijan Song, Shuntang Guo, Wenbin Li, Yuanchao Wang, Tianfu Han, Xiaobing Liu, Deyue Yu, Lianzhou Jiang, Deliang Peng.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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33. | | SILLA, P. R.; PASSIANOTTO, A. L. L.; CAMARGO-BRUNETTO, M. A. O.; GONELA, A.; MARCELINO, F. C.; BINNECK, E. Algoritmo computacional para determinar o perfil mínimo de marcadores moleculares que discriminam um conjunto de cultivares. In: JORNADA ACADÊMICA DA EMBRAPA SOJA, 5., 2010, Londrina. Resumos... Londrina: Embrapa Soja, 2010. p. 133-135. (Embrapa Soja. Documentos, 323). Editado por Odilon Ferreira Saraiva, Paula Geron Saiz Melo.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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34. | | SOSA-GÓMEZ, D. R.; OLIVEIRA, L. J. SILVA, J. J. da; MARIN, S. R. R.; BINNECK, E. Caracterização molecular de espécies de Scaptocoris (Hemiptera: Cydnidae). In: REUNIÃO SUL-BRASILEIRA SOBRE PRAGAS DE SOLO, 10., 2007, Dourados. Pragas-Solo-Sul: anais e ata. Dourados: Embrapa Agropecuária Oeste, 2007. 1 CD-ROM. (Embrapa Agropecuária Oeste. Documentos, 88). Organizado por: Crébio José Ávila, Rômulo Penna Scorza Júnior.Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica | Circulação/Nível: -- - -- |
Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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35. | | TURCHETTO, C.; GONZÁLES, H. H. S.; FERREIRA, J. R.; TORRES, G. A. M.; CONSOLI, L.; NHANI JUNIOR, A.; BINNECK, E. Prospecção de genes relacionados à interação de Magnaporthe oryzae com trigo. In: MOSTRA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 10., MOSTRA DE PÓS-GRADUAÇÃO DA EMBRAPA TRIGO, 7., 2015, Passo Fundo. Resumos... Brasília, DF: Embrapa, 2015. Pós-Graduação. p. 45.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Trigo. |
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36. | | SOSA-GÓMEZ, D. R.; SILVA, J. J. da; COSTA, F.; BINNECK, E.; MARIN, S. R. R.; NEPOMUCENO, A. L. Population structure of the Brazilian southern green stink bug, Nezara viridula. Journal of Insect Science, 5, n. 23, p. 1-14, Oct. 2005.Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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37. | | ZIOBER, I. L.; PAIÃO, F. G.; MARCHI, D. F.; COUTINHO, L. L.; BINNECK, E.; NEPOMUCENO, A. L.; SHIMOKOMAKI, M. Heat and chemical stress modulate the expression of the alfa-RYR gene in broiler chickens. Genetics and Molecular Research, Ribeirão Preto, v. 9, n. 2, p. 1258-1266, 2010.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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38. | | FUGANTI, R.; SILVA, J. F. V.; ARIAS, C. A. A.; MARIN, S. R. R.; BINNECK, E.; NEPOMUCENO, A. L. Desenvolvimento de marcadores moleculares de microssatélite para seleção de genótipos de soja resistentes a Meloidogyne javanica. In: CONGRESSO NACIONAL DE GENÉTICA, 48., 2002, Águas de Lindóia. A genética na inclusão social: resumos. Águas de Lindóia: SBG, 2002. 1 CD-ROM. Resumo Área MG pdf.025.Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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39. | | SOUZA, T. D. de; GODOY, S. M. de; BINNECK, E.; FELICIANO, D. C.; SÓSA-GOMEZ, D. R. Desenvolvimento de microssatélites como ferramenta para estudo da diversidade genética do fungo entomopatogênico Metarhizium rileyi. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ENTOMOLOGIA, 28., 2022, Fortaleza. Biodiversidade: Conhecer, conservar e utilizar. anais. Fortaleza: Sociedade Entomológica do Brasil, 2022. Edição Técnica: Nivia da Silva Dias Pini, Gerane Celly Dias Bezerra Silva, Márcio Alves Silva, Regiane Cristina Oliveira, José Wagner da Silva Melo, Flávia Rabelo Barbosa. resumo. p. 324.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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40. | | NEPOMUCENO, A. L.; FARIAS, J. R. B.; NEUMAIER, N.; TOBITA, S.; YAMANAKA, N.; BINNECK, E.; MOLINA, J.; STOLF, R. Drought induced gene expression in Brazilian soybean genotypes. In: INTERNATIONAL CONFERENCE ON INTEGRATED APPROACHES TO SUSTAIN AND IMPROVE PLANT PRODUCTION UNDER DROUGHT STRESS, 2., 2005, Rome. InterDrought - II: final program and abstract book. Rome, 2005. Não paginado. Resumo: P 6.34.Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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