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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Soja. |
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Data corrente: |
07/11/2008 |
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Data da última atualização: |
26/10/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
ALMEIDA, A. M. R.; SOSA-GOMEZ, D. R.; BINNECK, E.; MARIN, S. R. R.; ZUCCHI, M. I. ABDELNOOR, R. V.; SOUTO, E. R. |
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Afiliação: |
Alvaro Manoel Rodrigues Almeida, CNPSo; Daniel Ricardo Sosa Gomez, CNPSo; Eliseu Binneck, CNPSo; Silvana Regina Rockenbach Marin, CNPSo; Maria Ines Zucchi, Instituto Agronômico de Campinas, IAC; Ricardo Vilela Abdelnoor, CNPSo; Eliezer Rodrigues de Souto. |
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Título: |
Effect of crop rotation on specialization and genetic diversity of Macrophomina phaseolina. |
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Ano de publicação: |
2008 |
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Fonte/Imprenta: |
Tropical Plant Pathology, Brasília, DF, v. 33, n. 4, p. 257-264, jul./aug. 2008. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Charcoal rot, caused by Macrophomina phaseolina, is one of the most important diseases of soybean. Genetic variability among soybean isolates has been observed but the effect of host specialization on genetic variability has not been reported. In this work, isolates from soybean, corn and sunflower were evaluated based on cross inoculations and number of microsclerotia/g of roots. The highest and lowest significant (P<0.005) production of microsclerotia was obtained in soybean (863 microsclerotia/g of roots) and sunflower (578 microsclerotia/g of roots), respectively, regardless of the origin of the isolate. Additionally, the effect of a 20-year crop rotation on genetic variability based on RAPD was studied. Eighty-nine isolates from five populations were obtained from soil samples under four crop rotation systems and an uncropped soil. Seven clusters were obtained considering a similarity level of 85%. Analysis indicated that M. phaseolina is a highly diverse species and also revealed a strong effect of the rotation system on genetic diversity. AMOVA was conducted for the RAPD data. From the total genetic variability, 21% (P<0.0001) could be explained by the differences between populations while 79% could be explained by differences within populations ( Fst = 0.2110; P<0.0001). The mean coefficient of gene differentiation (GST) estimated among the five populations indicated 27% of differentiation between populations similar to the AMOVA results where Fst= 0.2110. Total gene diversity estimated indicated high levels of variability (HT =0.3484). Results suggest that genetic differentiation of M. phaseolina can be altered by crop rotation. MenosCharcoal rot, caused by Macrophomina phaseolina, is one of the most important diseases of soybean. Genetic variability among soybean isolates has been observed but the effect of host specialization on genetic variability has not been reported. In this work, isolates from soybean, corn and sunflower were evaluated based on cross inoculations and number of microsclerotia/g of roots. The highest and lowest significant (P<0.005) production of microsclerotia was obtained in soybean (863 microsclerotia/g of roots) and sunflower (578 microsclerotia/g of roots), respectively, regardless of the origin of the isolate. Additionally, the effect of a 20-year crop rotation on genetic variability based on RAPD was studied. Eighty-nine isolates from five populations were obtained from soil samples under four crop rotation systems and an uncropped soil. Seven clusters were obtained considering a similarity level of 85%. Analysis indicated that M. phaseolina is a highly diverse species and also revealed a strong effect of the rotation system on genetic diversity. AMOVA was conducted for the RAPD data. From the total genetic variability, 21% (P<0.0001) could be explained by the differences between populations while 79% could be explained by differences within populations ( Fst = 0.2110; P<0.0001). The mean coefficient of gene differentiation (GST) estimated among the five populations indicated 27% of differentiation between populations similar to the AMOVA results where Fst= 0.2110. Total gene... Mostrar Tudo |
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Thesagro: |
Rotação de Cultura. |
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Thesaurus Nal: |
Crop rotation. |
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Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/42998/1/28690.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Soja (CNPSO) |
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| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 42. | | NASCIMENTO, L. C. do; COSTA, G. G. L.; BINNECK, E.; PEREIRA, G. A. G.; CARAZZOLLE, M. F. A web-based bioinformatics interface applied to the GENOSOJA Project: databases and pipelines. Genetics and Molecular Biology, Ribeirão Preto, v. 35, n. 1, suppl., p. 203-211, May 2012.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 43. | | BINNECK, E.; IWATA, M.; SANTOS, L. G. A. dos; MARCELINO, F. C.; ABDELNOOR, R. V.; NEPOMUCENO, A. L. VSQUAL: a visual system to assist DNA sequencing quality control. In: SIMPOSIO NACIONAL DE BIOTECNOLOGIA REDBIO-ARGENTINA, 7.; CONGRESO INTERNACIONAL-REDBIO-ARGENTINA, 2., 2009, Rosario. La biotecnologia y los futuros escenarios mundiales: [resumenes]. Rosario: INTA, 2009. p. 59.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 44. | | SOSA-GÓMEZ, D. R.; SILVA, J. J. da; COSTA, F.; BINNECK, E.; MARIN, S. R. R.; NEPOMUCENO, A. L. Population structure of the Brazilian southern green stink bug, Nezara viridula. Journal of Insect Science, 5, n. 23, p. 1-14, Oct. 2005.| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 46. | | DROVAL, A. A.; BINNECK, E.; MARIN, S. R. R.; PAIÃO, F. G.; OBA, A.; NEPOMUCENO, A. L.; SHIMOKOMAKI, M. A new single nucleotide polymorphism in the ryanodine gene of chicken skeletal muscle. Genetics and Molecular Research, Ribeirão Preto, v. 11, n. 2, p. 821-829, 2012.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
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| 47. | | MARTINS, P. K.; JORDÃO, B. Q.; BRETON, M. C.; PEDROSO, J. C.; MARIN, S. R. R.; BINNECK, E.; OYA, T.; NEPOMUCENO, A. L. Avaliação dos efeitos do déficit hídrico na expressão gênica em raízes de soja [Glycine max (l.) Merrill] In: CONGRESSO NACIONAL DE GENÉTICA, 48., 2002, Águas de Lindóia. A genética na inclusão social: resumos. Águas de Lindóia: SBG, 2002. 1 CD-ROM. Resumo Área MG pdf.091.| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 48. | | PEREIRA, S. S.; STOLF, R.; ROLLA, A. A. P.; FUGANTI, R.; MARIN, S. R. R.; BINNECK, E.; ABDELNOOR, R. V.; MARCELINO F. C.; NEPOMUCENO, A. L. Análise da expressão de fatores de transcrição relacionados com tolerância à seca, em soja, através da técnica de PCR em tempo real. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 54., 2008, Salvador. Resumos... Salvador: SBG, 2008. p. 245.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 49. | | BRITO JÚNIOR, S. L.; MARCELINO, F. C.; POLIZEL, A. L.; STOLF, R.; BINNECK, E.; NEPOMUCENO, A. L.; BORÉM, A.; ABDELNOOR, R. V. Análise da expressão de genes relacionados a estresses em soja em resposta ao fungo Phakopsora pachyrhizi. Tropical Plant Pathology, Brasília, DF, v. 33, p. S 202, ago. 2008. Suplemento. Edição dos Resumos apresentado no XLI Congresso Brasileiro de Fitopatologia, Belo Horizonte, ago., 2008.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Internacional - A |
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| 58. | | KIDO, E. A.; FERREIRA-NETO, J. R. C.; BINNECK, E.; SILVA, M. da; SILVA JUNIOR, W. da; BENKO-ISEPPON, A. M. Explore the RNA-sequencing and the next-generation sequencing in crops responding to abiotic stress. In: SHARMA, P.; YADAV, D.; GAUR, R. K. (ed.). Bioinformatics in Agriculture: Next Generation Sequencing Era. [S. l.]: Elsevier Academic Press, c2022. CHAP. 10, p. 161-175.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
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