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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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Data corrente: |
02/02/2016 |
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Data da última atualização: |
06/09/2021 |
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Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
SANTOS, J. M. L. dos; FREITAS, E. P. de; ARAÚJO FILHO, J. V. de; MONTEIRO, P. R.; RIBEIRO, W. L. C.; ANDRE, W. P. P.; VIEIRA, L. da S.; MONTEIRO, J. P.; BEVILAQUA, C. M. L. |
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Afiliação: |
Jéssica Maria Leite dos Santos, Pós-graduação - Universidade Estadual do Ceará (UECe) - Fortaleza, CE; Edilson Pereira de Freitas, Pós-graduação - UECe - Fortaleza, CE; José Vilemar de Araújo Filho; Paulo Ricardo Monteiro, Pós-graduação - UECe - Fortaleza, CE; Wesley Lyeverton Correia Ribeiro; Weibson Paz Pinheiro Andre, Pós-graduação - UECe - Fortaleza, CE; LUIZ DA SILVA VIEIRA, CNPC; JOMAR PATRICIO MONTEIRO, CNPC; Cláudia Maria Leal Bevilaqua, Pós-graduação - UECe - Fortaleza, CE. |
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Título: |
Frequência de polimorfismos responsáveis pela resistência a benzimidazóis em populações de Haemonchus contortus do Ceará. |
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Ano de publicação: |
2015 |
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Fonte/Imprenta: |
In: SIMPÓSIO INTERNACIONAL DE RAÇAS NATIVAS: SUSTENTABILIDADE E PROPRIEDADE INTELECTUAL, 1., 2015, Teresina. Anais... Teresina: SFA-PI: ABCPD, 2015. p. 649. Ref.: P-378. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
Haemonchus contortus é o nematóide de maior prevalência em pequenos ruminantes no Brasil. O seu controle tem sido realizado de forma indiscriminada com a utilização de anti-helmínticos de amplo espectro, o que inevitavelmente acelerou o desenvolvimento de resistência anti-helmíntica (RAH). Os benzimidazóis são uma das classes mais utilizadas no estado do Ceará, região Nordeste. Para diagnóstico de RAH tem sido utilizados apenas métodos fenotípicos que apresentam baixa sensibilidade. Embora existam algumas técnicas moleculares altamente sensíveis de RAH, a maioria delas é aplicável apenas quando os polimorfismos de nucleotídeo único (SNP) responsáveis pela resistência a benzimidazóis são conhecidos. Dessa forma, o objetivo desse trabalho foi identificar e determinar a frequência dos SNP responsáveis pela resistência a benzimidazóis em populações de H. contortus isoladas no Ceará. Para tanto, foram coletadas fezes em 19 propriedades de ovinos, uma por município, de modo que fossem contempladas todas as mesorregiões do estado. Para extração de DNA foram utilizados em média 10.000 ovos, obtidos por técnica de recuperação por meio de tamises. A identificação e quantificação da frequência alélica dos SNP F167Y, E198A e F200Y do gene codificante para ?-tubulina foram realizadas por meio de PCR em tempo real quantitativa (qPCR) utilizando SYBR Green. As frequências de alelos resistentes médias para os SNP F167Y, E198A, F200Y foram de 62,31%, 0,02% e 33,65%, respectivamente. Os resultados sugerem que os SNP F167Y e F200Y são importantes para a resistência a benzimidazóis nas populações estudadas e devem ser incluídos no diagnóstico molecular de RAH no Ceará. Além disso, o uso de ovos para o diagnóstico molecular pode ser uma boa ferramenta para uso em campo. MenosHaemonchus contortus é o nematóide de maior prevalência em pequenos ruminantes no Brasil. O seu controle tem sido realizado de forma indiscriminada com a utilização de anti-helmínticos de amplo espectro, o que inevitavelmente acelerou o desenvolvimento de resistência anti-helmíntica (RAH). Os benzimidazóis são uma das classes mais utilizadas no estado do Ceará, região Nordeste. Para diagnóstico de RAH tem sido utilizados apenas métodos fenotípicos que apresentam baixa sensibilidade. Embora existam algumas técnicas moleculares altamente sensíveis de RAH, a maioria delas é aplicável apenas quando os polimorfismos de nucleotídeo único (SNP) responsáveis pela resistência a benzimidazóis são conhecidos. Dessa forma, o objetivo desse trabalho foi identificar e determinar a frequência dos SNP responsáveis pela resistência a benzimidazóis em populações de H. contortus isoladas no Ceará. Para tanto, foram coletadas fezes em 19 propriedades de ovinos, uma por município, de modo que fossem contempladas todas as mesorregiões do estado. Para extração de DNA foram utilizados em média 10.000 ovos, obtidos por técnica de recuperação por meio de tamises. A identificação e quantificação da frequência alélica dos SNP F167Y, E198A e F200Y do gene codificante para ?-tubulina foram realizadas por meio de PCR em tempo real quantitativa (qPCR) utilizando SYBR Green. As frequências de alelos resistentes médias para os SNP F167Y, E198A, F200Y foram de 62,31%, 0,02% e 33,65%, respectivamente. Os resul... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Nematódeo gastrintestinal; Resistance to anthelmintics. |
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Thesagro: |
Anti-helmíntico; Benzimidazol; Haemonchus Contortus; Helminto gastrintestinal; Nematóide; Ovino. |
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Thesaurus Nal: |
Anthelmintics; Benzimidazoles; Sheep. |
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Categoria do assunto: |
H Saúde e Patologia |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/138294/1/cnpc-2015-Frequencia.pdf
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Marc: |
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520 $aHaemonchus contortus é o nematóide de maior prevalência em pequenos ruminantes no Brasil. O seu controle tem sido realizado de forma indiscriminada com a utilização de anti-helmínticos de amplo espectro, o que inevitavelmente acelerou o desenvolvimento de resistência anti-helmíntica (RAH). Os benzimidazóis são uma das classes mais utilizadas no estado do Ceará, região Nordeste. Para diagnóstico de RAH tem sido utilizados apenas métodos fenotípicos que apresentam baixa sensibilidade. Embora existam algumas técnicas moleculares altamente sensíveis de RAH, a maioria delas é aplicável apenas quando os polimorfismos de nucleotídeo único (SNP) responsáveis pela resistência a benzimidazóis são conhecidos. Dessa forma, o objetivo desse trabalho foi identificar e determinar a frequência dos SNP responsáveis pela resistência a benzimidazóis em populações de H. contortus isoladas no Ceará. Para tanto, foram coletadas fezes em 19 propriedades de ovinos, uma por município, de modo que fossem contempladas todas as mesorregiões do estado. Para extração de DNA foram utilizados em média 10.000 ovos, obtidos por técnica de recuperação por meio de tamises. A identificação e quantificação da frequência alélica dos SNP F167Y, E198A e F200Y do gene codificante para ?-tubulina foram realizadas por meio de PCR em tempo real quantitativa (qPCR) utilizando SYBR Green. As frequências de alelos resistentes médias para os SNP F167Y, E198A, F200Y foram de 62,31%, 0,02% e 33,65%, respectivamente. Os resultados sugerem que os SNP F167Y e F200Y são importantes para a resistência a benzimidazóis nas populações estudadas e devem ser incluídos no diagnóstico molecular de RAH no Ceará. Além disso, o uso de ovos para o diagnóstico molecular pode ser uma boa ferramenta para uso em campo.
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Registro original: |
Embrapa Caprinos e Ovinos (CNPC) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Cerrados. |
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Data corrente: |
14/12/2020 |
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Data da última atualização: |
14/12/2020 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
A - 1 |
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Autoria: |
ARAI, E.; SANO, E. E.; DUTRA. A. C.; CASSOL, H. L. G.; HOFFMANN, T. B.; SHIMABUKURO, Y. E. |
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Afiliação: |
EDSON EYJI SANO, CPAC. |
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Título: |
Vegetation Fraction Images Derived from PROBA-V Data for Rapid Assessment of Annual Croplands in Brazil. |
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Ano de publicação: |
2020 |
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Fonte/Imprenta: |
Remote Sensing, v. 12, n. 7, 2020. |
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ISSN: |
2072-4292 |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
Abstract: This paper presents a new method for rapid assessment of the extent of annual croplands in Brazil. The proposed method applies a linear spectral mixing model (LSMM) to PROBA-V time series images to derive vegetation, soil, and shade fraction images for regional analysis. We used S10-TOC (10 days synthesis, 1 km spatial resolution, and top-of-canopy) products for Brazil and S5-TOC (five days synthesis, 100 m spatial resolution, and top-of-canopy) products for Mato Grosso State (Brazilian Legal Amazon). Using the time series of the vegetation fraction images of the whole year (2015 in this case), only one mosaic composed with maximum values of vegetation fraction was generated, allowing detecting and mapping semi-automatically the areas occupied by annual crops during the year. The results (100 m spatial resolution map) for the Mato Grosso State were compared with existing global datasets (Finer Resolution Observation and Monitoring?Global Land Cover (FROM-GLC) and Global Food Security?Support Analyses Data (GFSAD30)). Visually those maps present a good agreement, but the area estimated are not comparable since the agricultural class definition are different for those maps. In addition, we found 11.8 million ha of agricultural areas in the entire Brazilian territory. The area estimation for the Mato Grosso State was 3.4 million ha for 1 km dataset and 5.3 million ha for 100 m dataset. This difference is due to the spatial resolution of the PROBA-V datasets used. A coefficient of determination of 0.82 was found between PROBA-V 100 m and Landsat-8 OLI area estimations for the Mato Grosso State. Therefore, the proposed method is suitable for detecting and mapping annual croplands distribution operationally using PROBA-V datasets for regional analysis. MenosAbstract: This paper presents a new method for rapid assessment of the extent of annual croplands in Brazil. The proposed method applies a linear spectral mixing model (LSMM) to PROBA-V time series images to derive vegetation, soil, and shade fraction images for regional analysis. We used S10-TOC (10 days synthesis, 1 km spatial resolution, and top-of-canopy) products for Brazil and S5-TOC (five days synthesis, 100 m spatial resolution, and top-of-canopy) products for Mato Grosso State (Brazilian Legal Amazon). Using the time series of the vegetation fraction images of the whole year (2015 in this case), only one mosaic composed with maximum values of vegetation fraction was generated, allowing detecting and mapping semi-automatically the areas occupied by annual crops during the year. The results (100 m spatial resolution map) for the Mato Grosso State were compared with existing global datasets (Finer Resolution Observation and Monitoring?Global Land Cover (FROM-GLC) and Global Food Security?Support Analyses Data (GFSAD30)). Visually those maps present a good agreement, but the area estimated are not comparable since the agricultural class definition are different for those maps. In addition, we found 11.8 million ha of agricultural areas in the entire Brazilian territory. The area estimation for the Mato Grosso State was 3.4 million ha for 1 km dataset and 5.3 million ha for 100 m dataset. This difference is due to the spatial resolution of the PROBA-V datasets used. A co... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Fração máxima; Mapeamento de terras agrícolas; Mato Grosso. |
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Thesagro: |
Cerrado; Sensoriamento Remoto. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/219147/1/SANO-VEGETATION-FRACTION-IMAGES-DERIVED.pdf
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Marc: |
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520 $aAbstract: This paper presents a new method for rapid assessment of the extent of annual croplands in Brazil. The proposed method applies a linear spectral mixing model (LSMM) to PROBA-V time series images to derive vegetation, soil, and shade fraction images for regional analysis. We used S10-TOC (10 days synthesis, 1 km spatial resolution, and top-of-canopy) products for Brazil and S5-TOC (five days synthesis, 100 m spatial resolution, and top-of-canopy) products for Mato Grosso State (Brazilian Legal Amazon). Using the time series of the vegetation fraction images of the whole year (2015 in this case), only one mosaic composed with maximum values of vegetation fraction was generated, allowing detecting and mapping semi-automatically the areas occupied by annual crops during the year. The results (100 m spatial resolution map) for the Mato Grosso State were compared with existing global datasets (Finer Resolution Observation and Monitoring?Global Land Cover (FROM-GLC) and Global Food Security?Support Analyses Data (GFSAD30)). Visually those maps present a good agreement, but the area estimated are not comparable since the agricultural class definition are different for those maps. In addition, we found 11.8 million ha of agricultural areas in the entire Brazilian territory. The area estimation for the Mato Grosso State was 3.4 million ha for 1 km dataset and 5.3 million ha for 100 m dataset. This difference is due to the spatial resolution of the PROBA-V datasets used. A coefficient of determination of 0.82 was found between PROBA-V 100 m and Landsat-8 OLI area estimations for the Mato Grosso State. Therefore, the proposed method is suitable for detecting and mapping annual croplands distribution operationally using PROBA-V datasets for regional analysis.
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653 $aMapeamento de terras agrícolas
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