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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Caprinos e Ovinos; Embrapa Meio-Norte. |
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Data corrente: |
09/12/2019 |
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Data da última atualização: |
09/12/2019 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
GOMES, S. O.; SOUZA, I. G. B.; SANTOS, M. F.; SILVA, G. R.; ALBRECHT, M.; MCKINLEY, A. S.; BENTZEN, P.; DINIZ, F. M. |
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Afiliação: |
SULIMARY O. GOMES; ISIS G. B. SOUZA; MICHELLI F. SANTOS; GEICE R. SILVA; MARC ALBRECHT; ALAN S. MCKINLEY; PAUL BENTZEN; FABIO MENDONCA DINIZ, CNPC. |
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Título: |
Discovery of novel NGS-mined microsatellite markers and an exploratory analysis of genetic differentiation between two Western Atlantic populations of Cardisoma guanhumi Latreille, 1825 (Decapoda: Brachyura: Gecarcinidae). |
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Ano de publicação: |
2019 |
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Fonte/Imprenta: |
Journal of Crustacean Biology, v. 32, n. 2, p. 1-5, 2019. |
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DOI: |
doi:10.1093/jcbiol/ruy115 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Abstract: The blue land crab Cardisoma guanhumiLatreille, 1825 is a highly valued food resource widespread in tropical and subtropical regions of the west Atlantic region. Current overharvesting, however, has played a significant role in stock decline. We describe the development of 12 new microsatellite markers, by next-generation sequencing, for evaluating genetic diversity and population structure across the geographical range of the species. A glimpse into the genetic variation in the Caribbean is also provided. The highly informative nature of these markers was also given by the mean estimate values for allelic richness (AR), gene diversity, and polymorphic information content (PIC); 3.8, 0.593, 0.518 in Florida and 2.9, 0.450, 0.385 in Puerto Rico. A preliminary genetic diversity analysis revealed high population differentiation between both locations (FST = 0.310 and DEST = 0.526). PCoA and Bayesian clustering provisionally detected two genetically distinct groups based on the two predefined populations from the Caribbean |
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Palavras-Chave: |
Blue land crab; Caranguejo azul; Cardisoma guanhumi; Conservation; Diversidade genética; Molecular markers; NGS technology. |
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Thesagro: |
Biodiversidade; Caranguejo; Marcador Molecular. |
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Thesaurus Nal: |
Crabs; Florida; Genetic markers; Molecular genetics; Population dynamics; Population genetics; Population structure; Puerto Rico. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético
L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal |
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Marc: |
LEADER 02398naa a2200433 a 4500
001 2116375
005 2019-12-09
008 2019 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $adoi:10.1093/jcbiol/ruy115$2DOI
100 1 $aGOMES, S. O.
245 $aDiscovery of novel NGS-mined microsatellite markers and an exploratory analysis of genetic differentiation between two Western Atlantic populations of Cardisoma guanhumi Latreille, 1825 (Decapoda$bBrachyura: Gecarcinidae).$h[electronic resource]
260 $c2019
520 $aAbstract: The blue land crab Cardisoma guanhumiLatreille, 1825 is a highly valued food resource widespread in tropical and subtropical regions of the west Atlantic region. Current overharvesting, however, has played a significant role in stock decline. We describe the development of 12 new microsatellite markers, by next-generation sequencing, for evaluating genetic diversity and population structure across the geographical range of the species. A glimpse into the genetic variation in the Caribbean is also provided. The highly informative nature of these markers was also given by the mean estimate values for allelic richness (AR), gene diversity, and polymorphic information content (PIC); 3.8, 0.593, 0.518 in Florida and 2.9, 0.450, 0.385 in Puerto Rico. A preliminary genetic diversity analysis revealed high population differentiation between both locations (FST = 0.310 and DEST = 0.526). PCoA and Bayesian clustering provisionally detected two genetically distinct groups based on the two predefined populations from the Caribbean
650 $aCrabs
650 $aFlorida
650 $aGenetic markers
650 $aMolecular genetics
650 $aPopulation dynamics
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700 1 $aMCKINLEY, A. S.
700 1 $aBENTZEN, P.
700 1 $aDINIZ, F. M.
773 $tJournal of Crustacean Biology$gv. 32, n. 2, p. 1-5, 2019.
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Registro original: |
Embrapa Caprinos e Ovinos (CNPC) |
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Biblioteca |
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Registro |
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Status |
URL |
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| Registros recuperados : 14 | |
| 3. |  | DINIZ, F. M.; IYENGAR, A.; LIMA, P. S. da C.; MACLEAN, N.; BENTZEN, P. Application of a double-enrichment procedure for microsatellite isolation and the use tailed primers for high throughput genotyping. Genetics and Molecular Biology, São Paulo, v. 30, n. 2, p. 380-384, mar. 2007.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Internacional - A |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 5. | | BRITTO, F. B.; DINIZ, F. M.; KOBAYASHI, A. K.; LIMA, P. S. C.; ARAÚJO, E. C. E.; BENTZEN, P. Caracterização da estrutura genética do pinhão manso (Jatropha curcas L.): isolamento de fragmentos de dna enriquecidos com sequências de microssatélites. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE PLANTAS OLEAGINOSAS, ÓLEOS, GORDURAS E BIODIESEL, 5.; CLÍNICA TECNOLÓGICA EM BIODIESEL, 2., 2008, Lavras. Biodiesel: tecnologia limpa. Revista de Resumos. Lavras: UFLA, 2008. p. 105| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 6. | | BRITTO, F. B.; DINIZ, F. M.; KOBAYASHI, A. K.; LIMA, P. S. C.; ARAÚJO, E. C. E.; BENTZEN, P. Caracterização da estrutura genética do pinhão manso (Jatropha curcas L.): isolamento de fragmentos de dna enriquecidos com sequências de microssatélites. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE PLANTAS OLEAGINOSAS, ÓLEOS, GORDURAS E BIODIESEL, 5.; CLÍNICA TECNOLÓGICA EM BIODIESEL, 2., 2008, Lavras. Biodiesel: tecnologia limpa. Anais... Lavras: UFLA, 2008. 8 p.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 7. | | SANTOS, M. F.; SOUZA, I. G. B.; GOMES, S. O.; SILVA, G. R.; BENTZEN, P.; DINIZ, F. M. Isolation and characterization of microsatellite markers in the spiny lobster, Panulirus echinatus Smith, 1869 (Decapoda: Palinuridae) by Illumina MiSeq sequencing. Journal of Genetics, v. 97, Online resources, p. e25-e30, 2018.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 8. | | SILVA, G. R. da; SOUZA, I. G. de B.; PEREIRA, F. de M.; SOUZA, B. de A.; LOPES, M. T. do R.; BENTZEN, P.; DINIZ, F. M. Genome-wide discovery and characterization of microsatellite markers from Melipona fasciculata (Hymenoptera: Apidae), cross-amplifi cation and a snapshot assessment of the genetic diversity in two stingless bee populations. European Journal of Entomology, v. 115, p. 614-619, 2018.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 9. | | GOMES, S. O.; SOUZA, I. G. B.; SANTOS, M. F.; SILVA, G. R.; ALBRECHT, M.; MCKINLEY, A. S.; BENTZEN, P.; DINIZ, F. M. Discovery of novel NGS-mined microsatellite markers and an exploratory analysis of genetic differentiation between two Western Atlantic populations of Cardisoma guanhumi Latreille, 1825 (Decapoda: Brachyura: Gecarcinidae). Journal of Crustacean Biology, v. 32, n. 2, p. 1-5, 2019.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos; Embrapa Meio-Norte. |
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| 10. | | RAPOSO, R. da S.; BRITTO, F. B.; SOUZA, I. G. de B; CARVALHO, A. M. F. de; KOBAYASHI, A. K.; LAVIOLA, B. G.; BENTZEN, P.; DINIZ, F. M. Development and use of novel microsatellite markers from double-enriched genomic libraries in Guatemalan Jatropha curcas. Biochemical Systematics and Ecology, v. 59, p. 168-173, 2015.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia; Embrapa Meio-Norte. |
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| 11. | | SOUZA, I. G. B.; PATERSON, I.; McBRIDE, M. C.; SOUZA, B. A.; PEREIRA, F. M.; LOPES, M. T. R.; BENTZEN, P.; DINIZ, F. M. Isolation and characterization of 23 microsatellite loci in the stingless bee Melipona subnitida using next-generation sequencing. Conservation Genetics Resources, v. 7, n. 1, p. 239-241, 2015.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 12. | | BRITTO, F. B.; SCHMIDT, A. J.; CARVALHO, A. M. F.; VASCONCELOS, C. C. M. P.; FARIAS, A. M.; BENTZEN, P.; DINIZ, F. M. Population connectivity and larval dispersal of the exploited mangrove crab Ucides cordatus along the Brazilian coast. PeerJ, v. 6, Article e4702, Apr. 2018.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 13. | | BRITTO, F. B.; SABÓIA, E. N.; KOBAYASHI, A. K.; LAVIOLA, B. G.; ROSADO-LAVIOLA, T. B.; BENTZEN, P.; DINIZ, F. M. Molecular markers for the assessment of genetic diversity in Jatropha curcas L. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE PESQUISA EM PINHÃO MANSO, 1., 2009, Brasília, DF. Anais... Brasília, DF: Embrapa Agroenergia; São Paulo: ABPPM, 2009. Editores: Bruno Galveas Laviola, Sérgio Delmar dos Anjos e Silva, Júlio César Albrecht. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 14. | | SILVA, G. R. da; SOUZA, I. G. de B.; PEREIRA, F. de M.; LOPES, M. T. do R.; SOUZA, B. de A.; BENTZEN, P.; DINIZ, F. M. Sequenciamento de nova geração no desenvolvimento de Marcadores Microssatélites Dinucleotideos para abelhas-sem-ferrão. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 4., 2016, Curitiba. Recursos genéticos no Brasil: a base para o desenvolvimento sustentável: anais. Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Recursos Genéticos, 2016. p. 103.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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