|
|
Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Soja; Embrapa Unidades Centrais. |
Data corrente: |
24/03/2011 |
Data da última atualização: |
14/10/2011 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
STOLF-MOREIRA, R.; LEMOS, E. G. de M.; ABDELNOOR, R. V.; BENEVENTI, M. A.; ROLLA, A. A. P.; PEREIRA, S. dos S.; OLIVEIRA, M. C. N. de; NEPOMUCENO, A. L.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C. |
Afiliação: |
RENATA STOLF-MOREIRA, UNESP Jaboticabal; ELIANA GERTRUDES DE MACEDO LEMOS, UNESP Jaboticabal; RICARDO VILELA ABDELNOOR, CNPSO; MAGDA APARECIDA BENEVENTI, UFRGS; AMANDA ALVES PAIVA ROLLA, UEL; SELMA DOS SANTOS PEREIRA, UEL; MARIA CRISTINA NEVES DE OLIVEIRA, CNPSO; ALEXANDRE LIMA NEPOMUCENO, CNPSO; FRANCISMAR CORREA MARCELINO, CNPSO. |
Título: |
Identification of reference genes for expression analysis by real-time quantitative PCR in drought-stressed soybean. |
Ano de publicação: |
2011 |
Fonte/Imprenta: |
Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 46, n. 1, p. 58-65, jan. 2011. |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
The objective of this work was to validate, by quantitative PCR in real time (RT-qPCR), genes to be used as reference in studies of gene expression in soybean in drought-stressed trials. Four genes commonly used in soybean were evaluated: GmB-actin, GmGAPDH, GmLectin and GmRNAr18S. Total RNA was extracted from six samples: three from roots in a hydroponic system with different drought intensities (0, 25, 50, 75 and 100 minutes of water stress), and three from leaves of plants grown in sand with different soil moistures (15, 5 and 2.5% gravimetric humidity). The raw cycle threshold (Ct) data were analyzed, and the efficiency of each primer was calculated for an overall analysis of the Ct range among the different samples. The GeNorm application was used to evaluate the best reference gene, according to its stability. The GmGAPDH was the least stable gene, with the highest mean values of expression stability (M), and the most stable genes, with the lowest M values, were the GmB-actin and GmRNAr18S, when both root and leaves samples were tested. These genes can be used in RT-qPCR as reference gene for expression analysis. |
Palavras-Chave: |
Déficit hídrico; Estabilidade de expressão; Expressão gênica; Expression stability; RT-qPCR. |
Thesagro: |
Biotecnologia; Deficiência hídrica; Glycine Max; Soja. |
Thesaurus Nal: |
Agricultural biotechnology; Gene expression; Plant-water relations; Soybeans. |
Categoria do assunto: |
-- F Plantas e Produtos de Origem Vegetal |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/31023/1/46n01a08.pdf
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/168638/1/Identification-of-reference-genes-for-expression.pdf
|
Marc: |
LEADER 02275naa a2200373 a 4500 001 1882641 005 2011-10-14 008 2011 bl uuuu u00u1 u #d 100 1 $aSTOLF-MOREIRA, R. 245 $aIdentification of reference genes for expression analysis by real-time quantitative PCR in drought-stressed soybean. 260 $c2011 520 $aThe objective of this work was to validate, by quantitative PCR in real time (RT-qPCR), genes to be used as reference in studies of gene expression in soybean in drought-stressed trials. Four genes commonly used in soybean were evaluated: GmB-actin, GmGAPDH, GmLectin and GmRNAr18S. Total RNA was extracted from six samples: three from roots in a hydroponic system with different drought intensities (0, 25, 50, 75 and 100 minutes of water stress), and three from leaves of plants grown in sand with different soil moistures (15, 5 and 2.5% gravimetric humidity). The raw cycle threshold (Ct) data were analyzed, and the efficiency of each primer was calculated for an overall analysis of the Ct range among the different samples. The GeNorm application was used to evaluate the best reference gene, according to its stability. The GmGAPDH was the least stable gene, with the highest mean values of expression stability (M), and the most stable genes, with the lowest M values, were the GmB-actin and GmRNAr18S, when both root and leaves samples were tested. These genes can be used in RT-qPCR as reference gene for expression analysis. 650 $aAgricultural biotechnology 650 $aGene expression 650 $aPlant-water relations 650 $aSoybeans 650 $aBiotecnologia 650 $aDeficiência hídrica 650 $aGlycine Max 650 $aSoja 653 $aDéficit hídrico 653 $aEstabilidade de expressão 653 $aExpressão gênica 653 $aExpression stability 653 $aRT-qPCR 700 1 $aLEMOS, E. G. de M. 700 1 $aABDELNOOR, R. V. 700 1 $aBENEVENTI, M. A. 700 1 $aROLLA, A. A. P. 700 1 $aPEREIRA, S. dos S. 700 1 $aOLIVEIRA, M. C. N. de 700 1 $aNEPOMUCENO, A. L. 700 1 $aMARCELINO-GUIMARÃES, F. C. 773 $tPesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF$gv. 46, n. 1, p. 58-65, jan. 2011.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
Registro original: |
Embrapa Soja (CNPSO) |
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
Registros recuperados : 50 | |
21. | | GROSSI-DE-SA, M.; PETITOT, A.-S.; XAVIER, D. A.; SÁ, M. E. L.; MEZZALIRA, I.; BENEVENTI, M. A.; MARTINS, N. F.; BAIMEY, H. K.; ALBUQUERQUE, E. V. S.; GROSSI-DE-SA, M. F.; FERNANDEZ, D. Rice susceptibility to root-knot nematodes is enhanced by the Meloidogyne incognita MSP18 effector gene. Planta, v. 250, n. 4, p. 1215-1227, 2019.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
| |
22. | | BENEVENTI, M. A.; NEPOMUCENO, A. L.; YAMANAKA, N.; SHINOZAKI, K. Y.; NAKASHIMA, K.; BINNECK, E.; FARIAS, J. R. B.; MARIN, S. R. R.; SILVEIRA, C. A.; LUGLE, S. M.; ROLLA, A. A. P.; POLIZEL, A. M. Transformação genética em soja (Glycine max (L)Merril) visando tolerância à seca. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 51., 2005, Águas de Lindóia. Resumos... Águas de Lindóia: SBG, 2005. 1 CD-ROM. Seção: Genética e Melhoramento - Resumos: Pdf.634.Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
| |
23. | | BENEVENTI, M. A.; NEPOMUCENO, A. L.; YAMANAKA, N.; YAMAGUCHI-SHINOZAKI, K.; NAKASHIMA, K.; BINNECK, E.; FARIAS, J. R. B.; MARIN, S. R. R.; SILVEIRA, C. A.; PAIVA, A. A. R.; ABDELNOOR, R. V.; POLIZEL, A. M.; LUGLE, S. M. Transformação genética em soja pela inserção da construção gênica contendo a região promotora do gene rd29A e a região codante do gene DREB1A de Arabidopsis thaliana, visando tolerância à seca. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE SOJA, 4., 2006, Londrina. Resumos... Londrina: Embrapa Soja, 2006. p. 47. Organizado por Odilon Ferreira Saraiva, Simone Ery Grosskopf.Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
| |
24. | | BENEVENTI, M. A.; NEPOMUCENO, A. L.; YAMANAKA, N.; SHINOZAKI, K. Y.; NAKASHIMA, K.; BINNECK, E.; FARIAS, J. R. B.; MARIN, S. R. R.; SILVEIRA, C. A.; LUGLE, S. M.; ABDELNOOR, R. V.; ROLLA, A. A. P.; POLIZEL, A. M. Transformação genética de soja com promotor e fator de transcrição estresse induzidos visando tolerancia à seca. In: REUNIÃO DE PESQUISA DE SOJA DA REGIÃO CENTRAL DO BRASIL, 27., 2005. Cornélio Procópio. Resumos... Londrina: Embrapa Soja, 2005. p. 108-109. (Embrapa Soja. Documentos, 257). Organizado por Odilon Ferreira Saraiva, Janete Lasso Ortiz, Simone Ery Grosskopf.Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
| |
25. | | NEPOMUCENO, A. L.; BENEVENTI, M. A., YAMAGUCHI-SHINOZAKI, K.; YAMANAKA, N.; NAKASHIMA, K.; BINNECK, E.; FARIAS, J. R. B.; MARIN, S. R. R.; SILVEIRA, C. A.; LUGLE, S. M.; ABDELNOOR, R.; PAIVA, A. A. R.; POLIZEL, A. M. Transformação genética em soja visando tolerância à seca. In: CONGRESO DE SOJA DEL MERCOSUR, 3., 2006, Rosário. Mercosoja 2006: mesas científico-técnicas, resúmenes expandidos / comunicaciones. Rosário: Associación de la Cadena de Soja Argentina, 2006. p. 242-245. Nome correto do décimo primeiro autor ABDELNOOR, R. V.Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
| |
26. | | FARIAS, D. F.; VIANA, M. P.; OLIVEIRA, G. R. de; BENEVENTI, M. A.; SOARES, B. M.; PESSOA, C.; PESSOA, I. P.; SILVA, L. P.; VASCONCELOS, I. M.; SA, M. F. G. de; CARVALHO, A. F. U. Evaluation of cytotoxic and antimicrobial effects of two Bt Cry proteins on a GMO safety perspective. BioMed Research International, article ID 810490, 2014.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 2 |
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
| |
27. | | STOLF-MOREIRA, R.; LEMOS, E. G. de M.; ABDELNOOR, R. V.; BENEVENTI, M. A.; ROLLA, A. A. P.; PEREIRA, S. dos S.; OLIVEIRA, M. C. N. de; NEPOMUCENO, A. L.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C. Identification of reference genes for expression analysis by real-time quantitative PCR in drought-stressed soybean. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 46, n. 1, p. 58-65, jan. 2011.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
Biblioteca(s): Embrapa Soja; Embrapa Unidades Centrais. |
| |
28. | | ARRAES, F. B. M.; BENEVENTI, M. A.; SA, M. E. L. de; PAIXAO, J. F. R.; ALBUQUERQUE, E. V. S.; MARIN, S. R. R.; PURGATTO, E.; NEPOMUCENO, A. L.; GROSSI-DE-SA, M. F. Implications of ethylene biosynthesis and signaling in soybean drought stress tolerance. BMC Plant Biology, v. 15:213, 2015. (Open access).Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia; Embrapa Soja. |
| |
29. | | YAMANAKA, N.; BENEVENTI, M. A.; POLIZEL, A.; STOLF, R.; PAIVA, A. A. R.; SALINET, L. H.; LEMOS, N. G.; MARIN, S. R. R.; SILVEIRA, C. A.; TOBITA, S.; NAKASHIMA, K.; YAMAGUCHI-SHINOZAKI, K.; FARIAS, J. R. B.; NEPOMUCENO, A. L. Development of transgenic soybean tolerant tos drought stress. In: SUENAGA, K.; KUDO, H.; OSHIO, S. (Ed.). Comprehensive studies on the development of sustainable soybean production technology in South America. Tsukuba: JIRCAS, 2007. p. 21-26. (JIRCAS Working Report, 51).Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
| |
30. | | PEREIRA, S. dos S.; STOLF, R.; ROLLA, A. A. de P.; POLIZEL, A. M.; BENEVENTI, M. A.; YAMANAKA, N.; NAKASHIMA, K.; YAMAGUCHI-SHINOZAKI, K.; FARIAS, J. R. B.; NEPOMUCENO, A. L. Quantificação dos níveis de expressão do gene DREB1A endógeno e do DREB1A de Arabidopsis thaliana introduzido em soja, sob controle do promotor estresse-induzido rd29A. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 4., 2007, São Lourenço. Anais... São Lourenço: Sociedade Brasileira de Melhoramento de Plantas, 2007. 1 CD-ROM. Pdf. 517.Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica | Circulação/Nível: -- - -- |
Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
| |
31. | | ROLLA, A. A. P.; BENEVENTI, M. A.; FUGANTI, R.; PEREIRA, S. S.; MARIN, S. R. R.; FARIAS, J. R. B.; LOPES, V. S.; YAMAGUCHI -SHINOZAKI, K.; BINNECK, E.; ABDELNOOR, R. V.; MARCELINO, F. C.; NEPOMUCENO, A. L. Quantification of transgene copies in soybean genome using quantitative real time PCR through absolute and relative methodologies. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE GENÉTICA MOLECULAR DE PLANTAS, 2., 2009, Búzios. Programa e resumos. [S.l.]: SBG, 2009. p. 167.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
| |
32. | | LACERDA, A. F.; BENEVENTI, M. A.; DEL SARTO, R. P.; CRUZ, C. C. M.; OLIVEIRA, G. R.; SILVA, M. S. S.; ROCHA, T. L.; MATTAR, M. C. S.; GROSSI DE SÁ, M. F. Methylotrophic yeast expression of sunflower defensin (SD2). In: ANNUAL MEETING OF SBBQ, 27.; CONGRESS OF THE PAN-AMERICAN ASSOCIATION FOR BIOCHEMISTRY AND MOLECULAR BIOLOGY, 11., 2008, Águas de Lindóia. Program and index... Águas de Lindóia: SBBq, 2008. 37º Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular.
Resumo - R8934.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
| |
33. | | LACERDA, A. F.; BENEVENTI, M. A.; DEL SARTO, R. P.; CRUZ, C. C. M.; OLIVEIRA, G. R.; SILVA, M. S. S.; ROCHA, T. L.; MATTAR, M. C. S.; GROSSI DE SÁ, M. F. Methylotrophic yeast expression of sunflower defensin (SD2). In: ANNUAL MEETING OF SBBQ, 37.; CONGRESS OF THE PABMB, 11., 2008, Águas de Lindóia, SP. Abstracts... Águas de Lindóia: SBBq, 2008. 1 CD-ROM.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
| |
34. | | ROLLA, A. A. de P.; NEPOMUCENO, A. L.; YAMANAKA, N.; SHINOZAKI, K. Y.; NAKASHIMA, K.; BINNECK, E.; FARIAS, J. R. B.; BENEVENTI, M. A.; SILVEIRA, C. A.; MARIN, S. R. R.; POLIZEL, A. M.; LUGLE, S. M. Obtenção de soja geneticamente modificada por biobalística visando tolerância à seca. In: SIMPÓSIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA UNIFIL, 13., 2005, Londrina. Resumos... Londrina: UniFil, 2005. 1 CD-ROM. Área Biologia.Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
| |
35. | | LISEI-DE-SÁ, M. E.; ARRAES, F. B. N.; BRITO, G. G.; BENEVENTI, M. A.; LOURENCO-TESSUTTI, I.; BASSO, A. M. M.; AMORIM, R. M. S.; SILVA, M. C. M.; FAHEEM, M.; OLIVEIRA, N. G.; MIZOI, J.; YAMAGUCHI-SHINOZAKI, K.; GROSSI-DE-SA, M. F. AtDREB2A-CA influences root architecture and increases drought tolerance in transgenic cotton. Agricultural Sciences, v. 8, p. 1195-1225, 2017.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 3 |
Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
| |
36. | | MARTINS, M. T. B.; NEPOMUCENO, A. L.; MARCELlNO, F. C.; FARIAS, J. R. B.; ABDELNOOR, R.; MARIN S. R. R.; SILVEIRA, C. A.; YAMAGUCHI-SHINOZAKI, K.; YAMANAKA, N.; NAKASHIMA K.; PAIVA, A. A. R.; BENEVENTI, M. A.; STOLF, R.; OLIVEIRA, G. B. A. de. Caracterização molecular de eventos transformados com a construção rd29A: DREB1 A. In: JORNADA ACADÊMICA DA EMBRAPA SOJA, 2008, Londrina. Resumos expandidos... Londrina: Embrapa Soja, 2008. p. 125-128 (Embrapa Soja. Documentos, 297).Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
| |
37. | | POLIZEL, A M.; MEDRI, M. E.; YAMANAKA, N.; BENEVENTI, M. A.; SHINOZAKI, K. Y.; NAKASHIMA, K.; OLIVEIRA, M. C. N. de; BINNECK, E.; FARIAS, J. R. B.; MARIN, S. R. R.; SILVEIRA, C. A.; ABDELNOOR, R. V.; PAIVA, A. A. R.; STOLF, R.; SALINET, L. H.; LEMOS, N. G.; NEUMAIER, N.; NEPOMUCENO, A. L. Avaliação molecular e fisiológica de soja geneticamente modificadas com a construção rd29:DREB1A, de Arabidopsis thaliana, visando tolerância à seca. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 52.; CONGRESO DE LA ASOCIACIÓN LATINOAMERICANA DE GENÉTICA, 12., 2006, Foz do Iguaçu. Resumos... Ribeirão Preto, SP: Sociedade Brasileira de Genética, 2006. 1 CD-ROM. Área Plantas - pdf 1136.Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
| |
38. | | BENEVENTI, M. A.; SILVA JUNIOR, O. B. da; SÁ, M. E. L. de; FIRMINO, A. A. P.; AMORIM, R. M. S. de; ALBUQUERQUE, E. V. S.; SILVA, M. C. M. da; SILVA, J. P. da; CAMPOS, M. de A.; LOPES, M. J. C.; TOGAWA, R. C.; PAPPAS JÚNIOR, G. J.; GROSSI DE SÁ, M. F. Transcription profile of soybean-root-knot nematode interaction reveals a key role of phythormones in the resistance reaction. BMC Genomics, v. 14: 322, 2013.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
| |
39. | | WEBER, R. L. M. W.; WIEBKE-STROHM, B.; BREDEMEIER, C.; MARGIS-PINHEIRO, M.; BRITO, G. G. de; RECHENMACHER, C.; BERTAGNOLLI, P. F.; SÁ, M. E. L. de; CAMPOS, M. de A.; AMORIM, R. M. S. de; BENEVENTI, M. A.; MARGIS, R.; GROSSI-DE SA, M. F.; BODANESE-ZANETTINI, M. H. Expression of an osmotin-like protein from Solanum nigrum confers drought tolerance in transgenic soybean. BMC Plant Biology, v. 14:343, 2014. (Open Access).Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
| |
40. | | NEPOMUCENO, A. L.; SILVA, J. F. V.; LEMOS, E. G. M.; BINNECK, E.; CARNEIRO, N.; MARIN, S. R.; SILVEIRA, C. A; WENDLAND, A.; BASSOI, M. C.; ALMIEDA, A. M.; MORAES, A.; BENEVENTI, M. A.; GIACOMINI, N.; STOLF, R.; FUGANTI, R.; NEUMAIER, N.; FARIAS, J. R. B.; ARIAS, C. A.; MOLINA, J. C. Genoma funcional de raízes de soja. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE NEMATOLOGIA, 24., 2003, Petrolina. [ Anais...]. Petrolina: Sociedade Brasileira de Nematologia: Embrapa Semi-Árido, 2003. p. 53-55. Editado por Wellington Antonio Moreira, Lúcia Helena Piedade Kiill.Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
| |
Registros recuperados : 50 | |
|
Nenhum registro encontrado para a expressão de busca informada. |
|
|