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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Soja; Embrapa Unidades Centrais. |
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Data corrente: |
24/03/2011 |
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Data da última atualização: |
14/10/2011 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
STOLF-MOREIRA, R.; LEMOS, E. G. de M.; ABDELNOOR, R. V.; BENEVENTI, M. A.; ROLLA, A. A. P.; PEREIRA, S. dos S.; OLIVEIRA, M. C. N. de; NEPOMUCENO, A. L.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C. |
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Afiliação: |
RENATA STOLF-MOREIRA, UNESP Jaboticabal; ELIANA GERTRUDES DE MACEDO LEMOS, UNESP Jaboticabal; RICARDO VILELA ABDELNOOR, CNPSO; MAGDA APARECIDA BENEVENTI, UFRGS; AMANDA ALVES PAIVA ROLLA, UEL; SELMA DOS SANTOS PEREIRA, UEL; MARIA CRISTINA NEVES DE OLIVEIRA, CNPSO; ALEXANDRE LIMA NEPOMUCENO, CNPSO; FRANCISMAR CORREA MARCELINO, CNPSO. |
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Título: |
Identification of reference genes for expression analysis by real-time quantitative PCR in drought-stressed soybean. |
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Ano de publicação: |
2011 |
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Fonte/Imprenta: |
Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 46, n. 1, p. 58-65, jan. 2011. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
The objective of this work was to validate, by quantitative PCR in real time (RT-qPCR), genes to be used as reference in studies of gene expression in soybean in drought-stressed trials. Four genes commonly used in soybean were evaluated: GmB-actin, GmGAPDH, GmLectin and GmRNAr18S. Total RNA was extracted from six samples: three from roots in a hydroponic system with different drought intensities (0, 25, 50, 75 and 100 minutes of water stress), and three from leaves of plants grown in sand with different soil moistures (15, 5 and 2.5% gravimetric humidity). The raw cycle threshold (Ct) data were analyzed, and the efficiency of each primer was calculated for an overall analysis of the Ct range among the different samples. The GeNorm application was used to evaluate the best reference gene, according to its stability. The GmGAPDH was the least stable gene, with the highest mean values of expression stability (M), and the most stable genes, with the lowest M values, were the GmB-actin and GmRNAr18S, when both root and leaves samples were tested. These genes can be used in RT-qPCR as reference gene for expression analysis. |
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Palavras-Chave: |
Déficit hídrico; Estabilidade de expressão; Expressão gênica; Expression stability; RT-qPCR. |
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Thesagro: |
Biotecnologia; Deficiência hídrica; Glycine Max; Soja. |
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Thesaurus Nal: |
Agricultural biotechnology; Gene expression; Plant-water relations; Soybeans. |
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Categoria do assunto: |
--
F Plantas e Produtos de Origem Vegetal |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/31023/1/46n01a08.pdf
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/168638/1/Identification-of-reference-genes-for-expression.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Soja (CNPSO) |
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Biblioteca |
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URL |
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| Registros recuperados : 50 | |
| 2. |  | LEMOS, N. G.; STOLF, R.; MARIN, S. R. R.; POLIZEL, A. M.; BENEVENTI, M. A.; YAMANAKA, N.; NEPOMUCENO, A. L. Caracterização molecular pela técnica de PCR em tempo real de soja geneticamente modificada. In: CONGRESO DE SOJA DEL MERCOSUR, 3., 2006, Rosário. Mercosoja 2006: mesas científico-técnicas, resúmenes expandidos / comunicaciones. Rosário: Associación de la Cadena de Soja Argentina, 2006. p. 287-289.| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 3. | | BENEVENTI, M. A.; FUGANTI, R.; ARIAS, C. A. A.; MARIN, S. R. R.; SILVA, J. F. V.; NEPOMUCENO, A. L. Seleção de genótipos de soja resistentes a Meloidogyne javanica assistida por marcadores moleculares. In: CONGRESSO NACIONAL DE GENÉTICA , 49., 2003, Águas de Lindóia. A dupla hélice do DNA: [resumos]. [S. l.]: SBG, 2003. 1 CD-ROM. Resumo Área GP pdf. 059.| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 4. | | SILVA, J. F. V.; BENEVENTI, M. A.; FUGANTI, R.; ARIAS, C. A. A.; MARINS, S. R.; NEPOMUCENO, A. L. Seleção de genótipos de soja resistentes a Meloidogyne javanica assistida por marcadores moleculares. In: SIMPÓSIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA UNIFIL, 11., 2003, Londrina. Resumos... Londrina: UniFil, 2003. 1 CD-ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 5. | | NEPOMUCENO, A. L.; FARIAS, J. R. B.; SALINET, L. H.; POLIZEL, A. M.; NEUMAIER, N.; BENEVENTI, M. A.; STOLF, R.; ROLLA, A. P. Engenharia genética como ferramenta no desenvolvimento de plantas de soja adaptadas a cenários futuros de mudanças climáticas. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE AGROMETEOROLOGIA, 15., 2007, Aracaju. Efeito das mudanças climáticas na agricultura: anais. Campinas: Sociedade Brasileira de Agrometeorologia, 2007. 6 p. 1 CD-ROM. PDF 3377.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica | Circulação/Nível: -- - -- |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 6. | | FUGANTI, R.; BENEVENTI, M. A.; SILVA, J. F. V.; ARIAS, C. A. A.; MARIN, S. R. R.; BINNECK, E.; NEPOMUCENO, A. L. Inserção de microssatélite na região promotora da proteína de choque térmico (GMHSP17.6-L) em plantas de soja resistentes e suscetíveis a Meloidogyne javanica. In: CONGRESSO NACIONAL DE GENÉTICA , 49., 2003, Águas de Lindóia. A dupla hélice do DNA: [resumos]. [S. l.]: SBG, 2003. 1 CD-ROM. Resumo Área GP pdf. 058.| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 7. | | ROLLA, A. A. P.; BENEVENTI, M. A.; FUGANTI, R.; MARIN, S. R. R.; FARIAS, J. R. B.; BINNECK, E.; ABDELNOOR, R. V.; NEPOMUCENO, A. L.; MARCELINO, F. C. Desenvolvimento e validação de um método de determinação do número de cópias de transgenes no genoma da soja por quantificação relativa por QPCR. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE SOJA, 5.; MERCOSOJA 2009, Goiânia. Resumos... Londrina: Embrapa Soja, 2009. p. 100, trab. 168. Editado por Adilson de Oliveira Júnior, Odilon Ferreira Saraiva, Clara Beatriz Hoffmann Campo, César de Castro.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 8. | | STOLF, R.; MARCELINO, F. C.; LEMOS, E. G. M.; BENEVENTI, M. A.; YAMANAKA, N.; ABDELNOOR, R. V.; FARIAS, J. R. B.; NEPOMUCENO, A. L. Comparison of endogenous control for real-time PCR analysis of gene expression in soybean under water stress. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE BIOSSEGURANÇA, 5.; SIMPÓSIO LATINO AMERICANO DE PRODUTOS TRANSGÊNICOS, 5.; SEMINÁRIO DE BIOENERGIA, 1.; SIMPÓSIO DE POPULARIZAÇÃO DA BIOTECNOLOGIA, 2.; MOSTRA DE BIOTECNOLOGIA PARA A SOCIEDADE, 1., 2007, Ouro Preto, MG. Anais dos eventos... Rio de Janeiro: Associação Nacional de Biossegurança, 2007. p.128. Trabalho apresentado também no VI Encuentro Latinoamericano y del Caribe de Biotecnologia Agropecuaria, Viña del Mar, Valparaiso, Chile, octubre, 2007.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso | Circulação/Nível: -- - -- |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 9. | | SILVA, J. F. V.; BENEVENTI, M. A.; FUGANTI, R.; ARIAS, C. A. A.; MARIN, S. R. R.; NEPOMUCENO, A. L.; LIMA, C. G. Seleção de genótipos de soja resistentes a Meloidogyne javanica e Heterodera glycines assistida por marcadores moleculares. In: REUNIÃO DE PESQUISA DE SOJA DA REGIÃO CENTRAL DO BRASIL, 25., 2003, Uberaba. Resumos... Londrina: Embrapa Soja: EPAMIG: Fundação Triângulo, 2003. p. 212-213. (Embrapa Soja. Documentos, 209). Organizado por Odilon Ferreira Saraiva, Regina Maria Villas Boas de Campos Leite.| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 10. | | MARTINS, P. K.; JORDÃO, B. Q.; YAMANAKA, N.; FARIAS, J. R. B.; BENEVENTI, M. A.; BINNECK, E.; FUGANTI, R.; STOLF, R.; NEPOMUCENO, A. L. Differential gene expression and mitotic cell analysis of the drought tolerant soybean (Glycine max L. Merrill Fabales, Fabaceae) cultivar MG/BR46 (Conquista) under two water deficit induction systems. Genetics and Molecular Biology, Ribeirão Preto, v. 31, n. 2, p. 512-521, 2008.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Internacional - A |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 11. | | FUGANTI, R.; BENEVENTI, M. A.; SILVA, J. F. V.; ARIAS, C. A. A.; MARIN, S. R. R.; BINNECK, E.; NEPOMUCENO, A. L. Identificação de marcadores moleculares de microssatélites para seleção de genótipos de soja resistentes a Meloidogyne javanica. Nematologia Brasileira, Brasília, DF, v. 28, n. 2, p. 125-130, dez. 2004.| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 12. | | FUGANTI, R.; BENEVENTI, M. A.; SILVA, J. F. V.; ARIAS, C. A. A.; MARIN, S. R. R.; BINNECK, E.; NEPOMUCENO, A. L. Microsatellite insertion in a heat-shock protein-promoter region (Gmhsp 17.6-L) in soybean plants resistant and susceptible to Meloidogyne javanica. In: WORLD SOYBEAN RESEARCH CONFERENCE, 7.; INTERNATIONAL SOYBEAN PROCESSING AND UTILIZATION CONFERENCE, 4.; CONGRESSO BRASILEIRO DE SOJA, 3., 2004, Foz do Iguassu. Abstracts of contributed papers and posters. Londrina: Embrapa Soybean, 2004. p. 321. (Embrapa Soja. Documentos, 228). Editado por Flávio Moscardi, Clara Beatriz Hoffmann-Campo, Odilon Ferreira Saraiva, Paulo Roberto Galerani, Francisco Carlos Krzyzanowski, Mercedes Concordia Carrão-Panizzi.| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 13. | | BENEVENTI, M. A.; FUGANTI, R.; SILVA, J. F. V.; ARIAS, C. A. A.; MARIN, S. R. R.; BINNECK, E.; LIMA, C. G.; NEPOMUCENO, A. L. Microsatellite molecular markers associated with selection process of soybean resistant genotypes to Meloidogyne javanica and Heterodera glycines. In: WORLD SOYBEAN RESEARCH CONFERENCE, 7.; INTERNATIONAL SOYBEAN PROCESSING AND UTILIZATION CONFERENCE, 4.; CONGRESSO BRASILEIRO DE SOJA, 3., 2004, Foz do Iguassu. Abstracts of contributed papers and posters. Londrina: Embrapa Soybean, 2004. p. 321-322. (Embrapa Soja. Documentos, 228). Editado por Flávio Moscardi, Clara Beatriz Hoffmann-Campo, Odilon Ferreira Saraiva, Paulo Roberto Galerani, Francisco Carlos Krzyzanowski, Mercedes Concordia Carrão-Panizzi.| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 14. | | ROLLA, A. A. P.; BENEVENTI, M. A.; FUGANTI, R.; MARIN, S. R. R.; FARIAS, J. R. B.; ABDELNOOR, R. V.; NEPOMUCENO, A. L.; MARCELINO, F. C. Method validation for quantification of transgene copy number in soybean genome using qPCR relative quantification by 2 -^^ Ct or 2 ^ Ct formule. In: WORLD SOYBEAN RESEARCH CONFERENCE, 8., 2009, Beijing. Developing a global soy blueprint for a safe secure and sustainable supply: abstracts. Beijing: Chinese Academy of Agricultural Sciences: Institute of Crop Science, 2009. p. 233, ref. P581. WSRC 2009. Editado por Lijuan Qiu, Rongxia Guan, Jian Jin, Qijan Song, Shuntang Guo, Wenbin Li, Yuanchao Wang, Tianfu Han, Xiaobing Liu, Deyue Yu, Lianzhou Jiang, Deliang Peng.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 15. | | SALINET, L. H.; FARIAS, J. R. B.; NEUMAIER, N.; BENEVENTI, M. A.; ROLLA, A. A. P.; POLIZEL, A. M.; MARIN, S. R. R.; ENGELS, C.; OLIVEIRA, R. F. de; OLIVEIRA, M. C. N. de; NEPOMUCENO, A. L. Avaliação fisiológica e agronômica de soja geneticamente modificada visando maior tolerância à seca. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE SOJA, 5.; MERCOSOJA 2009, Goiânia. Anais... Londrina: Embrapa Soja, 2009. Seção trabalhos, t. 173. 1 CD-ROM. Editado por Adilson de Oliveira Júnior, Odilon Ferreira Saraiva, Clara Beatriz Hoffmann Campo, César de Castro.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 16. | | ROLLA, A. A. de P.; STOLF, R.; SALINET, L. H.; PEREIRA, S. dos S.; POLIZEL, A. M.; BENEVENTI, M. A.; YAMANAKA, N.; NAKASHIMA, K.; YAMAGUCHI-SHINOZAKI, K.; OLIVEIRA, M. C. N. de; FARIAS, J. R. B.; NEPOMUCENO, A. L. Avaliação de parâmetros fisiológicos em eventos de soja geneticamente modificados com a construção rd29A:DREB1A. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 4., 2007, São Lourenço. Anais... São Lourenço: Sociedade Brasileira de Melhoramento de Plantas, 2007. 1 CD-ROM. Pdf. 116.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica | Circulação/Nível: -- - -- |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 17. | | STOLF, R.; MEDRI, M. E.; FARIAS, J. R. B.; BINNECK, E.; LEMOS N. G.; BENEVENTI, M. A.; MARIN, S. R. R.; SILVEIRA, C. A.; BROGIN, R. L.; YAMANAKA, N.; LEMOS, E. G. M.; NEPOMUCENO, A. L. Análise de expressão por PCR em tempo real e clonagem de genes induzidos sob condições de seca, em duas cultivares de soja, Glycine max (L.) Merrill. In: REUNIÃO DE PESQUISA DE SOJA DA REGIÃO CENTRAL DO BRASIL, 27., 2005. Cornélio Procópio. Resumos... Londrina: Embrapa Soja, 2005. p. 86-87. (Embrapa Soja. Documentos, 257). Organizado por Odilon Ferreira Saraiva, Janete Lasso Ortiz, Simone Ery Grosskopf.| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 18. | | PAIVA, A. A. R.; YAMAGUCHI-SHINOZAKI, K.; YAMANAKA, N.; NAKASHIMA, K.; FARIAS, J. R. B.; MARIN, S. R. R.; SILVEIRA, C. A.; LUGLE, S. M.; BENEVENTI, M. A.; ABDELNOOR, R. V.; POLIZEL, A. M.; NEPOMUCENO, A. L. Análise da indução do promotor rd29A de Arabidopsis thaliana em soja após déficit hídrico através de ensaio histoquímico e fluorimétrico em plantas transformadas com a construção rd29A:GUS. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE SOJA, 4., 2006, Londrina. Resumos... Londrina: Embrapa Soja, 2006. p. 46-47. Organizado por Odilon Ferreira Saraiva, Simone Ery Grosskopf.| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 19. | | ROLLA, A. A. de P.; YAMAGUCHI-SHINOZAKI, K.; YAMANAKA, N.; NAKASHIMA, K.; FARIAS, J. R. B.; MARIN, S. R. R.; SILVEIRA, C. A.; LUGLE, S. M.; BENEVENTI, M. A.; ABDELNOOR, R. V.; POLIZEL, A. M.; NEPOMUCENO, A. L. Análise da indução do promotor rd29A de Arabidopsis thaliana em soja após déficit hídrico, através de ensaios histoquímico e fluorimétrico em plantas transformadas com a construção rd29A:GUS. In: JORNADA ACADÊMICA DA EMBRAPA SOJA, 2., 2006, Londrina. Resumos expandidos. Londrina: Embrapa Soja, 2006. p. 171-174. (Embrapa Soja. Documentos, 276).| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 20. | | MORALES, A. M. R.; LEMOS, E. G. M.; WENDLAND, A.; FUGANTI, R.; ALVES, L. C.; MARIN, S. R. R.; BENEVENTI, M. A.; SILVA, J. F. V.; ARIAS, C. A. A.; DIAS, W. P.; ABDELNOOR, R. V.; NEPOMUCENO, A. L. Análise em soja da expressão de genes envolvidos na resistência à Meloidogyne javanica, através da técnica de PCR em tempo real. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE SOJA, 4., 2006, Londrina. Resumos... Londrina: Embrapa Soja, 2006. p. 47-48. Organizado por Odilon Ferreira Saraiva, Simone Ery Grosskopf.| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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