| |
|
|
 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Pecuária Sul. Para informações adicionais entre em contato com cppsul.biblioteca@embrapa.br. |
|
Registro Completo |
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Pecuária Sul. |
|
Data corrente: |
23/01/2019 |
|
Data da última atualização: |
23/01/2019 |
|
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
|
Autoria: |
NICIURA, S. C. M.; CRUVINEL, G. G.; MORAES, C. V.; DONATONI, F. A. B.; MALAGO JUNIOR, W.; BENAVIDES, M. V.; CHAGAS, A. C. de S. |
|
Afiliação: |
SIMONE CRISTINA MEO NICIURA, CPPSE; Giovanna Gabrielle Cruvinel, UNICEP; Caroline Valério Moraes, UFSCar; FLAVIA ALINE BRESSANI DONATONI, CPPSE; WILSON MALAGO JUNIOR, CPPSE; MAGDA VIEIRA BENAVIDES, CPPSUL; ANA CAROLINA DE SOUZA CHAGAS, CPPSE. |
|
Título: |
PCR-based genotyping of SNP markers in sheep. |
|
Ano de publicação: |
2018 |
|
Fonte/Imprenta: |
Molecular Biology Reports, v. 45, n. 4, p. 651-654, Aug. 2018. |
|
DOI: |
https://doi.org/10.1007/s11033-018-4206-8 |
|
Idioma: |
Inglês |
|
Conteúdo: |
Single nucleotide polymorphisms (SNPs) are the main type of variation in genome, enabling them to be associated with traits of economic importance in livestock. Genome-wide association studies (GWAS) have led to the discovery of SNPs associated with desirable traits in sheep. However, in these studies, SNPs are genotyped by high-throughput methods in genome scale, which are expensive and require sophisticated equipment and analysis methods. Therefore, the goal of this study was to develop a reliable, rapid, and inexpensive polymerase chain reaction (PCR)-based method to genotype a medium number of animals for a few candidate SNPs previously associated with desirable phenotypes in sheep by GWAS, using markers associated with gastrointestinal nematode resistance as a model. DNA extracted from white-blood cells of 150 sheep was submitted to PCR amplification followed by agarose gel electrophoresis and determination of banding pattern. Tetra-primer ARMS-PCR was successfully optimized after changes in annealing temperature; annealing and extension times; concentration of MgCl2 and DNA; ratios of inner, outer, forward and reverse primer; and addition of adjuvants, for genotyping the OAR2_14765360, OAR6_81718546, OAR11_62887032, and OAR12_69606944 SNPs in sheep. An extensive optimization of tetra-primer ARMS-PCR resulted in a suitable, simple, cost-effective PCR-based method of genotyping four SNP markers previously detected by chip arrays. |
|
Palavras-Chave: |
PCR RFLP; Resistência nematódeo gastrintestinal; Tetra primer ARMS PCR. |
|
Thesagro: |
Marcador Molecular; Ovino. |
|
Thesaurus Nal: |
Genome. |
|
Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
|
Marc: |
LEADER 02277naa a2200277 a 4500
001 2104694
005 2019-01-23
008 2018 bl --- 0-- u #d
024 7 $ahttps://doi.org/10.1007/s11033-018-4206-8$2DOI
100 1 $aNICIURA, S. C. M.
245 $aPCR-based genotyping of SNP markers in sheep.$h[electronic resource]
260 $c2018
520 $aSingle nucleotide polymorphisms (SNPs) are the main type of variation in genome, enabling them to be associated with traits of economic importance in livestock. Genome-wide association studies (GWAS) have led to the discovery of SNPs associated with desirable traits in sheep. However, in these studies, SNPs are genotyped by high-throughput methods in genome scale, which are expensive and require sophisticated equipment and analysis methods. Therefore, the goal of this study was to develop a reliable, rapid, and inexpensive polymerase chain reaction (PCR)-based method to genotype a medium number of animals for a few candidate SNPs previously associated with desirable phenotypes in sheep by GWAS, using markers associated with gastrointestinal nematode resistance as a model. DNA extracted from white-blood cells of 150 sheep was submitted to PCR amplification followed by agarose gel electrophoresis and determination of banding pattern. Tetra-primer ARMS-PCR was successfully optimized after changes in annealing temperature; annealing and extension times; concentration of MgCl2 and DNA; ratios of inner, outer, forward and reverse primer; and addition of adjuvants, for genotyping the OAR2_14765360, OAR6_81718546, OAR11_62887032, and OAR12_69606944 SNPs in sheep. An extensive optimization of tetra-primer ARMS-PCR resulted in a suitable, simple, cost-effective PCR-based method of genotyping four SNP markers previously detected by chip arrays.
650 $aGenome
650 $aMarcador Molecular
650 $aOvino
653 $aPCR RFLP
653 $aResistência nematódeo gastrintestinal
653 $aTetra primer ARMS PCR
700 1 $aCRUVINEL, G. G.
700 1 $aMORAES, C. V.
700 1 $aDONATONI, F. A. B.
700 1 $aMALAGO JUNIOR, W.
700 1 $aBENAVIDES, M. V.
700 1 $aCHAGAS, A. C. de S.
773 $tMolecular Biology Reports$gv. 45, n. 4, p. 651-654, Aug. 2018.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Pecuária Sul (CPPSUL) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
|
| Registros recuperados : 126 | |
| 81. |  | HAEHLING, M. B.; TOSCANO, J. H. B.; GIRALDELO, L. A.; SANTOS, I. B.; ESTEVES, S. N.; BENAVIDES, M. V.; THOLON, P.; CHAGAS, A. C. de S. Is selection for resistance and resilience to Haemonchus contortus possible in Morada Nova sheep? Small Ruminant Research, v.201, aug. 2021, 106447. 10 p.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste; Embrapa Pecuária Sul. |
|    |
| 82. | | HASSUM, I. C.; SOUZA, C. J. H. de; BENAVIDES, M. V.; BERNE, M. E. A.; VIEIRA, L. da S.; ZAROS, L. G. Metodologias para avaliar protocolos de desafio na fenotipagem de ovinos resistentes à infecção por endoparasitos. In: SIMPÓSIO EMBRAPA LABEX DE SANIDADE ANIMAL, 1., 2009, Campo Grande. Anais... Campo Grande: Embrapa Gado de Corte, 2009. 1 CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul. |
| |
| 83. | | NICIURA, S. C. M.; CRUVINEL, G. G.; MORAES, C. V.; DONATONI, F. A. B.; MALAGO JUNIOR, W.; BENAVIDES, M. V.; CHAGAS, A. C. de S. PCR-based genotyping of SNP markers in sheep. Molecular Biology Reports, v.45, n.4, p.651-654, aug. 2018.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
|  |
| 84. | | NICIURA, S. C. M.; CRUVINEL, G. G.; MORAES, C. V.; DONATONI, F. A. B.; MALAGO JUNIOR, W.; BENAVIDES, M. V.; CHAGAS, A. C. de S. PCR-based genotyping of SNP markers in sheep. Molecular Biology Reports, v. 45, n. 4, p. 651-654, Aug. 2018.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul. |
| |
| 85. | | SILVEIRA, J. C. da; FERRONATO, G. de A.; OLIVEIRA, J. F. C. de; HENKES, L. E.; BENAVIDES, M. V.; CESAR, A. S. M. Marcadores moleculares aplicados à seleção animal. In: GONÇALVES, P. B. D.; FIGUEIREDO, J. R. de; GASPERIN, B. G. (ed.). Biotécnicas aplicadas à reprodução animal e à humana. 3. ed. Rio de Janeiro: Roca, 2021. p. 323-340.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul. |
| |
| 86. | | SANTOS, L. R. dos; ARAUJO, F. R.; GASPAR, E. B.; GULIAS-GOMES, C. C.; SACCO, A. M. S.; BENAVIDES, M. V.; RAMOS, C. A. do N. Protocolos para diagnóstico de babesiose e anaplasmose. In: ANDREOTTI, R.; KOLLER, W. W. (Ed.). Carrapatos: protocolos e técnicas para estudo. Brasília, DF: Embrapa, 2016. p. 75-97.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte; Embrapa Pecuária Sul; Embrapa Pesca e Aquicultura. |
| |
| 87. | | NICIURA, S. C. M.; OKINO, C. H.; NUCCI, A. DA S.; MALAGO JUNIOR, W.; BENAVIDES, M. V.; ESTEVES, S. N.; CHAGAS, A. C. de S. Polymorphisms in exon 11 of the mptl-1 gene and monepantel resistance in Haemonchus contortus. Parasitology Research, v. 121, p. 3581-3588, 2022.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste; Embrapa Pecuária Sul. |
| |
| 88. | | BENAVIDES, M. V.; SANTOS, V. R. V. dos; SIMON, J.; SANTOS, D.; ALCANTARA, P. H. R. de; CARDOSO, D. da S.; QUEIROZ, F. M.; MONTEIRO, H. C. Presença de larvas de Tricostrongilídeos e de larvas de vida livre em pastagens de capim-massai irrigadas na região de Palmas, Tocantins. Palmas: Embrapa Pesca e Aquicultura, 2017. 24 p. (Embrapa Pesca e Aquicultura. Boletim de pesquisa e desenvolvimento, 19).| Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul; Embrapa Pesca e Aquicultura. |
| |
| 89. | | REINIGER, R. C. P.; CASTRO, L. L. D. de; PINTO, N. B.; BOTELHO, F. B.; BENAVIDES, M. V.; BERNE, M. E. A. Resposta de cordeiros ao parasitismo por Haemonchus contortus previamente infectados com Haemonchus placei. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MEDICINA VETERINARIA, 38., 2011, Florianópolis, SC. [Anais...]. Florianópolis: Sociedade Brasileira de Medicina Veterinária, 2011.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul. |
| |
| 90. | | BENAVIDES, M. V.; SOUZA, C. J. H. de; MORAES, J. C. F.; BERNE, M. E. A.; HASSUM, I. C.; VIEIRA, L.; ZAROS, L.; REINIGER, R. C. P. Resposta da inoculação por Haemonchus contortus em cordeiros primo-infectados com Haemonchus placei. In: SIMPÓSIO EMBRAPA LABEX DE SANIDADE ANIMAL, 1., 2009, Campo Grande. Anais... Campo Grande: Embrapa Gado de Corte, 2009. 1 CD-ROM. Resumo em português e inglês.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul. |
| |
| 91. | | CHAGAS, A. C. de S.; LOPES, L. G.; SILVA, M. H.; GIRALDELO, L. A.; TOSCANO, J. H. B.; OKINO, C. H.; BENAVIDES, M. V.; ESTEVES, S. N. Phenotypic characterization of the parasite resistance in Morada Nova sheep. In: ANNUAL MEETING OF THE EUROPEAN FEDERATION OF ANIMAL SCIENCE, 69., 2018, Dubrovnik, Croatia. Proceedings... Dubrovnik, Croatia: Wageningen Academic Publishers, 2018. p.308. 27-31 august 2018.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
| |
| 92. | | NICIURA, S. C. M.; CRUVINEL, G. G.; MORAES, C. V.; CHAGAS, A. C. de S.; ESTEVES, S. N.; BENAVIDES, M. V.; AMARANTE, A. F. T. do. In vivo selection for Haemonchus contortus resistance to monepantel. Journal of Helminthology, v. 94, e-46, p. 1-5, 2020.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul. |
| |
| 93. | | NICIURA, S. C. M.; CRUVINEL, G. G.; MORAES, C. V.; CHAGAS, A. C. de S.; ESTEVES, S. N.; BENAVIDES, M. V.; AMARANTE, A. F. T. do. In vivo selection for Haemonchus contortus resistance to monepantel. Journal of Helminthology, v. 94, e-46, p. 1-5, 2020.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
| |
| 94. | | NICIURA, S. C. M.; MINHO, A. P.; MCINTYRE, J.; BENAVIDES, M. V.; OKINO, C. H.; ESTEVES, S. N.; CHAGAS, A. C. de S.; AMARANTE, A. F. T. DO. In vitro culture of parasitic stages of Haemonchus contortus. Revista Brasileira de Parasitologia Veterinária, v. 32, n. 1, 2023, e010122. 12 p.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste; Embrapa Pecuária Sul. |
| |
| 95. | | KICH, J. D.; UTHE, J. J.; BENAVIDES, M. V.; CANTAO, M. E.; ZANELLA, R.; TUGGLE, C. K.; BEARSON, S. M. D. TLR4 Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs) Associated with Salmonella Shedding in Pigs. In: SAFEPORK, 2013, Portland. Proceeding... Portland, 2013. 1 Pen drive.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
| |
| 96. | | KICH, J. D.; UTHE, J. J.; BENAVIDES, M. V.; CANTAO, M. E.; ZANELLA, R.; TUGGLE, C. K.; BEARSON, S. M. D. TLR4 single nucleotide polymorphisms (SNPs) associated with Salmonella shedding in pigs. Journal of Applied Genetics, v. 55, n. 2, p. 267-71, 2014.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul; Embrapa Suínos e Aves. |
| |
| 97. | | RASSIER, G. L.; BORSUK, S.; PAPPEN, F.; SCAINI, C. J.; GALLINA, T.; VILLELA, M. M.; FARIAS, N. A. da R.; BENAVIDES, M. V.; BERNE, M. E. A. Toxocara spp. seroprevalence in sheep from southern Brazil. Parasitology Research, v. 112, n. 9, p. 3181-3186, 2013.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul. |
| |
| 98. | | SMITH, W. D.; NEWLANDS, G.; FITZPATRICK, J.; SPICKETT, A.; AMARANTE, A.; SOUZA, C. J. H. de; BENAVIDES, M. V.; BESIER, B. Towards a commercial vaccine for Haemonchosis in ruminants. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE WORLD ASSOCIATION FOR THE ADVANCEMENT OF VETERINARY PARASITOLOGY, 23., 2011, Buenos Aires. Proceedings... Buenos Aires: WAAVP, 2011. 1 CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul. |
| |
| 99. | | SANTOS, L. R. dos; ARAUJO, F. R.; GULIAS-GOMES, C. C.; GASPAR, E. B.; BENAVIDES, M. V.; RAMOS, C. A. Do N. Tristeza parasitária bovina: avanços no controle. In: ANDREOTTI, R.; KOLLER, W. W. (Ed.). Carrapatos no Brasil: biologia, controle e doenças transmitidas. Brasília, DF: Embrapa, 2013. p. 51-71.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
| |
| 100. | | SANTOS, L. R. dos; ARAUJO, F. R.; RAMOS, C. A. do N.; GULIAS GOMES, C. C.; GASPAR, E. B.; BENAVIDES, M. V. Tristeza parasitária bovina: avanços no controle. In: ANDREOTTI, R.; KOLLER, W. W. (Ed.). Carrapatos no Brasil. Brasília, DF: Embrapa, 2013. p. 51-71.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul. |
| |
| Registros recuperados : 126 | |
|
| Nenhum registro encontrado para a expressão de busca informada. |
|
|
