| |
|
|
|
Registro Completo |
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Pesca e Aquicultura. |
|
Data corrente: |
27/03/2015 |
|
Data da última atualização: |
24/02/2016 |
|
Tipo da produção científica: |
Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento |
|
Autoria: |
VARELA, E. S.; ALVES, A. L.; BARROSO, A. da S.; TARDIVO, T. F. |
|
Afiliação: |
EDUARDO SOUSA VARELA, CNPASA; ANDERSON LUIS ALVES, CNPASA; AURISAN DA SILVA BARROSO, bolsista CNPASA; THIAGO FONTOLAN TARDIVO, RURALTINS. |
|
Título: |
Parentesco genético em reprodutores de tambaqui (Colossoma macropomum) baseado em marcadores de DNA: perspectivas de manejo genético na ausência de pedigree. |
|
Ano de publicação: |
2015 |
|
Fonte/Imprenta: |
Palmas: Embrapa Pesca e Aquicultura, 2015. |
|
Páginas: |
28 p. |
|
Série: |
(Embrapa Pesca e Aquicultura. Boletim de pesquisa e desenvolvimento, 8). |
|
ISSN: |
2358-6273 |
|
Idioma: |
Português |
|
Conteúdo: |
O controle das relações de parentesco de peixes nativos em fase inicial de domesticação é uma atividade fundamental para sustentabilidade dos recursos genéticos e fortalecimento das cadeias produtivas emergentes. O objetivo deste trabalho foi estimar o parentesco genético em reprodutores de tambaqui de uma piscicultura comercial, sem as informações de procedência e pedigree, utilizando marcadores moleculares. Quarenta e oito animais foram avaliados com seis marcadores microssatélites. O polimorfismo encontrado nessa piscicultura foi considerado moderado, com número médio de alelos de 6,5. O parentesco médio estimado foi de -0,015 a -0,02, e a curva dos genótipos reais similar à distribuição simulada de animais não aparentados. A taxa de erro foi de 7,8% a 5,5% para meios-irmãos e irmãos-completos, respectivamente. De modo geral os animais do plantel de tambaqui investigado não exibiram vínculo genético entre si o que lhes asseguram amplas possibilidades de acasalamento de reprodutores. Essa condição melhora as perspectivas de manejo na seleção de reprodutores e o descarte de acasalamento machos e fêmeas altamente consanguíneos. |
|
Palavras-Chave: |
Manejo genético; Microsatélite. |
|
Thesagro: |
Colossoma macropomum; Marcador molecular; Melhoramento genético animal; Peixe de água doce; Tambaqui. |
|
Categoria do assunto: |
L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal |
|
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/124951/1/cnpasa-2015.pdf
|
|
Marc: |
LEADER 02076nam a2200265 a 4500
001 2012252
005 2016-02-24
008 2015 bl uuuu u0uu1 u #d
022 $a2358-6273
100 1 $aVARELA, E. S.
245 $aParentesco genético em reprodutores de tambaqui (Colossoma macropomum) baseado em marcadores de DNA$bperspectivas de manejo genético na ausência de pedigree.$h[electronic resource]
260 $aPalmas: Embrapa Pesca e Aquicultura$c2015
300 $a28 p.
490 $a(Embrapa Pesca e Aquicultura. Boletim de pesquisa e desenvolvimento, 8).
520 $aO controle das relações de parentesco de peixes nativos em fase inicial de domesticação é uma atividade fundamental para sustentabilidade dos recursos genéticos e fortalecimento das cadeias produtivas emergentes. O objetivo deste trabalho foi estimar o parentesco genético em reprodutores de tambaqui de uma piscicultura comercial, sem as informações de procedência e pedigree, utilizando marcadores moleculares. Quarenta e oito animais foram avaliados com seis marcadores microssatélites. O polimorfismo encontrado nessa piscicultura foi considerado moderado, com número médio de alelos de 6,5. O parentesco médio estimado foi de -0,015 a -0,02, e a curva dos genótipos reais similar à distribuição simulada de animais não aparentados. A taxa de erro foi de 7,8% a 5,5% para meios-irmãos e irmãos-completos, respectivamente. De modo geral os animais do plantel de tambaqui investigado não exibiram vínculo genético entre si o que lhes asseguram amplas possibilidades de acasalamento de reprodutores. Essa condição melhora as perspectivas de manejo na seleção de reprodutores e o descarte de acasalamento machos e fêmeas altamente consanguíneos.
650 $aColossoma macropomum
650 $aMarcador molecular
650 $aMelhoramento genético animal
650 $aPeixe de água doce
650 $aTambaqui
653 $aManejo genético
653 $aMicrosatélite
700 1 $aALVES, A. L.
700 1 $aBARROSO, A. da S.
700 1 $aTARDIVO, T. F.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Pesca e Aquicultura (CNPASA) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
|
Registro Completo
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital. |
|
Data corrente: |
09/02/2015 |
|
Data da última atualização: |
22/01/2020 |
|
Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
|
Autoria: |
SILVA, J. M. da; GIACHETTO, P. F.; SILVA, L. O. C. da; PAIVA, S. R.; CAETANO, A. R.; YAMAGISHI, M. E. B. |
|
Afiliação: |
JOAQUIM MANOEL DA SILVA, Unemat, IB/Unicamp, CNPTIA; POLIANA FERNANDA GIACHETTO, CNPTIA; LUIZ OTAVIO CAMPOS DA SILVA, CNPGC; SAMUEL REZENDE PAIVA, SRI; ALEXANDRE RODRIGUES CAETANO, CENARGEN; MICHEL EDUARDO BELEZA YAMAGISHI, CNPTIA. |
|
Título: |
Detection of copy number variations in nelore beef cattle with high-density SNP genotyping data. |
|
Ano de publicação: |
2014 |
|
Fonte/Imprenta: |
In: PLANT & ANIMAL GENOME CONFERENCE, 22., 2014, San Diego, CA. [Abstracts...]. San Diego: [s.n.], 2014. |
|
Páginas: |
Não paginado. |
|
Idioma: |
Inglês |
|
Notas: |
P553. |
|
Conteúdo: |
Genome-wide single nucleotide polymorphism (SNP) genotyping platforms have been widely used in studies in diverse areas, ranging from population genetics to applied genetic improvement and breeding. SNP genotyping data generated with these platforms can also be used for detecting and genotyping copy number variations (CNVs). CNVs are defined as a variable copy numbers of DNA segments ranging from 50bp to several megabases (Mbp), in comparison with a reference genome. Several studies have identified an abundance of CNVs in human and domestic animal genomes, where it has been shown that they are involved in phenotypic variability. This initial study reports a high resolution map of CNVs in Nelore beef cattle generated with the PennCNV software. CNVs were called in a dataset from 1709 animals of the Nelore breed genotyped with Illumina BovineHD BeadChip for a total of 735,242 markers. After non-restrictive quality filtering, a total of 246,290 CNVs were identified on autosomal chromosomes, representing 219,997 and 26,293 gain and loss events, respectively. CNVs lengths ranged from 20.02 Kb to 8.37 Mb with an average of 352 Kb and a median of 204.5 Kb. The number of SNPs in each detected CNV varied from 20 to 2,116 with an average of 104 and a median of 63. A total of 138,066 CNVs were present in regions with annotated genes. |
|
Palavras-Chave: |
Polimorfismo de nucleotídeo único. |
|
Thesagro: |
Gado de corte. |
|
Thesaurus NAL: |
Beef cattle; Nellore; Single nucleotide polymorphism. |
|
Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
|
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/117503/1/Joaquim-Manoel-Silva-PAG-XXII-2014-ARC-CNVR.pdf
|
|
Marc: |
LEADER 02168nam a2200253 a 4500
001 2008077
005 2020-01-22
008 2014 bl uuuu u00u1 u #d
100 1 $aSILVA, J. M. da
245 $aDetection of copy number variations in nelore beef cattle with high-density SNP genotyping data.$h[electronic resource]
260 $aIn: PLANT & ANIMAL GENOME CONFERENCE, 22., 2014, San Diego, CA. [Abstracts...]. San Diego: [s.n.]$c2014
300 $aNão paginado.
500 $aP553.
520 $aGenome-wide single nucleotide polymorphism (SNP) genotyping platforms have been widely used in studies in diverse areas, ranging from population genetics to applied genetic improvement and breeding. SNP genotyping data generated with these platforms can also be used for detecting and genotyping copy number variations (CNVs). CNVs are defined as a variable copy numbers of DNA segments ranging from 50bp to several megabases (Mbp), in comparison with a reference genome. Several studies have identified an abundance of CNVs in human and domestic animal genomes, where it has been shown that they are involved in phenotypic variability. This initial study reports a high resolution map of CNVs in Nelore beef cattle generated with the PennCNV software. CNVs were called in a dataset from 1709 animals of the Nelore breed genotyped with Illumina BovineHD BeadChip for a total of 735,242 markers. After non-restrictive quality filtering, a total of 246,290 CNVs were identified on autosomal chromosomes, representing 219,997 and 26,293 gain and loss events, respectively. CNVs lengths ranged from 20.02 Kb to 8.37 Mb with an average of 352 Kb and a median of 204.5 Kb. The number of SNPs in each detected CNV varied from 20 to 2,116 with an average of 104 and a median of 63. A total of 138,066 CNVs were present in regions with annotated genes.
650 $aBeef cattle
650 $aNellore
650 $aSingle nucleotide polymorphism
650 $aGado de corte
653 $aPolimorfismo de nucleotídeo único
700 1 $aGIACHETTO, P. F.
700 1 $aSILVA, L. O. C. da
700 1 $aPAIVA, S. R.
700 1 $aCAETANO, A. R.
700 1 $aYAMAGISHI, M. E. B.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
Fechar
|
|
|
| Registros recuperados : 3 | |
| 2. |  | 2001303, AGRICULTURE (PARIS), Paris, FR
Biblioteca(s): Catálogo Coletivo de Periódicos Embrapa; Embrapa Algodão; Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Semiárido; Embrapa Soja; Embrapa Trigo. |   |
| 3. | | 0904326, BOLETIM TECNICO. COPERSUCAR, COOPERSUCAR, Sao Paulo-SP
Biblioteca(s): Catálogo Coletivo de Periódicos Embrapa; Embrapa Acre; Embrapa Agrobiologia; Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Arroz e Feijão; Embrapa Meio Ambiente; Embrapa Semiárido. | |
| Registros recuperados : 3 | |
|
|
|
