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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Corte. |
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Data corrente: |
27/12/2019 |
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Data da última atualização: |
27/12/2019 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
MATIAS, F. I.; VIDOTTI, M. S.; MEIRELES, K. G. X.; BARRIOS, S. C. L.; VALLE, C. B. do; CARLEY, C. A. S.; FRITSCHE-NETO, R. |
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Afiliação: |
Filipe Inácio Matias, Universidade de São Paulo - USP/Escola Superior de Agricultura "Luiz de Queiroz" - ESALQ/Departamento de Genética; Miriam Suzane Vidotti, Universidade de São Paulo - USP/Escola Superior de Agricultura "Luiz de Queiroz" - ESALQ/Departamento de Genética; KAREM GUIMARAES XAVIER MEIRELES, CNPGC; SANZIO CARVALHO LIMA BARRIOS, CNPGC; Cacilda Borges do Valle, Colaboradora da Embrapa Gado de Corte; Cari A. Schmitz Carley; Roberto Fritsche-Neto, Universidade de São Paulo - USP/Escola Superior de Agricultura "Luiz de Queiroz" - ESALQ/Departamento de GenéticaUniversidade de São Paulo - USP/Escola Superior de Agricultura "Luiz de Queiroz" - ESALQ/Departamento de Genética. |
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Título: |
Association Mapping Considering Allele Dosage: An Example of Forage Traits in an Interspecific Segmental Allotetraploid Urochloa spp. |
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Ano de publicação: |
2019 |
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Fonte/Imprenta: |
Crop Science, v. 59, n. 5, p. 2062-2076, september-october, 2019. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
The breeding process in tropical segmental allopolyploid forage Urochloa is challenging due to the complex genetic control of the traits. Knowledge about genes associated with forage traits, expressed in the different cutting seasons, are extremely useful to support breeding programs and development of new cultivars. Thus, the aims of our study were (i) to identify genomic regions related to forage traits through genomewide association studies (GWAS), and (ii) to verify the influence of allele dosage on these results. A panel of 272 genotypes of Urochloa spp. [U. brizantha (Hoscht. ex A. Rich.) R. Webster ´ U. ruziziensis (Hoscht. ex A. Rich.) R. Webster] was evaluated in both the wet and dry seasons. The GWAS analyses were performed with 26,535 single nucleotide polymorphisms (SNPs) obtained by genotyping-by-sequencing (GBS) using diploid and tetraploid allele dosage configurations. Furthermore, we evaluated scenarios including additive, dominance, and epistatic effects. Seven candidate genomic regions associated with the main forage traits of Urochloa spp. were identified. The importance of the diploid and tetraploid molecular configuration in GWAS analyses for segmental allopolyploid species was demonstrated to identify the genomic behavior of important regions. Results demonstrated that it is possible to identify the same regions using both ploidy configurations; however, in some cases, the allele substitution effect can be biased mainly for regions with dominance and epistatic effects. Finally, this study contributes to the understanding of genetic control of tropical forage traits and genomics to accelerate the selection and reduce the cost to release new cultivars. MenosThe breeding process in tropical segmental allopolyploid forage Urochloa is challenging due to the complex genetic control of the traits. Knowledge about genes associated with forage traits, expressed in the different cutting seasons, are extremely useful to support breeding programs and development of new cultivars. Thus, the aims of our study were (i) to identify genomic regions related to forage traits through genomewide association studies (GWAS), and (ii) to verify the influence of allele dosage on these results. A panel of 272 genotypes of Urochloa spp. [U. brizantha (Hoscht. ex A. Rich.) R. Webster ´ U. ruziziensis (Hoscht. ex A. Rich.) R. Webster] was evaluated in both the wet and dry seasons. The GWAS analyses were performed with 26,535 single nucleotide polymorphisms (SNPs) obtained by genotyping-by-sequencing (GBS) using diploid and tetraploid allele dosage configurations. Furthermore, we evaluated scenarios including additive, dominance, and epistatic effects. Seven candidate genomic regions associated with the main forage traits of Urochloa spp. were identified. The importance of the diploid and tetraploid molecular configuration in GWAS analyses for segmental allopolyploid species was demonstrated to identify the genomic behavior of important regions. Results demonstrated that it is possible to identify the same regions using both ploidy configurations; however, in some cases, the allele substitution effect can be biased mainly for regions with dominance and ep... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Tropical regions. |
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Thesaurus Nal: |
Animal performance; Animal proteins; Cattle feeding; Forage; Pastures; Urochloa. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/207880/1/Association-mapping-considering-Allele-dosage.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Gado de Corte (CNPGC) |
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| 81. |  | FIQUEIREDO, R. N. G.; BARRIOS, S. C. L.; VALLE, C. B. do; CANDIDO, A. R.; MACHADO, W. K. R.; QUEIROZ JÚNIOR, J. M.; NOBRE, A. A. A. Avaliação genética e produção de sementes de híbridos de Brachiaria. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA GADO DE CORTE, 14., 2018, Campo Grande - MS. [Resumos dos trabalhos]. Brasília, DF, Embrapa, 2018 115 p. (Embrapa Gado de Corte. Documentos, 258). P. 98-99| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 82. | | MENDONÇA, S. A.; MATEUS, R. G.; BARRIOS, S. C. L.; VALLE, C. B. do; MEIRELLES, P. R. de L.; FIGUEIREDO, U. J. Avaliação de híbridos intraespecíficos de Brachiaria decumbens sob cortes. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 49., 2012, Brasília. A produção animal no mundo em transformação: anais. Brasília, DF: SBZ, 2012. 3 p. 1 CD-ROM. Trabalho 4PSB.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 83. | | NOBRE, A. A. A.; BARRIOS, S. C. L.; VALLE, C. B. do; DIAS, A. M.; MACHADO, W. K. R.; GOUVEIA, B. T.; CANDIDO, A. R.; QUEIROZ JÚNIOR, J. Avaliação e estimativa de parâmetros genéticos para caracteres relacionados à produção de sementes em híbridos de Brachiaria decumbens. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA GADO DE CORTE, 14., 2018, Campo Grande - MS. [Resumos dos trabalhos]. Brasília, DF, Embrapa, 2018 115 p. (Embrapa Gado de Corte. Documentos, 258). p. 10-11 (Embrapa Gado de Corte. Documentos, 258).| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 84. | | MATIAS, F. I.; VIDOTTI, M. S.; MEIRELES, K. G. X.; BARRIOS, S. C. L.; VALLE, C. B. do; CARLEY, C. A. S.; FRITSCHE-NETO, R. Association Mapping Considering Allele Dosage: An Example of Forage Traits in an Interspecific Segmental Allotetraploid Urochloa spp. Crop Science, v. 59, n. 5, p. 2062-2076, september-october, 2019.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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| 85. | | RAMOS, A. K. B.; BRAGA, G. J.; CARVALHO, M. A.; FONSECA, C. E. L. da; FERNANDES, F. D.; BARRIOS, S. C. L.; VALLE, C. B. do. Agronomic evaluation of Brachiaria decumbens hybrids in Cerrado: Planaltina, DF regional trial - collection 2011. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 55.; CONGRESSO BRASILEIRO DE ZOOTECNIA, 28., 2018, Goiânia. Construindo saberes, formando pessoas e transformando a produção animal: anais eletrônicos. Goiânia: Sociedade Brasileira de Zootecnia, 2018.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 89. | | GOUVEIA, B. T.; BARRIOS, S. C. L.; VALLE, C. B. do; NUNES, J. A. R.; ALMEIDA, B. B. de; FREITAS, J. C. R.; QUEIROZ JÚNIOR, J. M. Correlação entre caracteres em híbridos de Brachiaria spp. sob corte no período das águas e de seca. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 9., 2017, Foz de Iguaçu. Melhoramento de plantas: projetando o futuro: resumos das palestras. p. 607| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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