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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Soja. |
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Data corrente: |
23/05/2007 |
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Data da última atualização: |
24/05/2007 |
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Autoria: |
BARBOSA, S. R. C.; GOMES, E.; BRESEGHELO, L.; MOURA, A. L. D.; ALVES, E. B.; KNOB, A.; ALMEIDA, A. M. R.; LOBO JUNIOR, M.; PETROFEZA, S. |
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Título: |
Análise parcial do transcriptoma de Sclerotinia sclerotiorum durante a interação patogênica com feijão comum (Phaseolus vulgaris L.). |
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Ano de publicação: |
2006 |
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Fonte/Imprenta: |
In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 52.; CONGRESO DE LA ASOCIACIÓN LATINOAMERICANA DE GENÉTICA, 12., 2006, Foz do Iguaçu. Resumos... Ribeirão Preto, SP: Sociedade Brasileira de Genética, 2006. |
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Descrição Física: |
1 CD-ROM. |
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Idioma: |
Português |
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Notas: |
Área Microorganismos - pdf 898. |
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Conteúdo: |
No Brasil, perdas na produção de diversas culturas causadas por Sclerotinia sclerotiorum vêm chamando a atenção de produtores e pesquisadores, como em lavouras de feijão e soja, irrigadas por pivô central em diversas regiões do país. Dentre as culturas comerciais afetadas, a do feijoeiro é a que mais sofre perdas na produção, sendo o número de sementes por planta e seu peso os componentes de rendimento mais afetados trazendo enorme prejuízo. O interesse em genes de fungos diferencialmente expressos durante a interação com a planta hospedeira é nutrido pela idéia que tais genes podem desempenhar um papel crucial durante o desenvolvimento da patologia. Neste sentido este trabalho objetivou a identificação e a análise de genes de S. sclerotiorum que são expressos preferentemente durante sua interação com a planta de feijoeiro (Phaseolus vulgaris L) o pode permitir a detecção de genes que são potencialmente importantes para o processo de patogênese em cada uma das fases consideradas. Os bancos de cDNA foram construídos no vetor uni-direcional e de expressão ?ZAP a partir de S. sclerotiorum crescido em meio BDA (condição normal) e de S. sclerotiorum durante a infecção em plântulas de feijoeiro Os cDNAs clonados nestes fagos foram isolados e amplificados por PCR, sendo o produto submetido direto ao seqüenciamento da região 5'.Os eletroferogramas foram analisadas pelo programa PHRED e as seqüências correspondentes aos vetores foram mascaradas através do programa CrossMatch. Somente as seqüências que apresentaram um tamanho acima de 200 nucleotídeos, com índice PHRED maior do que 20 foram selecionadas. As ESTs foram agrupadas utilizando o programa CAP3 sendo que as seqüências similares formaram um contig, que era representado por uma única seqüência consenso, e os singlets, seqüências unitárias que não apresentaram similaridade com nenhuma outra seqüência.Um total de 1860 ESTs foram geradas, sendo 940 da condição Normal e 920 seqüências da interação sclerotinia-feijoeiro. Destas foram consideradas apenas seqüências de ESTs que apresentaram um E value < 10-5, correspondendo a 58,51% e 46,74% do total de ESTs seqüenciadas da condição normal e interação, respectivamente. A subtração eletrônica de ESTs foi feita utilizando as seqüências da condição normal e seqüências da interação de S. sclerotiorum-feijoeiro. Os genes diferencialmente expressos foram obtidos considerando-se os contigs formados exclusivamente por normal ou interação. As seqüências consenso dos contigs e os singlets, foram comparadas com seqüências de outros organismos, utilizando o BLASTx e os bancos de dados GenBank nr; COG (Cluster of Orthologous Groups), GO (Gene Ontology) e MIPs (Munich Information Center for Proteins Sequences). As seqüências foram categorizadas e suas possíveis funções inferidas por analogia com outras depositadas nos bancos de dados. MenosNo Brasil, perdas na produção de diversas culturas causadas por Sclerotinia sclerotiorum vêm chamando a atenção de produtores e pesquisadores, como em lavouras de feijão e soja, irrigadas por pivô central em diversas regiões do país. Dentre as culturas comerciais afetadas, a do feijoeiro é a que mais sofre perdas na produção, sendo o número de sementes por planta e seu peso os componentes de rendimento mais afetados trazendo enorme prejuízo. O interesse em genes de fungos diferencialmente expressos durante a interação com a planta hospedeira é nutrido pela idéia que tais genes podem desempenhar um papel crucial durante o desenvolvimento da patologia. Neste sentido este trabalho objetivou a identificação e a análise de genes de S. sclerotiorum que são expressos preferentemente durante sua interação com a planta de feijoeiro (Phaseolus vulgaris L) o pode permitir a detecção de genes que são potencialmente importantes para o processo de patogênese em cada uma das fases consideradas. Os bancos de cDNA foram construídos no vetor uni-direcional e de expressão ?ZAP a partir de S. sclerotiorum crescido em meio BDA (condição normal) e de S. sclerotiorum durante a infecção em plântulas de feijoeiro Os cDNAs clonados nestes fagos foram isolados e amplificados por PCR, sendo o produto submetido direto ao seqüenciamento da região 5'.Os eletroferogramas foram analisadas pelo programa PHRED e as seqüências correspondentes aos vetores foram mascaradas através do programa CrossMatch. Somente... Mostrar Tudo |
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Categoria do assunto: |
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Registro original: |
Embrapa Soja (CNPSO) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Pantanal; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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Data corrente: |
28/11/2018 |
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Data da última atualização: |
30/11/2018 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
B - 3 |
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Autoria: |
MAGNUSSON, W. E.; GRELLE, C. E. V.; MARQUES, M. C. M.; ROCHA, C. F. D.; DIAS, B.; FONTANA, C. S.; BERGALLO, H.; OVERBECK, G. E.; VALE, M. M.; TOMAS, W. M.; CERQUEIRA, R.; COLLEVATTI, R.; PILLAR, V. D.; MALABARBA, L. R.; LINS-E-SILVA, A. C.; NECKEL-OLIVEIRA, S.; MARTINELLI, B.; AKAMA, A.; RODRIGUES, D.; SILVEIRA, L. F.; SCARIOT, A. O.; FERNANDES, G. W. |
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Afiliação: |
WILLIAM E. MAGNUSSON, INPA; CARLOS E. V. GRELLE, UFRJ; MÁRCIA C. M. MARQUES, UFPR; CARLOS F. D. ROCHA, UERJ; BRAULIO DIAS, UnB; CARLA S. FONTANA, PUCRS; HELENA BERGALLO, UERJ; GERHARD E. OVERBECK, UFRGS; MARIANA M. VALE, UFRJ; WALFRIDO MORAES TOMAS, CPAP; RUI CERQUEIRA, UFRJ; ROSANE COLLEVATTI, UFG; VALÉRIO D. PILLAR, UFRGS; LUIZ R. MALABARBA, UFRGS; ANA CAROLINA LINS-E-SILVA, UFRPE; SELVINO NECKEL-OLIVEIRA, UFSC; BRUNO MARTINELLI, UnB; ALBERTO AKAMA, MUSEU PARAENSE EMILIO GOELDI; DOMINGOS RODRIGUES, UFMT; LUIS F. SILVEIRA, USP; ALDICIR OSNI SCARIOT, Cenargen; GERALDO W. FERNANDES, UFMG. |
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Título: |
Effects of Brazil's political crisis on the science needed for biodiversity conservation. |
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Ano de publicação: |
2018 |
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Fonte/Imprenta: |
Frontiers in Ecology and Evolution, v. 6, n. 163, p. 1-6, oct. 2018. |
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DOI: |
https://doi.org/10.3389/fevo.2018.00163 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
The effects of Brazil's political crisis on science funding necessary for biodiversity conservation are likely to be global. Brazil is not only the world?s most biodiverse nation, it is responsible for the greater part of the Amazon forest, which regulates the climate and provides rain to much of southern South America. Brazil was a world leader in satellite monitoring of land-use change, in-situ biodiversity monitoring, reduction in tropical-forest deforestation, protection of indigenous lands, and a model for other developing nations. Coordinated public responses will be necessary to prevent special-interest groups from using the political crisis to weaken science funding, environmental legislation and law enforcement. |
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Thesagro: |
Biodiversidade; Financiamento; Pesquisa. |
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Thesaurus NAL: |
Biodiversity; Brazil; Climate change; Funding; Governance; Research. |
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Categoria do assunto: |
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P Recursos Naturais, Ciências Ambientais e da Terra |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/187428/1/Magnusson-Effects-of-Brazil.pdf
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/187902/1/fevo-06-00163.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Pantanal (CPAP) |
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