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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
Data corrente: |
19/09/2019 |
Data da última atualização: |
06/12/2019 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
FERREIRA, C. F.; GUTIERREZ, D. L.; KREUZE, J. F.; ISKRA-CARUANA, M. L.; CHABANNES, M.; BARBOSA, A. C. O.; SANTOS, T. A.; SILVA, A. G. S.; SANTOS, R. M. F.; AMORIM, E. P.; OLIVEIRA, S. A. S. de; JESUS, O. N. de. |
Afiliação: |
CLAUDIA FORTES FERREIRA, CNPMF; D. L. GUTIERREZ, INIA; J. F. KREUZE, CIP; M. L. ISKRA-CARUANA, CIRAD; M. CHABANNES, CIRAD; A. C. O. BARBOSA, UFRB; T. A. SANTOS, UFRB; A. G. S. SILVA, UFRB; R.M.F. SANTOS, UEFS; EDSON PERITO AMORIM, CNPMF; SAULO ALVES SANTOS DE OLIVEIRA, CNPMF; ONILDO NUNES DE JESUS, CNPMF. |
Título: |
Rapid plant DNA and RNA extraction protocol using a bench drill Brief Note. |
Ano de publicação: |
2019 |
Fonte/Imprenta: |
Genetics and Molecular Research, v. 18, n.3, 2019. |
Idioma: |
Inglês |
Notas: |
gmr18394 |
Conteúdo: |
Plant DNA and RNA extraction methods are well established, with a wide range of protocols, depending on the purposes of each laboratory/research. Nowadays, quick, inexpensive and easy plant DNA and RNA extraction methods are highly sought after. We developed an optimized protocol for plant DNA and RNA extraction that uses an inexpensive bench drill and plastic bags and does not require liquid nitrogen. DNA from leaves and RNA from leaves and roots of banana, pineapple, citrus, papaya, passion fruit and cassava, were extracted using a basic cetyltrimethylammonium bromide method. Both nucleic acids were quantified and evaluated for quality based on agarose gel electrophoresis. The DNA and RNA extractions were successful for all species, and RNA quality in pellets was maintained after storage at room temperature for three weeks. This protocol can reduce costs considerably in laboratories with ongoing routine activities of DNA and RNA extraction for genetic diversity and gene expression analyses, where other conventional methods have not been successful due to explant, condition of samples and quantity and quality of nucleic acids. This is especially relevant for many laboratories in developing countries where the cost and availability of liquid nitrogen may be a constraint. |
Thesagro: |
Melhoramento Vegetal. |
Thesaurus Nal: |
Breeding and Genetic Improvement. |
Categoria do assunto: |
-- |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/202165/1/-rapid-plant-dna-and-rna-extraction-protocol-using-bench-drill.pdf
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Marc: |
LEADER 02135naa a2200289 a 4500 001 2112332 005 2019-12-06 008 2019 bl uuuu u00u1 u #d 100 1 $aFERREIRA, C. F. 245 $aRapid plant DNA and RNA extraction protocol using a bench drill Brief Note.$h[electronic resource] 260 $c2019 500 $agmr18394 520 $aPlant DNA and RNA extraction methods are well established, with a wide range of protocols, depending on the purposes of each laboratory/research. Nowadays, quick, inexpensive and easy plant DNA and RNA extraction methods are highly sought after. We developed an optimized protocol for plant DNA and RNA extraction that uses an inexpensive bench drill and plastic bags and does not require liquid nitrogen. DNA from leaves and RNA from leaves and roots of banana, pineapple, citrus, papaya, passion fruit and cassava, were extracted using a basic cetyltrimethylammonium bromide method. Both nucleic acids were quantified and evaluated for quality based on agarose gel electrophoresis. The DNA and RNA extractions were successful for all species, and RNA quality in pellets was maintained after storage at room temperature for three weeks. This protocol can reduce costs considerably in laboratories with ongoing routine activities of DNA and RNA extraction for genetic diversity and gene expression analyses, where other conventional methods have not been successful due to explant, condition of samples and quantity and quality of nucleic acids. This is especially relevant for many laboratories in developing countries where the cost and availability of liquid nitrogen may be a constraint. 650 $aBreeding and Genetic Improvement 650 $aMelhoramento Vegetal 700 1 $aGUTIERREZ, D. L. 700 1 $aKREUZE, J. F. 700 1 $aISKRA-CARUANA, M. L. 700 1 $aCHABANNES, M. 700 1 $aBARBOSA, A. C. O. 700 1 $aSANTOS, T. A. 700 1 $aSILVA, A. G. S. 700 1 $aSANTOS, R. M. F. 700 1 $aAMORIM, E. P. 700 1 $aOLIVEIRA, S. A. S. de 700 1 $aJESUS, O. N. de 773 $tGenetics and Molecular Research$gv. 18, n.3, 2019.
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Registro original: |
Embrapa Mandioca e Fruticultura (CNPMF) |
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Registros recuperados : 15 | |
2. | | BARBOSA, A. C. O.; SANTOS, D. B.; OLIVEIRA, P. H. G. A.; CORDEIRO, Z. J. M.; FERREIRA, C. F. Diversidade genética de porta-enxertos cítricos baseada em marcadores moleculares ISSR. CONGRESSO BRASILEIRO DE FRUTICULTURA, 25., 2017; REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE INTERAMERICANA DE HORTICULTURA TROPICAL, 62., 2017. Resumos... Porto Seguro, BA: SIHT, 2017.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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4. | | SANTOS, T. A.; BARBOSA, A. C. O.; GABRIELY, A.; KRUEZE, J.; CARUANA, M. L. I.; FERREIRA, C. F. Validação de protocolo de extração de DNA sem uso de nitrogênio líquido. In : JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA MANDIOCA E FRUTICULTURA, 12., 2018. Ciência profissional : resumos. Cruz das Almas, BA: Embrapa Mandioca e Fruticultura, 2019. 1p.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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5. | | BARBOSA, A. C. O.; SANTOS, T. A.; SILVA, A. G. S.; GUTIERREZ, D.; CHABANNES, M.; FERREIRA, C. F. Protocolo de extração de RNA sem uso de nitrogênio líquido e avaliação da "Vida de Prateleira" de Pellets. In : JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA MANDIOCA E FRUTICULTURA, 12., 2018. Ciência profissional : resumos. Cruz das Almas, BA: Embrapa Mandioca e Fruticultura, 2019. 1 p.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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6. | | NASCIMENTO, D. S.; OLIVEIRA, L. B. de; BARBOSA, A. C. O.; DIAMANTINO, M. S. A. S.; FERREIRA, C. F.; OLIVEIRA, S. A. S. de. Avaliação de marcadores RAPD para estudo de diversidade de bactérias associadas ao sintoma de requeima da mandioca. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA MANDIOCA E FRUTICULTURA, 17., 2017 Ciência e Empreendedorismo : resumos. Cruz das Almas, BA: Embrapa Mandioca e Fruticultura, 2017. 137p. 1p. BiotecnologiaTipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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7. | | QUEIROZ, I. dos S.; SANTOS, A. S.; NEVES, D. M.; BARBOSA, A. C. O.; GESTEIRA, A. da S.; FERREIRA, C. F. Avaliação de parâmetros fisiológicos da seca no comportamento de porta-enxerto de citros como suporte à proteômica. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA MANDIOCA E FRUTICULTURA, 17., 2017 Ciência e Empreendedorismo : resumos. Cruz das Almas, BA: Embrapa Mandioca e Fruticultura, 2017. 137p. 1p. Desenvolvimento de VariedadesTipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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8. | | SANTOS, L. F. dos; OLIVEIRA, E. J. de; CARMO, C. D. do; PEREIRA, J. dos S.; RAMOS, A. P. de S.; BARBOSA, A. C. O. Geração de mutantes de mandioca com uso de agentes químicos. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA MANDIOCA E FRUTICULTURA, 17., 2017 Ciência e Empreendedorismo : resumos. Cruz das Almas, BA: Embrapa Mandioca e Fruticultura, 2017. 137p. 1p. Recursos GenéticosTipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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9. | | BARBOSA, A. C. O.; OLIVEIRA, P. H. G. A. de; CARMO, C. D. do; QUEIROZ, I. dos S.; OLIVEIRA, E. J. de; FERREIRA, C. F. Seleção assistida por marcadores moleculares para obtenção de indivíduos endogâmicos em populações segregantes de mandioca. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA MANDIOCA E FRUTICULTURA, 17., 2017 Ciência e Empreendedorismo : resumos. Cruz das Almas, BA: Embrapa Mandioca e Fruticultura, 2017. 137p. 1p. BiotecnologiaTipo: Resumo em Anais de Congresso |
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10. | | QUEIROZ, I. dos S.; DIAS, N. dos S.; MIRANDA, C. M.; BARBOSA, A. C. O.; SANTOS, W. N.; PESTANA, K. N.; SILVA, P. H.; VELAME, L K. V. C.; HADDAD, F.; AMORIM, E. P.; FERREIRA, C. F. Bulks de DNA para identificação de marcadores SCAR relacionados à resistência a Fusarium oxysporum cubense. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA MANDIOCA E FRUTICULTURA, 8., 2014, Cruz das Almas, Ba. Pesquisa: despertando mentes para a inovação e transformando o futuro :[anais]. Cruz das Almas, Ba, Embrapa Mandioca e Fruticultura, 2014.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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11. | | BARBOSA, A. C. O.; SANTOS, R. M. F.; QUEIROZ, I. dos S.; DIAS, N. dos S.; MIRANDA, C. M.; PESTANA, K. N.; SILVA, P. H. da; SOARES FILHO, W. dos S.; GESTEIRA, A. da S.; FERREIRA, C. F. Caracterização molecular de híbridos do banco ativo de germoplasma de citros da Embrapa. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA MANDIOCA E FRUTICULTURA, 8., 2014, Cruz das Almas, Ba. Pesquisa: despertando mentes para a inovação e transformando o futuro :[anais]. Cruz das Almas, Ba, Embrapa Mandioca e Fruticultura, 2014.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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12. | | BARBOSA, A. C. O.; OLIVEIRA, P. H. G. A. de; CARMO, C. D. do; ALVES, L. B.; SANTOS, D. B. dos; QUEIROZ, I. dos S.; OLIVEIRA, E. J. de; FERREIRA, C. F. Seleção assistida em progênie S1 para obtenção de linhagens por marcadores microssatélites. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA MANDIOCA E FRUTICULTURA, 10., 2016: Cruz das Almas, BA. Traduzindo ciência para o mundo : resumos. Brasília, DF : Embrapa, 2016.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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13. | | DIAS, N. dos S.; MIRANDA, C. M.; QUEIROZ, I. dos S.; BARBOSA, A. C. O.; PESTANA, K. N.; SILVA, P. H.; SANTOS, R. M. F.; OLIVEIRA, E. J. de; SANTOS, V. da S.; FERREIRA, C. F. Utilização de PCR multiplex a partir de marcadores VNTR em mandioca. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA MANDIOCA E FRUTICULTURA, 8., 2014, Cruz das Almas, Ba. Pesquisa: despertando mentes para a inovação e transformando o futuro :[anais]. Cruz das Almas, Ba, Embrapa Mandioca e Fruticultura, 2014.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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14. | | MIRANDA, C. M.; QUEIROZ, I. dos S.; DIAS, N. dos S.; BARBOSA, A. C. O.; SANTOS, W. N. dos; PESTANA, K. N.; SILVA, P. H. da; VELAME, K. V. C.; SANTOS, R. M. F.; OLIVEIRA, E. J. de; SANTOS, V. da S.; FERREIRA, C. F. Identificação de progênies S1 de mandioca com maior nível de endogamia com base em marcadores microssatélites. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA MANDIOCA E FRUTICULTURA, 8., 2014, Cruz das Almas, Ba. Pesquisa: despertando mentes para a inovação e transformando o futuro :[anais]. Cruz das Almas, Ba, Embrapa Mandioca e Fruticultura, 2014.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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15. | | FERREIRA, C. F.; GUTIERREZ, D. L.; KREUZE, J. F.; ISKRA-CARUANA, M. L.; CHABANNES, M.; BARBOSA, A. C. O.; SANTOS, T. A.; SILVA, A. G. S.; SANTOS, R. M. F.; AMORIM, E. P.; OLIVEIRA, S. A. S. de; JESUS, O. N. de. Rapid plant DNA and RNA extraction protocol using a bench drill Brief Note. Genetics and Molecular Research, v. 18, n.3, 2019. gmr18394Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
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