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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Cerrados. |
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Data corrente: |
12/12/2018 |
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Data da última atualização: |
12/12/2018 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
STAFUZZA, N. B.; SILVA, R. M. de O.; PERIPOLLI, E.; BEZERRA, L. A. F.; LOBO, R. B.; MAGNABOSCO, C. de U.; DI CROCE, F.; OSTERSTOCK, J.; MUNARI, D. P.; LOURENCO, D. A. L.; BALDI, F. |
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Afiliação: |
Nedenia Bonvino Stafuzza, UNESP; Rafael Medeiros de Oliveira Silva, University of Georgia; ELISA PERIPOLLI, UNESP; Luiz Antônio Framartino Bezerra, USP; Raysildo Barbosa Lôbo, Associaçao Nacional dos Criadores e Pesquisadores; CLAUDIO DE ULHOA MAGNABOSCO, CPAC; Fernando Di Croce, Zoetis; Jason Osterstock, Zoetis; Danísio Prado Munari, UNESP; Daniela A. Lino Lourenco, University of Georgia; Fernando Baldi, UNESP. |
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Título: |
Genome-wide association study provides insights into genes related with horn development in Nelore beef cattle. |
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Ano de publicação: |
2018 |
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Fonte/Imprenta: |
PLoS ONE, v. 13, n. 8, e0202978, August 30, 2018. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1371/journal.pone.0202978 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Abstract The causal mutation for polledness in Nelore (Bos taurus indicus) breed seems to have appeared first in Brazil in 1957. The expression of the polled trait is known to be ruled by a few groups of alleles in taurine breeds; however, the genetic basis of this trait in indicine cattle is still unclear. The aim of this study was to identify genomic regions associated with the hornless trait in a commercial Nelore population. A total of 107,294 animals had phenotypes recorded and 2,238 were genotyped/imputed for 777k SNP. The weighted single-step approach for genome-wide association study (WssGWAS) was used to estimate the SNP effects and variances accounted for by 1 Mb sliding SNP windows. A centromeric region of chromosome 1 with 3.11 Mb size (BTA1: 878,631?3,987,104 bp) was found to be associated with hornless in the studied population. A total of 28 protein-coding genes are mapped in this region, including the taurine Polled locus and the IFNAR1, IFNAR2, IFNGR2, KRTAP11-1, MIS18A, OLIG1, OLIG2, and SOD1 genes, which expression can be related to the horn formation as described in literature. The functional enrichment analysis by DAVID tool revealed cytokine-cytokine receptor interaction, JAK-STAT signaling, natural killer cell mediated cytotoxicity, and osteoclast differentiation pathways as significant (P < 0.05). In addition, a runs of homozygosity (ROH) analysis identified a ROH island in polled animals with 2.47 Mb inside the region identified by WssGWAS. Polledness in Nelore cattle is associated with one region in the genome with 3.1 Mb size in chromosome 1. Several genes are harbored in this region, and they may act together in the determination of the polled/horned phenotype. Fine mapping the locus responsible for polled trait in Nelore breed and the identification of the molecular mechanisms regulating the horn growth deserve further investigation. MenosAbstract The causal mutation for polledness in Nelore (Bos taurus indicus) breed seems to have appeared first in Brazil in 1957. The expression of the polled trait is known to be ruled by a few groups of alleles in taurine breeds; however, the genetic basis of this trait in indicine cattle is still unclear. The aim of this study was to identify genomic regions associated with the hornless trait in a commercial Nelore population. A total of 107,294 animals had phenotypes recorded and 2,238 were genotyped/imputed for 777k SNP. The weighted single-step approach for genome-wide association study (WssGWAS) was used to estimate the SNP effects and variances accounted for by 1 Mb sliding SNP windows. A centromeric region of chromosome 1 with 3.11 Mb size (BTA1: 878,631?3,987,104 bp) was found to be associated with hornless in the studied population. A total of 28 protein-coding genes are mapped in this region, including the taurine Polled locus and the IFNAR1, IFNAR2, IFNGR2, KRTAP11-1, MIS18A, OLIG1, OLIG2, and SOD1 genes, which expression can be related to the horn formation as described in literature. The functional enrichment analysis by DAVID tool revealed cytokine-cytokine receptor interaction, JAK-STAT signaling, natural killer cell mediated cytotoxicity, and osteoclast differentiation pathways as significant (P < 0.05). In addition, a runs of homozygosity (ROH) analysis identified a ROH island in polled animals with 2.47 Mb inside the region identified by WssGWAS. Pollednes... Mostrar Tudo |
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Thesagro: |
Bos Indicus; Gado Nelore; Mutação. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/188280/1/Genome-wide-association-study-provides-apagar.pdf
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Marc: |
LEADER 02768naa a2200289 a 4500
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Registro original: |
Embrapa Cerrados (CPAC) |
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| Registros recuperados : 51 | |
| 21. |  | SOARES, B. B.; BRUNES, L. C.; BALDI, F.; LOPES, F. B.; LOBO, R. B.; PEREIRA, L. S.; CARVALHO, R. A. de; MAGNABOSCO, C. U. Análise genética de características de carcaça e habilidade materna em bovinos Nelore. In: SEMINÁRIO JOVENS TALENTOS, 14., 2020, Santo Antônio de Goiás. Resumos... Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2021. p. 55.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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| 22. | | SOARES, B. B.; BRUNES, L. C.; BALDI, F.; LOPES, F. B.; LOBO, R. B.; PEREIRA, L. S.; CARVALHO, R. A. de; MAGNABOSCO, C. U. Análise genética de características de carcaça e habilidade materna em bovinos Nelore. In: SEMINÁRIO JOVENS TALENTOS, 14., 2020, Santo Antônio de Goiás. Resumos... Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2021. p. 55.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 23. | | BALDI, F.; FIGUEIREDO, L. G.; OLIVEIRA, H. N. de; MAGNABOSCO, C. de U.; BEZERRA, L. A. F.; FARIA, C. U.; LOBO, R. B. Bioeconomic selection index (EMGTe) for Nellore Brazil breeding program. In: International Conference on Quantitative Genetics, 5., 2016, Madison. Proceedings... Madison , 2016. (ICQG5)| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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| 24. | | VENTURINI, G. C.; CRUZ, V. A. R. da; ROSA, J. O.; BALDI, F.; EL FARO, L.; LEDUR, M. C.; PEIXOTO, J. de O.; MUNARI, D. P. Genetic and phenotypic parameters of carcass and organ traits of broiler chickens. Genetics and Molecular Research, Ribeirão Preto, v. 13, n. 4, p. 10294-10300.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 25. | | PERIPOLLI, E.; TONUSSI, R. L; VERNEQUE, R. Da S.; PANETTO, J. C. do C.; MACHADO, M. A.; SILVA, M. V. G. B.; BALDI, F. Exploring runs of homozygosity patterns in Gyr cattle. In: INTERNATIONAL MEETING OF ADVANCES IN ANIMAL SCIENCE, 1, 2016, Jaboticabal. Anais ... Jaboticabal: [s.n.], 2016.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 26. | | CANESIN, R. C.; BERCHIELLI, T. T.; MESSANA, J. D.; BALDI, F.; PIRES, A. V.; FRIGHETTO, R. T. S.; FIORENTINI, G.; REIS, R. A. Effects of supplementation frequency on the ruminal fermentation and enteric methane production of beef cattle grazing in tropical pastures. Revista Brasileira de Zootecnia, Brasília, DF, v. 43, n. 11 , p. 590-600, 2014.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
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| 27. | | CAMARGO, G. M. F. de; CARDOSO, D. F.; FONSECA, P. D. da S.; BALDI, F.; REGITANO, L. C. de A.; TONHATI, H. Polimorfismos no éxon 3 do gene JY-1 e suas associações com probabilidade de prenhez precoce e características de crescimento em novilhas da raça Nelore. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 9., 2012, João Pessoa. Anais... João Pessoa: SBMA, 2012.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 28. | | CAMARGO, G. M. F. de; COSTA, R. B.; ALBUQUERQUE, L. G. de; REGITANO, L. C. de A.; BALDI, F.; TONHATI, H. Polimorfismos no gene JY-1 e suas associações com ocorrência de prenhez precoce e idade ao primeiro parto em fêmeas bovinas. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 10., 2013, Uberaba. Anais... Belo Horizonte: SBMA, 2013. 3 p.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 29. | | SOARES, B. B.; BRUNES, L. C.; BALDI, F.; NARCISO, M. G.; CARMO, A. S. do; PEREIRA, L. S.; CARVALHO, R. A. de; MAGNABOSCO, C. U. Parâmetros genéticos de características morfológicas e de carcaça em bovinos Nelore. In: SEMINÁRIO JOVENS TALENTOS, 15., 2021, Santo Antônio de Goiás. Resumos... Brasília, DF: Embrapa; Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2021. p. 57. Evento online.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 30. | | BRUNES, L. C.; BALDI, F.; LOPES, F. B.; LOBO, R. B.; ESPIGOLAN, R.; COSTA, M. F. O. e; STAFUZZA, N. B.; MAGNABOSCO, C. de U. Weighted single-step genome-wide association study and pathway analyses for feed efficiency traits in Nellore cattle. Journal of Animal Breeding and Genetics, v. 138, n. 1, p. 23-44, Jan. 2021.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão; Embrapa Cerrados. |
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| 31. | | PERIPOLLI, E.; OLIVIERI. B. F.; FEITOSA, F. L. B.; LEMOS, M. V. A. de; TONUSSI, R. L.; MUNARI, D. P.; PANETTO, J. C. do C.; MACHADO, M. A.; VENTURA, R. V.; BALDI, F.; SILVA, M. V. G. B. Avaliação dos coeficientes de endogamia em bovinos da raça Gir (Bos primigenius indicus). In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 12., 2017, Ribeirão Preto. Anais... Ribeirão Preto: SBMA, 2017. 3 p.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 32. | | PERIPOLLI, E.; STAFUZZA, N. B.; MUNARI, D. P.; LIMA, A. L. F.; IRGANG, R.; MACHADO, M. A.; PANETTO, J. C. do C.; VENTURA, R. V.; BALDI, F.; SILVA, M. V. G. B. Assessment of runs of homozygosity islands and estimates of genomic inbreeding in Gyr (Bos indicus) dairy cattle. BMC Genomics, v. 19, n. 34, 2018. 13 p.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte; Embrapa Gado de Leite. |
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| 38. | | BRUNES, L. C.; MAGNABOSCO, C. de U.; BALDI, F. S.; COSTA, M. F. O. e; QUEIROZ, L. C. R. de; LOBO, R. B.; CROZARA, A. S.; LOPES, F. B. Genetic association between growth and maternal ability traits in Nelore cattle. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 55.; CONGRESSO BRASILEIRO DE ZOOTECNIA, 28., 2018, Goiânia. Construindo saberes, formando pessoas e transformando a produção animal: anais eletrônicos. Goiânia: Sociedade Brasileira de Zootecnia, 2018.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 39. | | BRUNES, L. C.; MAGNABOSCO, C. de U.; BALDI, F. S.; COSTA, M. F. O. e; QUEIROZ, L. C. R. de; LOBO, R. B.; CROZARA, A. S.; LOPES, F. B. Genetic association between growth and maternal ability traits in Nelore cattle. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 55.; CONGRESSO BRASILEIRO DE ZOOTECNIA, 28., 2018, Goiânia. Construindo saberes, formando pessoas e transformando a produção animal: anais eletrônicos. Goiânia: Sociedade Brasileira de Zootecnia, 2018.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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| 40. | | BUZANSKAS, M. E.; GROSSI, D. A.; BALDI, F.; BARROZO, D. D.; SILVA, L. O. C. da; TORRES JUNIOR, R. A. de A.; MUNARI, D. P.; ALENCAR, M. M. de. Genetic associations between stayability and reproductive and growth traits in Canchim beef cattle. Livestock Science, v. 132, n. 1-3, p. 107-112, 2010| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
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