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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Unidades Centrais. |
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Data corrente: |
13/07/2022 |
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Data da última atualização: |
29/01/2024 |
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Autoria: |
SÁ, L. G. de; AZEVEDO, A. M.; ALBUQUERQUE, C. J. B.; VALADARES, N. R.; BRITO, O. G.; FERNANDES, A. C. G.; ASPIAZÚ, I. |
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Afiliação: |
LUDIMILA GEICIANE DE SÁ, UNIVERSIDADE FEDERAL DE MINAS GERAIS; ALCINEI MISTICO AZEVEDO, UNIVERSIDADE FEDERAL DE MINAS GERAIS; CARLOS JULIANO BRANT ALBUQUERQUE, UNIVERSIDADE FEDERAL DE MINAS GERAIS; NERMY RIBEIRO VALADARES, UNIVERSIDADE FEDERAL DE MINAS GERAIS; ORLANDO GONÇALVES BRITO, UNIVERSIDADE FEDERAL DE LAVRAS; ANA CLARA GONÇALVES FERNANDES, UNIVERSIDADE FEDERAL DE MINAS GERAIS; IGNACIO ASPIAZÚ, UNIVERSIDADE ESTADUAL DE MONTES CLAROS. |
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Título: |
Kohonen's self-organizing maps for the study of genetic dissimilarity among soybean cultivars and genotypes. |
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Ano de publicação: |
2022 |
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Fonte/Imprenta: |
Pesquisa Agropecuária Brasileira, v. 57, e02722, 2022. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1590/S1678-3921.pab2022.v57.02722 |
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Idioma: |
Inglês |
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Notas: |
Título em português: Mapas auto-organizáveis de Kohonen no estudo da dissimilaridade genética entre cultivares e genótipos de soja. |
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Conteúdo: |
ABSTRACT - The objective of this work was to evaluate the genetic dissimilarity between soybean cultivars and genotypes for the selection of parents, as well as to propose a new method for using Kohonen?s self-organizing maps (SOMs) and to test its efficiency through Anderson?s discriminant analysis. The morphoagronomic descriptors of soybean cultivars and genotypes were evaluated. For data analysis, SOM-type artificial neural networks were used. The proposed method allowed the determination of the best network architecture in a nonsubjective way. Furthermore, at the beginning of training, it was possible to mitigate the randomness effect of the synaptic weights on the formed clusters. Six dissimilar clusters were formed; therefore, there is genetic dissimilarity between soybean cultivars and genotypes. Cultivars C25, C8, and C13 can be combined with C36, C31, C32, and C33 because they show good yield-related attributes and high dissimilarity. The proposed methodology is advantageous in comparison with the use of traditional SOMs, besides being efficient due to clustering consistency according to Anderson?s discriminant analysis. RESUMO - O objetivo deste trabalho foi avaliar a dissimilaridade genética entre cultivares e genótipos de soja para a seleção de genitores, bem como propor um novo método para a utilização de mapas auto-organizáveis de Kohonen (SOMs) e testar sua eficiência por meio da análise discriminante de Anderson. Foram avaliados os descritores morfoagronômicos de cultivares e genótipos de soja. Para análise dos dados, utilizaram-se redes neurais artificiais do tipo SOM. O método proposto permitiu a determinação da melhor arquitetura de rede de forma não subjetiva. Além disso, no início do treinamento, foi possível mitigar o efeito da aleatoriedade dos pesos sinápticos sobre os grupos formados. Foram formados seis grupos dissimilares; portanto, há dissimilaridade genética entre cultivares e genótipos de soja. As cultivares C25, C8 e C13 podem ser combinadas com as C36, C31, C32 e C33, por apresentarem bons atributos de produtividade e alta dissimilaridade. A metodologia proposta é vantajosa em comparação ao uso de SOMs tradicionais e se mostrou eficiente devido à consistência dos agrupamentos de acordo com a análise discriminante de Anderson. MenosABSTRACT - The objective of this work was to evaluate the genetic dissimilarity between soybean cultivars and genotypes for the selection of parents, as well as to propose a new method for using Kohonen?s self-organizing maps (SOMs) and to test its efficiency through Anderson?s discriminant analysis. The morphoagronomic descriptors of soybean cultivars and genotypes were evaluated. For data analysis, SOM-type artificial neural networks were used. The proposed method allowed the determination of the best network architecture in a nonsubjective way. Furthermore, at the beginning of training, it was possible to mitigate the randomness effect of the synaptic weights on the formed clusters. Six dissimilar clusters were formed; therefore, there is genetic dissimilarity between soybean cultivars and genotypes. Cultivars C25, C8, and C13 can be combined with C36, C31, C32, and C33 because they show good yield-related attributes and high dissimilarity. The proposed methodology is advantageous in comparison with the use of traditional SOMs, besides being efficient due to clustering consistency according to Anderson?s discriminant analysis. RESUMO - O objetivo deste trabalho foi avaliar a dissimilaridade genética entre cultivares e genótipos de soja para a seleção de genitores, bem como propor um novo método para a utilização de mapas auto-organizáveis de Kohonen (SOMs) e testar sua eficiência por meio da análise discriminante de Anderson. Foram avaliados os descritores morfoagronômico... Mostrar Tudo |
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Thesagro: |
Genótipo; Glycine Max; Melhoramento Genético Vegetal; Seleção Genética; Soja; Variedade. |
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Thesaurus Nal: |
Cultivars; Genotype; Multivariate analysis; Plant breeding; Soybeans. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1144702/1/Kohonens-self-organizing-maps-2022.pdf
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Marc: |
LEADER 03489naa a2200349 a 4500
001 2144702
005 2024-01-29
008 2022 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $ahttps://doi.org/10.1590/S1678-3921.pab2022.v57.02722$2DOI
100 1 $aSÁ, L. G. de
245 $aKohonen's self-organizing maps for the study of genetic dissimilarity among soybean cultivars and genotypes.$h[electronic resource]
260 $c2022
500 $aTítulo em português: Mapas auto-organizáveis de Kohonen no estudo da dissimilaridade genética entre cultivares e genótipos de soja.
520 $aABSTRACT - The objective of this work was to evaluate the genetic dissimilarity between soybean cultivars and genotypes for the selection of parents, as well as to propose a new method for using Kohonen?s self-organizing maps (SOMs) and to test its efficiency through Anderson?s discriminant analysis. The morphoagronomic descriptors of soybean cultivars and genotypes were evaluated. For data analysis, SOM-type artificial neural networks were used. The proposed method allowed the determination of the best network architecture in a nonsubjective way. Furthermore, at the beginning of training, it was possible to mitigate the randomness effect of the synaptic weights on the formed clusters. Six dissimilar clusters were formed; therefore, there is genetic dissimilarity between soybean cultivars and genotypes. Cultivars C25, C8, and C13 can be combined with C36, C31, C32, and C33 because they show good yield-related attributes and high dissimilarity. The proposed methodology is advantageous in comparison with the use of traditional SOMs, besides being efficient due to clustering consistency according to Anderson?s discriminant analysis. RESUMO - O objetivo deste trabalho foi avaliar a dissimilaridade genética entre cultivares e genótipos de soja para a seleção de genitores, bem como propor um novo método para a utilização de mapas auto-organizáveis de Kohonen (SOMs) e testar sua eficiência por meio da análise discriminante de Anderson. Foram avaliados os descritores morfoagronômicos de cultivares e genótipos de soja. Para análise dos dados, utilizaram-se redes neurais artificiais do tipo SOM. O método proposto permitiu a determinação da melhor arquitetura de rede de forma não subjetiva. Além disso, no início do treinamento, foi possível mitigar o efeito da aleatoriedade dos pesos sinápticos sobre os grupos formados. Foram formados seis grupos dissimilares; portanto, há dissimilaridade genética entre cultivares e genótipos de soja. As cultivares C25, C8 e C13 podem ser combinadas com as C36, C31, C32 e C33, por apresentarem bons atributos de produtividade e alta dissimilaridade. A metodologia proposta é vantajosa em comparação ao uso de SOMs tradicionais e se mostrou eficiente devido à consistência dos agrupamentos de acordo com a análise discriminante de Anderson.
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Embrapa Unidades Centrais (AI-SEDE) |
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| 21. |  | SILVA, N. P. da; SILVA, F. G. da; ASPIAZÚ, I.; CARVALHO, A. J. de; MAGALHAES, P. C.; PORTUGAL, A. F. Rendimento de híbridos de milho cultivados com e sem restrição hídrica. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 32., 2018, Lavras. Soluções integradas para os sistemas de produção de milho e sorgo no Brasil: resumos. Sete Lagoas: Associação Brasileira de Milho e Sorgo, 2018. p. 221.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 22. | | OLIVEIRA, S. M. de; BARBOSA, V. M.; CAMPOS, M. de; SOUZA, T. P. O. de; ASPIAZÚ, I.; CARVALHO, A. de. Produtividade de grãos de linhagens-elite de feijão branco no norte de Minas Gerais:ciclo de avaliação 2018-2019. In: CONGRESSO NACIONAL DE PESQUISA DE FEIJÃO, 13., 2021, Goiânia. Conectividade tecnológica, intensificação sustentável: resumos. Brasília, DF: Embrapa; Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2021. p. 91. Evento online.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 24. | | SOUZA, B. P.; ALMEIDA, M. O.; JUNKER, L. C.; FERREIRA, E. A.; CONCENCO, G.; FRANÇA, A. C.; DELGADO, M. N.; GALON, L.; ASPIAZÚ, I.; SILVA, A. F. da. Anatomia da raiz de biotipos de capim-arroz resistente ao Quinclorac. In: CONGRESSO BRASILEIRO DA CIÊNCIA DAS PLANTAS DANINHAS, 28., 2012, Campo Grande. A ciência das plantas daninhas na era da biotecnologia: anais. Campo Grande: SBCPD, 2012. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agropecuária Oeste. |
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| 25. | | REZENDES, I.; BASEGGIO, E. R.; GALON, L.; BRANDLER, D.; FORTE, C. T.; ASPIAZÚ, I.; FRANCESCHETTI, M. B.; SILVA, A. F. da. Allelopathy of weeds on the growth of vegetables. Communications in Plant Sciences, v. 10, p. 1-10, 2020.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 3 |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 26. | | GALON. L.; FERREIRA, E. A.; CONCENCO, G.; SILVA, A. A.; SILVA, D. V.; SILVA, A. F. da; ASPIAZU, I.; VARGAS, L. Características fisiológicas de biótipos de Conyza bonariensis Resistentes ao glyphosate cultivados sob competição. Planta Daninha, Viçosa, MG, v. 31, n. 4, p. 859-866, out./dez, 2013.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agropecuária Oeste; Embrapa Milho e Sorgo; Embrapa Trigo. |
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| 27. | | FERREIRA, E. A.; CONCENÇO, G.; GALON, L.; DELGADO, M. N.; ASPIAZÚ, I.; SILVA, A. F. da; FERREIRA, F. A.; MEIRA, R. M. S. A. Características micromorfológicas de biótipos de capim-arroz resistente e suscetível ao quinclorac. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, v. 47, n. 8, p. 1048-1056, ago. 2012.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agropecuária Oeste; Embrapa Milho e Sorgo; Embrapa Unidades Centrais. |
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| 28. | | GALON, L.; SANTIN, C. O.; RADÜNZ, A. L.; ANDRES, A.; CONCENÇO, G.; SILVA, A. F. da; NONEMACHER, F.; PERIN, G. F.; ASPIAZÚ, I. Competitive ability of sweet sorghum (Sorghum bicolor (L.) Moench) cultivars against hairy beggarticks (Bidens pilosa L.). Revista de Ciencias Agrícolas, v. 39, n. 1, p. 70-84, Jan./June 2022. Título em espanhol: Capacidad competitiva de cultivares de sorgo dulce (Sorghum bicolor (L.) Moench) contra papunga (Bidens pilosa L.).| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 4 |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado; Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 29. | | SHUCH, L. O. B.; ANDRES, A.; FREITAS, G. D.; CONCENÇO, G.; FERREIRA, E. A.; ASPIAZU, I.; SILVA, A. F.; GALON, L. Crescimento de raízes de biótipos de capim-arroz resistente e suscetível ao quinclorac em competição. Revista Plantas Daninnhas, Campinas, v. 26, n. 4, 2008. p. 893-900| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Nacional - A |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 30. | | GUIMARÃES, A. A.; SANT'ANNA, S. J.; FERREIRA, E. A.; VARGAS, L.; SILVA, A. A. de; VIANA, R. G.; CONCENÇO, G.; ASPIAZU, I.; GALON, L. Composição química da cera epicuticular de biótipos de azevém. In: CONGRESSO BRASILEIRO DA CIÊNCIA DAS PLANTAS DANINHAS, 26.; CONGRESO DE LA ASOCIACION LATINOAMERICANA DE MALEZAS, 18., 2008, Ouro Preto. A ciência das plantas daninhas na sustentabilidade dos sistemas agrícolas: palestras apresentadas. Sete Lagoas: SBCPD: Embrapa Milho e Sorgo, 2008. 1 CD-ROM. 9 p.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Trigo. |
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| 31. | | FERREIRA, E. A.; CONCENÇO, G.; SILVA, A. A. da; OLIVEIRA, J. A. de; VARGAS, L.; SILVA, A. F. da; ASPIAZU, I.; GALON, L. Translocação de glyphosate em espécie de plantas daninhas tolerantes. In: CONGRESSO BRASILEIRO DA CIÊNCIA DAS PLANTAS DANINHAS, 26.; CONGRESO DE LA ASOCIACION LATINOAMERICANA DE MALEZAS, 18., 2008, Ouro Preto. A ciência das plantas daninhas na sustentabilidade dos sistemas agrícolas: palestras apresentadas. Sete Lagoas: SBCPD: Embrapa Milho e Sorgo, 2008. 1 CD-ROM. 8 p.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 32. | | SÁ, L. G. de; AZEVEDO, A. M.; ALBUQUERQUE, C. J. B.; VALADARES, N. R.; BRITO, O. G.; FERNANDES, A. C. G.; ASPIAZÚ, I. Kohonen's self-organizing maps for the study of genetic dissimilarity among soybean cultivars and genotypes. Pesquisa Agropecuária Brasileira, v. 57, e02722, 2022. Título em português: Mapas auto-organizáveis de Kohonen no estudo da dissimilaridade genética entre cultivares e genótipos de soja.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 33. | | OLIVEIRA, R. M. de; ASPIAZU, I.; PORTUGAL, A. F.; SILVA, K. M. de J.; SILVA, A. F. da; CARVALHO, A. J. de. Interferência de plantas daninhas em sorgo sacarino em diferentes espaçamentos no semiárido mineiro. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 31., 2016, Bento Gonçalves. Milho e sorgo: inovações, mercados e segurança alimentar: anais. Sete Lagoas: Associação Brasileira de Milho e Sorgo, 2016.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 34. | | OLIVEIRA, R. M. de; ASPIAZÚ, I.; SILVA, K. M. de J.; PORTUGAL, A. F.; SILVA, A. F. da; CARVALHO, A. J. de. Interferência de plantas daninhas em sorgo sacarino em diferentes espaçamentos no semiárido mineiro. Revista Brasileira de Milho e Sorgo, Sete Lagoas, v. 15, n. 3, p. 481-489, 2016.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 35. | | SANTOS, M. V.; FERREIRA, E. A.; CRUZ, P. J. R. da; RIBEIRO, V. G. V.; ALENCAR, B. T. B.; CABRAL, C. M.; FRANCISCO, D. M. T.; ASPIAZÚ, I. Leaf anatomy of 'Marandu' grass cultivated in plant arrangements in agrosilvopastoral systems. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 53, n. 12, p. 1320-1328, Dez. 2018. Título em português: Anatomia foliar de capim-marandu cultivado em arranjos de plantio em sistemas agrossilvipastoris.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 36. | | GUERRA, J. V. S.; SOARES, T. A. de S.; OLIVEIRA, S. M. de; SOUZA, T. L. P. O. de; ASPIAZÚ, I.; CARVALHO, A. J. de. Produtividade de grãos de linhagens-elite de feijão roxo no Norte de Minas Gerais. Ciclo de avaliação 2018-2019. In: CONGRESSO NACIONAL DE PESQUISA DE FEIJÃO, 13., 2021, Goiânia. Conectividade tecnológica, intensificação sustentável: resumos. Brasília, DF: Embrapa; Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2021. p. 129. Evento online.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 37. | | CONCENCO, G.; ASPIAZU, I.; GALON, L.; FERREIRA, E. A.; FREITAS, M. A. M.; SCHWANKE, A. M. L.; FERREIRA, F. A.; SILVA, A. A. Photosynthetic characteristics of hybrid and conventional rice plants as a function of plant competition. Planta Daninha, Viçosa, MG, v. 29, n. 4, p. 803-809, Oct./Dec. 2011.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agropecuária Oeste. |
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| 38. | | LACERDA, M. L.; ASPIAZU, I.; CARVALHO, A. J. de; SILVA, A. F. da; FERREIRA, E. A.; SOUZA, A. A. de; CAMPOS, M. L. de; BRITO, C. F. B. Periods of weed interference in cowpea crop in the semi-arid of Minas Gerais, Brazil. Revista Brasileira de Ciências Agrárias, v. 15, n. 2, e6749, 2020.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 39. | | FERREIRA, E. A.; SILVA, A. A. da; VARGAS, L.; REIS, M. R. dos; CONCENÇO, G.; ASPIAZU, I.; GALON, L.; FRANÇA, A. C. Potencial competitivo de biótipos de azevém resistente e suscetível ao glyphosate. In: CONGRESSO BRASILEIRO DA CIÊNCIA DAS PLANTAS DANINHAS, 26.; CONGRESO DE LA ASOCIACION LATINOAMERICANA DE MALEZAS, 18., 2008, Ouro Preto. A ciência das plantas daninhas na sustentabilidade dos sistemas agrícolas: palestras apresentadas. Sete Lagoas: SBCPD: Embrapa Milho e Sorgo, 2008. 1 CD-ROM. 10 p.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 40. | | SILVA, A. F. da; GALON, L.; ASPIAZÚ, I.; FERREIRA, E. A.; CONCENCO, G.; RAMOS JUNIOR, E. U.; ROCHA, P. R. R. Weed management in the soybean crop. In: EL-SHEMY, H. A. (Ed.). Soybean: pest resistance. Rijeka: In Tech, 2013. cap. 4, p. 85-112.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
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