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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Unidades Centrais. |
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Data corrente: |
13/07/2022 |
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Data da última atualização: |
29/01/2024 |
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Autoria: |
SÁ, L. G. de; AZEVEDO, A. M.; ALBUQUERQUE, C. J. B.; VALADARES, N. R.; BRITO, O. G.; FERNANDES, A. C. G.; ASPIAZÚ, I. |
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Afiliação: |
LUDIMILA GEICIANE DE SÁ, UNIVERSIDADE FEDERAL DE MINAS GERAIS; ALCINEI MISTICO AZEVEDO, UNIVERSIDADE FEDERAL DE MINAS GERAIS; CARLOS JULIANO BRANT ALBUQUERQUE, UNIVERSIDADE FEDERAL DE MINAS GERAIS; NERMY RIBEIRO VALADARES, UNIVERSIDADE FEDERAL DE MINAS GERAIS; ORLANDO GONÇALVES BRITO, UNIVERSIDADE FEDERAL DE LAVRAS; ANA CLARA GONÇALVES FERNANDES, UNIVERSIDADE FEDERAL DE MINAS GERAIS; IGNACIO ASPIAZÚ, UNIVERSIDADE ESTADUAL DE MONTES CLAROS. |
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Título: |
Kohonen's self-organizing maps for the study of genetic dissimilarity among soybean cultivars and genotypes. |
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Ano de publicação: |
2022 |
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Fonte/Imprenta: |
Pesquisa Agropecuária Brasileira, v. 57, e02722, 2022. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1590/S1678-3921.pab2022.v57.02722 |
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Idioma: |
Inglês |
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Notas: |
Título em português: Mapas auto-organizáveis de Kohonen no estudo da dissimilaridade genética entre cultivares e genótipos de soja. |
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Conteúdo: |
ABSTRACT - The objective of this work was to evaluate the genetic dissimilarity between soybean cultivars and genotypes for the selection of parents, as well as to propose a new method for using Kohonen?s self-organizing maps (SOMs) and to test its efficiency through Anderson?s discriminant analysis. The morphoagronomic descriptors of soybean cultivars and genotypes were evaluated. For data analysis, SOM-type artificial neural networks were used. The proposed method allowed the determination of the best network architecture in a nonsubjective way. Furthermore, at the beginning of training, it was possible to mitigate the randomness effect of the synaptic weights on the formed clusters. Six dissimilar clusters were formed; therefore, there is genetic dissimilarity between soybean cultivars and genotypes. Cultivars C25, C8, and C13 can be combined with C36, C31, C32, and C33 because they show good yield-related attributes and high dissimilarity. The proposed methodology is advantageous in comparison with the use of traditional SOMs, besides being efficient due to clustering consistency according to Anderson?s discriminant analysis. RESUMO - O objetivo deste trabalho foi avaliar a dissimilaridade genética entre cultivares e genótipos de soja para a seleção de genitores, bem como propor um novo método para a utilização de mapas auto-organizáveis de Kohonen (SOMs) e testar sua eficiência por meio da análise discriminante de Anderson. Foram avaliados os descritores morfoagronômicos de cultivares e genótipos de soja. Para análise dos dados, utilizaram-se redes neurais artificiais do tipo SOM. O método proposto permitiu a determinação da melhor arquitetura de rede de forma não subjetiva. Além disso, no início do treinamento, foi possível mitigar o efeito da aleatoriedade dos pesos sinápticos sobre os grupos formados. Foram formados seis grupos dissimilares; portanto, há dissimilaridade genética entre cultivares e genótipos de soja. As cultivares C25, C8 e C13 podem ser combinadas com as C36, C31, C32 e C33, por apresentarem bons atributos de produtividade e alta dissimilaridade. A metodologia proposta é vantajosa em comparação ao uso de SOMs tradicionais e se mostrou eficiente devido à consistência dos agrupamentos de acordo com a análise discriminante de Anderson. MenosABSTRACT - The objective of this work was to evaluate the genetic dissimilarity between soybean cultivars and genotypes for the selection of parents, as well as to propose a new method for using Kohonen?s self-organizing maps (SOMs) and to test its efficiency through Anderson?s discriminant analysis. The morphoagronomic descriptors of soybean cultivars and genotypes were evaluated. For data analysis, SOM-type artificial neural networks were used. The proposed method allowed the determination of the best network architecture in a nonsubjective way. Furthermore, at the beginning of training, it was possible to mitigate the randomness effect of the synaptic weights on the formed clusters. Six dissimilar clusters were formed; therefore, there is genetic dissimilarity between soybean cultivars and genotypes. Cultivars C25, C8, and C13 can be combined with C36, C31, C32, and C33 because they show good yield-related attributes and high dissimilarity. The proposed methodology is advantageous in comparison with the use of traditional SOMs, besides being efficient due to clustering consistency according to Anderson?s discriminant analysis. RESUMO - O objetivo deste trabalho foi avaliar a dissimilaridade genética entre cultivares e genótipos de soja para a seleção de genitores, bem como propor um novo método para a utilização de mapas auto-organizáveis de Kohonen (SOMs) e testar sua eficiência por meio da análise discriminante de Anderson. Foram avaliados os descritores morfoagronômico... Mostrar Tudo |
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Thesagro: |
Genótipo; Glycine Max; Melhoramento Genético Vegetal; Seleção Genética; Soja; Variedade. |
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Thesaurus Nal: |
Cultivars; Genotype; Multivariate analysis; Plant breeding; Soybeans. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1144702/1/Kohonens-self-organizing-maps-2022.pdf
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Marc: |
LEADER 03489naa a2200349 a 4500
001 2144702
005 2024-01-29
008 2022 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $ahttps://doi.org/10.1590/S1678-3921.pab2022.v57.02722$2DOI
100 1 $aSÁ, L. G. de
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520 $aABSTRACT - The objective of this work was to evaluate the genetic dissimilarity between soybean cultivars and genotypes for the selection of parents, as well as to propose a new method for using Kohonen?s self-organizing maps (SOMs) and to test its efficiency through Anderson?s discriminant analysis. The morphoagronomic descriptors of soybean cultivars and genotypes were evaluated. For data analysis, SOM-type artificial neural networks were used. The proposed method allowed the determination of the best network architecture in a nonsubjective way. Furthermore, at the beginning of training, it was possible to mitigate the randomness effect of the synaptic weights on the formed clusters. Six dissimilar clusters were formed; therefore, there is genetic dissimilarity between soybean cultivars and genotypes. Cultivars C25, C8, and C13 can be combined with C36, C31, C32, and C33 because they show good yield-related attributes and high dissimilarity. The proposed methodology is advantageous in comparison with the use of traditional SOMs, besides being efficient due to clustering consistency according to Anderson?s discriminant analysis. RESUMO - O objetivo deste trabalho foi avaliar a dissimilaridade genética entre cultivares e genótipos de soja para a seleção de genitores, bem como propor um novo método para a utilização de mapas auto-organizáveis de Kohonen (SOMs) e testar sua eficiência por meio da análise discriminante de Anderson. Foram avaliados os descritores morfoagronômicos de cultivares e genótipos de soja. Para análise dos dados, utilizaram-se redes neurais artificiais do tipo SOM. O método proposto permitiu a determinação da melhor arquitetura de rede de forma não subjetiva. Além disso, no início do treinamento, foi possível mitigar o efeito da aleatoriedade dos pesos sinápticos sobre os grupos formados. Foram formados seis grupos dissimilares; portanto, há dissimilaridade genética entre cultivares e genótipos de soja. As cultivares C25, C8 e C13 podem ser combinadas com as C36, C31, C32 e C33, por apresentarem bons atributos de produtividade e alta dissimilaridade. A metodologia proposta é vantajosa em comparação ao uso de SOMs tradicionais e se mostrou eficiente devido à consistência dos agrupamentos de acordo com a análise discriminante de Anderson.
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Registro original: |
Embrapa Unidades Centrais (AI-SEDE) |
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| Registros recuperados : 51 | |
| 2. |  | CONCENCO, G.; ANDRES, A.; SILVA, A. F. da; GALON, L.; FERREIRA, E. A.; ASPIAZU, I. Ciência das plantas daninhas: histórico, biologia, ecologia e fisiologia. In: MONQUERO, P. A. (Org.). Aspectos da biologia e manejo das plantas daninhas. São Carlos, SP: RiMa, 2014. p. 1-31.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 4. | | SILVA, A. F. da; CONCENCO, G.; ASPIAZÚ, I.; GALON, L.; FERREIRA, E. A. Métodos de controle de planta daninhas. In: OLIVEIRA, M. F. de; BRIGHENTI, A. M. (Ed.). Controle de plantas daninhas: métodos físico, mecânico, cultural, biológico e alelopatia. Brasília, DF: Embrapa, 2018.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado; Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 5. | | GUIMARÃES, B. V. C.; DONATO, S. L. R.; MAIA, V. M.; ASPIAZÚ, I.; COELHO, E. F. Phenotypical correlations between agronomical characters in Prata type bananas (Musa) and its implications on yield estimate. African Journal of Agricultural Research, v. 9, n. 17, p. 1358-1365, 24 April, 2014.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 9. | | SILVA, N. P. da; SILVA, F. G. da; ASPIAZÚ, I.; CARVALHO, A. J. de; MAGALHAES, P. C.; PORTUGAL, A. F. Características morfológicas de híbridos de milho cultivados com e sem restrição hídrica. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 32., 2018, Lavras. Soluções integradas para os sistemas de produção de milho e sorgo no Brasil: resumos. Sete Lagoas: Associação Brasileira de Milho e Sorgo, 2018. p. 155.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 10. | | CONCENCO, G.; FERREIRA, E. A.; ASPIAZU, I.; SILVA, A. F.; GALON, L.; FERREIRA, F. A.; SILVA, A. A.; ANDRES, A. Uso da água por plantas de arroz em competição com biótipos de Echinochloa crusgalli resisitente e suscetivel ao herbicida Quinclorac. Planta Daninha, Viçosa, v. 27, n. 2, p. 249-256, 2009.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 11. | | C0NCENÇO, G.; FERREIRA, E. A.; ASPIAZU, I.; SILVA, A. F.; GALON, L.; FERREIRA, F. A.; SILVA, A. A.; ANDRES, A. Uso da água por plantas de arroz em competição com biótipos de Echinochloa crusgalli resistente e suscetível ao herbicida quinclorac. Planta Daninha, Viçosa, v. 27, n. 2, p. 249-256, 2009. p. 249-256| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 12. | | SILVA, A. F. da; GALON, L.; CONCENCO, G.; ASPIAZÚ, I.; FERREIRA, E. A.; TIRONI, S. P.; SILVA, A. A. da. Sugarcane cultivars present differential susceptibility to herbicides ametryn and trifloxysulfuron-sodium. Australian Journal of Crop Science, v. 8, n. 6, p. 965-976, 2014.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agropecuária Oeste; Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 13. | | FERREIRA, E. A.; ASPIAZÚ, I.; CONCENCO, G.; SILVA, A. F.; SILVA, A. A.; GALON, L. L.; SILVA, D. V. Evaluation and grouping of sugarcane genotypes in agreement with their physiologic characteristics types. Revista Trópica: Ciências Agrárias e Biológicas, v. 5, n. 3, p. 30-38, 2011.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 5 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agropecuária Oeste. |
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| 14. | | GALON, L.; SILVA, A. F. da; CONCENCO, G.; FERREIRA, E. A.; SILVA, D. V.; ASPIAZÚ, I.; SILVA, A. A. da. Efeito de herbicidas na atividade microbiana do solo cultivado com diferentes genótipos de cana-de-açúcar. Revista Brasileira de Herbicidas, Brasília, v. 13, n. 1, p. 47-57, jan./abr. 2014.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 4 |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 15. | | FERREIRA, E. A.; GALON, L.; ASPIAZU, I.; SILVA, A. A.; CONCENÇO, G.; SILVA, A. F.; OLIVEIRA, J. A.; VARGAS, L. Glyphosate translocation in hairy fleabane (Conyza bonariensis) biotypes. Planta Daninha, Viçosa, MG, v. 26, n. 3, p. 637-643, 2008.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Nacional - B |
| Biblioteca(s): Embrapa Trigo. |
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| 16. | | GALON, L.; FERREIRA, E. A.; ASPIAZÚ, I.; CONCENCO, G.; SILVA, A. F.; SILVA, A. A.; VARGAS, L. Glyphosate translocation in herbicide tolerant plants. Planta Daninha, Viçosa, MG, v. 31, n. 1, p. 193-201, jan./mar. 2013.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agropecuária Oeste; Embrapa Milho e Sorgo; Embrapa Trigo. |
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| 17. | | SILVA, C. T. da; FERREIRO, E. A.; ASPIAZÚ, I.; GALON, L.; SILVA, A. F. da; CONCENCO, G. Manejo de plantas daninhas. In: NICK, C.; BORÉM, A. (Ed.). Alface: do plantio à colheita. Viçosa, MG: Universidade Federal de Viçosa, 2019. p. 190-208.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado; Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 18. | | GALON, L.; CONCENCO, G.; FERREIRA, E. A.; ASPIAZU, I.; SILVA, A. F. da; GIACOBBO, C. L.; ANDRES, A. Influence of biotic and abiotic stress factors on physiological traits of sugarcane varieties. In: DUBINSKY, Z. (Ed.). Photosynthesis. Rijeka: In Tech, 2013. cap. 7, p. 185-208.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Agropecuária Oeste; Embrapa Clima Temperado; Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 19. | | SANTOS, J. R. P. dos; MAIA, V. M.; SILVA, B. S. da; DEMICHELI, P. M.; ASPIAZÚ, I.; CONCENÇO, G. Dynamics of the weed community during pineapple growth in the Brazilian semi-arid region. Agronomía Colombiana, v. 40, n. 1, p. 109-119, 2022. Título em espanhol: Dinámica de la comunidad de malezas a lo largo del crecimiento de piña en la región semiárida brasileña.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 3 |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 20. | | TEIXEIRA, M. F. F.; ASPIAZU, I.; BARROS, T. T. V.; KARAM, D.; CARVALHO, A. J. de; FREITAS, N. M. de. Seletividade de herbicidas aplicados em pós-emergência na cultura do sorgo sacarino. Revista Espacios, v. 38, n. 13, p. 1-9, 2017.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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