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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agrobiologia. |
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Data corrente: |
09/06/2021 |
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Data da última atualização: |
09/11/2021 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
PESSOA, D. D. V.; SANTOS, C. M. dos; VIDAL, M. S.; BALDANI, J. I.; TADRA-SFEIR, M. Z.; SOUZA, E. M. de; ARAUJO, J. L. S. de. |
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Afiliação: |
DANIELLA DUARTE VILLARINHO PESSOA, UFRRJ; CARLOS MAGNO DOS SANTOS, UFRRJ; MARCIA SOARES VIDAL, CNPAB; JOSE IVO BALDANI, CNPAB; MICHELLE ZIBETTI TADRA-SFEIR, UFPR; EMANUEL MALTEMPI DE SOUZA, UFPR; JEAN LUIZ SIMOES DE ARAUJO, CNPAB. |
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Título: |
Herbaspirillum seropedicae strain HRC54 expression profile in response to sugarcane apoplastic fluid. |
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Ano de publicação: |
2021 |
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Fonte/Imprenta: |
3 Biotech, v. 11, Article number 292, 2021. |
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ISSN: |
2190-5738 |
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DOI: |
10.1007/s13205-021-02848-y |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Bacterial transcriptome profiling in the presence of plant fluids or extracts during microbial growth may provide relevant information on plant?bacteria interactions. Here, RNA sequencing (RNA-Seq) was used to determine the transcriptomic profile of Herbaspirillum seropedicae strain HRC54 at the early stages of response to sugarcane apoplastic fluid. Differentially expressed gene (DEG) analysis was performed using the DESeq2 and edgeR packages, followed by functional annotation using Blast2GO and gene ontology enrichment analysis using the COG and KEGG databases. After 2 h of sugarcane apoplastic fluid addition to the H. seropedicae HRC54 culture, respectively, 44 and 45 genes were upregulated and downregulated. These genes were enriched in bacterial metabolism (e.g., oxidoreductase and transferase), ABC transporters, motility, secretion systems, and signal transduction. RNA-Seq expression profiles of 12 genes identified in data analyses were verified by RT-qPCR. The results suggested that H. seropedicae HRC54 recognized sugarcane apoplastic fluid as the host signal, and some DEGs were closely involved at the early stages of the establishment of plant?bacteria interactions. |
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Palavras-Chave: |
Plant bacteria interactions. |
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Thesaurus Nal: |
Sugarcane. |
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Categoria do assunto: |
S Ciências Biológicas |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Agrobiologia (CNPAB) |
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| Registros recuperados : 163 | |
| 81. |  | SILVA, C. G. N. da; MONTEIRO, E. de C.; DINIZ, P. P.; TERRA, L. A.; SCHWAB, S.; REIS, V. M.; ARAUJO, J. L. S. de; URQUIAGA, S. Designing and validation of specific primers for the quantitative detection of bacteria in sugarcane inoculant. Brazilian Journal of Microbiology,, Published: 16 October 2023| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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| 82. | | VIDEIRA, S. S.; BORGES, W. L.; OLIVEIRA, D. M.; ARAUJO, J. L. S. de; BALDANI, J. I.; BALDANI, V. L. D. Genetic diversity of diazotrophic bacteria isolated from elephant-grass. In: INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON BIOLOGICAL NITROGEN WITH NON-LEGUMES, 12.; INTERNATIONAL INCT SYMPOSIUM ON NITROGEN BIOLOGICAL FIXATION, 2., 03 a 8 de outubro, 2010, Búzios, RJ. Book of abstracts... Seropédica: Embrapa Agrobiologia, 2010. Sll. 30| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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| 83. | | SILVA, P. R. A. da; SCHWAB, S.; ARAUJO, J. L. S. de; TEIXEIRA, K. R. dos S.; VIDAL, M. S.; BALDANI, J. I. Genômica funcional da bactéria diazotrófica Burkholderia tropica cultivada em líquido de apoplasto de cana-de-açúcar In: SEMANA CIENTÍFICA JOHANNA DÖBEREINER, 12., 2012. Economia verde, sustentabilidade e erradicação da pobreza: caderno de resumos. Seropédica: Embrapa Agrobiologia, 2012.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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| 84. | | SILVA, H. A. P da; GALISA, P. de S.; OLIVEIRA, R. S. da S.; VIDAL, M. S.; ARAUJO, J. L. S. de. Expressão gênica induzida por estresses abióticos em nódulos de feijão-caupi. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 47, n. 6, p. 797-807, jun. 2012. Titulo em inglês: Gene expression induced by abiotic stress in cowpea nodules.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 85. | | PASSOS, S. R.; CORREIA, M. E. F.; SOARES, L. H. de B.; ARAUJO, J. L. S. de; RUMJANEK, N. G.; XAVIER, G. R. Exploração do potencial biotecnológico da microbiota associada ao trato intestinal de Trigoniulus corallinus (Diplopoda). In: SEMANA CIENTÍFICA JOHANNA DÖBEREINER, 10., 18 a 24 de outubro de 2010, Seropédica. Ciência para o Desenvolvimento Sustentável: anais... Seropédica: Embrapa Agrobiologia, 2010.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 86. | | POLESE, V.; SILVA, P. R. A.; TADRA-SFEIR, M. Z.; ARAUJO, J. L. S. de; SOUZA, E. M.; BALDANI, J. I.; VIDAL, M. S. Functional genomic of Herbaspirillum rubrisubalbicans HCC103 strain grown in the presence of sugarcane apoplastic liquid In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA, 28., 2015, Florianópolis. Resumos. Florianópolis: Sociedade Brasileira de Microbiologia, 2015.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 87. | | GALVÃO, P. G.; RODRIGUES, E. P.; ROUWS, L. F. M.; ARAUJO, J. L. S. de; VIDAL, M. S.; BALDANI, J. I. Geração e avaliação de um mutante nitB de Gluconacetobacter diazotrophicus. In: SEMANA CIENTÍFICA JOHANNA DÖBEREINER, 10., 18 a 24 de outubro de 2010, Seropédica. Ciência para o Desenvolvimento Sustentável: anais... Seropédica: Embrapa Agrobiologia, 2010.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 88. | | BALDANI, J. I.; GUEDES, H. V.; ROUWS, L. F. M.; VIDAL, M. S.; ARAUJO, J. L. S. de; SCHWAB, S.; TEIXEIRA, K. R. dos S. Gluconacetobacter dizotrophicus genome and its potential for biotechnological apllication In: REUNIÓN CIENTIFICO TÉCNICA DE BIOLOGIA DEL SUELO Y FIJACIÓN BIOLÓGICA DE NITRÓGENIO- REBIOS, 7., 2009, San Miguel de Tucaumán, AR. Libro de resúmenes...San Miguel de Tucaumán: Universidad Nacional de Tucumán, 2009.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 90. | | FERREIRA, V. de L.; GALISA, P. de S.; SCHWAB, S.; VIDAL, M. S.; BALDANI, J. I.; ARAUJO, J. L. S. de. Caracterização da função de MatE em Gluconacetobacter diazotrophicus. In: SEMANA CIENTÍFICA JOHANNA DÖBEREINER, 10., 18 a 24 de outubro de 2010, Seropédica. Ciência para o Desenvolvimento Sustentável: anais... Seropédica: Embrapa Agrobiologia, 2010.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 91. | | CARVALHO, P. de A.; MENESES, C. H. S. G.; ROUWS, L. F. M.; ARAÚJO, J. L. S. de; VIDAL, M. S.; BALDANI, J. I. Caracterização funcional de uma provável B-1,4-endoglucanase de Gluconacetobacter diazotrophicus PAL5T. In: SEMANA CIENTÍFICA JOHANNA DÖBEREINER, 9., 19 a 23 de outubro de 2009, Seropédica. Ciência no Brasil: desafios, avanços e aplicações: caderno de resumos. Seropédica: Embrapa Agrobiologia, 2009. p.43| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 92. | | VILLA, J. C.; ZOFFOLI, B. C.; PITARD, R. M.; ARAUJO, J. L. S. de; SOUZA FILHO, B. F.; ARAUJO, A. P.; STRALIOTTO, R. Caracterização de isolados indígenas de rizóbio visando a seleção de estirpes eficientes e adaptados a área de cultivo tradicional de feijoeiro no Estado do Rio de Janeiro. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 31.; REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS, 15.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 13.; REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 10., 2014, Araxá. Fertilidade e biologia do solo: integração e tecnologias para todos: anais. Araxá: Núcleo Regional Leste da Sociedade Brasileira de Ciência do Solo, 2014. FertBio 2014.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 93. | | BALDANI, J. I.; VIDEIRA, S. S.; QUESSADA, D.; BALDANI, V. L. D.; VIDAL, M. S.; SCHWAB, S.; ARAUJO, J. L. S. de; URQUIAGA, S. BNF in the bioenergy Pennisetum purpureum In: SYMPOSIUM ON BIOLOGICAL NITROGEN FIXATION WITH NON-LEGUMES, 15.; SYMPOSIUM OF THE EUROPEAN NITROGEN FIXATION CONFERENCE, 12., 2016, Hungary. Book of abstracts. Hungary: Biological Research Center, 2016.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 94. | | MATOS, G. F. de; ROUWS, J. R. C.; ARAUJO, J. L. S. de; REIS, V. M.; BALDANI, J. I.; ROUWS, L. F. M. Bradyrhizobium isolates from sugarcane roots form a new fhylogenetic group with potential for the development of inoculants In: REUNIÃO LATINOAMERICANA DE RIZOBIOLOGIA, 27., 2016, Londrina. Fortalecendo as parcerias Sul-Sul: anais. Curitiba: SBCS-NEPAR, 2016. 308 p. Editado por Mariangle Hungria, Douglas Fabiano Gomes, Arnaldo Colozzi Filho. RELAR 2016. p. 133| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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| 95. | | MATOS, G. F. de; ZILLI, J. E.; ARAUJO, J. L. S. de; REIS, V. M.; BALDANI, J. I.; ROUWS, L. F. M. Bradyrhizobium isolates from sugarcane roots represent a nex phylogenetic group with potential for the development fo inoculants. In: SYMPOSIUM ON BIOLOGICAL NITROGEN FIXATION WITH NON-LEGUMES, 15.; SYMPOSIUM OF THE EUROPEAN NITROGEN FIXATION CONFERENCE, 12., 2016, Hungary. Book of abstracts. Hungary: Biological Research Center, 2016. P. 38| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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| 96. | | ROUWS, L. F. M.; FISCHER, D.; ARAUJO, J. L. S. de; SCHMID, M.; SCHLOTER, M.; REIS, V. M.; BALDANI, J. I.; HARTMANN, A. Bradyrhizobium spp. are part of the nitrogen-fixing bacterial community associated with the field grown sugar cane Seropédica/ Rio de Janeiro, Brasil. EUROPEAN NITROGEN FIXATION CONFERENCE, 10., 2012, Munich. Abstract.... Munich: German Research Center for Environmental Health, 2012. 72 p. PP3-30| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 97. | | DELAMUTA, J. R. M.; RIBEIRO, R. A.; ARAUJO, J. L. S. de; ROUWS, L. F. M.; ZILLI, J. E.; PARMA, M. M.; MELO, I. S. de; HUNGRIA, M. Bradyrhizobium stylosanthis sp. nov., comprising nitrogen-fixing symbionts isolated from nodules of the tropical forage legume Stylosanthes spp. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, v. 66, n. 8, p. 3078-3087, 2016.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio Ambiente. |
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| 98. | | PASSOS, S. R.; CORREIA, M. E. F.; SOARES, L. H. de B.; ARAUJO, J. L. S. de; RUMJANEK, N. G.; XAVIER, G. R. Bioprospecção de microorganismo com capacidade celulolítica no trato intestinal do diplópode trrigoniuulus corallinus In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA, 25.,2009, Porto de Galinhas, PE. Anais... [São Paulo]: Sociedade Bras. de Microbiologia, 2009. 01 p. 01 de 01| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 99. | | VIDEIRA, S. S.; OLIVEIRA, D. M. de; BARROS, D. R.; BALDANI, J. I.; ARAUJO, J. L. S. de; BALDANI, V. L. D. Diversidade morfológica de bactérias diazotróficas oriundas de plantas de capim-elefante no Estado do rio de Janeiro. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA, 25., 2009, Porto de Galinhas, PE. Anais... [São Paulo]: Sociedade Bras. de Microbiologia, 2009.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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