| |
|
|
|
Registro Completo |
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Pantanal. |
|
Data corrente: |
25/10/2023 |
|
Data da última atualização: |
25/10/2023 |
|
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
|
Autoria: |
DINIZ SOBRINHO, F. de A.; MOURA, J. de O.; BAJAY, M. M.; CASTELO BRANCO, L.; BEZERRA, R. D. S.; ARAÚJO, A. M. de. |
|
Afiliação: |
FRANCISCO DE A. DINIZ SOBRINHO, UNIVERSIDADE FEDERAL DO PIAUÍ, Teresina-PI; JEANE DE O. MOURA, INSTITUTO FEDERAL DO PIAUÍ, Teresina-PI; MIKLOS M. BAJAY, UNIVERSIDADE DO ESTADO DE SANTA CATARINA, Laguna-SC; LEONARDO CASTELO BRANCO, UNIVERSIDADE FEDERAL RURAL DA AMAZÔNIA, Belém-PA; ROOSEVELT D. S. BEZERRA, INSTITUTO FEDERAL DO PIAUÍ, Teresina-PI; ADRIANA MELLO DE ARAUJO, CPAP. |
|
Título: |
Capra hircus outliers markers in Brazil: searching for genomic regions under the action of natural selection. |
|
Ano de publicação: |
2023 |
|
Fonte/Imprenta: |
Genetics and Molecular Biology, v. 46, n. 3, e20230084, 2023. |
|
ISSN: |
1678-4685 |
|
DOI: |
https://doi.org/10.1590/1678-4685-GMB-2023-0084 |
|
Idioma: |
Inglês |
|
Conteúdo: |
Identifying genome regions subject to selection in local breeds of Brazil is an opportunity to elucidate the C. hircus genome plasticity, flowing the colonization history of the country. Using SNP Bead Chip Illumina 50K genotyping of Brazilian Anglo-Nubian (standardized breed) and Marota (local endangered population from the semiarid area of Brazil) to show outliers loci in genome regions subject to selection. After applying data quality control, 45,600 SNPs were included in this investigation. Principal component analysis (PCAdapt) and FDIST2 analysis signalized 14 genomic regions more affected by selection in the Brazilian dry zone environment. The genome study signalized regions that are close to the sequences of genes related to growth and embryonic skeletal development (FGF12, AMPD2, OSTN). In addition, flagged regions close to the genes UTSB2 and SLC5A2 contribute to research on functional adaptation with low water needs and poor nutritive diet to survive. Both genes encode proteins that act on osmotic pathways and avoid cell flooding on stress cell responses. Further studies on the genetic role and involvement of these outliers? genomic regions, building a robust conceptual high-resolution map of natural selection drives, help to achieve hardiness candidate genes linked to the evolutionary history of Capra hircus in the semiarid area of Brazil. |
|
Palavras-Chave: |
Candidate genes; Hardiness; Non-neutral loci; Outliers; Seleção natural; Tropical adaptation. |
|
Thesagro: |
Capra Hircus; Caprino; Genoma; Seleção. |
|
Thesaurus Nal: |
Genome; Natural selection. |
|
Categoria do assunto: |
L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal |
|
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1157489/1/gmb-2023.pdf
|
|
Marc: |
LEADER 02405naa a2200349 a 4500
001 2157489
005 2023-10-25
008 2023 bl uuuu u00u1 u #d
022 $a1678-4685
024 7 $ahttps://doi.org/10.1590/1678-4685-GMB-2023-0084$2DOI
100 1 $aDINIZ SOBRINHO, F. de A.
245 $aCapra hircus outliers markers in Brazil$bsearching for genomic regions under the action of natural selection.$h[electronic resource]
260 $c2023
520 $aIdentifying genome regions subject to selection in local breeds of Brazil is an opportunity to elucidate the C. hircus genome plasticity, flowing the colonization history of the country. Using SNP Bead Chip Illumina 50K genotyping of Brazilian Anglo-Nubian (standardized breed) and Marota (local endangered population from the semiarid area of Brazil) to show outliers loci in genome regions subject to selection. After applying data quality control, 45,600 SNPs were included in this investigation. Principal component analysis (PCAdapt) and FDIST2 analysis signalized 14 genomic regions more affected by selection in the Brazilian dry zone environment. The genome study signalized regions that are close to the sequences of genes related to growth and embryonic skeletal development (FGF12, AMPD2, OSTN). In addition, flagged regions close to the genes UTSB2 and SLC5A2 contribute to research on functional adaptation with low water needs and poor nutritive diet to survive. Both genes encode proteins that act on osmotic pathways and avoid cell flooding on stress cell responses. Further studies on the genetic role and involvement of these outliers? genomic regions, building a robust conceptual high-resolution map of natural selection drives, help to achieve hardiness candidate genes linked to the evolutionary history of Capra hircus in the semiarid area of Brazil.
650 $aGenome
650 $aNatural selection
650 $aCapra Hircus
650 $aCaprino
650 $aGenoma
650 $aSeleção
653 $aCandidate genes
653 $aHardiness
653 $aNon-neutral loci
653 $aOutliers
653 $aSeleção natural
653 $aTropical adaptation
700 1 $aMOURA, J. de O.
700 1 $aBAJAY, M. M.
700 1 $aCASTELO BRANCO, L.
700 1 $aBEZERRA, R. D. S.
700 1 $aARAÚJO, A. M. de
773 $tGenetics and Molecular Biology$gv. 46, n. 3, e20230084, 2023.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Pantanal (CPAP) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
|
| Registros recuperados : 232 | |
| 121. |  | MENDES, R. R.; LIMA, B.; CARDOSO, J. P. B.; CAMPELO, J. E. G.; CARVALHO, G. M. C.; ARAUJO, A. M. de. Caracteristicas fenotípicas de galinhas caipiras (Gallus gallus domesticus) criadas no Maranhão. In: JORNADA CIENTÍFICA DA EMBRAPA MEIO-NORTE, 2., 2016, Teresina. Anais da II Jornada Científica da Embrapa Meio-Norte. Teresina: Embrapa Meio-Norte, 2016. p. 86-88.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
|    |
| 122. | | PIRES, L. C.; MACHADO, T. M. M.; ARAUJO, A. M. de; OLSON, T. A.; SILVA, J. B. L. da; TORRES, R. A.; COSTA, M. da S. Biometric variability of goat populations revealed by means of principal component analysis. Genetics and Molecular Biology, São Paulo, v. 35, n. 4, p. 777-782, 2012.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
| |
| 123. | | DINIZ SOBRINHO, F. de A.; MOURA, J. de O.; BAJAY, M. M.; CASTELO BRANCO, L.; BEZERRA, R. D. S.; ARAÚJO, A. M. de. Capra hircus outliers markers in Brazil: searching for genomic regions under the action of natural selection. Genetics and Molecular Biology, v. 46, n. 3, e20230084, 2023.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 3 |
| Biblioteca(s): Embrapa Pantanal. |
| |
| 124. | | CAMPELO, J. E. G.; BRANCO, J. da F. C.; ARAUJO, A. M. de; MOITA NETO, J. M. M.; ALMEIDA, M. J. de O.; SANTOS, N. P. da S. Caracterização de caprinos do grupo naturalizado Nambi no estado do Piauí. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 47., 2010, Salvador. Empreendedorismo e progresso científicos na zootecnia brasileira de vanguarda: anais. Salvador: SBZ, 2010.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
| |
| 125. | | COSTA, M. da S.; ARAUJO, A. M. de; CAMPELO, J. E. G.; MACHADO, T. M. M; PIRES, L. C.; EGITO, A. A. do; MARIANTE, A. da S. Inventário e caracterização morfológica de caprinos Gurgueia no Estado do Piauí. Revista Brasileira de Saúde e Produção Animal, Salvador, v. 17, n. 2, p. 127-138, abr./jun. 2016.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte; Embrapa Meio-Norte; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
| |
| 126. | | COSTA, M. da S.; ARAUJO, A. M. de; BRANCO, J. da F. C.; CAMPELO, E. G.; EGITO, A. A. do; MACHADO, T. M. M.; PIRES, L. C. Levantamento populacional da raça gurguéia no Estado do Piauí. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS; WORKSHOP EM BIOPROSPECÇÃO E CONSERVAÇÃO DE PLANTAS NATIVAS DO SEMI-ÁRIDO, 3.; WORKSHOP INTERNACIONAL SOBRE BIOENERGIA E MEIO AMBIENTE, 2010, Salvador. Bancos de germoplasma: descobrir a riqueza, garantir o futuro: anais. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2010. 550 p. (Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. Documentos, 304). Editora técnica Clara Oliveira Goedert. p. 27| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
| |
| 127. | | COSTA, M. da S.; ARAUJO, A. M. de; BRANCO, J. da F. C.; CAMPELO, J. E. G.; EGITO, A. A. do; MACHADO, T. M. M.; PIRES, L. C. Levantamento populacional da raça gurguéia no estado do Piauí. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS; WORKSHOP EM BIOPROSPECÇÃO E CONSERVAÇÃO DE PLANTAS NATIVAS DO SEMI-ÁRIDO, 3.; WORKSHOP INTERNACIONAL SOBRE BIOENERGIA E MEIO AMBIENTE, 2010, Salvador. Bancos de germoplasma: descobrir a riqueza, garantir o futuro: anais. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2010. CD-ROM| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
| |
| 128. | | PIRES, L. C.; MACHADO, T. M. M.; FONSECA, J. F. da; ARAUJO, A. M. de; FONSECA, J. de D.; BARBOSA, A. D. de H. Índices zoométricos para caprinos das Repúblicas de Cabo Verde e Brasil. In: SIMPÓSIO INTERNACIONAL SOBRE CAPRINOS E OVINOS DE CORTE, 5.; FEIRA NACIONAL DO AGRONEGÓCIO DA CAPRINO-OVINOCULTURA DE CORTE, 3., 2011, João Pessoa. [Anais...]. João Pessoa: [SEBRAE-PB]; EMEPA-PB, 2011. 3 f. 1 CD ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
| |
| 129. | | COSTA, M. da S.; BRANCO, J. da F. C.; ARAÚJO, A. M. de; CAMPELO, J. E. G.; MACHADO, T. M. M.; SARMENTO, J. L.; EGITO, A. A. do. Levantamento geográfico de caprinos Nambi no Estado Piaurí-Brasil. In: SIMPÓSIO DE RECURSOS GENÉTICOS PARA AMÉRICA LATINA Y EL CARIBE, SIRGEALC, 7, 2009, Pucón, Chile. Proceeding... Santiago de Chile: Ministério de Agricultura, Instituto de Investigaciones Agropecuarias, 2009. p. 165-166 Titulo: Piaurí [i. e. Piauí], Brasil.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
| |
| 130. | | ARAUJO, A. M. de; SILVA, F. L. R. D.; MOTTA, M. M.; MACHADO, T. M. M.; SANTOS, D. O.; CARVALHO, G. M. C. Evolução no rebanho de conservação de caprinos Moxotó. In: SIMPOSIO DE RECURSOS GENÉTICOS PARA AMÉRICA LATINA Y EL CARIBE, SIRGEALC, 5., 2005, Montevideo, Uruguay. Resúmenes... Montevideo: Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria: Universidad de la República, Facultad de Agronomía, 2005. p. 103.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
| |
| 131. | | ARAUJO, A. M. de; SILVA, F. L. R.; MOTTA, M. M.; MACHADO, T. M. M.; SANTOS, D. O.; CARVALHO, G. M. C. Evolução no rebanho de conservação de caprinos Moxotó. In: SIMPOSIO DE RECURSOS GENÉTICOS PARA AMÉRICA LATINA Y EL CARIBE, SIRGEALC, 5., 2005, Montevideo, Uruguay. Resúmenes... Montevideo: Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria: Universidad de la República, Facultad de Agronomía, 2005. p. 103.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
| |
| 132. | | PIRES, L. C.; MACHADO, T. M. M.; EUCLYDES, R. F.; PEREIRA, R. J.; ARAÚJO, A. M. de; TORRES, R. de A.; CHAKIR, M. Estimativa dos componentes de (CO) variância de medidas corporais em caprinos. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 2., 2008, Brasília, DF. Anais... Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2008. p. 488.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
| |
| 133. | | PIRES, L. C.; MACHADO, T. M. M.; SANTOS, L. G. dos; EUCLYDES, R. F.; ARAUJO, A. M. de; ESPESCHIT, C. J. B. Estudo de populações ovina da raça santa inês utilizando a análise de componentes principais. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 45., 2008, Lavras, MG. Anais... Lavras: SBZ: UFLA, 2008. 5 p.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
| |
| 134. | | TOLEDO, N. M. de; McMANUS, C.; PAIM, T. do P.; PAIVA, S. R.; FACO, O.; AZEVEDO, H. C.; ARAUJO, A. M. de. Estrutura genética de raças ovinas brasileiras. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 3., 2014, Santos. Anais... Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Recursos Genéticos, 2014. 1 p.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pantanal. |
| |
| 135. | | RODRIGUES, F. N.; LEAL, T. M.; ARAUJO, A. M. de; HASSUM, I. C.; ALMENDRA, S. de O.; OLIVEIRA, M. B. de; SARMENTO, J. L. R. Genetic parameters for resistance to parasitism in Santa Ines sheep using animal model Bayesian. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 54., 2017, Foz do Iguaçu. A new view of animal science: challenges and perspectives: proceedings. Foz do Iguaçu: Sociedade Brasileira de Zootecnia, 2017. p. 426.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
| |
| 136. | | ARAUJO, A. M. de; SILVA, F. L. R. D.; MOTTA, M. M.; MACHADO, T. M. M.; SANTOS, D. O.; CARVALHO, G. M. C. Evoluação no rebanho de conservação de caprinos Moxotó. In: SIMPOSIO DE RECURSOS GENÉTICOS PARA AMÉRICA LATINA Y EL CARIBE, SIRGEALC, 5., 2005, Montevideo, Uruguay. Resúmenes... Montevideo: Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria: Universidad de la República, Facultad de Agronomía, 2005. n. 298, p. 103.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
| |
| 137. | | MACHADO, T. M. M.; PIRES, L. C.; CARNEIRO, P. L. S.; BARBOSA, A. D. de H.; ARAUJO, A. M. de; NOVAES, M. A. S. Evaluation of structural traits of goats from Northeastern Brazil using zoometric ratios. Advances in Animal Biosciences, v. 1, n. 2, p. 375-376, 2010. Edição do anais do International Symposium on Sustainable Animal Production in the Tropics: Farming in a Changing World. Guadelouple 14th-18th November 2010.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
| |
| 138. | | OLIVEIRA, W. P. da S.; SANTOS, N. P. da S.; OLIVEIRA, M. B. de; EVANGELISTA, A. F.; COSTA FILHO, R. T. da; ARAÚJO, A. M. de. Função discriminatória de lógica Fuzzy para avaliação de cabras expostas a ocorrência de verminose quanto à resistência, resiliência ou sensibilidade ao parasitismo. Ciência Animal Brasileira, v. 24, 2023. Título em Inglês: Fuzzy logic discriminant function for evaluating goats exposed to verminosis occurrence regarding resistance, resilience, or sensitivity to parasitism.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Pantanal. |
| |
| 139. | | ASSIS, H. J. C. de; COSTA, J. V.; OLIVEIRA, M. E. de; RODRIGUES, I.; LEAL, T. M.; ARAUJO, A. M. de. Produção de Panicum maximum 'Massai' consorciado com cunhã (Clitoria ternatea) e em sistema silvipastoril. In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA MEIO-NORTE, 4., 2018, Teresina, PI. Anais da IV Jornada Científica da Embrapa Meio-Norte. Brasília, DF: Embrapa, 2018. P. 46.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
| |
| 140. | | SANTOS, A. da S.; SILVA, F. L. R. da; MEDEIROS, H. R. de; ARAÚJO, A. M. de; BEZERRA, F. G. S. Desempenho produtivo de raças nativas Moxotó e Canindé no semi-árido nordestino do Brasil. In: CONGRESSO NORDESTINO DE PRODUÇÃO ANIMAL, 5.; SIMPÓSIO NORDESTINO DE ALIMENTAÇÃO DE RUMINANTES, 11.; SIMPÓSIO SERGIPANO DE PRODUÇÃO ANIMAL, 1., 2008, Aracaju. Anais... Aracaju: Sociedade Nordestina de Produção Animal; Embrapa Tabuleiros Costeiros, 2008. 3 f.1 CD ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
| |
| Registros recuperados : 232 | |
|
| Nenhum registro encontrado para a expressão de busca informada. |
|
|
