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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
Data corrente: |
09/07/2009 |
Data da última atualização: |
14/06/2023 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
KUBO, K. S.; STUART, R. M.; FREITAS-ASTÚA, J.; ANTONIOLI-LUIZON, R.; LOCALI-FABRIS, E. C.; COLETTA-FILHO, H. D.; MACHADO, M. A.; KITAJIMA, E. W. |
Afiliação: |
Karen Sumire Kubo, APTA; R. M. Stuart, APTA; Juliana Freitas-Ástua, CNPMF; Renata Antonioli-Luizon, APTA; Eliane Cristina Locali-Fabris, APTA; Helvecio Della Coletta-Filho, APTA; Marcos Antonio Machado, APTA; Elliot Watanabe Kitajima, ESALQ. |
Título: |
Evaluation of the genetic variability of orchid fleck virus by single-strand conformational polymorphism analysis and nucleotide sequencing of a fragment from the nucleocapsid. |
Ano de publicação: |
2009 |
Fonte/Imprenta: |
Archives of Virology, v. 154, n. 6, p. 1009-1014, mai. 2009. |
ISSN: |
0304-8608 |
DOI: |
DOI 10.1007/s00705-009-0395-8 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
The variability of a fragment of the nucleocapsid gene of orchid fleck virus (OFV) was investigated by single-strand conformational polymorphism (SSCP) analysis and nucleotide sequencing. Forty-eight samples of 18 genera of orchids were collected from Brazil, Costa Rica and Australia. The SSCP analysis yielded six different band patterns, and phylogenetic analysis based on the nucleotide fragment sequence obtained in this work and six available in GenBank showed two different groups, one with isolates 023Germany and So-Japan, and other with the rest of the isolates. None of the analyses showed geographic correlation among the Brazilian strains. The data obtained in this study showed a low genetic variation in this region of the genome; the dN/dS ratio of 0.251-0.405 demonstrated a negative selective pressure that maintains the stability of the analyzed fragments. |
Palavras-Chave: |
Nuclear type. |
Thesaurus Nal: |
Orchid fleck virus. |
Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
Marc: |
LEADER 01736naa a2200253 a 4500 001 1654417 005 2023-06-14 008 2009 bl uuuu u00u1 u #d 022 $a0304-8608 024 7 $aDOI 10.1007/s00705-009-0395-8$2DOI 100 1 $aKUBO, K. S. 245 $aEvaluation of the genetic variability of orchid fleck virus by single-strand conformational polymorphism analysis and nucleotide sequencing of a fragment from the nucleocapsid.$h[electronic resource] 260 $c2009 520 $aThe variability of a fragment of the nucleocapsid gene of orchid fleck virus (OFV) was investigated by single-strand conformational polymorphism (SSCP) analysis and nucleotide sequencing. Forty-eight samples of 18 genera of orchids were collected from Brazil, Costa Rica and Australia. The SSCP analysis yielded six different band patterns, and phylogenetic analysis based on the nucleotide fragment sequence obtained in this work and six available in GenBank showed two different groups, one with isolates 023Germany and So-Japan, and other with the rest of the isolates. None of the analyses showed geographic correlation among the Brazilian strains. The data obtained in this study showed a low genetic variation in this region of the genome; the dN/dS ratio of 0.251-0.405 demonstrated a negative selective pressure that maintains the stability of the analyzed fragments. 650 $aOrchid fleck virus 653 $aNuclear type 700 1 $aSTUART, R. M. 700 1 $aFREITAS-ASTÚA, J. 700 1 $aANTONIOLI-LUIZON, R. 700 1 $aLOCALI-FABRIS, E. C. 700 1 $aCOLETTA-FILHO, H. D. 700 1 $aMACHADO, M. A. 700 1 $aKITAJIMA, E. W. 773 $tArchives of Virology$gv. 154, n. 6, p. 1009-1014, mai. 2009.
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Registro original: |
Embrapa Mandioca e Fruticultura (CNPMF) |
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Registros recuperados : 14 | |
1. | | ANTONIOLI-LUIZON, R.; LOCALI-FABRIS, E. C.; ASTÚA, J. F.; MACHADO, M. A.; KITAJIMA, E. W. Estudo da variabilidade genética do vírus da pinta verde do maracujazeiro através de SSCP (Single Strand Conformational Polymorphism). In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA, 25., 2009, Porto de Galinhas, PE. Anais... [São Paulo]: Sociedade Bras. de Microbiologia, 2009. Resumo I - Virologia (Divisão P).Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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2. | | ANTONIOLI-LUIZON, R.; FREITAS-ÁSTUA, J.; REZENDE, J. A. M.; MACHADO, M. A.; KITAJIMA, E. W. Detecção específica do vírus da pinta verde do maracujazeiro por RT-PCR. Tropical Plant Pathology, Brasília, DF, v. 34, ago. 2009. Suplemento. Edição dos Resumos do XLII Congresso Brasileiro de Fitopatologia, Rio de Janeiro, ago. 2009. Suplemento. Resumo 907.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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5. | | NICOLINI, F.; BASTIANEL, M.; FREITAS-ÁSTUA, J.; ANTONIOLI-LUIZON, R.; SCHONS, J.; MACHADO, M. A. Quantificação do vírus da leprose dos citros no hospedeiro vegetal. Summa Phytopathologica, Botucatu, v. 34, , p. 66, fev. 2008. Suplemento. Edição dos Resumos do XXXI Congresso Paulista de Fitopatologia, Campinas, fev. 2008.
R 199Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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7. | | ASTUA, J. de F.; FADEL, A. L.; BASTIANEL, M.; NOVELLI, V. M.; ANTONIOLI-LUIZON, R.; MACHADO, M. A. Resposta diferencial de espécies e de híbridos de citros à leprose. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 43, n. 7, p. 809-814, jul. 2008. Título em inglês: Differential response of citrus species and hybrids to leprosis.Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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8. | | FREITAS-ÁSTUA, J.; FADEL, A. L.; BASTIANEL, M.; NOVELLI, V. M.; ANTONIOLI-LUIZON, R.; MACHADO, M. A. Resposta diferencial de espécies e de híbridos de citros à leprose. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 43, n. 7, p. 809-814, jul. 2008.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Internacional - A |
Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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9. | | BASTIANEL, M.; PEREIRA, J. A.; NOVELLI, V. M.; ANTONIOLI-LUIZON, R.; AZEVEDO, F. A.; FREITAS-ASTUA, J. Resposta de tangerinas e híbridos ao virus da leprose dos citros. In:CONGRESSO BRASILEIRO DE FRUTICULTURA, 21., 2010, Natal. Frutas: saúde, inovação e responsabilidade: anais. Natal: Sociedade Brasileira de Fruticultura, 2010. pdf 1458Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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10. | | PEREIRA, J. A.; ANTONIOLI - LUIZON, R.; NICOLINI, F.; LOCALI-FABRIS, E. C.; KUBO, K. S.; M ACHADO, M. A.; FREITAS-ASTÚA, J. Análise da variabilidade genética do gene da capa protéica do vírus da leprose dos citros. Tropical Plant Pathology, Brasilia, DF, v. 33, supl., p. 287, ago. 2008.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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11. | | KUBO, K. S.; STUART, R. M.; FREITAS-ASTÚA, J.; ANTONIOLI-LUIZON, R.; LOCALI-FABRIS, E. C.; COLETTA-FILHO, H. D.; MACHADO, M. A.; KITAJIMA, E. W. Evaluation of the genetic variability of orchid fleck virus by single-strand conformational polymorphism analysis and nucleotide sequencing of a fragment from the nucleocapsid. Archives of Virology, v. 154, n. 6, p. 1009-1014, mai. 2009.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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12. | | NOVELLI, V. M.; ASTUA, J. de F.; LOCALI-FABRIS, E. C.; BASTIANEL, M.; ANTONIOLI-LUIZON, R.; RIBEIRO, B. M.; MACHADO, M. A. Detecção do vírus da leprose dos citros no ácaro vetor. Laranja, Cordeiropólis, v. 28, n. 1/2, 2007 Disponível em: Acesso em: 26 out. 2010.
Pdf: 04_313 desenvolvimento [1]. pdf
Secção: FitopalogiaTipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 4 |
Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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13. | | KUBO, K. S.; NOVELLI, V. M.; BASTIANEL, M.; LOCALI-FABRIS, E. C.; ANTONIOLI-LUIZON, R.; MACHADO, M. A.; FREITAS-ASTUA, J. Detection of Brevipalpus-transmitted viruses in their mite vectors by RT-PCR. Experimental Applied Acarology, Dordrechet, v. 54, n. 1, jan. 2011.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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14. | | FREITAS-ÁSTUA, J.; LOCALI-FABRIS, E. C.; ANTONIOLI-LUIZON, R.; PEREIRA, J.; NOVELLI, V. M.; CACERES, S.; LEON, M. G. A.; GOMEZ, E. C.; COSTA, F. M.; KITAJIMA, E. W.; MACHADO, M. A. Variabilidade do vírus da leprose dos citros C (CiLV-C) em amostras de diferentes países da América Latina. Tropical Plant Pathology, Brasília, DF, v. 34, ago. 2009. Suplemento. Edição dos Resumos do XLII Congresso Brasileiro de Fitopatologia, Rio de Janeiro, ago. 2009. Suplemento. Resumo 920.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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