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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Amazônia Oriental. |
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Data corrente: |
01/12/2022 |
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Data da última atualização: |
01/12/2022 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
CHAVES, S. F. S.; EVANGELISTA, J. S. P. C.; ALVES, R. S.; FERREIRA, F. M.; DIAS, L. A. S.; ALVES, R. M.; DIAS, K. O. G.; BHERING, L. L. |
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Afiliação: |
SAULO F. S. CHAVES, UNIVERSIDADE FEDERAL DE VIÇOSA; JENIFFER S. P. C. EVANGELISTA, UNIVERSIDADE FEDERAL DE VIÇOSA; RODRIGO S. ALVES, UNIVERSIDADE FEDERAL DE LAVRAS; FILIPE M. FERREIRA, UNIVERSIDADE FEDERAL DE VIÇOSA; LUIZ A. S. DIAS, UNIVERSIDADE FEDERAL DE VIÇOSA; RAFAEL MOYSES ALVES, CPATU; KAIO O. G. DIAS, UNIVERSIDADE FEDERAL DE VIÇOSA; LEONARDO L. BHERING, UNIVERSIDADE FEDERAL DE VIÇOSA. |
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Título: |
Application of linear mixed models for multiple harvest/site trial analyses in perennial plant breeding. |
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Ano de publicação: |
2022 |
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Fonte/Imprenta: |
Tree Genetics & Genomes, v. 18, n. 6, Article number: 44, Dec. 2022. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1007/s11295-022-01576-5 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
The optimization of perennial plant breeding necessarily involves the evaluation of multi-harvest and/or multi-site trials. In these situations, modeling covariance structures can elevate accuracy. This study aimed to evaluate different covariance structures for multi-harvest and multi-site trial analyses, using two datasets (D1 and D2). In D1, 25 hybrids of Theobroma grandiflorum were evaluated in a complete randomized block design, during twelve consecutive harvest years. In D2, 215 clones of Eucalyptus spp. were evaluated in a complete randomized block design, in four sites. For both datasets, the covariance structures of the random effects were modeled, and their adequacy was tested by the Akaike and Bayesian information criteria. From the selected model, the variance components and genetic parameters were estimated. We also compared the expected genetic gains and the rankings of genotypes based on the genotypic values provided by the basic and the selected models. For D1, the third-order factor analytic model was the most suitable for genetic effects, while for D2, the unstructured model showed the best fit for such effects. The models provided a better insight into the variances dynamics over the harvest years/sites. The genetic gains were 3.52 percentage points higher in D1 and did not change in D2. Despite similar results, the standard model, modeled with covariance structures that assume homogeneity of co-variances, was not the most statistically appropriate model for D2 according to the information criteria. Therefore, the modeling of covariance structures can and should be used in the genetic evaluation of perennial plants MenosThe optimization of perennial plant breeding necessarily involves the evaluation of multi-harvest and/or multi-site trials. In these situations, modeling covariance structures can elevate accuracy. This study aimed to evaluate different covariance structures for multi-harvest and multi-site trial analyses, using two datasets (D1 and D2). In D1, 25 hybrids of Theobroma grandiflorum were evaluated in a complete randomized block design, during twelve consecutive harvest years. In D2, 215 clones of Eucalyptus spp. were evaluated in a complete randomized block design, in four sites. For both datasets, the covariance structures of the random effects were modeled, and their adequacy was tested by the Akaike and Bayesian information criteria. From the selected model, the variance components and genetic parameters were estimated. We also compared the expected genetic gains and the rankings of genotypes based on the genotypic values provided by the basic and the selected models. For D1, the third-order factor analytic model was the most suitable for genetic effects, while for D2, the unstructured model showed the best fit for such effects. The models provided a better insight into the variances dynamics over the harvest years/sites. The genetic gains were 3.52 percentage points higher in D1 and did not change in D2. Despite similar results, the standard model, modeled with covariance structures that assume homogeneity of co-variances, was not the most statistically appropriate model f... Mostrar Tudo |
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Thesagro: |
Árvore Frutífera; Floresta; Melhoramento. |
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Categoria do assunto: |
K Ciência Florestal e Produtos de Origem Vegetal |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Amazônia Oriental (CPATU) |
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| 41. |  | EVANGELISTA, J. S. P. C.; PEIXOTO, M. A.; COELHO, I. F.; ALVES, R. S.; SILVA, F. F. e; RESENDE, M. D. V. de; SILVA, F. L. da; BHERING, L. L. Environmental stratification and genotype recommendation toward the soybean ideotype: a Bayesian approach. Crop Breeding and Applied Biotechnology, v. 21, n. 1, e359721111, 2021.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 42. | | FERREIRA, F. M.; ROCHA, J. R. do A. S. de C.; ALVES, R. S.; ELIZEU, A. M.; BENITES, F. R. G.; RESENDE, M. D. V. de; SOUZA SOBRINHO, F. de; BHERING, L. L. Estimates of repeatability coefficients and optimum number of measures for genetic selection of Cynodon spp. Euphytica, v. 216, article 70, 2020.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Florestas; Embrapa Gado de Leite. |
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| 43. | | MIRANDA, T. L. R.; RESENDE, M. D. V. de; AZEVEDO, C. F.; NUNES, A. C. P.; TAKAHASHI, E. K.; SIMIQUELI, G. F.; SILVA, F. F. e; ALVES, R. S. Evaluation of a new additive-dominance genomic model and implications for quantitative genetics and genomic selection. Scientia Agricola, v. 79, n. 6, p. 1-7, 2022.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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| 44. | | ALVES, R. S.; TEODORO, P. E.; FARIAS, F. C.; FARIAS, F. J. C.; CARVALHO, L. P. de; RODRIGUES, J. I. S.; BHERING, L. L.; RESENDE, M. D. V. de. Evaluation of genotype x environment interactions in cotton using the method proposed by Eberhart and Russell and reaction norm models. Genetics and Molecular Research, v. 16, n. 3, gmr16039726, 2017.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
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| 46. | | ALVES, R. S.; SILVA, M. S.; RABELLO, A. R.; ESPÍNDOLA, L. S.; SILVA, E. M.; PAULA, J. E. de; LIMA, T. R.; VIEIRA, E. A.; ANJOS, J. de R. N. dos. Extratos orgânicos de plantas nativas do cerrado dos gêneros Cibistax, Tabebuia, Arrabeia e Anemopaegma (Família Bignoniaceae) não apresentaram atividade antimicrobiana contra vários fungos fitopatogênicos. In: SIMPÓSIO NACIONAL CERRADO, 9.; SIMPÓSIO INTERNACIONAL SAVANAS TROPICAIS, 2., 2008, Brasília, DF. Desafios e estratégias para o equilíbrio entre sociedade, agronegócio e recursos naturais: anais... Planaltina, DF: Embrapa Cerrados, 2008. 1 CD-ROM. Organizado por Fábio Gelape Faleiro e Austeclínio Lopes de Farias Neto.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
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| 48. | | ALVES, R. S.; SILVA, M. S.; RABELLO, A. R.; ESPÍNDOLA, L. S.; SILVA, E. M.; PAULA, J. E. de; LIMA, T. R.; VIEIRA, E. A.; ANJOS, J. de R. N. dos. Extratos orgânicos de plantas nativas do Cerrado dos gêneros Cibistax, Tabebuia, Arrabeia e Anemopaegma (Família Bignoniaceae) não apresentaram atividade antimicrobiana contra vários fungos fitpatogênicos. In: SIMPÓSIO NACIONAL CERRADO, 9.; SIMPÓSIO INTERNACIONAL SAVANAS TROPICAIS, 2., 2008, Brasília, DF. Desafios e estratégias para o equilíbrio entre sociedade, agronegócio e recursos naturais: anais... Planaltina, DF: Embrapa Cerrados, 2008. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
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| 49. | | NASCIMENTO, T. A. do; SILVA, M. S.; RABELLO, A. R.; ALVES R. S.; ESPÍNDOLA, L. S.; SILVA, E. M.; PAULA, J. E. de; LIMA, T. R.; VIEIRA, E. A.; ANJOS, J. de R. N. dos. Extratos orgânicos de plantas "Pau-terra" nativas do Cerrado (Gênero Qualea; Família: Vochysiaceae) são ativos contra crescimento micelial in vitro de fungos fitopatogênicos. In: SIMPÓSIO NACIONAL CERRADO, 9.; SIMPÓSIO INTERNACIONAL SAVANAS TROPICAIS, 2., 2008, Brasília, DF. Desafios e estratégias para o equilíbrio entre sociedade, agronegócio e recursos naturais: anais... Planaltina, DF: Embrapa Cerrados, 2008. 1 CD-ROM. Organizado por Fábio Gelape Faleiro e Austeclínio Lopes de Farias Neto.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
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| 50. | | NASCIMENTO, T. A. do; SILVA, M. S.; RABELLO, A. R.; ALVES R. S.; ESPÍNDOLA, L. S.; SILVA, E. M.; PAULA, J. E. de; LIMA, T. R.; VIEIRA, E. A.; ANJOS, J. de R. N. dos. Extratos orgânicos de plantas "Pau-terra" nativas do Cerrado (Gênero Qualea; Família: Vochysiaceae) são ativos contra crescimento micelial in vitro de fungos fitopatogênicos. In: SIMPÓSIO NACIONAL CERRADO, 9.; SIMPÓSIO INTERNACIONAL SAVANAS TROPICAIS, 2., 2008, Brasília, DF. Desafios e estratégias para o equilíbrio entre sociedade, agronegócio e recursos naturais: anais... Planaltina, DF: Embrapa Cerrados, 2008. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
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| 51. | | COSTA, J. V. M.; SILVA, M. S.; RABELLO, A. R.; ALVES, R. S.; ESPÍNDOLA, L. S.; SILVA, E. M.; PAULA, J. E. de; LIMA, T. R.; VIEIRA, E. A.; ANJOS, J. de R. N. dos. Raízes de plantas nativas do Cerrado, gênero Matayba e Serjania, da família do "guaraná" (Sapindaceae), apresentam princípios ativos contra o fungo causador da brusone em trigo. In: SIMPÓSIO NACIONAL CERRADO, 9.; SIMPÓSIO INTERNACIONAL SAVANAS TROPICAIS, 2., 2008, Brasília, DF. Desafios e estratégias para o equilíbrio entre sociedade, agronegócio e recursos naturais: anais... Planaltina, DF: Embrapa Cerrados, 2008. 1 CD-ROM. Organizado por Fábio Gelape Faleiro e Austeclínio Lopes de Farias Neto.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
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| 52. | | COSTA, J. V. M.; SILVA, M. S.; RABELLO, A. R.; ALVES, R. S.; ESPÍNDOLA, L. S.; SILVA, E. M.; PAULA, J. E. de; LIMA, T. R.; VIEIRA, E. A.; ANJOS, J. de R. N. dos. Raízes de plantas nativas do Cerrado, gênero Matayba e Serjania, da família do "guaraná" (Sapindaceae), apresentam princípios ativos contra o fungo causador da brusone em trigo. In: SIMPÓSIO NACIONAL CERRADO, 9.; SIMPÓSIO INTERNACIONAL SAVANAS TROPICAIS, 2., 2008, Brasília, DF. Desafios e estratégias para o equilíbrio entre sociedade, agronegócio e recursos naturais: anais... Planaltina, DF: Embrapa Cerrados, 2008. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
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| 53. | | ALVES, R. S.; RESENDE, M. D. V. de; ROCHA, J. R. do A. S. de C.; PEIXOTO, M. A.; TEODORO, P. E.; SILVA, F. F. e; BHERING, L. L.; SANTOS, G. A. dos. Quantifying individual variation in reaction norms using random regression models fitted through Legendre polynomials: application in eucalyptus breeding. Bragantia, v. 79, n. 4, 2020. p. 360-376.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
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| 55. | | RABELLO, A. R.; SILVA, M. S.; ALVES, R. S.; ESPÍNDOLA, L. S.; SILVA, E. M.; PAULA, J. E. de; LIMA, T. R.; VIEIRA, E. A.; ANJOS, J. de R. N. dos. Gênero Pouteria de plantas nativas do Cerrado, da família do "sapoti" (Sapotaceae) , produz princípios ativos na raiz contra crescimento micelial in vitro de fungos patogênicos de soja. In: SIMPÓSIO NACIONAL CERRADO, 9.; SIMPÓSIO INTERNACIONAL SAVANAS TROPICAIS, 2., 2008, Brasília, DF. Desafios e estratégias para o equilíbrio entre sociedade, agronegócio e recursos naturais: anais... Planaltina, DF: Embrapa Cerrados, 2008. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
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| 57. | | SANTOS, L. C. B. dos; SILVA, M. S.; PEREIRA, A. C. G.; RABELLO, A. R.; ALVES, R. S.; ESPÍNDOLA, L. S.; PAULA, J. E. de; VIEIRA, E. A.; LIMA, T. R.; ANJOS, J. de R. N. dos. Fungos patogênicos de algodão, soja e estilosantes são sensíveis a extratos orgânicos de planta nativa do Cerrado do gênero Duguetia (Família Annonacea). In: SIMPÓSIO NACIONAL CERRADO, 9.; SIMPÓSIO INTERNACIONAL SAVANAS TROPICAIS, 2., 2008, Brasília, DF. Desafios e estratégias para o equilíbrio entre sociedade, agronegócio e recursos naturais: anais... Planaltina, DF: Embrapa Cerrados, 2008. 1 CD-ROM. Organizado por Fábio Gelape Faleiro e Austeclínio Lopes de Farias Neto.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
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| 59. | | ASSIS, M. F. de O.; SILVA, M. S.; OLIVEIRA, L. D. de; RABELLO, A. R.; ALVES, R. S.; ESPÍNDOLA, L. S.; PAULA, J. E. de; VIEIRA, E. A.; LIMA, T. R.; ANJOS, J. de R. N. dos. Fungos patogênicos de soja e algodão são sensíveis a extratos orgânicos de planta nativa do Cerrado do gênero Xylopia, Família Annonacea. Planaltina, DF: Embrapa Cerrados, 2008. 1 folder.| Tipo: Folder/Folheto/Cartilha |
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| 60. | | ASSIS, M. F. de O.; SILVA, M. S.; OLIVEIRA, L. D. de; RABELLO, A. R.; ALVES, R. S.; ESPÍNDOLA, L. S.; PAULA, J. E. de; VIEIRA, E. A.; LIMA, T. R.; ANJOS, J. de R. N. dos. Fungos patogênicos de soja e algodão são sensíveis a extratos orgânicos de planta nativa do Cerrado do gênero Xylopia, Família Annonacea. In: SIMPÓSIO NACIONAL CERRADO, 9.; SIMPÓSIO INTERNACIONAL SAVANAS TROPICAIS, 2., 2008, Brasília, DF. Desafios e estratégias para o equilíbrio entre sociedade, agronegócio e recursos naturais: anais... Planaltina, DF: Embrapa Cerrados, 2008. 1 CD-ROM. Organizado por Fábio Gelape Faleiro e Austeclínio Lopes de Farias Neto.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
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