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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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Data corrente: |
30/09/2019 |
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Data da última atualização: |
24/10/2019 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
SOUSA, E. M. R.; SUZART, C.; COSTA, S. N.; COSTA, M. G. C.; ALMEIDA, A. A. F. de; COELHO FILHO, M. A.; SILVA, F. R. da; SOARES FILHO, W. dos S.; MICHELI, F.; GESTEIRA, A. da S. |
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Afiliação: |
ELIANA MARIA ROCHA SOUSA, UESC; CAIO SUZART, UESC; SHIRLEY NASCIMENTO COSTA, UESC; MARCIO GILBERTO CARDOSO COSTA, UESC; ALEX-ALAN FURTADO DE ALMEIDA, UESC; MAURICIO ANTONIO COELHO FILHO, CNPMF; FELIPE RODRIGUES DA SILVA, CNPTIA; WALTER DOS SANTOS SOARES FILHO, CNPMF; FABIENNE MICHELI, UESC, CIRAD -UMR AGAP; ABELMON DA SILVA GESTEIRA, UESC, CNPMF. |
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Título: |
Transcriptomic analysis related to the flowering of the citrus hybrid Microcitrangemonia. |
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Ano de publicação: |
2019 |
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Fonte/Imprenta: |
Current Plant Biology, v. 18, p. 1-9, May 2019. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1016/j.cpb.2018.12.003 |
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Idioma: |
Inglês |
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Notas: |
Article number: 100097. |
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Conteúdo: |
ABSTRACT. Flowering in citrus plants grown from seeds occurs between four to ten years; therefore, the reduction of the juvenile period is a challenge for the genetic improvement of citrus. However, the Embrapa Mandioca e Fruticultura created a hybrid called Microcitrangemonia [Lemon Tree 'Rangpur' (LCR) X Citrus 'Yuma' (CTYM) - 005) X Microcitrus papuana (MCP) - 011] which presents a short juvenile period (one year) and flowering in all seasons of the year. It has a rare genotype for citrus cultivation. Other varieties with similar characteristics are only transgenic. This work describes the genes expressed in flowering-related pathways in the citrus hybrid Microcitrangemonia, which shows early and constant flowering and compares the gene function of each pathway with the existing Arabidopsis thaliana homologues. We performed RNA extraction, RNA-sequence library construction and sequencing from leaves, reproductive buds and stems of the H011 plant. We identified floweringrelated transcripts and cladograms of similarity for the SOC1, AP1 and FLC proteins. Sequence annotation showed that most of the hits are similar to Citrus sinensis, 57%, and Citrus clementina, 38.9%. Different sequences similar to 29 proteins belonging to different flowering-related pathways have been identified, such as gibberellin, photoperiod, autonomous and vernalization. The analysis of similarity allowed inferring that H011 has greater evolutionary kinship with Citrus sinensis. The outcomes contribute to the understanding of the early and constant flowering of H011 as well as provide an important resource for breeding programs in citrus aimed at juvenile period reduction. MenosABSTRACT. Flowering in citrus plants grown from seeds occurs between four to ten years; therefore, the reduction of the juvenile period is a challenge for the genetic improvement of citrus. However, the Embrapa Mandioca e Fruticultura created a hybrid called Microcitrangemonia [Lemon Tree 'Rangpur' (LCR) X Citrus 'Yuma' (CTYM) - 005) X Microcitrus papuana (MCP) - 011] which presents a short juvenile period (one year) and flowering in all seasons of the year. It has a rare genotype for citrus cultivation. Other varieties with similar characteristics are only transgenic. This work describes the genes expressed in flowering-related pathways in the citrus hybrid Microcitrangemonia, which shows early and constant flowering and compares the gene function of each pathway with the existing Arabidopsis thaliana homologues. We performed RNA extraction, RNA-sequence library construction and sequencing from leaves, reproductive buds and stems of the H011 plant. We identified floweringrelated transcripts and cladograms of similarity for the SOC1, AP1 and FLC proteins. Sequence annotation showed that most of the hits are similar to Citrus sinensis, 57%, and Citrus clementina, 38.9%. Different sequences similar to 29 proteins belonging to different flowering-related pathways have been identified, such as gibberellin, photoperiod, autonomous and vernalization. The analysis of similarity allowed inferring that H011 has greater evolutionary kinship with Citrus sinensis. The outcomes contribut... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Citrus spp; Melhoramento genético de citros; Microcitrangemonia; Precocius molecular reproduction. |
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Thesagro: |
Fruta Cítrica. |
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Thesaurus Nal: |
Genetic improvement. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
LEADER 02685naa a2200325 a 4500
001 2112595
005 2019-10-24
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Registro original: |
Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
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| 63. | | CARMO, M. do; GENRO, T. C. M.; CIBILS, A. F.; SOCA, P. M. Herbage mass and allowance and animal genotype affect daily herbage intake, productivity, and efficiency of beef cows grazing native subtropical grassland. Journal of Animal Science, v. 99, n. 10, p. 1-9, 2021. Online.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul. |
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| 66. | | LACA, E.; GENRO, T. C. M.; BREMM, C.; GENRO, J.; SCHRIEFER, C. Patch size controls selectivity of sheep grazing grass-clover grasslands. In: ANNUAL MEETING OF THE SOCIETY FOR RANGE MANAGEMENT, 64., 2011, Billings, MT. Abstracts... [Wheat Ridge: Society for Range Management], 2011. p. 392.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 68. | | KIPPER, D. K.; YOKOO, M. J. I.; NALERIO, E. S.; GIONGO, C.; GENRO, T. C. M.; FARIAS, B, M. de. Avaliação das características de carcaça de animais da raça Hereford alimentados em pastagens nativas: resultados iniciais. In: SALÃO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA PECUÁRIA SUL, 3., 2013, Bagé. Resumos... Bagé: Embrapa Pecuária Sul, 2013. p. 9.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 71. | | SOLARI, F. L.; GENRO, T. C. M.; SOUZA, A. L. F.; TRENTIN, G.; SILVEIRA, M. C. T. da. Comportamento da distribuição dos componentes morfológicos do perfil vertical de campos nativos, sob níveis de intensificação, em quatro de anos de monitoramento. In: CONGRESSO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 25.; SEMANA INTEGRADA DE ENSINO, PESQUISA E EXTENSÃO, 2., 2016, Pelotas. Anais... Pelotas: UFPel, 2016. CIC.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 73. | | FARIA, B. M. de; GENRO, T. C. M.; ROSSETTO, J.; GARAGORRY, F. C.; NASCIMENTO, P. G. M.; KOSLOSKI, G. V. Composição química de pastagem natural com diferentes níveis de intensificação. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ZOOTECNIA, 26., 2016, Santa Maria. Cinquenta anos de zootecnia no Brasil: anais. Santa Maria: Sociedade Brasileira de Zootecnia, 2016. Zootec.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 74. | | CARBALLO, C.; CLARAMUNT, M.; MOTTA, G.; FABER, A.; SOCA, P.; CHILIBROSTE, P.; GENRO, T. C. M.; BENTANCUR, O.; MATTIAUDA, D. Behavior, intake and milk production of Holstein cows grazing perennial pasture under different intensities. In: INTERNATIONAL RANGELAND CONGRESS, 9., 2011, Rosario, Argentina. Diverse rangelands for a sustainable society: [proceedings...]. Rosario: Instituto Nacional de Tecnología Agrpecuaria; Asociación Argentina para el Manejo de Pastizales Naturales, 2011. p. 441.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 75. | | SILVEIRA, M. C. T. da; GENRO, T. C. M.; KÖPP, M. M.; YOKOO, M. J. I.; BARBOSA, E. C. Caracterização da estrutura vertical de pastagem natural sob diferentes níveis de intensificação. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE AGROPECUÁRIA SUSTENTÁVEL, 7.; CONGRESSO INTERNACIONAL DE AGROPECUÁRIA SUSTENTÁVEL, 4., 2015, Viçosa, MG. Estratégias para a sustentabilidade da cadeia agropecuária: anais de resumos expandidos. Viçosa, MG: UFV, 2015. p. 595-598.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 76. | | SILVA, P. S. da; OLIVEIRA, L. G. G. de; SILVEIRA, M. C. T. da; GENRO, T. C. M. Caracterização da massa de forragem do pastejo simulado de capim-sudão BRS Estribo com e sem irrigação. In: SIMPÓSIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA PECUÁRIA SUL, 8., 2018, Bagé. Resumos... Bagé: Embrapa Pecuária Sul, 2018. p. 21. (Embrapa Pecuária Sul. Eventos técnicos & científicos, 1). Fernando Flores Cardoso, Daniel Portella Montardo, José Carlos Ferrugem Moraes, Marcos Flávio Silva Borba, Sandro da Silva Camargo, editores técnicos.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 77. | | BRATZ, M. M.; ROSSETTO, J.; FARIA, B. M.; GENRO, T. C. M.; CARDOSO, L. L.; YOKOO, M. J. I. Características pré-abate de bovinos de corte mantidos em pastagem natural do bioma Pampa. In: JORNADA [DO] NÚCLEO DE ESTUDOS EM SISTEMAS DE PRODUÇÃO DE BOVINOS DE CORTE E CADEIA PRODUTIVA, 10.; SIMPÓSIO INTERNACIONAL SOBRE SISTEMA DE PRODUÇÃO DE BOVINOS DE CORTE, 2., 2015, Porto Alegre. Fronteiras do conhecimento frente a um ambiente de transição na pecuária de corte: resumos expandidos. Porto Alegre: UFRGS, 2015. p. 111-113. Organizadores Gabriel Ribas Pereira, Tamara Esteves de Oliveira, Júlio Otávio Jardim Barcellos. Nespro.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 80. | | MELLO, G. L.; GENRO, T. C. M.; FARIA, B. M.; GARAGORRY, F. C.; QUADROS, F. L. F. de. Conteúdo de n-alcanos em gramíneas nativas do bioma Pampa. In: SALÃO INTERNACIONAL DE ENSINO, EXTENSÃO E PESQUISA, 5., 2013, Bagé. Discussão, participação e cidadania: anais. Bagé: Unipampa, 2013. SIEPE.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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