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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Pecuária Sudeste. |
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Data corrente: |
08/03/2023 |
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Data da última atualização: |
08/03/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
BUSS, C. E.; AFONSO, J.; OLIVEIRA, P. S. N. DE; PETRINI, J.; TIZIOTO, P. C.; CESAR, A. S. M.; GUSTANI-BUSS, E. C.; CARDOSO, T. F.; ROVADOSKI, G. A.; DINIZ, W. J. DA S.; LIMA, A. O. DE; ROCHA, M. I. P.; ANDRADE, B. G. N.; WOLF, J. B.; COUTINHO, L. L.; MOURÃO, G. B.; REGITANO, L. C. de A. |
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Afiliação: |
CARLOS EDUARDO BUSS, Federal University of São Carlos; JULIANA AFONSO; PRISCILA S. N. DE OLIVEIRA, Federal University of São Carlos; JULIANA PETRINI, University of São Paulo/ESALQ, Piracicaba; POLYANA CRISTINE TIZIOTO, NGS Soluções Genômicas; ALINE S. M. CESAR, University of São Paulo/ESALQ; EMANUELE CRISTINA GUSTANI-BUSS, Mindflow Genomics, Leuven, Flanders, Belgium.; TAINÃ FIGUEIREDO CARDOSO; GREGORI A. ROVADOSKI, University of São Paulo/ESALQ; WELLISON JARLES DA SILVA DINIZ, Auburn University; ANDRESSA OLIVEIRA DE LIMA, University of Washington; MARINA IBELLI PEREIRA ROCHA, Federal University of São Carlos; BRUNO GABRIEL NASCIMENTO ANDRADE, Munster Technological University/MTU; JASON B. WOLF, University of Bath; LUIZ LEHMANN COUTINHO, University of São Paulo/ESALQ; GERSON BARRETO MOURÃO, University of São Paulo/ESALQ; LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE. |
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Título: |
Bivariate GWAS reveals pleiotropic regions among feed efficiency and beef quality-related traits in Nelore cattle. |
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Ano de publicação: |
2022 |
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Fonte/Imprenta: |
Mammalian Genome, v. 34, p. 90-103, dec. 2022. |
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DOI: |
10.1007/s00335-022-09969-6 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Feed-efcient cattle selection is among the most leading solutions to reduce cost for beef cattle production. However, technical difculties in measuring feed efciency traits had limited the application in livestock. Here, we performed a Bivariate Genome-Wide Association Study (Bi-GWAS) and presented candidate biological mechanisms underlying the association between feed efciency and meat quality traits in a half-sibling design with 353 Nelore steers derived from 34 unrelated sires. A total of 13 Quantitative Trait Loci (QTL) were found explaining part of the phenotypic variations. An important transcription factor of adipogenesis in cattle, the TAL1 (rs133408775) gene located on BTA3 was associated with intramuscular fat and average daily gain (IMF-ADG), and a region located on BTA20, close to CD180 and MAST4 genes, both related to fat accumulation. We observed a low positive genetic correlation between IMF-ADG (r=0.30±0.0686), indicating that it may respond to selection in the same direction. Our fndings contributed to clarifying the pleiotropic modulation of the complex traits, indicating new QTLs for bovine genetic improvement. |
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Palavras-Chave: |
Bi GWAS; Efciency and meat quality; Phenotypic variations; Pleiotropic modulation; QTL. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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Marc: |
LEADER 02281naa a2200385 a 4500
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005 2023-03-08
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520 $aFeed-efcient cattle selection is among the most leading solutions to reduce cost for beef cattle production. However, technical difculties in measuring feed efciency traits had limited the application in livestock. Here, we performed a Bivariate Genome-Wide Association Study (Bi-GWAS) and presented candidate biological mechanisms underlying the association between feed efciency and meat quality traits in a half-sibling design with 353 Nelore steers derived from 34 unrelated sires. A total of 13 Quantitative Trait Loci (QTL) were found explaining part of the phenotypic variations. An important transcription factor of adipogenesis in cattle, the TAL1 (rs133408775) gene located on BTA3 was associated with intramuscular fat and average daily gain (IMF-ADG), and a region located on BTA20, close to CD180 and MAST4 genes, both related to fat accumulation. We observed a low positive genetic correlation between IMF-ADG (r=0.30±0.0686), indicating that it may respond to selection in the same direction. Our fndings contributed to clarifying the pleiotropic modulation of the complex traits, indicating new QTLs for bovine genetic improvement.
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Registro original: |
Embrapa Pecuária Sudeste (CPPSE) |
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Biblioteca |
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| Registros recuperados : 51 | |
| 41. |  | CARDOSO, T. F.; BRUSCADIN, J. J.; DINIZ, W. J. da S.; BANERJEE, P.; AFONSO, J.; ANDRADE, B. G. N. B; MALHEIROS, J. M.; ZERLOTINI NETO, A.; VIEIRA, D. da S.; FERNANDES, A. C.; CESAR, A. S. M.; MOURÃO, G. B.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A. Integration of different omics layers with SNP-SNP interaction networks associated with methane emission in nelore cattle. In: BRAZILIAN CONGRESS OF GENETICS, 67., 2022, Natal. [Abstracts]. Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2022. p. 247. e-book. Na publicação: Adhemar Zerlotini.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 42. | | AFONSO, J.; SHIM, W. J.; BODEN, M.; FORTES, M. R. S.; DINIZ, W. J. da S.; LIMA, A. O. de; ROCHA, M. I. P.; CARDOSO, T. F.; BRUSCADIN, J. J.; GROMBONI, C. F.; NOGUEIRA, A. R. A.; MOURÃO, G. B.; ZERLOTINI NETO, A.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A. Repressive epigenetic mechanisms, such as the H3K27me3 histone modification, were predicted to affect muscle gene expression and its mineral content in Nelore cattle. Biochemistry and Biophysics Reports, v. 33, 101420, Mar. 2023.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 4 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 43. | | LIMA, A. O. D.; OLIVEIRA, P. S. N.; TIZIOTO, P. C.; SOMAVILLA, A. L.; DINIZ, W. J. S.; SILVA, J. V. D.; ANDRADE, S. C. S.; BOSCHIERO, C.; CESAR, A. S. M.; SOUZA, M. M.; ROCHA, M. I. P.; AFONSO, J.; BUSS, C. E.; MUDADU, M. de A.; MOURAO, G. B.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A. PRUNE2 gene has a potential effect on residual feed intake in Nellore cattle. Journal of Animal Science, v. 94, p. 152-153, 2016. Supplement 5.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 44. | | LIMA, A. O. D.; OLIVEIRA, P. S. N.; TIZIOTO, P. C.; SOMAVILLA, A. L.; DINIZ, W. J. S.; SILVA, J. V. D.; ANDRADE, S. C. S.; BOSCHIERO, C.; CESAR, A. S. M.; SOUZA, M. M.; ROCHA, M. I. P.; AFONSO, J.; BUSS, C. E.; MUDADU, M. de A.; MOURAO, G. B.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A. PRUNE2 gene has a potential effect on residual feed intake in Nellore cattle. Journal of Animal Science, v. 94, p. 152-153, 2016. p. 148-149. Supplement 5.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 45. | | LIMA, A. O.; MALHEIROS, J. M.; AFONSO, J.; PETRINI, J.; COUTINHO, L. L.; DINIZ, W. J. da S.; DONATONI, F. A. B.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N. de; RIBEIRO, J. A. S.; OLIVEIRA, K. S. de; ROCHA, M. I. P.; ANDRADE, B. G. N.; FUKUMASU, H.; BEIKI, H.; REECY, J. M.; ZERLOTINI NETO, A.; MOURAO, G. B.; REGITANO, L. C. de A. Prune homolog 2 with BCH domain (PRUNE2) gene expression is associated with feed efficiency related traits in Nelore steers. Mammalian Genome, 2022.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 46. | | AFONSO, J.; LINS, L. A.; CASSARO, E. G.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N. de O.; DINIZ, W. J. da S.; LIMA, A. O. de; SOUZA, M. M. de; ROCHA, M. I. P.; SILVA, J. V. da; BUSS, C. E.; GROMBONI, C. F.; MOURAO, G. B.; NOGUEIRA, A. R. de A.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A. Putative genes involved in muscle functioning are differentially expressed in Nelore steers divergent for sodium and potassium concentration. In: WORKSHOP ON OMICS STRATEGIES APPLIED TO LIVESTOCK SCIENCE, 1., 2017, Piracicaba, SP. Proceedings... São Carlos, SP: Embrapa Pecuária Sudeste, 2017. p. 18. (Embrapa Pecuária Sudeste. Documentos, 125) Editores: Luiz Lehmann Coutinho, ESALQ/USP; Luciana Correia de Almeida Regitano, Embrapa Pecuária Sudeste; Gerson Barreto Mourão, ESALQ/USP; Aline Silva Mello Cesar, ESALQ/USP; Bárbara Silva Vignato, FZEA/USP; Mirele Daiana Poleti,...| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 47. | | AFONSO, J.; COUTINHO, L. L.; TIZIOTO, P. C.; DINIZ, W. J. da S.; LIMA, A. O. de; ROCHA, M. I. P.; BUSS, C, E.; ANDRADE, B. G. N. A.; PIAYA. O.; SILVA, J. V.; LINS, L. A.; GROMBONI, C. F.; NOGUEIRA, A. R. de A.; FORTES, M. R. S.; MOURÃO, G. B.; REGITANO, L. C. de A. Muscle transcriptome analysis reveals genes and metabolic pathways related to mineral concentration in Bos indicus. Scientific Reports, v. 9, n. 12715, 2019.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 48. | | LIMA, A. O. de; KOLTES, J. E.; DINIZ, W. J. S.; OLIVEIRA, P. S. N. de; CESAR, A. S. M.; TIZIOTO, P. L.; AFONSO, J.; SOUZA, M. de S.; PETRINI, J.; ROCHA, M. I. P.; CARDOSO, T. F.; ZERLOTINI NETO, A.; COUTINHO, L. L.; MOURÃO, G. B.; REGITANO, L. C. de A. Potential biomarkers for feed efficiency-related traits in nelore cattle identified by co-expression network and integrative genomics analyses. Frontiers in Genetics, v. 11, p. 1-14, Mar. 2020. Article 189. Na publicação: Luciana C. A. Regitano.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 49. | | LIMA, A. O. de; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N. de; GEISTLINGER, L.; ROCHA, M. I. P.; DINIZ, W. J. da S.; AFONSO, J.; BUSS, C. E.; PETRINI, J.; MOURAO, G. B.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A. Potential regulatory elements on PCDH7 gene affecting residual feed intake in Nelore cattle. In: WORKSHOP ON OMICS STRATEGIES APPLIED TO LIVESTOCK SCIENCE, 1., 2017, Piracicaba, SP. Proceedings... São Carlos, SP: Embrapa Pecuária Sudeste, 2017. p. 23. (Embrapa Pecuária Sudeste. Documentos, 125) Editores: Luiz Lehmann Coutinho, ESALQ/USP; Luciana Correia de Almeida Regitano, Embrapa Pecuária Sudeste; Gerson Barreto Mourão, ESALQ/USP; Aline Silva Mello Cesar, ESALQ/USP; Bárbara Silva Vignato, FZEA/USP; Mirele Daiana Poleti,...| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 50. | | FANALLI, S. L.; SILVA, B. P. M. DA; GOMES, J. D.; CICONELLO, F. N.; ALMEIDA, V. V. DE; FREITAS, F. A. O.; MOREIRA, G. C. M.; VIGNATO, B. S.; AFONSO, J.; REECY, J.; KOLTES, J.; KOLTES, D.; REGITANO, L. C. de A.; BAILEIRO, J. C. DE C.; FREITAS, L.; COUTINHO, L. L.; FUKUMASU, H.; ALENCAR, S. M. DE; LUCHIARI FILHO, A.; CESAR, A. S. M. Effect of dietary soybean oil inclusion on liver-related transcription factors in a pig model for metabolic diseases. Scientific Reports, v. 12, 10318, jun. 2022. 10 p.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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| 51. | | FINALLI, S. L.; SILVA, B. P. M. DA; GOMES, J. D.; ALMEIDA, V. V. DE; FREITAS, F. A. O.; MOREIRA, G. C. M.; VIGNATO, B. S.; AFONSO, J.; REECY, J.; KOLTES, J.; KOLTES, D.; REGITANO, L. C. de A.; GARRICK, D. J.; BALIEIRO, J. C. DE C.; MEIRA, A. N.; FREITAS, L.; COUTINHO, L. L.; FUKUMASU, H.; MOURÃO, G. B.; ALENCAR, S. M. DE; LUCHIARI FILHO, A.; CESAR, A. S. M. Differential gene expression associated with soybean oil level in the diet of pigs. Animals, v. 12, n. 13 1632, jun. 2022. 21 p.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
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